MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018626	CAG	2	6	208553	208558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593130
4002	NC_018626	AG	3	6	208633	208638	50 %	0 %	50 %	0 %	406593131
4003	NC_018626	TCTCT	2	10	208641	208650	0 %	60 %	0 %	40 %	406593131
4004	NC_018626	TTG	2	6	208667	208672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593131
4005	NC_018626	CTT	2	6	208687	208692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593131
4006	NC_018626	ACA	2	6	208728	208733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593131
4007	NC_018626	TGT	2	6	208796	208801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593131
4008	NC_018626	AAC	2	6	208837	208842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593131
4009	NC_018626	TCT	2	6	208860	208865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593131
4010	NC_018626	TAAA	2	8	208906	208913	75 %	25 %	0 %	0 %	406593131
4011	NC_018626	T	6	6	208934	208939	0 %	100 %	0 %	0 %	406593131
4012	NC_018626	AGA	2	6	208949	208954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593131
4013	NC_018626	TTGT	2	8	209010	209017	0 %	75 %	25 %	0 %	406593131
4014	NC_018626	AG	3	6	209018	209023	50 %	0 %	50 %	0 %	406593131
4015	NC_018626	CTC	2	6	209065	209070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593131
4016	NC_018626	ATT	2	6	209113	209118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593131
4017	NC_018626	TTCT	2	8	209150	209157	0 %	75 %	0 %	25 %	406593131
4018	NC_018626	CAAC	2	8	209205	209212	50 %	0 %	0 %	50 %	406593131
4019	NC_018626	GAT	2	6	209232	209237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593131
4020	NC_018626	CAGGAA	2	12	209269	209280	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406593131
4021	NC_018626	ACA	2	6	209303	209308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593131
4022	NC_018626	T	6	6	209346	209351	0 %	100 %	0 %	0 %	406593131
4023	NC_018626	A	6	6	209397	209402	100 %	0 %	0 %	0 %	406593131
4024	NC_018626	ACA	2	6	209486	209491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593131
4025	NC_018626	CTT	2	6	209531	209536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593131
4026	NC_018626	A	6	6	209570	209575	100 %	0 %	0 %	0 %	406593131
4027	NC_018626	AGA	2	6	209582	209587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593131
4028	NC_018626	CGC	2	6	209701	209706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406593132
4029	NC_018626	AG	3	6	209801	209806	50 %	0 %	50 %	0 %	406593132
4030	NC_018626	GGA	2	6	209812	209817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593132
4031	NC_018626	CTGT	2	8	209910	209917	0 %	50 %	25 %	25 %	406593132
4032	NC_018626	AGA	2	6	209978	209983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593132
4033	NC_018626	AAT	2	6	210008	210013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593132
4034	NC_018626	TCCG	2	8	210017	210024	0 %	25 %	25 %	50 %	406593132
4035	NC_018626	AG	3	6	210095	210100	50 %	0 %	50 %	0 %	406593132
4036	NC_018626	GAA	2	6	210502	210507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593133
4037	NC_018626	ATG	2	6	210547	210552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593133
4038	NC_018626	GAT	2	6	210562	210567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593133
4039	NC_018626	GCA	2	6	210637	210642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593133
4040	NC_018626	TCG	2	6	210650	210655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593133
4041	NC_018626	GATT	2	8	210668	210675	25 %	50 %	25 %	0 %	406593133
4042	NC_018626	GT	3	6	210686	210691	0 %	50 %	50 %	0 %	406593133
4043	NC_018626	AG	3	6	210706	210711	50 %	0 %	50 %	0 %	406593133
4044	NC_018626	TTG	2	6	210819	210824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593133
4045	NC_018626	CTC	2	6	210854	210859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593133
4046	NC_018626	CTAA	2	8	210878	210885	50 %	25 %	0 %	25 %	406593133
4047	NC_018626	AAT	2	6	211228	211233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593134
4048	NC_018626	AAGC	2	8	211243	211250	50 %	0 %	25 %	25 %	406593134
4049	NC_018626	ATT	2	6	211288	211293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593134
4050	NC_018626	AAG	2	6	211314	211319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593134
4051	NC_018626	GTT	2	6	211336	211341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593134
4052	NC_018626	GTA	2	6	211394	211399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593134
4053	NC_018626	GA	3	6	211428	211433	50 %	0 %	50 %	0 %	406593134
4054	NC_018626	GTAG	2	8	211715	211722	25 %	25 %	50 %	0 %	406593135
4055	NC_018626	TGA	2	6	211729	211734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593135
4056	NC_018626	TTG	2	6	211761	211766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593135
4057	NC_018626	AT	3	6	211789	211794	50 %	50 %	0 %	0 %	406593135
4058	NC_018626	TTC	2	6	211800	211805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593135
4059	NC_018626	GGT	2	6	212041	212046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593136
4060	NC_018626	GAA	2	6	212166	212171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593136
4061	NC_018626	GTT	2	6	212272	212277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593136
4062	NC_018626	AGG	2	6	212292	212297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593136
4063	NC_018626	ATT	2	6	212448	212453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593136
4064	NC_018626	ATT	2	6	212652	212657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593136
4065	NC_018626	GTT	2	6	212658	212663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593136
4066	NC_018626	TCC	2	6	212692	212697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593136
4067	NC_018626	AGA	3	9	212700	212708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593136
4068	NC_018626	TGA	2	6	212790	212795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593136
4069	NC_018626	T	7	7	213738	213744	0 %	100 %	0 %	0 %	406593137
4070	NC_018626	TTG	2	6	213775	213780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593137
4071	NC_018626	GTT	2	6	213795	213800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593137
4072	NC_018626	ATG	2	6	213845	213850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593137
4073	NC_018626	GTT	2	6	213916	213921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593137
4074	NC_018626	AGAT	2	8	214022	214029	50 %	25 %	25 %	0 %	406593137
4075	NC_018626	AGAA	2	8	214145	214152	75 %	0 %	25 %	0 %	406593137
4076	NC_018626	GAAAA	2	10	214174	214183	80 %	0 %	20 %	0 %	406593137
4077	NC_018626	TGC	2	6	214197	214202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593137
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4079	NC_018626	GTA	2	6	214266	214271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593137
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4082	NC_018626	CAA	2	6	214339	214344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593137
4083	NC_018626	GTT	2	6	214457	214462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593138
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4085	NC_018626	TTC	2	6	214492	214497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593138
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4089	NC_018626	ACG	2	6	214667	214672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593138
4090	NC_018626	GCT	2	6	214737	214742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593138
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4093	NC_018626	T	6	6	214970	214975	0 %	100 %	0 %	0 %	406593138
4094	NC_018626	T	7	7	215003	215009	0 %	100 %	0 %	0 %	406593138
4095	NC_018626	T	6	6	215064	215069	0 %	100 %	0 %	0 %	406593138
4096	NC_018626	TTC	2	6	215203	215208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593138
4097	NC_018626	AAGAA	2	10	215238	215247	80 %	0 %	20 %	0 %	406593138
4098	NC_018626	AAG	2	6	215254	215259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593138
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4102	NC_018626	GT	3	6	216092	216097	0 %	50 %	50 %	0 %	406593139
4103	NC_018626	GACA	2	8	216129	216136	50 %	0 %	25 %	25 %	406593139
4104	NC_018626	AG	3	6	216158	216163	50 %	0 %	50 %	0 %	406593139
4105	NC_018626	CTC	2	6	216215	216220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593139
4106	NC_018626	ATT	2	6	216243	216248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593139
4107	NC_018626	TTG	2	6	216351	216356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593139
4108	NC_018626	GGT	2	6	216362	216367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593139
4109	NC_018626	AGC	2	6	216418	216423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593139
4110	NC_018626	ATT	2	6	216430	216435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593139
4111	NC_018626	AAG	2	6	216518	216523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593140
4112	NC_018626	GAAAG	2	10	216539	216548	60 %	0 %	40 %	0 %	406593140
4113	NC_018626	TAT	2	6	216627	216632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593140
4114	NC_018626	AGA	2	6	216654	216659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593140
4115	NC_018626	ATTT	2	8	216710	216717	25 %	75 %	0 %	0 %	406593140
4116	NC_018626	TCA	2	6	216822	216827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593140
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4118	NC_018626	ACTC	2	8	216919	216926	25 %	25 %	0 %	50 %	406593140
4119	NC_018626	TTA	2	6	217013	217018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593140
4120	NC_018626	TGT	2	6	217071	217076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593140
4121	NC_018626	TG	3	6	217175	217180	0 %	50 %	50 %	0 %	406593140
4122	NC_018626	TAG	2	6	217260	217265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593140
4123	NC_018626	TAC	2	6	217276	217281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593140
4124	NC_018626	AGAA	2	8	217816	217823	75 %	0 %	25 %	0 %	406593141
4125	NC_018626	TTG	2	6	217828	217833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593141
4126	NC_018626	CAAC	2	8	217883	217890	50 %	0 %	0 %	50 %	406593141
4127	NC_018626	TTC	2	6	218222	218227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593141
4128	NC_018626	CAT	2	6	218287	218292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593141
4129	NC_018626	TGT	2	6	218314	218319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593141
4130	NC_018626	GA	3	6	218345	218350	50 %	0 %	50 %	0 %	406593141
4131	NC_018626	AGT	2	6	218383	218388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593141
4132	NC_018626	GCG	2	6	218411	218416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406593141
4133	NC_018626	CTC	2	6	218420	218425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593141
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4137	NC_018626	TGGAT	2	10	218675	218684	20 %	40 %	40 %	0 %	406593141
4138	NC_018626	CTG	4	12	218737	218748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593141
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4147	NC_018626	CAT	2	6	219142	219147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593141
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4149	NC_018626	TGC	2	6	219167	219172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593141
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4151	NC_018626	T	6	6	219227	219232	0 %	100 %	0 %	0 %	406593141
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4153	NC_018626	TTCC	2	8	219316	219323	0 %	50 %	0 %	50 %	406593141
4154	NC_018626	ATT	2	6	219344	219349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593141
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4247	NC_018626	ACC	2	6	223785	223790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593142
4248	NC_018626	AGC	2	6	223816	223821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593142
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4250	NC_018626	AGA	2	6	223893	223898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593142
4251	NC_018626	CCTT	2	8	223912	223919	0 %	50 %	0 %	50 %	406593142
4252	NC_018626	TCT	2	6	223987	223992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593142
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4261	NC_018626	TC	3	6	224468	224473	0 %	50 %	0 %	50 %	406593142
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4265	NC_018626	CAC	2	6	224756	224761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593142
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4272	NC_018626	TTTA	2	8	224973	224980	25 %	75 %	0 %	0 %	406593142
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4360	NC_018626	ATTT	2	8	230295	230302	25 %	75 %	0 %	0 %	406593149
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4363	NC_018626	ATAA	2	8	230484	230491	75 %	25 %	0 %	0 %	406593149
4364	NC_018626	AT	3	6	230496	230501	50 %	50 %	0 %	0 %	406593150
4365	NC_018626	AGGAG	2	10	230646	230655	40 %	0 %	60 %	0 %	406593150
4366	NC_018626	TTG	2	6	230711	230716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593150
4367	NC_018626	AATTGA	2	12	230786	230797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406593150
4368	NC_018626	TTC	2	6	230811	230816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593150
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4370	NC_018626	TGC	2	6	230865	230870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593150
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4372	NC_018626	GTT	2	6	230977	230982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593150
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4494	NC_018626	T	6	6	237468	237473	0 %	100 %	0 %	0 %	406593156
4495	NC_018626	AAC	3	9	237543	237551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593156
4496	NC_018626	T	6	6	237558	237563	0 %	100 %	0 %	0 %	406593156
4497	NC_018626	GTT	2	6	237564	237569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593156
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4499	NC_018626	TGC	2	6	237631	237636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593156
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