MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 22043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_018627	TCA	2	6	159142	159147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594448
3003	NC_018627	TCC	2	6	159178	159183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594448
3004	NC_018627	GTC	2	6	159187	159192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594448
3005	NC_018627	GTT	2	6	159416	159421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594245
3006	NC_018627	TGA	2	6	159499	159504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594245
3007	NC_018627	A	7	7	159707	159713	100 %	0 %	0 %	0 %	406594245
3008	NC_018627	T	7	7	159723	159729	0 %	100 %	0 %	0 %	406594245
3009	NC_018627	CCTT	2	8	159738	159745	0 %	50 %	0 %	50 %	406594245
3010	NC_018627	TTG	2	6	159765	159770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594245
3011	NC_018627	TCT	2	6	159797	159802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594245
3012	NC_018627	ACTG	2	8	159842	159849	25 %	25 %	25 %	25 %	406594245
3013	NC_018627	GGA	2	6	159972	159977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594245
3014	NC_018627	GAA	2	6	160005	160010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594245
3015	NC_018627	TTC	2	6	160018	160023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594245
3016	NC_018627	TTC	2	6	160027	160032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594245
3017	NC_018627	TTTC	2	8	160502	160509	0 %	75 %	0 %	25 %	406594027
3018	NC_018627	AAG	2	6	160664	160669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594027
3019	NC_018627	CTT	2	6	160779	160784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594027
3020	NC_018627	CTC	2	6	160798	160803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594027
3021	NC_018627	TGGATT	2	12	160812	160823	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406594027
3022	NC_018627	GA	3	6	160838	160843	50 %	0 %	50 %	0 %	406594027
3023	NC_018627	CGA	2	6	160848	160853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594027
3024	NC_018627	GAA	2	6	160897	160902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594027
3025	NC_018627	AAGGT	2	10	160938	160947	40 %	20 %	40 %	0 %	406594027
3026	NC_018627	CTT	2	6	161087	161092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594103
3027	NC_018627	AC	3	6	161110	161115	50 %	0 %	0 %	50 %	406594103
3028	NC_018627	TCT	2	6	161220	161225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594103
3029	NC_018627	CAG	2	6	161242	161247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594103
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3031	NC_018627	ATG	2	6	161323	161328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594103
3032	NC_018627	TGT	2	6	161333	161338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594103
3033	NC_018627	GA	3	6	161340	161345	50 %	0 %	50 %	0 %	406594103
3034	NC_018627	A	7	7	161439	161445	100 %	0 %	0 %	0 %	406594103
3035	NC_018627	A	6	6	161449	161454	100 %	0 %	0 %	0 %	406594103
3036	NC_018627	GTA	2	6	161521	161526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594103
3037	NC_018627	AGT	2	6	161577	161582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594103
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3039	NC_018627	A	6	6	161684	161689	100 %	0 %	0 %	0 %	406594103
3040	NC_018627	AAG	2	6	161693	161698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594103
3041	NC_018627	ATG	2	6	161729	161734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594103
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3043	NC_018627	TTTTG	2	10	161877	161886	0 %	80 %	20 %	0 %	406594412
3044	NC_018627	TGTT	2	8	161901	161908	0 %	75 %	25 %	0 %	406594412
3045	NC_018627	T	6	6	161910	161915	0 %	100 %	0 %	0 %	406594412
3046	NC_018627	ACA	2	6	161923	161928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594412
3047	NC_018627	ATA	2	6	161947	161952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594412
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3049	NC_018627	TTG	2	6	161982	161987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594412
3050	NC_018627	TCAA	2	8	162010	162017	50 %	25 %	0 %	25 %	406594412
3051	NC_018627	CAG	2	6	162018	162023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594412
3052	NC_018627	GGGGC	2	10	162024	162033	0 %	0 %	80 %	20 %	406594412
3053	NC_018627	GAC	2	6	162101	162106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594412
3054	NC_018627	AGGC	2	8	162111	162118	25 %	0 %	50 %	25 %	406594412
3055	NC_018627	AGA	2	6	162136	162141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594412
3056	NC_018627	AAT	2	6	162171	162176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594412
3057	NC_018627	TTC	2	6	162237	162242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594412
3058	NC_018627	TCG	2	6	162302	162307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594412
3059	NC_018627	TTTG	2	8	162378	162385	0 %	75 %	25 %	0 %	406594088
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3061	NC_018627	GATT	2	8	162489	162496	25 %	50 %	25 %	0 %	406594088
3062	NC_018627	TTCT	2	8	162497	162504	0 %	75 %	0 %	25 %	406594088
3063	NC_018627	AG	3	6	162505	162510	50 %	0 %	50 %	0 %	406594088
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3065	NC_018627	AG	3	6	162551	162556	50 %	0 %	50 %	0 %	406594088
3066	NC_018627	AT	3	6	162585	162590	50 %	50 %	0 %	0 %	406594088
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3069	NC_018627	T	6	6	162661	162666	0 %	100 %	0 %	0 %	406594088
3070	NC_018627	T	7	7	162711	162717	0 %	100 %	0 %	0 %	406594088
3071	NC_018627	TGT	2	6	162752	162757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594088
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3075	NC_018627	GGTG	2	8	163332	163339	0 %	25 %	75 %	0 %	406594066
3076	NC_018627	CT	3	6	163361	163366	0 %	50 %	0 %	50 %	406594066
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3081	NC_018627	AGGG	2	8	163527	163534	25 %	0 %	75 %	0 %	406594066
3082	NC_018627	T	6	6	163584	163589	0 %	100 %	0 %	0 %	406594066
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3091	NC_018627	A	6	6	163918	163923	100 %	0 %	0 %	0 %	406594066
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3108	NC_018627	ATC	2	6	164754	164759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593973
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3110	NC_018627	AG	3	6	164780	164785	50 %	0 %	50 %	0 %	406593973
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3122	NC_018627	TGA	2	6	165300	165305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593973
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3240	NC_018627	TAAAGA	2	12	173134	173145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406594036
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3242	NC_018627	GAGAG	2	10	173243	173252	40 %	0 %	60 %	0 %	406594712
3243	NC_018627	TCG	2	6	173314	173319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594712
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3245	NC_018627	T	6	6	173361	173366	0 %	100 %	0 %	0 %	406594712
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3247	NC_018627	GCT	2	6	173428	173433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594712
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3369	NC_018627	TGA	2	6	180240	180245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594235
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3371	NC_018627	TGA	2	6	180359	180364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594235
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3377	NC_018627	TCT	2	6	180544	180549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594235
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3387	NC_018627	GTA	2	6	181133	181138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594513
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3482	NC_018627	GTA	2	6	185418	185423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594617
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