MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 21902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_018623	CAC	4	12	78312	78323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458862
1503	NC_018623	CTT	2	6	78330	78335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458862
1504	NC_018623	GCT	2	6	78404	78409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458862
1505	NC_018623	AGT	2	6	78416	78421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458862
1506	NC_018623	CTC	2	6	78447	78452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458862
1507	NC_018623	AGG	2	6	78463	78468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458862
1508	NC_018623	TCT	2	6	78506	78511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458862
1509	NC_018623	AGT	2	6	78545	78550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458862
1510	NC_018623	CAC	2	6	78608	78613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458862
1511	NC_018623	GA	3	6	78655	78660	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
1512	NC_018623	AAC	2	6	78678	78683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458862
1513	NC_018623	ACAG	2	8	78715	78722	50 %	0 %	25 %	25 %	407458862
1514	NC_018623	CAA	2	6	78758	78763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458862
1515	NC_018623	GA	3	6	78846	78851	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
1516	NC_018623	CTT	2	6	78881	78886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458862
1517	NC_018623	GAA	2	6	78986	78991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458862
1518	NC_018623	AG	3	6	79046	79051	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
1519	NC_018623	AATTC	2	10	79166	79175	40 %	40 %	0 %	20 %	407458862
1520	NC_018623	AG	3	6	79180	79185	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
1521	NC_018623	AAC	2	6	79246	79251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458862
1522	NC_018623	TAAG	2	8	79292	79299	50 %	25 %	25 %	0 %	407458862
1523	NC_018623	CCT	2	6	79344	79349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458863
1524	NC_018623	GAT	2	6	79398	79403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458863
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1527	NC_018623	AGGT	2	8	79631	79638	25 %	25 %	50 %	0 %	407458863
1528	NC_018623	GAA	2	6	79686	79691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458863
1529	NC_018623	A	7	7	79799	79805	100 %	0 %	0 %	0 %	407458863
1530	NC_018623	TCT	2	6	79812	79817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458863
1531	NC_018623	TCT	2	6	79915	79920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458863
1532	NC_018623	AAT	2	6	79932	79937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458863
1533	NC_018623	AAC	2	6	79952	79957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458863
1534	NC_018623	GTC	2	6	80006	80011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458863
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1536	NC_018623	GAA	2	6	80217	80222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458863
1537	NC_018623	TTCT	2	8	80242	80249	0 %	75 %	0 %	25 %	407458863
1538	NC_018623	ATC	2	6	80337	80342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458863
1539	NC_018623	TTG	2	6	80365	80370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458863
1540	NC_018623	CTT	2	6	80383	80388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458863
1541	NC_018623	AGA	2	6	80390	80395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458863
1542	NC_018623	CAAA	2	8	80469	80476	75 %	0 %	0 %	25 %	407458863
1543	NC_018623	ATG	2	6	80640	80645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458864
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1545	NC_018623	TAA	2	6	80726	80731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458864
1546	NC_018623	A	6	6	80730	80735	100 %	0 %	0 %	0 %	407458864
1547	NC_018623	T	6	6	80827	80832	0 %	100 %	0 %	0 %	407458864
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1549	NC_018623	TAT	2	6	80876	80881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458864
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1551	NC_018623	GAAA	2	8	80952	80959	75 %	0 %	25 %	0 %	407458864
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1553	NC_018623	AACGCC	2	12	81010	81021	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407458864
1554	NC_018623	TAAA	2	8	81025	81032	75 %	25 %	0 %	0 %	407458864
1555	NC_018623	TTC	2	6	81080	81085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458864
1556	NC_018623	ATG	2	6	81103	81108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458864
1557	NC_018623	TCT	3	9	81171	81179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458864
1558	NC_018623	AG	3	6	81212	81217	50 %	0 %	50 %	0 %	407458864
1559	NC_018623	GCT	2	6	81276	81281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458864
1560	NC_018623	AGAA	2	8	81299	81306	75 %	0 %	25 %	0 %	407458864
1561	NC_018623	CT	3	6	81392	81397	0 %	50 %	0 %	50 %	407458864
1562	NC_018623	TAT	2	6	81433	81438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458864
1563	NC_018623	GAAG	2	8	81497	81504	50 %	0 %	50 %	0 %	407458864
1564	NC_018623	GCT	2	6	81510	81515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458864
1565	NC_018623	TTC	2	6	81535	81540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458864
1566	NC_018623	CGTAT	2	10	81543	81552	20 %	40 %	20 %	20 %	407458864
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1569	NC_018623	ATG	2	6	81657	81662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458864
1570	NC_018623	TGC	2	6	81667	81672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458864
1571	NC_018623	A	7	7	81720	81726	100 %	0 %	0 %	0 %	407458864
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1573	NC_018623	GCA	2	6	81761	81766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458864
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1582	NC_018623	GAT	2	6	82165	82170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458865
1583	NC_018623	TGA	2	6	82218	82223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458865
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1585	NC_018623	AC	3	6	82319	82324	50 %	0 %	0 %	50 %	407458865
1586	NC_018623	GAA	2	6	82325	82330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458865
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1591	NC_018623	CAT	2	6	82576	82581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458865
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1593	NC_018623	A	6	6	82683	82688	100 %	0 %	0 %	0 %	407458865
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1597	NC_018623	ACT	2	6	82779	82784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458865
1598	NC_018623	TG	3	6	82798	82803	0 %	50 %	50 %	0 %	407458865
1599	NC_018623	AAAG	2	8	82805	82812	75 %	0 %	25 %	0 %	407458865
1600	NC_018623	TACGT	2	10	82829	82838	20 %	40 %	20 %	20 %	407458865
1601	NC_018623	CT	4	8	82872	82879	0 %	50 %	0 %	50 %	407458865
1602	NC_018623	GAA	2	6	82885	82890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458865
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1604	NC_018623	CAC	2	6	82950	82955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458865
1605	NC_018623	CAA	2	6	83145	83150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458866
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1607	NC_018623	TGT	2	6	83230	83235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458866
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1609	NC_018623	ACT	2	6	83245	83250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458866
1610	NC_018623	AAG	2	6	83273	83278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458866
1611	NC_018623	GTA	2	6	83314	83319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458866
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1613	NC_018623	TAT	2	6	83488	83493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458867
1614	NC_018623	TTG	2	6	83735	83740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458867
1615	NC_018623	AG	3	6	83754	83759	50 %	0 %	50 %	0 %	407458867
1616	NC_018623	ATA	2	6	83796	83801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458867
1617	NC_018623	GGA	2	6	83869	83874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458867
1618	NC_018623	T	6	6	83994	83999	0 %	100 %	0 %	0 %	407458867
1619	NC_018623	TGT	2	6	84033	84038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458867
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1621	NC_018623	AGG	2	6	84060	84065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458867
1622	NC_018623	GTA	2	6	84066	84071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458867
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1625	NC_018623	ATA	2	6	84205	84210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458867
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