MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 21983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018625	TCA	2	6	51101	51106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591852
1002	NC_018625	AAT	2	6	51139	51144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591852
1003	NC_018625	AGT	2	6	51183	51188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591852
1004	NC_018625	TGA	2	6	51303	51308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591852
1005	NC_018625	CCT	2	6	51382	51387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591852
1006	NC_018625	ATG	2	6	51451	51456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591852
1007	NC_018625	TTTGG	2	10	51472	51481	0 %	60 %	40 %	0 %	406591852
1008	NC_018625	CTC	2	6	51538	51543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591852
1009	NC_018625	CAA	2	6	51610	51615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591852
1010	NC_018625	CAT	2	6	51617	51622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591852
1011	NC_018625	TTG	2	6	51626	51631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591852
1012	NC_018625	AAC	2	6	51651	51656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591852
1013	NC_018625	ATT	2	6	51664	51669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591852
1014	NC_018625	TTG	3	9	51725	51733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591852
1015	NC_018625	GTT	2	6	51757	51762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591852
1016	NC_018625	CTT	2	6	51873	51878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591852
1017	NC_018625	CAG	2	6	51969	51974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591852
1018	NC_018625	ATG	2	6	52006	52011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591852
1019	NC_018625	TTA	2	6	52028	52033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591852
1020	NC_018625	CAA	2	6	52062	52067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591852
1021	NC_018625	C	6	6	52146	52151	0 %	0 %	0 %	100 %	406591852
1022	NC_018625	GAAG	2	8	52718	52725	50 %	0 %	50 %	0 %	406591853
1023	NC_018625	CCT	2	6	52728	52733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591853
1024	NC_018625	T	6	6	52740	52745	0 %	100 %	0 %	0 %	406591853
1025	NC_018625	TGC	2	6	52806	52811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591853
1026	NC_018625	CCT	2	6	52812	52817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406591853
1027	NC_018625	TGC	2	6	52818	52823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591853
1028	NC_018625	AGG	2	6	52837	52842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591853
1029	NC_018625	CTT	2	6	52914	52919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591854
1030	NC_018625	TTA	2	6	52931	52936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591854
1031	NC_018625	GTT	2	6	52944	52949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591854
1032	NC_018625	ACG	2	6	52969	52974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591854
1033	NC_018625	TGT	2	6	53007	53012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591854
1034	NC_018625	ATCC	2	8	53024	53031	25 %	25 %	0 %	50 %	406591854
1035	NC_018625	GT	3	6	53098	53103	0 %	50 %	50 %	0 %	406591854
1036	NC_018625	T	6	6	53132	53137	0 %	100 %	0 %	0 %	406591854
1037	NC_018625	CTT	2	6	53164	53169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591854
1038	NC_018625	T	6	6	53168	53173	0 %	100 %	0 %	0 %	406591854
1039	NC_018625	TTC	2	6	53233	53238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591854
1040	NC_018625	AT	3	6	53285	53290	50 %	50 %	0 %	0 %	406591854
1041	NC_018625	AGCA	2	8	53316	53323	50 %	0 %	25 %	25 %	406591854
1042	NC_018625	AAT	2	6	53341	53346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591854
1043	NC_018625	TTCA	2	8	53476	53483	25 %	50 %	0 %	25 %	406591854
1044	NC_018625	A	6	6	53654	53659	100 %	0 %	0 %	0 %	406591854
1045	NC_018625	TCA	2	6	53720	53725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591854
1046	NC_018625	T	6	6	53776	53781	0 %	100 %	0 %	0 %	406591854
1047	NC_018625	CGT	2	6	53839	53844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591854
1048	NC_018625	AGG	2	6	53866	53871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591854
1049	NC_018625	AAG	2	6	53896	53901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591854
1050	NC_018625	GAA	2	6	53913	53918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591854
1051	NC_018625	T	6	6	53934	53939	0 %	100 %	0 %	0 %	406591855
1052	NC_018625	CAG	2	6	53965	53970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591855
1053	NC_018625	AGG	2	6	54033	54038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591855
1054	NC_018625	CGC	2	6	54050	54055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406591855
1055	NC_018625	ACC	2	6	54083	54088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406591855
1056	NC_018625	GTAT	2	8	54129	54136	25 %	50 %	25 %	0 %	406591855
1057	NC_018625	TCA	2	6	54201	54206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591855
1058	NC_018625	CAG	2	6	54253	54258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591855
1059	NC_018625	TGT	2	6	54280	54285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591855
1060	NC_018625	GTA	2	6	54293	54298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591855
1061	NC_018625	CATA	2	8	54324	54331	50 %	25 %	0 %	25 %	406591855
1062	NC_018625	CTTATC	2	12	54344	54355	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406591855
1063	NC_018625	TTG	2	6	54373	54378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591855
1064	NC_018625	CTT	2	6	54849	54854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591856
1065	NC_018625	TCG	2	6	54869	54874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591856
1066	NC_018625	T	7	7	54909	54915	0 %	100 %	0 %	0 %	406591856
1067	NC_018625	TCT	2	6	54935	54940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591856
1068	NC_018625	T	7	7	54955	54961	0 %	100 %	0 %	0 %	406591856
1069	NC_018625	CTT	2	6	55008	55013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591856
1070	NC_018625	ACG	2	6	55021	55026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591856
1071	NC_018625	TAA	2	6	55035	55040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591856
1072	NC_018625	CTG	2	6	55056	55061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591856
1073	NC_018625	AAATTT	2	12	55112	55123	50 %	50 %	0 %	0 %	406591856
1074	NC_018625	GCA	2	6	55124	55129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591856
1075	NC_018625	ATA	2	6	55130	55135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591856
1076	NC_018625	CTA	2	6	55266	55271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591856
1077	NC_018625	CTT	2	6	55308	55313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591856
1078	NC_018625	AGC	2	6	55330	55335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591856
1079	NC_018625	TTTTC	2	10	55341	55350	0 %	80 %	0 %	20 %	406591856
1080	NC_018625	TCA	2	6	55407	55412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591857
1081	NC_018625	AG	3	6	55428	55433	50 %	0 %	50 %	0 %	406591857
1082	NC_018625	GCT	2	6	55656	55661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591857
1083	NC_018625	GTT	2	6	55671	55676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591857
1084	NC_018625	CTT	2	6	55732	55737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591857
1085	NC_018625	GAG	2	6	55747	55752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406591857
1086	NC_018625	TAA	2	6	55793	55798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591857
1087	NC_018625	TCA	2	6	55809	55814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591857
1088	NC_018625	TAGC	2	8	55855	55862	25 %	25 %	25 %	25 %	406591857
1089	NC_018625	CAG	2	6	55876	55881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591857
1090	NC_018625	TTG	2	6	55907	55912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591857
1091	NC_018625	TGA	2	6	55924	55929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591857
1092	NC_018625	CTGT	2	8	56034	56041	0 %	50 %	25 %	25 %	406591857
1093	NC_018625	AG	4	8	56042	56049	50 %	0 %	50 %	0 %	406591857
1094	NC_018625	TAG	2	6	56231	56236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591858
1095	NC_018625	GAA	2	6	56249	56254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591858
1096	NC_018625	TGA	2	6	56272	56277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591858
1097	NC_018625	GAA	2	6	56316	56321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406591858
1098	NC_018625	CTT	2	6	56326	56331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591858
1099	NC_018625	GCT	2	6	56388	56393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591858
1100	NC_018625	CTTT	2	8	56424	56431	0 %	75 %	0 %	25 %	406591858
1101	NC_018625	AGAA	2	8	56444	56451	75 %	0 %	25 %	0 %	406591858
1102	NC_018625	GTT	2	6	56508	56513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406591858
1103	NC_018625	GAAG	2	8	56613	56620	50 %	0 %	50 %	0 %	406591858
1104	NC_018625	GTA	2	6	56623	56628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406591858
1105	NC_018625	CAA	2	6	56668	56673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591858
1106	NC_018625	ATT	2	6	56702	56707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406591858
1107	NC_018625	CAG	2	6	56743	56748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406591858
1108	NC_018625	TGC	2	6	56768	56773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406591858
1109	NC_018625	CTT	2	6	56782	56787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591858
1110	NC_018625	T	6	6	56804	56809	0 %	100 %	0 %	0 %	406591858
1111	NC_018625	GTAA	2	8	56836	56843	50 %	25 %	25 %	0 %	406591858
1112	NC_018625	CTT	2	6	56851	56856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591858
1113	NC_018625	TTAG	2	8	56959	56966	25 %	50 %	25 %	0 %	406591858
1114	NC_018625	T	7	7	56983	56989	0 %	100 %	0 %	0 %	406591859
1115	NC_018625	TCT	2	6	56999	57004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591859
1116	NC_018625	TCA	2	6	57014	57019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591859
1117	NC_018625	CT	3	6	57047	57052	0 %	50 %	0 %	50 %	406591859
1118	NC_018625	GA	3	6	57075	57080	50 %	0 %	50 %	0 %	406591859
1119	NC_018625	T	6	6	57097	57102	0 %	100 %	0 %	0 %	406591859
1120	NC_018625	CTA	2	6	57216	57221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406591859
1121	NC_018625	CAA	3	9	57285	57293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406591859
1122	NC_018625	CTTT	2	8	57309	57316	0 %	75 %	0 %	25 %	406591859
1123	NC_018625	TTC	2	6	57338	57343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406591859
1124	NC_018625	AAT	2	6	57344	57349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406591859
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1126	NC_018625	T	6	6	57382	57387	0 %	100 %	0 %	0 %	406591859
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1245	NC_018625	A	7	7	65162	65168	100 %	0 %	0 %	0 %	406591863
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1250	NC_018625	TGCA	2	8	65413	65420	25 %	25 %	25 %	25 %	406591863
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