MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018626	TCCCTG	2	12	183826	183837	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	406593106
3502	NC_018626	TAA	2	6	183853	183858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593106
3503	NC_018626	AGA	2	6	183923	183928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593107
3504	NC_018626	CCT	2	6	183950	183955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593107
3505	NC_018626	A	6	6	184024	184029	100 %	0 %	0 %	0 %	406593107
3506	NC_018626	AAG	2	6	184112	184117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593107
3507	NC_018626	CAA	2	6	184164	184169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593107
3508	NC_018626	GAA	2	6	184225	184230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593107
3509	NC_018626	TGT	2	6	184255	184260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593107
3510	NC_018626	CCA	2	6	184279	184284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593107
3511	NC_018626	ATGA	2	8	184309	184316	50 %	25 %	25 %	0 %	406593107
3512	NC_018626	T	6	6	184412	184417	0 %	100 %	0 %	0 %	406593107
3513	NC_018626	TAA	2	6	184434	184439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593107
3514	NC_018626	CAAA	2	8	184445	184452	75 %	0 %	0 %	25 %	406593107
3515	NC_018626	ATG	2	6	184495	184500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593107
3516	NC_018626	TA	3	6	184554	184559	50 %	50 %	0 %	0 %	406593107
3517	NC_018626	CAC	2	6	184620	184625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593107
3518	NC_018626	AAG	2	6	184681	184686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593107
3519	NC_018626	ACA	2	6	184718	184723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593107
3520	NC_018626	CCT	2	6	184789	184794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593108
3521	NC_018626	CGT	2	6	184795	184800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593108
3522	NC_018626	AGA	2	6	184831	184836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593108
3523	NC_018626	CCA	2	6	184930	184935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593108
3524	NC_018626	TAA	2	6	184944	184949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593108
3525	NC_018626	T	7	7	185021	185027	0 %	100 %	0 %	0 %	406593108
3526	NC_018626	ATG	2	6	185040	185045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593108
3527	NC_018626	T	6	6	185049	185054	0 %	100 %	0 %	0 %	406593108
3528	NC_018626	CCA	2	6	185080	185085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593108
3529	NC_018626	TCC	2	6	185131	185136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593108
3530	NC_018626	A	6	6	185261	185266	100 %	0 %	0 %	0 %	406593108
3531	NC_018626	CTT	2	6	185276	185281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593108
3532	NC_018626	AAT	2	6	185317	185322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593108
3533	NC_018626	AAT	2	6	185358	185363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593108
3534	NC_018626	GTA	2	6	185385	185390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593108
3535	NC_018626	ATG	2	6	185461	185466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593108
3536	NC_018626	AGC	2	6	185579	185584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593109
3537	NC_018626	CTT	2	6	185592	185597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593109
3538	NC_018626	TTC	2	6	185631	185636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593109
3539	NC_018626	AAT	2	6	185656	185661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593109
3540	NC_018626	TAG	2	6	185689	185694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593109
3541	NC_018626	AG	4	8	185826	185833	50 %	0 %	50 %	0 %	406593110
3542	NC_018626	T	6	6	185842	185847	0 %	100 %	0 %	0 %	406593110
3543	NC_018626	TTG	2	6	185932	185937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593110
3544	NC_018626	GTT	2	6	186241	186246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593111
3545	NC_018626	CAG	2	6	186272	186277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593111
3546	NC_018626	GCA	2	6	186287	186292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593111
3547	NC_018626	ATT	2	6	186336	186341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593111
3548	NC_018626	TTC	2	6	186441	186446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593111
3549	NC_018626	AG	4	8	186453	186460	50 %	0 %	50 %	0 %	406593111
3550	NC_018626	CTTT	2	8	186466	186473	0 %	75 %	0 %	25 %	406593111
3551	NC_018626	TCA	2	6	186513	186518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593111
3552	NC_018626	A	6	6	186578	186583	100 %	0 %	0 %	0 %	406593111
3553	NC_018626	A	6	6	186746	186751	100 %	0 %	0 %	0 %	406593111
3554	NC_018626	AAG	2	6	186797	186802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593111
3555	NC_018626	CTT	2	6	186854	186859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593111
3556	NC_018626	TA	3	6	186869	186874	50 %	50 %	0 %	0 %	406593111
3557	NC_018626	AT	3	6	186882	186887	50 %	50 %	0 %	0 %	406593111
3558	NC_018626	AGC	2	6	186900	186905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593111
3559	NC_018626	GTG	2	6	186931	186936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593111
3560	NC_018626	AGGGA	2	10	186940	186949	40 %	0 %	60 %	0 %	406593111
3561	NC_018626	TTC	2	6	187037	187042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593111
3562	NC_018626	AAGT	2	8	187083	187090	50 %	25 %	25 %	0 %	406593111
3563	NC_018626	TTG	2	6	187115	187120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593111
3564	NC_018626	TTC	2	6	187215	187220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593111
3565	NC_018626	TAT	3	9	187516	187524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593112
3566	NC_018626	TAAA	2	8	187587	187594	75 %	25 %	0 %	0 %	406593112
3567	NC_018626	A	6	6	187592	187597	100 %	0 %	0 %	0 %	406593112
3568	NC_018626	CAA	2	6	187616	187621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593112
3569	NC_018626	CGTA	2	8	187624	187631	25 %	25 %	25 %	25 %	406593112
3570	NC_018626	ATT	2	6	187667	187672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593112
3571	NC_018626	TCT	2	6	187682	187687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593112
3572	NC_018626	CT	3	6	187691	187696	0 %	50 %	0 %	50 %	406593112
3573	NC_018626	GTG	2	6	187745	187750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593112
3574	NC_018626	GTT	2	6	187877	187882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593112
3575	NC_018626	AGGAA	2	10	187963	187972	60 %	0 %	40 %	0 %	406593112
3576	NC_018626	GCT	2	6	187982	187987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593112
3577	NC_018626	TTC	2	6	188109	188114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593112
3578	NC_018626	CTT	2	6	188146	188151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593112
3579	NC_018626	AAC	2	6	188223	188228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593112
3580	NC_018626	A	6	6	188285	188290	100 %	0 %	0 %	0 %	406593112
3581	NC_018626	GCA	2	6	188325	188330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593112
3582	NC_018626	TTCTT	2	10	188342	188351	0 %	80 %	0 %	20 %	406593112
3583	NC_018626	AAAG	2	8	188369	188376	75 %	0 %	25 %	0 %	406593112
3584	NC_018626	TGCT	2	8	188406	188413	0 %	50 %	25 %	25 %	406593112
3585	NC_018626	TGA	2	6	188419	188424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593112
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3587	NC_018626	TATC	2	8	188587	188594	25 %	50 %	0 %	25 %	406593112
3588	NC_018626	GTT	2	6	188715	188720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593112
3589	NC_018626	GTT	2	6	188742	188747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593112
3590	NC_018626	ATCT	2	8	188764	188771	25 %	50 %	0 %	25 %	406593112
3591	NC_018626	AAG	2	6	189069	189074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593112
3592	NC_018626	GTT	2	6	189111	189116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593112
3593	NC_018626	TGC	2	6	189142	189147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593112
3594	NC_018626	TTG	2	6	189168	189173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593112
3595	NC_018626	GATT	2	8	189232	189239	25 %	50 %	25 %	0 %	406593112
3596	NC_018626	ATC	2	6	189276	189281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593112
3597	NC_018626	AAG	2	6	189303	189308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593112
3598	NC_018626	TGA	2	6	189325	189330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593112
3599	NC_018626	CG	3	6	189337	189342	0 %	0 %	50 %	50 %	406593112
3600	NC_018626	TTC	2	6	189427	189432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593112
3601	NC_018626	GTA	2	6	189470	189475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593112
3602	NC_018626	CTCTG	2	10	189496	189505	0 %	40 %	20 %	40 %	406593112
3603	NC_018626	AAG	2	6	189642	189647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593112
3604	NC_018626	TTC	2	6	189703	189708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593112
3605	NC_018626	TAC	2	6	189721	189726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593112
3606	NC_018626	A	6	6	189820	189825	100 %	0 %	0 %	0 %	406593112
3607	NC_018626	GA	3	6	189919	189924	50 %	0 %	50 %	0 %	406593112
3608	NC_018626	CATG	2	8	189932	189939	25 %	25 %	25 %	25 %	406593112
3609	NC_018626	TACT	2	8	189946	189953	25 %	50 %	0 %	25 %	406593112
3610	NC_018626	TTC	2	6	189991	189996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593112
3611	NC_018626	TGT	2	6	190018	190023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593112
3612	NC_018626	TAGT	2	8	190038	190045	25 %	50 %	25 %	0 %	406593112
3613	NC_018626	AGCG	2	8	190078	190085	25 %	0 %	50 %	25 %	406593112
3614	NC_018626	GTGAA	2	10	190107	190116	40 %	20 %	40 %	0 %	406593112
3615	NC_018626	GAA	2	6	190175	190180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593112
3616	NC_018626	TC	3	6	190185	190190	0 %	50 %	0 %	50 %	406593112
3617	NC_018626	CAG	2	6	190205	190210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593112
3618	NC_018626	GCCTTG	2	12	190236	190247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593112
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3620	NC_018626	CGG	2	6	190285	190290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406593112
3621	NC_018626	TCT	2	6	190321	190326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593112
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3623	NC_018626	GAG	2	6	190448	190453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593112
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3993	NC_018626	AT	3	6	208266	208271	50 %	50 %	0 %	0 %	406593130
3994	NC_018626	AGC	2	6	208274	208279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593130
3995	NC_018626	GATC	2	8	208330	208337	25 %	25 %	25 %	25 %	406593130
3996	NC_018626	TTG	2	6	208349	208354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593130
3997	NC_018626	TGC	2	6	208427	208432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593130
3998	NC_018626	A	6	6	208450	208455	100 %	0 %	0 %	0 %	406593130
3999	NC_018626	AG	3	6	208459	208464	50 %	0 %	50 %	0 %	406593130
4000	NC_018626	GATA	2	8	208494	208501	50 %	25 %	25 %	0 %	406593130

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