MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 22069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018626	GGATTA	2	12	290110	290121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593205
5502	NC_018626	GAG	2	6	290183	290188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593205
5503	NC_018626	GCT	2	6	290269	290274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593205
5504	NC_018626	AAG	2	6	290317	290322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593205
5505	NC_018626	AGG	2	6	290412	290417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593205
5506	NC_018626	CTG	2	6	290423	290428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593205
5507	NC_018626	ATTG	2	8	290436	290443	25 %	50 %	25 %	0 %	406593205
5508	NC_018626	TGCT	2	8	290444	290451	0 %	50 %	25 %	25 %	406593205
5509	NC_018626	CCT	2	6	290452	290457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593205
5510	NC_018626	GAA	2	6	290520	290525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593205
5511	NC_018626	T	6	6	290526	290531	0 %	100 %	0 %	0 %	406593205
5512	NC_018626	GAA	2	6	290574	290579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593205
5513	NC_018626	TGA	2	6	290586	290591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593205
5514	NC_018626	GTT	2	6	290611	290616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593205
5515	NC_018626	A	6	6	290630	290635	100 %	0 %	0 %	0 %	406593205
5516	NC_018626	AAGA	2	8	290641	290648	75 %	0 %	25 %	0 %	406593205
5517	NC_018626	ATAGAA	2	12	290650	290661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406593205
5518	NC_018626	CTG	2	6	290717	290722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593205
5519	NC_018626	CT	4	8	290774	290781	0 %	50 %	0 %	50 %	406593205
5520	NC_018626	TGCT	2	8	290792	290799	0 %	50 %	25 %	25 %	406593205
5521	NC_018626	TGT	2	6	290811	290816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593205
5522	NC_018626	TTG	2	6	290858	290863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593205
5523	NC_018626	A	6	6	291001	291006	100 %	0 %	0 %	0 %	406593205
5524	NC_018626	GAA	2	6	291106	291111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593205
5525	NC_018626	GTC	2	6	291169	291174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593205
5526	NC_018626	CTT	2	6	291193	291198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593205
5527	NC_018626	ATC	2	6	291311	291316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593205
5528	NC_018626	AG	3	6	291328	291333	50 %	0 %	50 %	0 %	406593205
5529	NC_018626	ACT	2	6	291353	291358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593205
5530	NC_018626	AGA	2	6	291393	291398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593205
5531	NC_018626	TCG	2	6	291404	291409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593205
5532	NC_018626	CGA	2	6	291420	291425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593205
5533	NC_018626	CATA	2	8	291666	291673	50 %	25 %	0 %	25 %	406593206
5534	NC_018626	AGG	2	6	291702	291707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593206
5535	NC_018626	CTC	2	6	291722	291727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593206
5536	NC_018626	GAT	3	9	291736	291744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593206
5537	NC_018626	AAAG	2	8	291826	291833	75 %	0 %	25 %	0 %	406593206
5538	NC_018626	ATC	2	6	291894	291899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593206
5539	NC_018626	AGG	2	6	291912	291917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593206
5540	NC_018626	TTC	2	6	291931	291936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593206
5541	NC_018626	GAAA	2	8	291971	291978	75 %	0 %	25 %	0 %	406593206
5542	NC_018626	TCT	2	6	292006	292011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593206
5543	NC_018626	A	6	6	292030	292035	100 %	0 %	0 %	0 %	406593206
5544	NC_018626	AC	3	6	292068	292073	50 %	0 %	0 %	50 %	406593206
5545	NC_018626	TTC	2	6	292179	292184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593206
5546	NC_018626	TGGT	2	8	292242	292249	0 %	50 %	50 %	0 %	406593206
5547	NC_018626	CAA	2	6	292267	292272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406593206
5548	NC_018626	TGG	2	6	292325	292330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406593206
5549	NC_018626	GAT	2	6	292344	292349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593206
5550	NC_018626	AGCG	2	8	292369	292376	25 %	0 %	50 %	25 %	406593206
5551	NC_018626	GATA	2	8	292456	292463	50 %	25 %	25 %	0 %	406593206
5552	NC_018626	TGA	2	6	292485	292490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593206
5553	NC_018626	ATC	2	6	292544	292549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593206
5554	NC_018626	GAA	2	6	292570	292575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593206
5555	NC_018626	GATA	2	8	292590	292597	50 %	25 %	25 %	0 %	406593206
5556	NC_018626	AG	3	6	292723	292728	50 %	0 %	50 %	0 %	406593206
5557	NC_018626	TCA	2	6	292895	292900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593206
5558	NC_018626	GAT	2	6	292906	292911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593206
5559	NC_018626	TC	3	6	292913	292918	0 %	50 %	0 %	50 %	406593206
5560	NC_018626	GTA	2	6	293002	293007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593206
5561	NC_018626	GGAT	2	8	293058	293065	25 %	25 %	50 %	0 %	406593206
5562	NC_018626	GAA	2	6	293071	293076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593206
5563	NC_018626	AGA	3	9	293088	293096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593206
5564	NC_018626	CTG	2	6	293246	293251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593206
5565	NC_018626	TA	3	6	293262	293267	50 %	50 %	0 %	0 %	406593206
5566	NC_018626	GAG	2	6	293479	293484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593206
5567	NC_018626	GAA	2	6	293542	293547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593206
5568	NC_018626	CGA	2	6	293551	293556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406593206
5569	NC_018626	CCT	2	6	293593	293598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593206
5570	NC_018626	ACC	3	9	293607	293615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593206
5571	NC_018626	AAT	2	6	293629	293634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593206
5572	NC_018626	GA	3	6	293787	293792	50 %	0 %	50 %	0 %	406593207
5573	NC_018626	AGG	2	6	293799	293804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593207
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5575	NC_018626	AGT	2	6	293933	293938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593207
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5577	NC_018626	TTTA	2	8	294175	294182	25 %	75 %	0 %	0 %	406593207
5578	NC_018626	GATTTA	2	12	294186	294197	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406593207
5579	NC_018626	TG	3	6	294225	294230	0 %	50 %	50 %	0 %	406593207
5580	NC_018626	CTT	2	6	294250	294255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593207
5581	NC_018626	AGT	2	6	294369	294374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593207
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5583	NC_018626	TCTTTT	2	12	294401	294412	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406593207
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5588	NC_018626	GAA	2	6	294596	294601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593207
5589	NC_018626	CGTA	2	8	294607	294614	25 %	25 %	25 %	25 %	406593207
5590	NC_018626	AG	3	6	294645	294650	50 %	0 %	50 %	0 %	406593207
5591	NC_018626	AT	3	6	294671	294676	50 %	50 %	0 %	0 %	406593207
5592	NC_018626	TTC	2	6	294778	294783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593207
5593	NC_018626	AGAGG	2	10	294891	294900	40 %	0 %	60 %	0 %	406593207
5594	NC_018626	GA	3	6	294920	294925	50 %	0 %	50 %	0 %	406593207
5595	NC_018626	ATC	2	6	295000	295005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406593207
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5599	NC_018626	AGG	2	6	295202	295207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406593207
5600	NC_018626	AGA	2	6	295447	295452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406593207
5601	NC_018626	TCT	2	6	295490	295495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593207
5602	NC_018626	ATA	2	6	295508	295513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406593207
5603	NC_018626	T	6	6	295565	295570	0 %	100 %	0 %	0 %	406593207
5604	NC_018626	CTG	2	6	295677	295682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406593207
5605	NC_018626	ATT	2	6	295738	295743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593207
5606	NC_018626	AT	3	6	295789	295794	50 %	50 %	0 %	0 %	406593207
5607	NC_018626	GTT	2	6	295819	295824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406593207
5608	NC_018626	TCT	2	6	295850	295855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593207
5609	NC_018626	TCT	2	6	295898	295903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406593207
5610	NC_018626	ATT	2	6	295927	295932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593207
5611	NC_018626	TTGA	2	8	295975	295982	25 %	50 %	25 %	0 %	406593207
5612	NC_018626	CTC	2	6	295992	295997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593207
5613	NC_018626	A	7	7	296119	296125	100 %	0 %	0 %	0 %	406593207
5614	NC_018626	ATT	2	6	296131	296136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593207
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5617	NC_018626	CCT	2	6	296198	296203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406593207
5618	NC_018626	TAT	2	6	296217	296222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406593207
5619	NC_018626	GCAAA	2	10	296225	296234	60 %	0 %	20 %	20 %	406593207
5620	NC_018626	CCA	2	6	296282	296287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406593207
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5622	NC_018626	GTA	2	6	296384	296389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406593207
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