MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_018626	CTT	2	6	1157545	1157550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593961
22003	NC_018626	A	7	7	1157555	1157561	100 %	0 %	0 %	0 %	406593961
22004	NC_018626	TTAT	2	8	1157606	1157613	25 %	75 %	0 %	0 %	406593961
22005	NC_018626	GAA	2	6	1157649	1157654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593961
22006	NC_018626	TTTTC	2	10	1157783	1157792	0 %	80 %	0 %	20 %	406593962
22007	NC_018626	TAT	2	6	1157813	1157818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593962
22008	NC_018626	ATAG	2	8	1157840	1157847	50 %	25 %	25 %	0 %	406593962
22009	NC_018626	T	6	6	1157902	1157907	0 %	100 %	0 %	0 %	406593962
22010	NC_018626	A	6	6	1157908	1157913	100 %	0 %	0 %	0 %	406593962
22011	NC_018626	CAT	2	6	1157980	1157985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593962
22012	NC_018626	TA	3	6	1158017	1158022	50 %	50 %	0 %	0 %	406593962
22013	NC_018626	CACAGG	2	12	1158037	1158048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593962
22014	NC_018626	A	7	7	1158076	1158082	100 %	0 %	0 %	0 %	406593962
22015	NC_018626	TTA	2	6	1158300	1158305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593962
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22021	NC_018626	CGT	2	6	1158656	1158661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593963
22022	NC_018626	TTA	2	6	1158704	1158709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593963
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22024	NC_018626	A	7	7	1158760	1158766	100 %	0 %	0 %	0 %	406593963
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22032	NC_018626	A	7	7	1158929	1158935	100 %	0 %	0 %	0 %	406593963
22033	NC_018626	GGTT	2	8	1158968	1158975	0 %	50 %	50 %	0 %	406593963
22034	NC_018626	GGA	3	9	1158980	1158988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593963
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22041	NC_018626	T	6	6	1159394	1159399	0 %	100 %	0 %	0 %	406593964
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22057	NC_018626	GTAC	2	8	1160737	1160744	25 %	25 %	25 %	25 %	406593965
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22068	NC_018626	GAA	2	6	1161259	1161264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593965
22069	NC_018626	TCA	2	6	1161268	1161273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593965

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.