MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018626	AATT	2	8	76212	76219	50 %	50 %	0 %	0 %	406592988
1502	NC_018626	GC	3	6	76233	76238	0 %	0 %	50 %	50 %	406592988
1503	NC_018626	GAA	2	6	76288	76293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592988
1504	NC_018626	TC	3	6	76300	76305	0 %	50 %	0 %	50 %	406592988
1505	NC_018626	TGT	2	6	76311	76316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592988
1506	NC_018626	TC	3	6	76403	76408	0 %	50 %	0 %	50 %	406592988
1507	NC_018626	GTT	2	6	76419	76424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592988
1508	NC_018626	TCCA	2	8	76442	76449	25 %	25 %	0 %	50 %	406592988
1509	NC_018626	GAA	2	6	76453	76458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592988
1510	NC_018626	TGC	2	6	76482	76487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592988
1511	NC_018626	TCC	2	6	76495	76500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592988
1512	NC_018626	ATG	2	6	76520	76525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592988
1513	NC_018626	CA	3	6	76538	76543	50 %	0 %	0 %	50 %	406592988
1514	NC_018626	CGG	2	6	76592	76597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406592988
1515	NC_018626	TCT	2	6	76602	76607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592988
1516	NC_018626	GGT	2	6	76681	76686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592988
1517	NC_018626	CT	3	6	76726	76731	0 %	50 %	0 %	50 %	406592988
1518	NC_018626	AGG	2	6	76755	76760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592988
1519	NC_018626	GAA	2	6	76816	76821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592988
1520	NC_018626	CG	3	6	76836	76841	0 %	0 %	50 %	50 %	406592988
1521	NC_018626	AGC	2	6	76862	76867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592988
1522	NC_018626	TTC	2	6	76883	76888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592988
1523	NC_018626	TCA	2	6	77032	77037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592988
1524	NC_018626	TCC	2	6	77076	77081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592988
1525	NC_018626	AGT	2	6	77142	77147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592988
1526	NC_018626	G	6	6	77148	77153	0 %	0 %	100 %	0 %	406592988
1527	NC_018626	TGC	3	9	77160	77168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592988
1528	NC_018626	TGT	2	6	77169	77174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592988
1529	NC_018626	GCACA	2	10	77189	77198	40 %	0 %	20 %	40 %	406592988
1530	NC_018626	GGT	3	9	77218	77226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592988
1531	NC_018626	TAA	4	12	77795	77806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592989
1532	NC_018626	AGT	2	6	77876	77881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592989
1533	NC_018626	ATA	2	6	77890	77895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592989
1534	NC_018626	ATA	2	6	77908	77913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592989
1535	NC_018626	CTT	2	6	77930	77935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592989
1536	NC_018626	TCT	2	6	77965	77970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592989
1537	NC_018626	AT	3	6	77974	77979	50 %	50 %	0 %	0 %	406592989
1538	NC_018626	TTC	2	6	77987	77992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592989
1539	NC_018626	ACC	2	6	78026	78031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406592989
1540	NC_018626	AGT	2	6	78039	78044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592989
1541	NC_018626	TCT	2	6	78051	78056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592989
1542	NC_018626	TCT	2	6	78060	78065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592989
1543	NC_018626	TGC	2	6	78194	78199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592989
1544	NC_018626	AAAG	2	8	78212	78219	75 %	0 %	25 %	0 %	406592989
1545	NC_018626	CTT	2	6	78313	78318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592989
1546	NC_018626	AAC	2	6	78329	78334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592989
1547	NC_018626	AGT	2	6	78399	78404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592989
1548	NC_018626	CTC	2	6	78427	78432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592989
1549	NC_018626	CAG	2	6	78439	78444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592989
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1551	NC_018626	GAA	2	6	78537	78542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592989
1552	NC_018626	CTG	2	6	78547	78552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592989
1553	NC_018626	CAC	2	6	78588	78593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406592989
1554	NC_018626	ACAG	2	8	78695	78702	50 %	0 %	25 %	25 %	406592989
1555	NC_018626	CAA	2	6	78738	78743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592989
1556	NC_018626	GA	3	6	78826	78831	50 %	0 %	50 %	0 %	406592989
1557	NC_018626	CTT	2	6	78861	78866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592989
1558	NC_018626	AGTTC	2	10	79146	79155	20 %	40 %	20 %	20 %	406592989
1559	NC_018626	AG	3	6	79160	79165	50 %	0 %	50 %	0 %	406592989
1560	NC_018626	ATG	2	6	79246	79251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592989
1561	NC_018626	TAAG	2	8	79272	79279	50 %	25 %	25 %	0 %	406592989
1562	NC_018626	GGT	2	6	79306	79311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592990
1563	NC_018626	CCT	2	6	79324	79329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592990
1564	NC_018626	GAG	2	6	79378	79383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592990
1565	NC_018626	AGA	2	6	79392	79397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592990
1566	NC_018626	AAG	2	6	79520	79525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592990
1567	NC_018626	T	6	6	79528	79533	0 %	100 %	0 %	0 %	406592990
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1569	NC_018626	A	6	6	79678	79683	100 %	0 %	0 %	0 %	406592990
1570	NC_018626	A	7	7	79779	79785	100 %	0 %	0 %	0 %	406592990
1571	NC_018626	TCT	2	6	79895	79900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592990
1572	NC_018626	GTC	2	6	79986	79991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592990
1573	NC_018626	GCTGAT	2	12	80122	80133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406592990
1574	NC_018626	GAA	2	6	80197	80202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592990
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1581	NC_018626	CAAA	2	8	80449	80456	75 %	0 %	0 %	25 %	406592990
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1584	NC_018626	TGA	2	6	80674	80679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592991
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1586	NC_018626	A	6	6	80702	80707	100 %	0 %	0 %	0 %	406592991
1587	NC_018626	T	6	6	80799	80804	0 %	100 %	0 %	0 %	406592991
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1589	NC_018626	TAT	2	6	80848	80853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592991
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1595	NC_018626	TCT	3	9	81143	81151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592991
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1599	NC_018626	ATT	2	6	81286	81291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592991
1600	NC_018626	CT	3	6	81364	81369	0 %	50 %	0 %	50 %	406592991
1601	NC_018626	TAT	2	6	81405	81410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592991
1602	NC_018626	GAAG	2	8	81469	81476	50 %	0 %	50 %	0 %	406592991
1603	NC_018626	GCT	2	6	81482	81487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592991
1604	NC_018626	TTC	2	6	81507	81512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592991
1605	NC_018626	CGTAT	2	10	81515	81524	20 %	40 %	20 %	20 %	406592991
1606	NC_018626	AGA	2	6	81526	81531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592991
1607	NC_018626	GAA	2	6	81582	81587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592991
1608	NC_018626	ATG	2	6	81629	81634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592991
1609	NC_018626	A	7	7	81692	81698	100 %	0 %	0 %	0 %	406592991
1610	NC_018626	AC	3	6	81711	81716	50 %	0 %	0 %	50 %	406592991
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1612	NC_018626	A	6	6	81755	81760	100 %	0 %	0 %	0 %	406592991
1613	NC_018626	CAT	2	6	81904	81909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592992
1614	NC_018626	AC	3	6	81914	81919	50 %	0 %	0 %	50 %	406592992
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1616	NC_018626	GT	3	6	82028	82033	0 %	50 %	50 %	0 %	406592992
1617	NC_018626	TTC	2	6	82040	82045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592992
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1621	NC_018626	TGA	2	6	82191	82196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592992
1622	NC_018626	AGA	2	6	82215	82220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592992
1623	NC_018626	AC	3	6	82292	82297	50 %	0 %	0 %	50 %	406592992
1624	NC_018626	GAA	2	6	82298	82303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592992
1625	NC_018626	GCA	2	6	82395	82400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592992
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