MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 21983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018625	GTTT	2	8	241665	241672	0 %	75 %	25 %	0 %	406592050
4502	NC_018625	AGG	2	6	241691	241696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592050
4503	NC_018625	TG	3	6	241749	241754	0 %	50 %	50 %	0 %	406592050
4504	NC_018625	ATT	2	6	241789	241794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592050
4505	NC_018625	TTC	2	6	241850	241855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592050
4506	NC_018625	AGA	2	6	241863	241868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592050
4507	NC_018625	TGA	2	6	241898	241903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592050
4508	NC_018625	TTG	2	6	241948	241953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592050
4509	NC_018625	CGG	2	6	241955	241960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406592050
4510	NC_018625	TTG	2	6	241966	241971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592050
4511	NC_018625	ATT	2	6	242001	242006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592050
4512	NC_018625	ATG	2	6	242071	242076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592050
4513	NC_018625	ATG	2	6	242103	242108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592050
4514	NC_018625	GCA	2	6	242133	242138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592050
4515	NC_018625	AAG	2	6	242155	242160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592050
4516	NC_018625	A	6	6	242178	242183	100 %	0 %	0 %	0 %	406592050
4517	NC_018625	TCA	2	6	242189	242194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592050
4518	NC_018625	GCTT	2	8	242248	242255	0 %	50 %	25 %	25 %	406592050
4519	NC_018625	AT	3	6	242329	242334	50 %	50 %	0 %	0 %	406592050
4520	NC_018625	TGA	2	6	242453	242458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592050
4521	NC_018625	GAA	2	6	242463	242468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592050
4522	NC_018625	ATT	2	6	242478	242483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592050
4523	NC_018625	TGA	2	6	242522	242527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592050
4524	NC_018625	GAA	2	6	242571	242576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592050
4525	NC_018625	TTA	2	6	242598	242603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592050
4526	NC_018625	TTTAG	2	10	242642	242651	20 %	60 %	20 %	0 %	406592050
4527	NC_018625	AG	3	6	242712	242717	50 %	0 %	50 %	0 %	406592051
4528	NC_018625	T	7	7	242743	242749	0 %	100 %	0 %	0 %	406592051
4529	NC_018625	GCA	2	6	242773	242778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592051
4530	NC_018625	TAAT	2	8	242840	242847	50 %	50 %	0 %	0 %	406592051
4531	NC_018625	ATG	2	6	242899	242904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592051
4532	NC_018625	ACT	2	6	242917	242922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592051
4533	NC_018625	GCT	2	6	242938	242943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592051
4534	NC_018625	CGT	2	6	242983	242988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592051
4535	NC_018625	G	6	6	243034	243039	0 %	0 %	100 %	0 %	406592051
4536	NC_018625	TTTA	2	8	243116	243123	25 %	75 %	0 %	0 %	406592051
4537	NC_018625	ATCG	2	8	243163	243170	25 %	25 %	25 %	25 %	406592051
4538	NC_018625	AAT	2	6	243313	243318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592052
4539	NC_018625	TTC	2	6	243363	243368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592052
4540	NC_018625	CTT	2	6	243369	243374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592052
4541	NC_018625	CTG	2	6	243378	243383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592052
4542	NC_018625	TTA	2	6	243393	243398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592052
4543	NC_018625	ATG	2	6	243405	243410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592052
4544	NC_018625	TG	3	6	243429	243434	0 %	50 %	50 %	0 %	406592052
4545	NC_018625	GTTGT	2	10	243447	243456	0 %	60 %	40 %	0 %	406592052
4546	NC_018625	A	6	6	243479	243484	100 %	0 %	0 %	0 %	406592052
4547	NC_018625	GGTA	2	8	243512	243519	25 %	25 %	50 %	0 %	406592052
4548	NC_018625	GTT	2	6	243548	243553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592052
4549	NC_018625	CA	4	8	243600	243607	50 %	0 %	0 %	50 %	406592052
4550	NC_018625	TTG	2	6	243660	243665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592052
4551	NC_018625	AG	3	6	243821	243826	50 %	0 %	50 %	0 %	406592052
4552	NC_018625	GCG	2	6	243857	243862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406592052
4553	NC_018625	GT	3	6	243957	243962	0 %	50 %	50 %	0 %	406592052
4554	NC_018625	AAAG	2	8	243983	243990	75 %	0 %	25 %	0 %	406592052
4555	NC_018625	TTA	2	6	244168	244173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592053
4556	NC_018625	TTTA	2	8	244226	244233	25 %	75 %	0 %	0 %	406592053
4557	NC_018625	AAG	2	6	244280	244285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592053
4558	NC_018625	GAA	2	6	244303	244308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592053
4559	NC_018625	A	6	6	244394	244399	100 %	0 %	0 %	0 %	406592053
4560	NC_018625	GCA	2	6	244509	244514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592053
4561	NC_018625	TAT	2	6	244542	244547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592053
4562	NC_018625	TAA	3	9	244560	244568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592053
4563	NC_018625	GAA	2	6	244585	244590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592053
4564	NC_018625	GTT	2	6	244680	244685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592053
4565	NC_018625	TCC	2	6	244749	244754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592053
4566	NC_018625	TTTCCT	2	12	244833	244844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592053
4567	NC_018625	GAA	3	9	244897	244905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592053
4568	NC_018625	GA	3	6	244969	244974	50 %	0 %	50 %	0 %	406592053
4569	NC_018625	TTC	2	6	245035	245040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592053
4570	NC_018625	GAC	3	9	245047	245055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592053
4571	NC_018625	TGA	2	6	245061	245066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592053
4572	NC_018625	AGCT	2	8	245171	245178	25 %	25 %	25 %	25 %	406592054
4573	NC_018625	T	8	8	245182	245189	0 %	100 %	0 %	0 %	406592054
4574	NC_018625	GTT	2	6	245218	245223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592054
4575	NC_018625	GAG	2	6	245368	245373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592054
4576	NC_018625	TTTAGG	2	12	245441	245452	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406592054
4577	NC_018625	CTC	2	6	245495	245500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592054
4578	NC_018625	TAAAAG	2	12	245533	245544	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406592054
4579	NC_018625	GTT	2	6	245560	245565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592054
4580	NC_018625	ATG	2	6	245723	245728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592054
4581	NC_018625	AGATA	2	10	245738	245747	60 %	20 %	20 %	0 %	406592054
4582	NC_018625	TTATC	2	10	245752	245761	20 %	60 %	0 %	20 %	406592054
4583	NC_018625	TTG	2	6	245805	245810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592055
4584	NC_018625	TAG	2	6	245816	245821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592055
4585	NC_018625	TCT	3	9	245857	245865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592055
4586	NC_018625	AGT	2	6	245888	245893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592055
4587	NC_018625	GCT	2	6	245947	245952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592055
4588	NC_018625	AG	3	6	245977	245982	50 %	0 %	50 %	0 %	406592055
4589	NC_018625	CTT	2	6	245993	245998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592055
4590	NC_018625	GAT	2	6	246020	246025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592055
4591	NC_018625	AGAA	2	8	246027	246034	75 %	0 %	25 %	0 %	406592055
4592	NC_018625	CAT	2	6	246179	246184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592055
4593	NC_018625	ATT	2	6	246253	246258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592055
4594	NC_018625	CTTT	2	8	246268	246275	0 %	75 %	0 %	25 %	406592055
4595	NC_018625	AGC	2	6	246279	246284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592055
4596	NC_018625	ATGG	2	8	246386	246393	25 %	25 %	50 %	0 %	406592055
4597	NC_018625	TAA	2	6	246396	246401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592055
4598	NC_018625	AAG	2	6	246441	246446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592055
4599	NC_018625	ATC	2	6	246489	246494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592055
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4601	NC_018625	AGA	2	6	246647	246652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592056
4602	NC_018625	TG	3	6	246681	246686	0 %	50 %	50 %	0 %	406592056
4603	NC_018625	G	6	6	246813	246818	0 %	0 %	100 %	0 %	406592056
4604	NC_018625	TGA	2	6	246822	246827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592056
4605	NC_018625	ATT	2	6	246863	246868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592056
4606	NC_018625	AAT	2	6	246885	246890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592056
4607	NC_018625	ATC	2	6	246914	246919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592056
4608	NC_018625	TAACA	2	10	246978	246987	60 %	20 %	0 %	20 %	406592056
4609	NC_018625	TCA	2	6	247086	247091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592056
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4611	NC_018625	GAATC	2	10	247117	247126	40 %	20 %	20 %	20 %	406592056
4612	NC_018625	T	6	6	247137	247142	0 %	100 %	0 %	0 %	406592056
4613	NC_018625	GTTT	2	8	247238	247245	0 %	75 %	25 %	0 %	406592056
4614	NC_018625	GTA	2	6	247268	247273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592056
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4616	NC_018625	T	6	6	247345	247350	0 %	100 %	0 %	0 %	406592056
4617	NC_018625	TAG	2	6	247441	247446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592056
4618	NC_018625	ATAA	2	8	247450	247457	75 %	25 %	0 %	0 %	406592056
4619	NC_018625	GGA	2	6	247463	247468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592056
4620	NC_018625	GTA	2	6	247469	247474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592056
4621	NC_018625	ACA	2	6	247476	247481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592056
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4623	NC_018625	TCT	2	6	247572	247577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592056
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4992	NC_018625	AGCAG	2	10	266179	266188	40 %	0 %	40 %	20 %	406592076
4993	NC_018625	AAG	2	6	266207	266212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592076
4994	NC_018625	GCAG	2	8	266353	266360	25 %	0 %	50 %	25 %	406592076
4995	NC_018625	ATGT	2	8	266441	266448	25 %	50 %	25 %	0 %	406592076
4996	NC_018625	AGG	2	6	266456	266461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592076
4997	NC_018625	ATA	2	6	266482	266487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592076
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