MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 22186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018624	T	6	6	240611	240616	0 %	100 %	0 %	0 %	407460399
4502	NC_018624	AAAT	2	8	240630	240637	75 %	25 %	0 %	0 %	407460399
4503	NC_018624	TCT	2	6	240680	240685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460399
4504	NC_018624	GAG	2	6	240711	240716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460399
4505	NC_018624	CTT	2	6	240719	240724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460399
4506	NC_018624	CGT	2	6	241129	241134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460400
4507	NC_018624	GAA	2	6	241166	241171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460400
4508	NC_018624	ATC	2	6	241213	241218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460400
4509	NC_018624	TAT	2	6	241250	241255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
4510	NC_018624	GAG	2	6	241265	241270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460400
4511	NC_018624	GAT	2	6	241289	241294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
4512	NC_018624	TTCAG	2	10	241319	241328	20 %	40 %	20 %	20 %	407460400
4513	NC_018624	TTG	2	6	241394	241399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460400
4514	NC_018624	CAT	2	6	241511	241516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460400
4515	NC_018624	ATT	2	6	241521	241526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
4516	NC_018624	GTTT	2	8	241632	241639	0 %	75 %	25 %	0 %	407460400
4517	NC_018624	AGG	2	6	241658	241663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460400
4518	NC_018624	TG	3	6	241716	241721	0 %	50 %	50 %	0 %	407460400
4519	NC_018624	ATT	2	6	241756	241761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
4520	NC_018624	TTC	2	6	241817	241822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460400
4521	NC_018624	AGA	2	6	241830	241835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460400
4522	NC_018624	TGA	2	6	241865	241870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
4523	NC_018624	TTG	2	6	241915	241920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460400
4524	NC_018624	CGG	2	6	241922	241927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407460400
4525	NC_018624	TTG	2	6	241933	241938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460400
4526	NC_018624	ATT	2	6	241968	241973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
4527	NC_018624	ATG	2	6	242038	242043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
4528	NC_018624	ATG	2	6	242070	242075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
4529	NC_018624	GCA	2	6	242100	242105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460400
4530	NC_018624	AAG	2	6	242122	242127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460400
4531	NC_018624	A	6	6	242145	242150	100 %	0 %	0 %	0 %	407460400
4532	NC_018624	TCA	2	6	242156	242161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460400
4533	NC_018624	GCTT	2	8	242215	242222	0 %	50 %	25 %	25 %	407460400
4534	NC_018624	AT	3	6	242296	242301	50 %	50 %	0 %	0 %	407460400
4535	NC_018624	TGA	2	6	242420	242425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
4536	NC_018624	GAA	2	6	242430	242435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460400
4537	NC_018624	ATT	2	6	242445	242450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
4538	NC_018624	TGA	2	6	242489	242494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
4539	NC_018624	GAA	2	6	242538	242543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460400
4540	NC_018624	TTA	2	6	242565	242570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
4541	NC_018624	TTTAG	2	10	242609	242618	20 %	60 %	20 %	0 %	407460400
4542	NC_018624	AG	3	6	242679	242684	50 %	0 %	50 %	0 %	407460401
4543	NC_018624	T	7	7	242710	242716	0 %	100 %	0 %	0 %	407460401
4544	NC_018624	GCA	2	6	242740	242745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460401
4545	NC_018624	TAAT	2	8	242807	242814	50 %	50 %	0 %	0 %	407460401
4546	NC_018624	ATG	2	6	242866	242871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460401
4547	NC_018624	ACT	2	6	242884	242889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460401
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4549	NC_018624	CGT	2	6	242950	242955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460401
4550	NC_018624	G	6	6	243001	243006	0 %	0 %	100 %	0 %	407460401
4551	NC_018624	TTTA	2	8	243083	243090	25 %	75 %	0 %	0 %	407460401
4552	NC_018624	ATCG	2	8	243130	243137	25 %	25 %	25 %	25 %	407460401
4553	NC_018624	AAT	2	6	243280	243285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460402
4554	NC_018624	TTC	2	6	243330	243335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460402
4555	NC_018624	CTT	2	6	243336	243341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460402
4556	NC_018624	CTG	2	6	243345	243350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460402
4557	NC_018624	TTA	2	6	243360	243365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460402
4558	NC_018624	ATG	2	6	243372	243377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460402
4559	NC_018624	TG	3	6	243396	243401	0 %	50 %	50 %	0 %	407460402
4560	NC_018624	GTTGT	2	10	243414	243423	0 %	60 %	40 %	0 %	407460402
4561	NC_018624	A	6	6	243446	243451	100 %	0 %	0 %	0 %	407460402
4562	NC_018624	GGTA	2	8	243479	243486	25 %	25 %	50 %	0 %	407460402
4563	NC_018624	GTT	2	6	243515	243520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460402
4564	NC_018624	CA	4	8	243567	243574	50 %	0 %	0 %	50 %	407460402
4565	NC_018624	TTG	2	6	243627	243632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460402
4566	NC_018624	AG	3	6	243788	243793	50 %	0 %	50 %	0 %	407460402
4567	NC_018624	GCG	2	6	243824	243829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407460402
4568	NC_018624	GT	3	6	243924	243929	0 %	50 %	50 %	0 %	407460402
4569	NC_018624	AAAG	2	8	243950	243957	75 %	0 %	25 %	0 %	407460402
4570	NC_018624	TTA	2	6	244135	244140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460403
4571	NC_018624	TTTA	2	8	244193	244200	25 %	75 %	0 %	0 %	407460403
4572	NC_018624	AAG	2	6	244247	244252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460403
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4574	NC_018624	A	6	6	244361	244366	100 %	0 %	0 %	0 %	407460403
4575	NC_018624	GCA	2	6	244476	244481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460403
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4578	NC_018624	GAA	2	6	244552	244557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460403
4579	NC_018624	GTT	2	6	244647	244652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460403
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4581	NC_018624	TTTCCT	2	12	244800	244811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460403
4582	NC_018624	GAA	3	9	244864	244872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460403
4583	NC_018624	GA	3	6	244936	244941	50 %	0 %	50 %	0 %	407460403
4584	NC_018624	TTC	2	6	245002	245007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460403
4585	NC_018624	GAC	3	9	245014	245022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460403
4586	NC_018624	TGA	2	6	245028	245033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460403
4587	NC_018624	AGCT	2	8	245138	245145	25 %	25 %	25 %	25 %	407460404
4588	NC_018624	T	7	7	245149	245155	0 %	100 %	0 %	0 %	407460404
4589	NC_018624	GTT	2	6	245184	245189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460404
4590	NC_018624	GAG	2	6	245334	245339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460404
4591	NC_018624	TTTAGG	2	12	245407	245418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407460404
4592	NC_018624	CTC	2	6	245461	245466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460404
4593	NC_018624	TAAAAG	2	12	245499	245510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407460404
4594	NC_018624	GTT	2	6	245526	245531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460404
4595	NC_018624	ATG	2	6	245689	245694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460404
4596	NC_018624	AGATA	2	10	245704	245713	60 %	20 %	20 %	0 %	407460404
4597	NC_018624	TTATC	2	10	245718	245727	20 %	60 %	0 %	20 %	407460404
4598	NC_018624	TTG	2	6	245771	245776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460404
4599	NC_018624	TAG	2	6	245782	245787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460404
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4601	NC_018624	AGT	2	6	245854	245859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460405
4602	NC_018624	GCT	2	6	245913	245918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460405
4603	NC_018624	AG	3	6	245943	245948	50 %	0 %	50 %	0 %	407460405
4604	NC_018624	CTT	2	6	245959	245964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460405
4605	NC_018624	GAT	2	6	245986	245991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460405
4606	NC_018624	CAT	2	6	246145	246150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460405
4607	NC_018624	ATT	2	6	246219	246224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460405
4608	NC_018624	CTTT	2	8	246234	246241	0 %	75 %	0 %	25 %	407460405
4609	NC_018624	AGC	2	6	246245	246250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460405
4610	NC_018624	ATGG	2	8	246352	246359	25 %	25 %	50 %	0 %	407460405
4611	NC_018624	TAA	2	6	246362	246367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460405
4612	NC_018624	AAG	2	6	246407	246412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460405
4613	NC_018624	T	7	7	246562	246568	0 %	100 %	0 %	0 %	407460406
4614	NC_018624	AGA	2	6	246613	246618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460406
4615	NC_018624	TG	3	6	246647	246652	0 %	50 %	50 %	0 %	407460406
4616	NC_018624	G	6	6	246779	246784	0 %	0 %	100 %	0 %	407460406
4617	NC_018624	TGA	2	6	246788	246793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460406
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4620	NC_018624	ATC	2	6	246880	246885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460406
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4622	NC_018624	TCA	2	6	247052	247057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460406
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4725	NC_018624	T	6	6	252458	252463	0 %	100 %	0 %	0 %	407460414
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4738	NC_018624	T	6	6	253168	253173	0 %	100 %	0 %	0 %	407460415
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4741	NC_018624	ATGC	2	8	253502	253509	25 %	25 %	25 %	25 %	407460415
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