MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 22043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018627	GAA	3	9	49943	49951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594792
1002	NC_018627	GC	3	6	49969	49974	0 %	0 %	50 %	50 %	406594792
1003	NC_018627	A	6	6	50015	50020	100 %	0 %	0 %	0 %	406594792
1004	NC_018627	AGA	2	6	50026	50031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594792
1005	NC_018627	AAG	3	9	50052	50060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594792
1006	NC_018627	AAC	2	6	50121	50126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594792
1007	NC_018627	CAA	2	6	50160	50165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594792
1008	NC_018627	AAG	3	9	50166	50174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594792
1009	NC_018627	TTA	2	6	50267	50272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594792
1010	NC_018627	TC	3	6	50374	50379	0 %	50 %	0 %	50 %	406594792
1011	NC_018627	TGT	2	6	50521	50526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594792
1012	NC_018627	TA	3	6	50547	50552	50 %	50 %	0 %	0 %	406594792
1013	NC_018627	ATT	2	6	50579	50584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594792
1014	NC_018627	ATG	2	6	50601	50606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594792
1015	NC_018627	AGC	2	6	50689	50694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594792
1016	NC_018627	TCC	2	6	50858	50863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594792
1017	NC_018627	AACA	2	8	50872	50879	75 %	0 %	0 %	25 %	406594792
1018	NC_018627	ACT	2	6	50890	50895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594792
1019	NC_018627	GAT	2	6	50933	50938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594792
1020	NC_018627	GCA	2	6	50951	50956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594792
1021	NC_018627	ATC	2	6	50965	50970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594792
1022	NC_018627	TCA	2	6	51102	51107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594792
1023	NC_018627	AAT	2	6	51140	51145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594792
1024	NC_018627	AGT	2	6	51184	51189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594792
1025	NC_018627	TGA	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594792
1026	NC_018627	CCT	2	6	51383	51388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594792
1027	NC_018627	ATG	2	6	51452	51457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594792
1028	NC_018627	TTTGG	2	10	51473	51482	0 %	60 %	40 %	0 %	406594792
1029	NC_018627	CTC	2	6	51539	51544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594792
1030	NC_018627	CAA	2	6	51611	51616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594792
1031	NC_018627	CAT	2	6	51618	51623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594792
1032	NC_018627	TTG	2	6	51627	51632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594792
1033	NC_018627	AAC	2	6	51652	51657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594792
1034	NC_018627	ATT	2	6	51665	51670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594792
1035	NC_018627	TTG	3	9	51726	51734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594792
1036	NC_018627	GTT	2	6	51758	51763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594792
1037	NC_018627	CTT	2	6	51874	51879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594792
1038	NC_018627	CAG	2	6	51970	51975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594792
1039	NC_018627	ATG	2	6	52007	52012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594792
1040	NC_018627	TTA	2	6	52029	52034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594792
1041	NC_018627	CAA	2	6	52063	52068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406594792
1042	NC_018627	C	6	6	52147	52152	0 %	0 %	0 %	100 %	406594792
1043	NC_018627	GAAG	2	8	52719	52726	50 %	0 %	50 %	0 %	406594722
1044	NC_018627	CCT	2	6	52729	52734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594722
1045	NC_018627	T	6	6	52741	52746	0 %	100 %	0 %	0 %	406594722
1046	NC_018627	TGC	2	6	52807	52812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594722
1047	NC_018627	CCT	2	6	52813	52818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406594722
1048	NC_018627	TGC	2	6	52819	52824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594722
1049	NC_018627	AGG	2	6	52838	52843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594722
1050	NC_018627	CTT	2	6	52915	52920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594229
1051	NC_018627	TTA	2	6	52932	52937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406594229
1052	NC_018627	GTT	2	6	52945	52950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594229
1053	NC_018627	ACG	2	6	52970	52975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594229
1054	NC_018627	TGT	2	6	53008	53013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594229
1055	NC_018627	ATCC	2	8	53025	53032	25 %	25 %	0 %	50 %	406594229
1056	NC_018627	GT	3	6	53099	53104	0 %	50 %	50 %	0 %	406594229
1057	NC_018627	T	6	6	53133	53138	0 %	100 %	0 %	0 %	406594229
1058	NC_018627	CTT	2	6	53165	53170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594229
1059	NC_018627	T	6	6	53169	53174	0 %	100 %	0 %	0 %	406594229
1060	NC_018627	TTC	2	6	53234	53239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594229
1061	NC_018627	AT	3	6	53286	53291	50 %	50 %	0 %	0 %	406594229
1062	NC_018627	AGCA	2	8	53317	53324	50 %	0 %	25 %	25 %	406594229
1063	NC_018627	AAT	2	6	53342	53347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594229
1064	NC_018627	TTCA	2	8	53477	53484	25 %	50 %	0 %	25 %	406594229
1065	NC_018627	A	6	6	53655	53660	100 %	0 %	0 %	0 %	406594229
1066	NC_018627	TCA	2	6	53721	53726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594229
1067	NC_018627	T	6	6	53777	53782	0 %	100 %	0 %	0 %	406594229
1068	NC_018627	CGT	2	6	53840	53845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594229
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1070	NC_018627	AAG	2	6	53897	53902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406594229
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1072	NC_018627	T	6	6	53935	53940	0 %	100 %	0 %	0 %	406594222
1073	NC_018627	CAG	2	6	53966	53971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594222
1074	NC_018627	AGG	2	6	54034	54039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594222
1075	NC_018627	CGC	2	6	54051	54056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406594222
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1079	NC_018627	CAG	2	6	54254	54259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594222
1080	NC_018627	TGT	2	6	54281	54286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594222
1081	NC_018627	GTA	2	6	54294	54299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594222
1082	NC_018627	CATA	2	8	54325	54332	50 %	25 %	0 %	25 %	406594222
1083	NC_018627	CTTATC	2	12	54345	54356	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406594222
1084	NC_018627	TTG	2	6	54374	54379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594222
1085	NC_018627	CTT	2	6	54850	54855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594381
1086	NC_018627	TCG	2	6	54870	54875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594381
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1089	NC_018627	T	7	7	54956	54962	0 %	100 %	0 %	0 %	406594381
1090	NC_018627	CTT	2	6	55009	55014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594381
1091	NC_018627	ACG	2	6	55022	55027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594381
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1093	NC_018627	CTG	2	6	55057	55062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594381
1094	NC_018627	AAATTT	2	12	55113	55124	50 %	50 %	0 %	0 %	406594381
1095	NC_018627	GCA	2	6	55125	55130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594381
1096	NC_018627	ATA	2	6	55131	55136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594381
1097	NC_018627	CTA	2	6	55267	55272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594381
1098	NC_018627	CTT	2	6	55309	55314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594381
1099	NC_018627	AGC	2	6	55331	55336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594381
1100	NC_018627	TTTTC	2	10	55342	55351	0 %	80 %	0 %	20 %	406594381
1101	NC_018627	TCA	2	6	55408	55413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594642
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1103	NC_018627	GCT	2	6	55657	55662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594642
1104	NC_018627	GTT	2	6	55672	55677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594642
1105	NC_018627	CTT	2	6	55733	55738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406594642
1106	NC_018627	GAG	2	6	55748	55753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406594642
1107	NC_018627	TAA	2	6	55794	55799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406594642
1108	NC_018627	TCA	2	6	55810	55815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406594642
1109	NC_018627	TAGC	2	8	55856	55863	25 %	25 %	25 %	25 %	406594642
1110	NC_018627	CAG	2	6	55877	55882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406594642
1111	NC_018627	TTG	2	6	55908	55913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594642
1112	NC_018627	TGA	2	6	55925	55930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594642
1113	NC_018627	CTGT	2	8	56035	56042	0 %	50 %	25 %	25 %	406594642
1114	NC_018627	TAG	2	6	56232	56237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594386
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1116	NC_018627	TGA	2	6	56273	56278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594386
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1119	NC_018627	GCT	2	6	56389	56394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406594386
1120	NC_018627	CTTT	2	8	56425	56432	0 %	75 %	0 %	25 %	406594386
1121	NC_018627	AGAA	2	8	56445	56452	75 %	0 %	25 %	0 %	406594386
1122	NC_018627	GTT	2	6	56509	56514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406594386
1123	NC_018627	GAAG	2	8	56614	56621	50 %	0 %	50 %	0 %	406594386
1124	NC_018627	GTA	2	6	56624	56629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406594386
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