MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_018626	CAG	2	6	24745	24750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592939
503	NC_018626	T	8	8	24800	24807	0 %	100 %	0 %	0 %	406592939
504	NC_018626	TGT	2	6	24822	24827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
505	NC_018626	GCT	2	6	24852	24857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592939
506	NC_018626	TAGT	2	8	24987	24994	25 %	50 %	25 %	0 %	406592939
507	NC_018626	TTG	2	6	25012	25017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
508	NC_018626	TTG	2	6	25022	25027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
509	NC_018626	ATT	2	6	25115	25120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
510	NC_018626	ATT	2	6	25277	25282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
511	NC_018626	AGC	2	6	25378	25383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592939
512	NC_018626	TTG	2	6	25391	25396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
513	NC_018626	GAAC	2	8	25446	25453	50 %	0 %	25 %	25 %	406592939
514	NC_018626	TC	3	6	25498	25503	0 %	50 %	0 %	50 %	406592939
515	NC_018626	TA	3	6	25506	25511	50 %	50 %	0 %	0 %	406592939
516	NC_018626	GCA	2	6	25512	25517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592939
517	NC_018626	TAG	2	6	25552	25557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592939
518	NC_018626	AAC	2	6	25646	25651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592939
519	NC_018626	TTC	3	9	25652	25660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
520	NC_018626	TCC	2	6	25661	25666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592939
521	NC_018626	TTA	2	6	25680	25685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
522	NC_018626	TCA	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592939
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524	NC_018626	TGG	2	6	25825	25830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592939
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529	NC_018626	TCA	2	6	25983	25988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592939
530	NC_018626	T	6	6	25997	26002	0 %	100 %	0 %	0 %	406592939
531	NC_018626	TCT	2	6	26023	26028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592939
532	NC_018626	ATT	2	6	26042	26047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592939
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534	NC_018626	TCC	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592939
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539	NC_018626	GTT	2	6	26318	26323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592939
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542	NC_018626	TA	3	6	26516	26521	50 %	50 %	0 %	0 %	406592939
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545	NC_018626	TATT	2	8	26657	26664	25 %	75 %	0 %	0 %	406592940
546	NC_018626	ATTA	2	8	26669	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	406592940
547	NC_018626	TTA	2	6	26700	26705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592940
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551	NC_018626	TGA	2	6	26912	26917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592941
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554	NC_018626	TTA	2	6	27135	27140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592941
555	NC_018626	A	6	6	27150	27155	100 %	0 %	0 %	0 %	406592941
556	NC_018626	CTGG	2	8	27189	27196	0 %	25 %	50 %	25 %	406592941
557	NC_018626	AG	3	6	27216	27221	50 %	0 %	50 %	0 %	406592941
558	NC_018626	G	6	6	27221	27226	0 %	0 %	100 %	0 %	406592941
559	NC_018626	AAG	2	6	27277	27282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592941
560	NC_018626	AGC	2	6	27293	27298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592941
561	NC_018626	TGGT	2	8	27331	27338	0 %	50 %	50 %	0 %	406592941
562	NC_018626	TA	3	6	27376	27381	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
563	NC_018626	AAG	2	6	27390	27395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592941
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565	NC_018626	GGT	2	6	27432	27437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592941
566	NC_018626	TC	3	6	27461	27466	0 %	50 %	0 %	50 %	406592941
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569	NC_018626	AC	3	6	27629	27634	50 %	0 %	0 %	50 %	406592941
570	NC_018626	AATC	2	8	27725	27732	50 %	25 %	0 %	25 %	406592941
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573	NC_018626	TCA	2	6	27824	27829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592941
574	NC_018626	CAG	2	6	27920	27925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592941
575	NC_018626	CGC	2	6	27926	27931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406592941
576	NC_018626	AATT	2	8	27962	27969	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
577	NC_018626	CAA	2	6	27996	28001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592941
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579	NC_018626	TA	3	6	28053	28058	50 %	50 %	0 %	0 %	406592941
580	NC_018626	TTG	2	6	28078	28083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592941
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593	NC_018626	GA	3	6	28762	28767	50 %	0 %	50 %	0 %	406592941
594	NC_018626	AAAT	2	8	28808	28815	75 %	25 %	0 %	0 %	406592941
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598	NC_018626	TAAGTG	2	12	29026	29037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592941
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600	NC_018626	GGCA	2	8	29086	29093	25 %	0 %	50 %	25 %	406592941
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608	NC_018626	CAA	2	6	29461	29466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592942
609	NC_018626	TGT	2	6	29531	29536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592942
610	NC_018626	ACT	2	6	29563	29568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592942
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612	NC_018626	GAT	3	9	29599	29607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592942
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620	NC_018626	CGT	2	6	29911	29916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592943
621	NC_018626	AG	3	6	29925	29930	50 %	0 %	50 %	0 %	406592943
622	NC_018626	T	6	6	29940	29945	0 %	100 %	0 %	0 %	406592943
623	NC_018626	ATC	2	6	29970	29975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592943
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