MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 22186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018624	GAA	3	9	49948	49956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460209
1002	NC_018624	GC	3	6	49974	49979	0 %	0 %	50 %	50 %	407460209
1003	NC_018624	A	6	6	50020	50025	100 %	0 %	0 %	0 %	407460209
1004	NC_018624	AGA	2	6	50031	50036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460209
1005	NC_018624	AAG	3	9	50057	50065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460209
1006	NC_018624	AAC	2	6	50126	50131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460209
1007	NC_018624	CAA	2	6	50165	50170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460209
1008	NC_018624	AAG	3	9	50171	50179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460209
1009	NC_018624	TTA	2	6	50272	50277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460209
1010	NC_018624	TC	3	6	50379	50384	0 %	50 %	0 %	50 %	407460209
1011	NC_018624	TGT	2	6	50526	50531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460209
1012	NC_018624	TA	3	6	50552	50557	50 %	50 %	0 %	0 %	407460209
1013	NC_018624	ATT	2	6	50584	50589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460209
1014	NC_018624	ATG	2	6	50606	50611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460209
1015	NC_018624	AGC	2	6	50694	50699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460209
1016	NC_018624	TCC	2	6	50863	50868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460209
1017	NC_018624	AACA	2	8	50877	50884	75 %	0 %	0 %	25 %	407460209
1018	NC_018624	ACT	2	6	50895	50900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460209
1019	NC_018624	GAT	2	6	50938	50943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460209
1020	NC_018624	GCA	2	6	50956	50961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460209
1021	NC_018624	ATC	2	6	50970	50975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460209
1022	NC_018624	TCA	2	6	51107	51112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460209
1023	NC_018624	AAT	2	6	51145	51150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460209
1024	NC_018624	AGT	2	6	51189	51194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460209
1025	NC_018624	TGA	2	6	51309	51314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460209
1026	NC_018624	CCT	2	6	51388	51393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460209
1027	NC_018624	ATG	2	6	51457	51462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460209
1028	NC_018624	TTTGG	2	10	51478	51487	0 %	60 %	40 %	0 %	407460209
1029	NC_018624	CTC	2	6	51544	51549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460209
1030	NC_018624	CAA	2	6	51616	51621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460209
1031	NC_018624	CAT	2	6	51623	51628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460209
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1033	NC_018624	AAC	2	6	51657	51662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460209
1034	NC_018624	ATT	2	6	51670	51675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460209
1035	NC_018624	TTG	3	9	51731	51739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460209
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1040	NC_018624	TTA	2	6	52034	52039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460209
1041	NC_018624	CAA	2	6	52068	52073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460209
1042	NC_018624	TGA	2	6	52101	52106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460209
1043	NC_018624	C	6	6	52152	52157	0 %	0 %	0 %	100 %	407460209
1044	NC_018624	GAAG	2	8	52724	52731	50 %	0 %	50 %	0 %	407460210
1045	NC_018624	CCT	2	6	52734	52739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460210
1046	NC_018624	T	6	6	52746	52751	0 %	100 %	0 %	0 %	407460210
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1049	NC_018624	TGC	2	6	52824	52829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460210
1050	NC_018624	AGG	2	6	52843	52848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460210
1051	NC_018624	CTT	2	6	52920	52925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460211
1052	NC_018624	TTA	2	6	52937	52942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460211
1053	NC_018624	GTT	2	6	52950	52955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460211
1054	NC_018624	ACG	2	6	52975	52980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460211
1055	NC_018624	TGT	2	6	53013	53018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460211
1056	NC_018624	ATCC	2	8	53030	53037	25 %	25 %	0 %	50 %	407460211
1057	NC_018624	GT	3	6	53104	53109	0 %	50 %	50 %	0 %	407460211
1058	NC_018624	T	6	6	53138	53143	0 %	100 %	0 %	0 %	407460211
1059	NC_018624	CTT	2	6	53170	53175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460211
1060	NC_018624	T	6	6	53174	53179	0 %	100 %	0 %	0 %	407460211
1061	NC_018624	TTC	2	6	53239	53244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460211
1062	NC_018624	AT	3	6	53291	53296	50 %	50 %	0 %	0 %	407460211
1063	NC_018624	AGCA	2	8	53322	53329	50 %	0 %	25 %	25 %	407460211
1064	NC_018624	AAT	2	6	53347	53352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460211
1065	NC_018624	TTCA	2	8	53482	53489	25 %	50 %	0 %	25 %	407460211
1066	NC_018624	A	6	6	53660	53665	100 %	0 %	0 %	0 %	407460211
1067	NC_018624	TCA	2	6	53726	53731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460211
1068	NC_018624	T	6	6	53782	53787	0 %	100 %	0 %	0 %	407460211
1069	NC_018624	CGT	2	6	53845	53850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460211
1070	NC_018624	AGG	2	6	53872	53877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460211
1071	NC_018624	AAG	2	6	53902	53907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460211
1072	NC_018624	GAA	2	6	53919	53924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460211
1073	NC_018624	T	6	6	53940	53945	0 %	100 %	0 %	0 %	407460212
1074	NC_018624	CAG	2	6	53971	53976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460212
1075	NC_018624	AGG	2	6	54039	54044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460212
1076	NC_018624	CGC	2	6	54056	54061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407460212
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1079	NC_018624	TCA	2	6	54207	54212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460212
1080	NC_018624	CAG	2	6	54259	54264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460212
1081	NC_018624	TGT	2	6	54286	54291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460212
1082	NC_018624	GTA	2	6	54299	54304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460212
1083	NC_018624	CATA	2	8	54330	54337	50 %	25 %	0 %	25 %	407460212
1084	NC_018624	CTTATC	2	12	54350	54361	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407460212
1085	NC_018624	TTG	2	6	54379	54384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460212
1086	NC_018624	CTT	2	6	54855	54860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460213
1087	NC_018624	TCG	2	6	54875	54880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460213
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1089	NC_018624	TCT	2	6	54941	54946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460213
1090	NC_018624	T	7	7	54961	54967	0 %	100 %	0 %	0 %	407460213
1091	NC_018624	CTT	2	6	55014	55019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460213
1092	NC_018624	ACG	2	6	55027	55032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460213
1093	NC_018624	TAA	2	6	55041	55046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460213
1094	NC_018624	CTG	2	6	55062	55067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460213
1095	NC_018624	AAATTT	2	12	55118	55129	50 %	50 %	0 %	0 %	407460213
1096	NC_018624	GCA	2	6	55130	55135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460213
1097	NC_018624	ATA	2	6	55136	55141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460213
1098	NC_018624	CTA	2	6	55272	55277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460213
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1100	NC_018624	AGC	2	6	55336	55341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460213
1101	NC_018624	TTTTC	2	10	55347	55356	0 %	80 %	0 %	20 %	407460213
1102	NC_018624	TCA	2	6	55413	55418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460214
1103	NC_018624	AG	3	6	55434	55439	50 %	0 %	50 %	0 %	407460214
1104	NC_018624	GCT	2	6	55662	55667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460214
1105	NC_018624	GTT	2	6	55677	55682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460214
1106	NC_018624	CTT	2	6	55738	55743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460214
1107	NC_018624	GAG	2	6	55753	55758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460214
1108	NC_018624	TAA	2	6	55799	55804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460214
1109	NC_018624	TCA	2	6	55815	55820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460214
1110	NC_018624	TAGC	2	8	55861	55868	25 %	25 %	25 %	25 %	407460214
1111	NC_018624	CAG	2	6	55882	55887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460214
1112	NC_018624	TTG	2	6	55913	55918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460214
1113	NC_018624	TGA	2	6	55930	55935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460214
1114	NC_018624	CTGT	2	8	56040	56047	0 %	50 %	25 %	25 %	407460214
1115	NC_018624	AG	4	8	56048	56055	50 %	0 %	50 %	0 %	407460214
1116	NC_018624	TAG	2	6	56237	56242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460215
1117	NC_018624	GAA	2	6	56255	56260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460215
1118	NC_018624	TGA	2	6	56278	56283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460215
1119	NC_018624	GAA	2	6	56322	56327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460215
1120	NC_018624	CTT	2	6	56332	56337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460215
1121	NC_018624	GCT	2	6	56394	56399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460215
1122	NC_018624	CTTT	2	8	56430	56437	0 %	75 %	0 %	25 %	407460215
1123	NC_018624	AGAA	2	8	56450	56457	75 %	0 %	25 %	0 %	407460215
1124	NC_018624	GTT	2	6	56514	56519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460215
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