MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 22043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_018627	TGC	2	6	1142007	1142012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594283
21502	NC_018627	TCT	2	6	1142038	1142043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594283
21503	NC_018627	AT	3	6	1142163	1142168	50 %	50 %	0 %	0 %	406594283
21504	NC_018627	AAT	2	6	1142250	1142255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594283
21505	NC_018627	A	6	6	1142272	1142277	100 %	0 %	0 %	0 %	406594283
21506	NC_018627	TTC	2	6	1142289	1142294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594283
21507	NC_018627	TTGT	2	8	1142313	1142320	0 %	75 %	25 %	0 %	406594283
21508	NC_018627	AGG	2	6	1142329	1142334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594283
21509	NC_018627	GGA	2	6	1142353	1142358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594283
21510	NC_018627	A	6	6	1143035	1143040	100 %	0 %	0 %	0 %	406594463
21511	NC_018627	TGT	2	6	1143130	1143135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594463
21512	NC_018627	TATCGA	2	12	1143160	1143171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406594463
21513	NC_018627	TTC	2	6	1143198	1143203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594463
21514	NC_018627	AAG	2	6	1143213	1143218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21515	NC_018627	TC	4	8	1143265	1143272	0 %	50 %	0 %	50 %	406594463
21516	NC_018627	GAGAAG	2	12	1143285	1143296	50 %	0 %	50 %	0 %	406594463
21517	NC_018627	CAA	2	6	1143434	1143439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594463
21518	NC_018627	TCG	2	6	1143442	1143447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594463
21519	NC_018627	ATCGT	2	10	1143456	1143465	20 %	40 %	20 %	20 %	406594463
21520	NC_018627	ACA	2	6	1143502	1143507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594463
21521	NC_018627	TACC	2	8	1143591	1143598	25 %	25 %	0 %	50 %	406594463
21522	NC_018627	TCC	2	6	1143621	1143626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594463
21523	NC_018627	CTG	2	6	1143669	1143674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594463
21524	NC_018627	ATTA	2	8	1143730	1143737	50 %	50 %	0 %	0 %	406594463
21525	NC_018627	AGA	2	6	1143775	1143780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21526	NC_018627	GAAA	2	8	1143811	1143818	75 %	0 %	25 %	0 %	406594463
21527	NC_018627	ACG	2	6	1143820	1143825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594463
21528	NC_018627	CCA	2	6	1143836	1143841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406594463
21529	NC_018627	TTA	2	6	1143843	1143848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594463
21530	NC_018627	CAA	2	6	1143860	1143865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594463
21531	NC_018627	GTC	2	6	1143873	1143878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594463
21532	NC_018627	TCT	3	9	1143890	1143898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594463
21533	NC_018627	ATTA	2	8	1143964	1143971	50 %	50 %	0 %	0 %	406594463
21534	NC_018627	TA	3	6	1144031	1144036	50 %	50 %	0 %	0 %	406594463
21535	NC_018627	A	6	6	1144090	1144095	100 %	0 %	0 %	0 %	406594463
21536	NC_018627	GAT	2	6	1144175	1144180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594463
21537	NC_018627	TTG	2	6	1144215	1144220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594463
21538	NC_018627	ATT	2	6	1144306	1144311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594463
21539	NC_018627	GAA	2	6	1144340	1144345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21540	NC_018627	GAT	3	9	1144352	1144360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594463
21541	NC_018627	GAA	3	9	1144367	1144375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21542	NC_018627	CAG	2	6	1144431	1144436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594463
21543	NC_018627	CTT	2	6	1144476	1144481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594463
21544	NC_018627	GCC	2	6	1144512	1144517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406594463
21545	NC_018627	ATA	2	6	1144701	1144706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594463
21546	NC_018627	CTT	2	6	1144724	1144729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594463
21547	NC_018627	TTC	2	6	1144749	1144754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594463
21548	NC_018627	ACT	2	6	1144763	1144768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594463
21549	NC_018627	AAG	2	6	1144776	1144781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21550	NC_018627	A	6	6	1144855	1144860	100 %	0 %	0 %	0 %	406594463
21551	NC_018627	GAA	3	9	1144913	1144921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21552	NC_018627	CAA	2	6	1144930	1144935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594463
21553	NC_018627	CCCTG	2	10	1144970	1144979	0 %	20 %	20 %	60 %	406594463
21554	NC_018627	AAG	3	9	1145097	1145105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21555	NC_018627	ATTCT	2	10	1145173	1145182	20 %	60 %	0 %	20 %	406594463
21556	NC_018627	TTA	2	6	1145232	1145237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594463
21557	NC_018627	GAAAA	2	10	1145270	1145279	80 %	0 %	20 %	0 %	406594463
21558	NC_018627	GAA	2	6	1145287	1145292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594463
21559	NC_018627	A	6	6	1145291	1145296	100 %	0 %	0 %	0 %	406594463
21560	NC_018627	CAG	2	6	1145311	1145316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594463
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21562	NC_018627	A	8	8	1145339	1145346	100 %	0 %	0 %	0 %	406594463
21563	NC_018627	GAAG	2	8	1145354	1145361	50 %	0 %	50 %	0 %	406594463
21564	NC_018627	TTAC	2	8	1145390	1145397	25 %	50 %	0 %	25 %	406594463
21565	NC_018627	TGA	2	6	1145418	1145423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594463
21566	NC_018627	AAAG	2	8	1145458	1145465	75 %	0 %	25 %	0 %	406594463
21567	NC_018627	TGC	2	6	1145520	1145525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594463
21568	NC_018627	CGA	2	6	1145527	1145532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594463
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21570	NC_018627	ACT	2	6	1145587	1145592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594463
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21573	NC_018627	ATCA	2	8	1145653	1145660	50 %	25 %	0 %	25 %	406594241
21574	NC_018627	CTT	2	6	1145670	1145675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594241
21575	NC_018627	AGAA	2	8	1145764	1145771	75 %	0 %	25 %	0 %	406594241
21576	NC_018627	CAA	2	6	1145925	1145930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594241
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21582	NC_018627	TTC	2	6	1146087	1146092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594241
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21586	NC_018627	CTGT	2	8	1146290	1146297	0 %	50 %	25 %	25 %	406594241
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21593	NC_018627	A	7	7	1147134	1147140	100 %	0 %	0 %	0 %	406594920
21594	NC_018627	CAT	2	6	1147148	1147153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594920
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21604	NC_018627	CT	4	8	1147699	1147706	0 %	50 %	0 %	50 %	406594920
21605	NC_018627	TGCC	2	8	1147716	1147723	0 %	25 %	25 %	50 %	406594920
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21609	NC_018627	CGCTC	2	10	1147873	1147882	0 %	20 %	20 %	60 %	406594920
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21614	NC_018627	GCA	2	6	1148199	1148204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594920
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