MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 22186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018624	TAA	4	12	77810	77821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460233
1502	NC_018624	AGT	2	6	77891	77896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460233
1503	NC_018624	ATA	2	6	77923	77928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460233
1504	NC_018624	CTT	2	6	77945	77950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460233
1505	NC_018624	TCT	2	6	77980	77985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460233
1506	NC_018624	TTC	2	6	78002	78007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460233
1507	NC_018624	ACC	2	6	78041	78046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460233
1508	NC_018624	AGT	2	6	78054	78059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460233
1509	NC_018624	TCT	2	6	78066	78071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460233
1510	NC_018624	TCT	2	6	78075	78080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460233
1511	NC_018624	AAAGA	2	10	78156	78165	80 %	0 %	20 %	0 %	407460233
1512	NC_018624	AAAG	2	8	78227	78234	75 %	0 %	25 %	0 %	407460233
1513	NC_018624	CACCTC	2	12	78310	78321	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	407460233
1514	NC_018624	CTT	2	6	78328	78333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460233
1515	NC_018624	AAC	2	6	78344	78349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460233
1516	NC_018624	GCT	2	6	78402	78407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460233
1517	NC_018624	AGT	2	6	78414	78419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460233
1518	NC_018624	CTC	2	6	78442	78447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460233
1519	NC_018624	CAG	2	6	78454	78459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460233
1520	NC_018624	ACC	2	6	78464	78469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460233
1521	NC_018624	GAA	2	6	78552	78557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460233
1522	NC_018624	CTG	2	6	78562	78567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460233
1523	NC_018624	CAC	2	6	78603	78608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460233
1524	NC_018624	ACAG	2	8	78710	78717	50 %	0 %	25 %	25 %	407460233
1525	NC_018624	CAA	2	6	78753	78758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460233
1526	NC_018624	GA	3	6	78841	78846	50 %	0 %	50 %	0 %	407460233
1527	NC_018624	CTT	2	6	78876	78881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460233
1528	NC_018624	GTT	2	6	78884	78889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460233
1529	NC_018624	AGTTC	2	10	79161	79170	20 %	40 %	20 %	20 %	407460233
1530	NC_018624	AG	3	6	79175	79180	50 %	0 %	50 %	0 %	407460233
1531	NC_018624	ATG	2	6	79261	79266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460233
1532	NC_018624	TAAG	2	8	79287	79294	50 %	25 %	25 %	0 %	407460233
1533	NC_018624	GGT	2	6	79321	79326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460234
1534	NC_018624	CCT	2	6	79339	79344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460234
1535	NC_018624	AGA	2	6	79407	79412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460234
1536	NC_018624	AAG	2	6	79535	79540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460234
1537	NC_018624	T	6	6	79543	79548	0 %	100 %	0 %	0 %	407460234
1538	NC_018624	GAA	2	6	79681	79686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460234
1539	NC_018624	AAG	2	6	79694	79699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460234
1540	NC_018624	A	7	7	79794	79800	100 %	0 %	0 %	0 %	407460234
1541	NC_018624	TCT	2	6	79910	79915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460234
1542	NC_018624	GTC	2	6	80001	80006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460234
1543	NC_018624	GCTGAT	2	12	80137	80148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407460234
1544	NC_018624	AC	3	6	80156	80161	50 %	0 %	0 %	50 %	407460234
1545	NC_018624	GAA	2	6	80212	80217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460234
1546	NC_018624	TTCT	2	8	80237	80244	0 %	75 %	0 %	25 %	407460234
1547	NC_018624	AC	3	6	80310	80315	50 %	0 %	0 %	50 %	407460234
1548	NC_018624	TTG	2	6	80360	80365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460234
1549	NC_018624	ACCT	2	8	80372	80379	25 %	25 %	0 %	50 %	407460234
1550	NC_018624	AGA	2	6	80385	80390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460234
1551	NC_018624	T	6	6	80448	80453	0 %	100 %	0 %	0 %	407460234
1552	NC_018624	CAAA	2	8	80464	80471	75 %	0 %	0 %	25 %	407460234
1553	NC_018624	ATG	2	6	80627	80632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460235
1554	NC_018624	TAT	2	6	80657	80662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460235
1555	NC_018624	TGA	2	6	80689	80694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460235
1556	NC_018624	TAA	2	6	80713	80718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460235
1557	NC_018624	A	6	6	80717	80722	100 %	0 %	0 %	0 %	407460235
1558	NC_018624	TTC	2	6	80761	80766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460235
1559	NC_018624	T	6	6	80814	80819	0 %	100 %	0 %	0 %	407460235
1560	NC_018624	CTT	2	6	80855	80860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460235
1561	NC_018624	TAT	2	6	80863	80868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460235
1562	NC_018624	GAAA	2	8	80939	80946	75 %	0 %	25 %	0 %	407460235
1563	NC_018624	TAAA	2	8	81012	81019	75 %	25 %	0 %	0 %	407460235
1564	NC_018624	TTC	2	6	81067	81072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460235
1565	NC_018624	ATG	2	6	81090	81095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460235
1566	NC_018624	TCT	3	9	81158	81166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460235
1567	NC_018624	AG	3	6	81199	81204	50 %	0 %	50 %	0 %	407460235
1568	NC_018624	GCT	2	6	81263	81268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460235
1569	NC_018624	AGAA	2	8	81286	81293	75 %	0 %	25 %	0 %	407460235
1570	NC_018624	TCA	2	6	81369	81374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460235
1571	NC_018624	CT	3	6	81379	81384	0 %	50 %	0 %	50 %	407460235
1572	NC_018624	TAT	2	6	81420	81425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460235
1573	NC_018624	GAAG	2	8	81484	81491	50 %	0 %	50 %	0 %	407460235
1574	NC_018624	GCT	2	6	81497	81502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460235
1575	NC_018624	TTC	2	6	81522	81527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460235
1576	NC_018624	CGTAT	2	10	81530	81539	20 %	40 %	20 %	20 %	407460235
1577	NC_018624	AGA	2	6	81541	81546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460235
1578	NC_018624	GAA	2	6	81597	81602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460235
1579	NC_018624	ATG	2	6	81644	81649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460235
1580	NC_018624	TGC	2	6	81654	81659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460235
1581	NC_018624	A	7	7	81707	81713	100 %	0 %	0 %	0 %	407460235
1582	NC_018624	AC	3	6	81726	81731	50 %	0 %	0 %	50 %	407460235
1583	NC_018624	GCA	2	6	81748	81753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460235
1584	NC_018624	A	6	6	81770	81775	100 %	0 %	0 %	0 %	407460235
1585	NC_018624	TGT	2	6	81794	81799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460236
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1587	NC_018624	T	6	6	81856	81861	0 %	100 %	0 %	0 %	407460236
1588	NC_018624	CAA	2	6	81879	81884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460236
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1590	NC_018624	CAT	2	6	81918	81923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460236
1591	NC_018624	AC	3	6	81928	81933	50 %	0 %	0 %	50 %	407460236
1592	NC_018624	ACA	2	6	81995	82000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460236
1593	NC_018624	GT	3	6	82042	82047	0 %	50 %	50 %	0 %	407460236
1594	NC_018624	TTC	2	6	82054	82059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460236
1595	NC_018624	CGG	2	6	82065	82070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407460236
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1597	NC_018624	GAT	2	6	82152	82157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460236
1598	NC_018624	TGA	2	6	82205	82210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460236
1599	NC_018624	AGA	2	6	82229	82234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460236
1600	NC_018624	AC	3	6	82306	82311	50 %	0 %	0 %	50 %	407460236
1601	NC_018624	GAA	2	6	82312	82317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460236
1602	NC_018624	GCA	2	6	82409	82414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460236
1603	NC_018624	GCA	2	6	82419	82424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460236
1604	NC_018624	A	6	6	82465	82470	100 %	0 %	0 %	0 %	407460236
1605	NC_018624	TGG	2	6	82529	82534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460236
1606	NC_018624	CAT	2	6	82563	82568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460236
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1608	NC_018624	A	6	6	82670	82675	100 %	0 %	0 %	0 %	407460236
1609	NC_018624	GTT	2	6	82692	82697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460236
1610	NC_018624	CGT	2	6	82728	82733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460236
1611	NC_018624	GAAAA	2	10	82740	82749	80 %	0 %	20 %	0 %	407460236
1612	NC_018624	ACT	2	6	82766	82771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460236
1613	NC_018624	TG	3	6	82785	82790	0 %	50 %	50 %	0 %	407460236
1614	NC_018624	AAAG	2	8	82792	82799	75 %	0 %	25 %	0 %	407460236
1615	NC_018624	TC	3	6	82860	82865	0 %	50 %	0 %	50 %	407460236
1616	NC_018624	GAA	2	6	82872	82877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460236
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1622	NC_018624	TCT	2	6	83223	83228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460237
1623	NC_018624	ACT	2	6	83232	83237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460237
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1625	NC_018624	TAT	2	6	83476	83481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460238
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1627	NC_018624	TTG	2	6	83723	83728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460238
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1998	NC_018624	CTCTTC	2	12	103770	103781	0 %	50 %	0 %	50 %	407460258
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