MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_018626	CCT	2	6	1133962	1133967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593939
21502	NC_018626	AG	3	6	1134013	1134018	50 %	0 %	50 %	0 %	406593939
21503	NC_018626	A	7	7	1134020	1134026	100 %	0 %	0 %	0 %	406593939
21504	NC_018626	CA	3	6	1134033	1134038	50 %	0 %	0 %	50 %	406593939
21505	NC_018626	TTCT	2	8	1134044	1134051	0 %	75 %	0 %	25 %	406593939
21506	NC_018626	AACA	2	8	1134086	1134093	75 %	0 %	0 %	25 %	406593939
21507	NC_018626	TTG	2	6	1134104	1134109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593939
21508	NC_018626	TCCT	2	8	1134116	1134123	0 %	50 %	0 %	50 %	406593939
21509	NC_018626	A	6	6	1134177	1134182	100 %	0 %	0 %	0 %	406593939
21510	NC_018626	GAA	2	6	1134190	1134195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593939
21511	NC_018626	TCA	2	6	1134342	1134347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593939
21512	NC_018626	ACA	2	6	1134364	1134369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593939
21513	NC_018626	ACA	2	6	1134405	1134410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593939
21514	NC_018626	CGT	2	6	1134427	1134432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593939
21515	NC_018626	AAAAG	2	10	1134478	1134487	80 %	0 %	20 %	0 %	406593939
21516	NC_018626	TGC	2	6	1134551	1134556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593940
21517	NC_018626	AGG	2	6	1134667	1134672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593940
21518	NC_018626	TTC	2	6	1134695	1134700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593940
21519	NC_018626	ACG	2	6	1134706	1134711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593940
21520	NC_018626	CAAT	2	8	1134726	1134733	50 %	25 %	0 %	25 %	406593940
21521	NC_018626	AGAA	2	8	1134760	1134767	75 %	0 %	25 %	0 %	406593940
21522	NC_018626	CTAACC	2	12	1134801	1134812	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	406593940
21523	NC_018626	AGAA	2	8	1134814	1134821	75 %	0 %	25 %	0 %	406593940
21524	NC_018626	CT	3	6	1134842	1134847	0 %	50 %	0 %	50 %	406593940
21525	NC_018626	TGC	2	6	1134949	1134954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593940
21526	NC_018626	TCT	2	6	1134980	1134985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593940
21527	NC_018626	GTT	2	6	1135051	1135056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593940
21528	NC_018626	AT	3	6	1135105	1135110	50 %	50 %	0 %	0 %	406593940
21529	NC_018626	AAT	2	6	1135192	1135197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593940
21530	NC_018626	A	6	6	1135214	1135219	100 %	0 %	0 %	0 %	406593940
21531	NC_018626	TTC	2	6	1135231	1135236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593940
21532	NC_018626	TTGT	2	8	1135255	1135262	0 %	75 %	25 %	0 %	406593940
21533	NC_018626	AGG	2	6	1135271	1135276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593940
21534	NC_018626	GGA	2	6	1135295	1135300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593940
21535	NC_018626	A	6	6	1135977	1135982	100 %	0 %	0 %	0 %	406593941
21536	NC_018626	TGT	2	6	1136072	1136077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593941
21537	NC_018626	TATCGA	2	12	1136102	1136113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406593941
21538	NC_018626	TTC	2	6	1136140	1136145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593941
21539	NC_018626	AAG	2	6	1136155	1136160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593941
21540	NC_018626	TC	4	8	1136207	1136214	0 %	50 %	0 %	50 %	406593941
21541	NC_018626	GAGAAG	2	12	1136227	1136238	50 %	0 %	50 %	0 %	406593941
21542	NC_018626	CAA	2	6	1136376	1136381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593941
21543	NC_018626	TCG	2	6	1136384	1136389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593941
21544	NC_018626	ATCGT	2	10	1136398	1136407	20 %	40 %	20 %	20 %	406593941
21545	NC_018626	ACA	2	6	1136444	1136449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593941
21546	NC_018626	TACC	2	8	1136533	1136540	25 %	25 %	0 %	50 %	406593941
21547	NC_018626	TCC	2	6	1136563	1136568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593941
21548	NC_018626	CTG	2	6	1136611	1136616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593941
21549	NC_018626	ATTA	2	8	1136672	1136679	50 %	50 %	0 %	0 %	406593941
21550	NC_018626	AAGCTC	2	12	1136686	1136697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406593941
21551	NC_018626	AGA	2	6	1136717	1136722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593941
21552	NC_018626	GAAA	2	8	1136753	1136760	75 %	0 %	25 %	0 %	406593941
21553	NC_018626	ACG	2	6	1136762	1136767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593941
21554	NC_018626	CCA	2	6	1136778	1136783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593941
21555	NC_018626	TTA	2	6	1136785	1136790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593941
21556	NC_018626	CAA	2	6	1136802	1136807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593941
21557	NC_018626	GTC	2	6	1136815	1136820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593941
21558	NC_018626	TCT	3	9	1136832	1136840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593941
21559	NC_018626	ATTA	2	8	1136906	1136913	50 %	50 %	0 %	0 %	406593941
21560	NC_018626	TA	3	6	1136973	1136978	50 %	50 %	0 %	0 %	406593941
21561	NC_018626	A	6	6	1137032	1137037	100 %	0 %	0 %	0 %	406593941
21562	NC_018626	GAT	2	6	1137117	1137122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593941
21563	NC_018626	TTG	2	6	1137157	1137162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593941
21564	NC_018626	ATT	2	6	1137248	1137253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593941
21565	NC_018626	GAA	2	6	1137282	1137287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593941
21566	NC_018626	GAT	3	9	1137294	1137302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593941
21567	NC_018626	GAA	3	9	1137309	1137317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593941
21568	NC_018626	CAG	2	6	1137373	1137378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593941
21569	NC_018626	CTT	2	6	1137418	1137423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593941
21570	NC_018626	GCC	2	6	1137454	1137459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406593941
21571	NC_018626	ATA	2	6	1137643	1137648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593941
21572	NC_018626	CTT	2	6	1137666	1137671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593941
21573	NC_018626	TTC	2	6	1137691	1137696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593941
21574	NC_018626	ACT	2	6	1137705	1137710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593941
21575	NC_018626	AAG	2	6	1137718	1137723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593941
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21577	NC_018626	GAA	3	9	1137855	1137863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593941
21578	NC_018626	CAA	2	6	1137872	1137877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593941
21579	NC_018626	CCCTG	2	10	1137912	1137921	0 %	20 %	20 %	60 %	406593941
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21582	NC_018626	ATTCT	2	10	1138115	1138124	20 %	60 %	0 %	20 %	406593941
21583	NC_018626	TTA	2	6	1138174	1138179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593941
21584	NC_018626	GAAAA	2	10	1138212	1138221	80 %	0 %	20 %	0 %	406593941
21585	NC_018626	GAA	2	6	1138229	1138234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593941
21586	NC_018626	A	6	6	1138233	1138238	100 %	0 %	0 %	0 %	406593941
21587	NC_018626	CAG	2	6	1138253	1138258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593941
21588	NC_018626	AAC	2	6	1138271	1138276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593941
21589	NC_018626	A	8	8	1138281	1138288	100 %	0 %	0 %	0 %	406593941
21590	NC_018626	CTTA	2	8	1138331	1138338	25 %	50 %	0 %	25 %	406593941
21591	NC_018626	TGA	2	6	1138360	1138365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593941
21592	NC_018626	AAAG	2	8	1138400	1138407	75 %	0 %	25 %	0 %	406593941
21593	NC_018626	TGC	2	6	1138462	1138467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593941
21594	NC_018626	CGA	2	6	1138469	1138474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593941
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21596	NC_018626	ACT	2	6	1138529	1138534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593941
21597	NC_018626	TCA	3	9	1138572	1138580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593942
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21599	NC_018626	ATCA	2	8	1138595	1138602	50 %	25 %	0 %	25 %	406593942
21600	NC_018626	CTT	2	6	1138612	1138617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593942
21601	NC_018626	AGAA	2	8	1138706	1138713	75 %	0 %	25 %	0 %	406593942
21602	NC_018626	CAA	2	6	1138867	1138872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593942
21603	NC_018626	CAT	2	6	1138898	1138903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593942
21604	NC_018626	GCT	2	6	1138911	1138916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593942
21605	NC_018626	A	6	6	1138924	1138929	100 %	0 %	0 %	0 %	406593942
21606	NC_018626	CGG	2	6	1138963	1138968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406593942
21607	NC_018626	TCGC	2	8	1138975	1138982	0 %	25 %	25 %	50 %	406593942
21608	NC_018626	TTC	2	6	1139029	1139034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593942
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21610	NC_018626	TTG	2	6	1139100	1139105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593942
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21612	NC_018626	CTGT	2	8	1139232	1139239	0 %	50 %	25 %	25 %	406593942
21613	NC_018626	TAC	2	6	1139320	1139325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593942
21614	NC_018626	AGT	2	6	1139395	1139400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593942
21615	NC_018626	ATG	2	6	1139455	1139460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593943
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21617	NC_018626	GAA	2	6	1139547	1139552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593943
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