MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 22186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018624	AGC	2	6	265699	265704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460425
5002	NC_018624	TGT	2	6	265735	265740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460425
5003	NC_018624	GGC	2	6	265942	265947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407460425
5004	NC_018624	ATT	2	6	266032	266037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460425
5005	NC_018624	A	6	6	266090	266095	100 %	0 %	0 %	0 %	407460425
5006	NC_018624	AGCAG	2	10	266144	266153	40 %	0 %	40 %	20 %	407460425
5007	NC_018624	AAG	2	6	266172	266177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460425
5008	NC_018624	GCAG	2	8	266318	266325	25 %	0 %	50 %	25 %	407460425
5009	NC_018624	ATGT	2	8	266406	266413	25 %	50 %	25 %	0 %	407460425
5010	NC_018624	AGG	2	6	266421	266426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460425
5011	NC_018624	ATA	2	6	266447	266452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460425
5012	NC_018624	TTC	2	6	266544	266549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460425
5013	NC_018624	AGG	3	9	266877	266885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460426
5014	NC_018624	CGTGG	2	10	266902	266911	0 %	20 %	60 %	20 %	407460426
5015	NC_018624	G	6	6	266910	266915	0 %	0 %	100 %	0 %	407460426
5016	NC_018624	AAG	2	6	266925	266930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460426
5017	NC_018624	GTAA	2	8	266989	266996	50 %	25 %	25 %	0 %	407460426
5018	NC_018624	CAAG	2	8	267135	267142	50 %	0 %	25 %	25 %	407460426
5019	NC_018624	AAGAT	2	10	267158	267167	60 %	20 %	20 %	0 %	407460426
5020	NC_018624	AAGA	2	8	267196	267203	75 %	0 %	25 %	0 %	407460426
5021	NC_018624	AAG	2	6	267248	267253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460426
5022	NC_018624	CTG	2	6	267278	267283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460426
5023	NC_018624	CAA	2	6	267451	267456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460426
5024	NC_018624	GA	3	6	267463	267468	50 %	0 %	50 %	0 %	407460426
5025	NC_018624	AAC	2	6	267512	267517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460426
5026	NC_018624	AAG	2	6	267538	267543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460426
5027	NC_018624	TATT	2	8	268065	268072	25 %	75 %	0 %	0 %	407460427
5028	NC_018624	A	6	6	268142	268147	100 %	0 %	0 %	0 %	407460427
5029	NC_018624	GTT	2	6	268200	268205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460427
5030	NC_018624	T	6	6	268243	268248	0 %	100 %	0 %	0 %	407460427
5031	NC_018624	GTT	2	6	268265	268270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460427
5032	NC_018624	TCT	2	6	268293	268298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460427
5033	NC_018624	TTA	2	6	268341	268346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460427
5034	NC_018624	AGA	2	6	268417	268422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460427
5035	NC_018624	AAG	2	6	268476	268481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460427
5036	NC_018624	GTT	2	6	268577	268582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460427
5037	NC_018624	TGG	2	6	268609	268614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460427
5038	NC_018624	T	6	6	268689	268694	0 %	100 %	0 %	0 %	407460427
5039	NC_018624	ATC	2	6	268710	268715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460427
5040	NC_018624	TCTT	2	8	268807	268814	0 %	75 %	0 %	25 %	407460427
5041	NC_018624	TGA	2	6	268873	268878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460427
5042	NC_018624	TA	4	8	268983	268990	50 %	50 %	0 %	0 %	407460427
5043	NC_018624	GAA	2	6	269078	269083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460427
5044	NC_018624	ATT	2	6	269223	269228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460427
5045	NC_018624	AGG	2	6	269285	269290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460428
5046	NC_018624	AT	3	6	269322	269327	50 %	50 %	0 %	0 %	407460428
5047	NC_018624	GAA	2	6	269358	269363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460428
5048	NC_018624	GGTT	2	8	269401	269408	0 %	50 %	50 %	0 %	407460428
5049	NC_018624	TTGGT	2	10	269421	269430	0 %	60 %	40 %	0 %	407460428
5050	NC_018624	TC	4	8	269446	269453	0 %	50 %	0 %	50 %	407460428
5051	NC_018624	GCA	2	6	269460	269465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460428
5052	NC_018624	AGG	2	6	269489	269494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460428
5053	NC_018624	T	6	6	269495	269500	0 %	100 %	0 %	0 %	407460428
5054	NC_018624	GAG	2	6	269610	269615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460428
5055	NC_018624	TGTA	2	8	269637	269644	25 %	50 %	25 %	0 %	407460428
5056	NC_018624	AG	3	6	269702	269707	50 %	0 %	50 %	0 %	407460428
5057	NC_018624	TCC	3	9	269756	269764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460428
5058	NC_018624	ATG	2	6	269769	269774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460428
5059	NC_018624	GGA	2	6	269790	269795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460428
5060	NC_018624	AAT	2	6	269841	269846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460428
5061	NC_018624	TCT	2	6	269856	269861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460428
5062	NC_018624	TAG	2	6	270123	270128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460428
5063	NC_018624	AAG	3	9	270163	270171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460428
5064	NC_018624	GA	3	6	270181	270186	50 %	0 %	50 %	0 %	407460428
5065	NC_018624	AAG	2	6	270231	270236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460428
5066	NC_018624	GTT	2	6	270247	270252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460428
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5068	NC_018624	AAAT	2	8	270367	270374	75 %	25 %	0 %	0 %	407460428
5069	NC_018624	GTT	2	6	270402	270407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460428
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5073	NC_018624	TGT	2	6	270609	270614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460428
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5076	NC_018624	GTC	2	6	270869	270874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460428
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5079	NC_018624	GTA	3	9	271084	271092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460428
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5082	NC_018624	GTAT	2	8	271253	271260	25 %	50 %	25 %	0 %	407460428
5083	NC_018624	CGT	2	6	271312	271317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460428
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5089	NC_018624	TG	4	8	271639	271646	0 %	50 %	50 %	0 %	407460429
5090	NC_018624	A	6	6	271674	271679	100 %	0 %	0 %	0 %	407460429
5091	NC_018624	CAC	2	6	271688	271693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460429
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5100	NC_018624	TGGCA	2	10	272058	272067	20 %	20 %	40 %	20 %	407460429
5101	NC_018624	T	8	8	272078	272085	0 %	100 %	0 %	0 %	407460429
5102	NC_018624	GGT	2	6	272087	272092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460429
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5105	NC_018624	GAA	2	6	272234	272239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460429
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5109	NC_018624	A	6	6	272479	272484	100 %	0 %	0 %	0 %	407460430
5110	NC_018624	ATT	2	6	272548	272553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460430
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5112	NC_018624	TGT	2	6	272791	272796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460431
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5114	NC_018624	CAA	2	6	272949	272954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460431
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5119	NC_018624	TGC	2	6	273203	273208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460431
5120	NC_018624	GAA	2	6	273222	273227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460431
5121	NC_018624	TCCT	2	8	273229	273236	0 %	50 %	0 %	50 %	407460431
5122	NC_018624	TC	3	6	273303	273308	0 %	50 %	0 %	50 %	407460431
5123	NC_018624	TCTAGA	2	12	273330	273341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407460431
5124	NC_018624	AAG	2	6	273346	273351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460431
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5137	NC_018624	TGCT	2	8	273961	273968	0 %	50 %	25 %	25 %	407460431
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5230	NC_018624	AG	3	6	278332	278337	50 %	0 %	50 %	0 %	407460437
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5233	NC_018624	TAA	2	6	278468	278473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460437
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5237	NC_018624	TTG	2	6	278594	278599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460437
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5239	NC_018624	TGC	2	6	278633	278638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460437
5240	NC_018624	GTAA	2	8	278658	278665	50 %	25 %	25 %	0 %	407460437
5241	NC_018624	GAA	3	9	278684	278692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460437
5242	NC_018624	AATCC	2	10	278746	278755	40 %	20 %	0 %	40 %	407460437
5243	NC_018624	TCA	2	6	278773	278778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460437
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5368	NC_018624	CTT	2	6	285413	285418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460443
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5477	NC_018624	AAGA	2	8	290833	290840	75 %	0 %	25 %	0 %	407460446
5478	NC_018624	ATAGAA	2	12	290842	290853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407460446
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5485	NC_018624	G	6	6	291207	291212	0 %	0 %	100 %	0 %	407460446
5486	NC_018624	GAA	2	6	291298	291303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460446
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5489	NC_018624	AG	3	6	291520	291525	50 %	0 %	50 %	0 %	407460446
5490	NC_018624	ACT	2	6	291545	291550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460446
5491	NC_018624	AGA	2	6	291585	291590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460446
5492	NC_018624	TCG	2	6	291596	291601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460446
5493	NC_018624	CGA	2	6	291612	291617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460446
5494	NC_018624	CATA	2	8	291858	291865	50 %	25 %	0 %	25 %	407460447
5495	NC_018624	AGG	2	6	291894	291899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460447
5496	NC_018624	CTC	2	6	291914	291919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460447
5497	NC_018624	GAT	3	9	291928	291936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460447
5498	NC_018624	AGA	2	6	292017	292022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460447
5499	NC_018624	ATC	2	6	292086	292091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460447
5500	NC_018624	AGG	2	6	292104	292109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460447

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