MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 2623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018627	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	406594902
2	NC_018627	GCGT	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	406594902
3	NC_018627	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	406594804
4	NC_018627	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	406594804
5	NC_018627	TGTT	2	8	2838	2845	0 %	75 %	25 %	0 %	406594726
6	NC_018627	GAAG	2	8	2949	2956	50 %	0 %	50 %	0 %	406594726
7	NC_018627	AGTA	2	8	2979	2986	50 %	25 %	25 %	0 %	406594726
8	NC_018627	TTTG	2	8	3297	3304	0 %	75 %	25 %	0 %	406594534
9	NC_018627	TCCT	2	8	3323	3330	0 %	50 %	0 %	50 %	406594534
10	NC_018627	GAAA	2	8	5252	5259	75 %	0 %	25 %	0 %	406594534
11	NC_018627	CGAG	2	8	5523	5530	25 %	0 %	50 %	25 %	406594817
12	NC_018627	TAAT	2	8	6729	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	406594141
13	NC_018627	AGAA	2	8	6961	6968	75 %	0 %	25 %	0 %	406594370
14	NC_018627	TCCC	2	8	7278	7285	0 %	25 %	0 %	75 %	406594370
15	NC_018627	GTAG	2	8	7312	7319	25 %	25 %	50 %	0 %	406594370
16	NC_018627	AATA	2	8	8009	8016	75 %	25 %	0 %	0 %	406594531
17	NC_018627	ATGA	2	8	8480	8487	50 %	25 %	25 %	0 %	406594531
18	NC_018627	TGGA	2	8	8668	8675	25 %	25 %	50 %	0 %	406594531
19	NC_018627	CTGT	2	8	8678	8685	0 %	50 %	25 %	25 %	406594531
20	NC_018627	ATTT	2	8	9400	9407	25 %	75 %	0 %	0 %	406594531
21	NC_018627	AAAG	2	8	10224	10231	75 %	0 %	25 %	0 %	406594531
22	NC_018627	AAGT	2	8	10523	10530	50 %	25 %	25 %	0 %	406594531
23	NC_018627	AGGG	2	8	10762	10769	25 %	0 %	75 %	0 %	406594531
24	NC_018627	TAAG	2	8	10772	10779	50 %	25 %	25 %	0 %	406594531
25	NC_018627	AAAG	2	8	11065	11072	75 %	0 %	25 %	0 %	406594948
26	NC_018627	AGTA	2	8	11723	11730	50 %	25 %	25 %	0 %	406594948
27	NC_018627	TCTT	2	8	12004	12011	0 %	75 %	0 %	25 %	406594948
28	NC_018627	TAAT	2	8	12145	12152	50 %	50 %	0 %	0 %	406594948
29	NC_018627	CAAA	2	8	12456	12463	75 %	0 %	0 %	25 %	406594948
30	NC_018627	AGAT	2	8	12566	12573	50 %	25 %	25 %	0 %	406594948
31	NC_018627	AAGA	2	8	12577	12584	75 %	0 %	25 %	0 %	406594948
32	NC_018627	ACTT	2	8	12699	12706	25 %	50 %	0 %	25 %	406594948
33	NC_018627	CACT	2	8	12796	12803	25 %	25 %	0 %	50 %	406594948
34	NC_018627	GCAA	2	8	13324	13331	50 %	0 %	25 %	25 %	406594948
35	NC_018627	GAAA	2	8	13745	13752	75 %	0 %	25 %	0 %	406594856
36	NC_018627	AGAT	2	8	14314	14321	50 %	25 %	25 %	0 %	406594874
37	NC_018627	TTGT	2	8	14364	14371	0 %	75 %	25 %	0 %	406594874
38	NC_018627	TTGG	2	8	14819	14826	0 %	50 %	50 %	0 %	406594874
39	NC_018627	GGAT	2	8	14948	14955	25 %	25 %	50 %	0 %	406594874
40	NC_018627	CCCA	2	8	15419	15426	25 %	0 %	0 %	75 %	406594874
41	NC_018627	AGAA	2	8	17163	17170	75 %	0 %	25 %	0 %	406594379
42	NC_018627	TCTT	2	8	17433	17440	0 %	75 %	0 %	25 %	406594379
43	NC_018627	GTCA	2	8	17836	17843	25 %	25 %	25 %	25 %	406594129
44	NC_018627	AAGC	2	8	18227	18234	50 %	0 %	25 %	25 %	406594129
45	NC_018627	ATTA	2	8	18367	18374	50 %	50 %	0 %	0 %	406594129
46	NC_018627	ATTA	2	8	18989	18996	50 %	50 %	0 %	0 %	406594049
47	NC_018627	GTTT	2	8	19262	19269	0 %	75 %	25 %	0 %	406594049
48	NC_018627	TTTG	2	8	19502	19509	0 %	75 %	25 %	0 %	406594049
49	NC_018627	TGCC	2	8	19534	19541	0 %	25 %	25 %	50 %	406594049
50	NC_018627	GCGT	2	8	19666	19673	0 %	25 %	50 %	25 %	406594049
51	NC_018627	TGGT	2	8	20447	20454	0 %	50 %	50 %	0 %	406594747
52	NC_018627	TAAA	2	8	21087	21094	75 %	25 %	0 %	0 %	406594747
53	NC_018627	TATG	2	8	21586	21593	25 %	50 %	25 %	0 %	406594747
54	NC_018627	CAAT	2	8	22281	22288	50 %	25 %	0 %	25 %	406594213
55	NC_018627	AGAA	2	8	22698	22705	75 %	0 %	25 %	0 %	406594213
56	NC_018627	TGAT	2	8	22905	22912	25 %	50 %	25 %	0 %	406594213
57	NC_018627	AGCT	2	8	24166	24173	25 %	25 %	25 %	25 %	406594484
58	NC_018627	AAAT	2	8	24503	24510	75 %	25 %	0 %	0 %	406594484
59	NC_018627	AATT	2	8	24628	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	406594484
60	NC_018627	ATAA	2	8	24695	24702	75 %	25 %	0 %	0 %	406594484
61	NC_018627	TAGT	2	8	24984	24991	25 %	50 %	25 %	0 %	406594484
62	NC_018627	GAAC	2	8	25443	25450	50 %	0 %	25 %	25 %	406594484
63	NC_018627	ATTC	2	8	25882	25889	25 %	50 %	0 %	25 %	406594484
64	NC_018627	TTTC	2	8	26014	26021	0 %	75 %	0 %	25 %	406594484
65	NC_018627	ATAG	2	8	26109	26116	50 %	25 %	25 %	0 %	406594484
66	NC_018627	TAAA	2	8	26473	26480	75 %	25 %	0 %	0 %	406594484
67	NC_018627	ATTT	2	8	26655	26662	25 %	75 %	0 %	0 %	406594478
68	NC_018627	ATTA	2	8	26666	26673	50 %	50 %	0 %	0 %	406594478
69	NC_018627	ACTT	2	8	27130	27137	25 %	50 %	0 %	25 %	406594343
70	NC_018627	AATT	2	8	27962	27969	50 %	50 %	0 %	0 %	406594343
71	NC_018627	GAAA	2	8	28154	28161	75 %	0 %	25 %	0 %	406594343
72	NC_018627	AAAT	2	8	28808	28815	75 %	25 %	0 %	0 %	406594343
73	NC_018627	AGGG	2	8	29431	29438	25 %	0 %	75 %	0 %	406594893
74	NC_018627	GAAT	2	8	29625	29632	50 %	25 %	25 %	0 %	406594146
75	NC_018627	ACCA	2	8	30240	30247	50 %	0 %	0 %	50 %	406594146
76	NC_018627	AACG	2	8	30847	30854	50 %	0 %	25 %	25 %	406594988
77	NC_018627	GTTT	2	8	31411	31418	0 %	75 %	25 %	0 %	406594988
78	NC_018627	ATTT	2	8	32434	32441	25 %	75 %	0 %	0 %	406593996
79	NC_018627	TTGT	2	8	32460	32467	0 %	75 %	25 %	0 %	406593996
80	NC_018627	TAGA	2	8	32666	32673	50 %	25 %	25 %	0 %	406593996
81	NC_018627	TTTA	2	8	33120	33127	25 %	75 %	0 %	0 %	406593996
82	NC_018627	TTAG	2	8	33607	33614	25 %	50 %	25 %	0 %	406594942
83	NC_018627	TGAA	2	8	34011	34018	50 %	25 %	25 %	0 %	406594543
84	NC_018627	GTAC	2	8	34089	34096	25 %	25 %	25 %	25 %	406594543
85	NC_018627	GATA	2	8	34125	34132	50 %	25 %	25 %	0 %	406594543
86	NC_018627	TCTT	2	8	34385	34392	0 %	75 %	0 %	25 %	406594615
87	NC_018627	AGGA	2	8	35337	35344	50 %	0 %	50 %	0 %	406594615
88	NC_018627	TAAT	2	8	36125	36132	50 %	50 %	0 %	0 %	406594996
89	NC_018627	CGCT	2	8	36841	36848	0 %	25 %	25 %	50 %	406594996
90	NC_018627	AAAG	2	8	38196	38203	75 %	0 %	25 %	0 %	406594065
91	NC_018627	TAAT	2	8	38212	38219	50 %	50 %	0 %	0 %	406594065
92	NC_018627	TCAA	2	8	38348	38355	50 %	25 %	0 %	25 %	406594065
93	NC_018627	TTTA	2	8	38681	38688	25 %	75 %	0 %	0 %	406594065
94	NC_018627	CTTT	2	8	38811	38818	0 %	75 %	0 %	25 %	406594065
95	NC_018627	CCTG	2	8	40296	40303	0 %	25 %	25 %	50 %	406594506
96	NC_018627	GAAA	2	8	41237	41244	75 %	0 %	25 %	0 %	406594506
97	NC_018627	AGCA	2	8	41408	41415	50 %	0 %	25 %	25 %	406594506
98	NC_018627	CTGT	2	8	41876	41883	0 %	50 %	25 %	25 %	406594506
99	NC_018627	TCTT	2	8	41916	41923	0 %	75 %	0 %	25 %	406594506
100	NC_018627	GAAG	2	8	42327	42334	50 %	0 %	50 %	0 %	406594506
101	NC_018627	AATA	2	8	42358	42365	75 %	25 %	0 %	0 %	406594506
102	NC_018627	GAAA	2	8	43495	43502	75 %	0 %	25 %	0 %	406594572
103	NC_018627	TAAT	2	8	43821	43828	50 %	50 %	0 %	0 %	406594572
104	NC_018627	TTAA	2	8	44223	44230	50 %	50 %	0 %	0 %	406594316
105	NC_018627	ATCA	2	8	44812	44819	50 %	25 %	0 %	25 %	406594316
106	NC_018627	ATGA	2	8	45090	45097	50 %	25 %	25 %	0 %	406594316
107	NC_018627	TAAA	2	8	45989	45996	75 %	25 %	0 %	0 %	406594098
108	NC_018627	GAAA	2	8	46971	46978	75 %	0 %	25 %	0 %	406594853
109	NC_018627	TCTT	2	8	47077	47084	0 %	75 %	0 %	25 %	406594853
110	NC_018627	GCTT	2	8	47606	47613	0 %	50 %	25 %	25 %	406594853
111	NC_018627	TGTT	2	8	48458	48465	0 %	75 %	25 %	0 %	406594614
112	NC_018627	TAAA	2	8	49695	49702	75 %	25 %	0 %	0 %	406594792
113	NC_018627	AAGC	2	8	49724	49731	50 %	0 %	25 %	25 %	406594792
114	NC_018627	CCAA	2	8	49748	49755	50 %	0 %	0 %	50 %	406594792
115	NC_018627	TTCC	2	8	49895	49902	0 %	50 %	0 %	50 %	406594792
116	NC_018627	AACA	2	8	50872	50879	75 %	0 %	0 %	25 %	406594792
117	NC_018627	GAAG	2	8	52719	52726	50 %	0 %	50 %	0 %	406594722
118	NC_018627	ATCC	2	8	53025	53032	25 %	25 %	0 %	50 %	406594229
119	NC_018627	AGCA	2	8	53317	53324	50 %	0 %	25 %	25 %	406594229
120	NC_018627	TTCA	2	8	53477	53484	25 %	50 %	0 %	25 %	406594229
121	NC_018627	GTAT	2	8	54130	54137	25 %	50 %	25 %	0 %	406594222
122	NC_018627	CATA	2	8	54325	54332	50 %	25 %	0 %	25 %	406594222
123	NC_018627	TAGC	2	8	55856	55863	25 %	25 %	25 %	25 %	406594642
124	NC_018627	CTGT	2	8	56035	56042	0 %	50 %	25 %	25 %	406594642
125	NC_018627	CTTT	2	8	56425	56432	0 %	75 %	0 %	25 %	406594386
126	NC_018627	AGAA	2	8	56445	56452	75 %	0 %	25 %	0 %	406594386
127	NC_018627	GAAG	2	8	56614	56621	50 %	0 %	50 %	0 %	406594386
128	NC_018627	GTAA	2	8	56837	56844	50 %	25 %	25 %	0 %	406594386
129	NC_018627	TTAG	2	8	56960	56967	25 %	50 %	25 %	0 %	406594447
130	NC_018627	CTTT	2	8	57310	57317	0 %	75 %	0 %	25 %	406594447
131	NC_018627	GTTA	2	8	57467	57474	25 %	50 %	25 %	0 %	406594447
132	NC_018627	AGCT	2	8	58625	58632	25 %	25 %	25 %	25 %	406594521
133	NC_018627	CCAA	2	8	58900	58907	50 %	0 %	0 %	50 %	406594521
134	NC_018627	CGTA	2	8	60460	60467	25 %	25 %	25 %	25 %	406594291
135	NC_018627	CCGT	2	8	60517	60524	0 %	25 %	25 %	50 %	406594291
136	NC_018627	GTTG	2	8	61160	61167	0 %	50 %	50 %	0 %	406594291
137	NC_018627	TCTG	2	8	62008	62015	0 %	50 %	25 %	25 %	406594291
138	NC_018627	GCTT	2	8	62654	62661	0 %	50 %	25 %	25 %	406594291
139	NC_018627	AAGA	2	8	63838	63845	75 %	0 %	25 %	0 %	406594486
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