MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 21902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018623	CAA	2	6	50163	50168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458838
1002	NC_018623	AAG	3	9	50169	50177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458838
1003	NC_018623	TTA	2	6	50270	50275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458838
1004	NC_018623	TC	3	6	50377	50382	0 %	50 %	0 %	50 %	407458838
1005	NC_018623	TGT	2	6	50524	50529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458838
1006	NC_018623	GT	3	6	50538	50543	0 %	50 %	50 %	0 %	407458838
1007	NC_018623	TA	3	6	50550	50555	50 %	50 %	0 %	0 %	407458838
1008	NC_018623	ATT	2	6	50582	50587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458838
1009	NC_018623	ATG	2	6	50604	50609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458838
1010	NC_018623	AGC	2	6	50692	50697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458838
1011	NC_018623	AACA	2	8	50875	50882	75 %	0 %	0 %	25 %	407458838
1012	NC_018623	ACT	2	6	50893	50898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458838
1013	NC_018623	GAT	2	6	50936	50941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458838
1014	NC_018623	GCA	2	6	50954	50959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458838
1015	NC_018623	ATC	2	6	50968	50973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458838
1016	NC_018623	TCA	2	6	51105	51110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458838
1017	NC_018623	AAT	2	6	51143	51148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458838
1018	NC_018623	AGT	2	6	51187	51192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458838
1019	NC_018623	TGA	2	6	51307	51312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458838
1020	NC_018623	CCT	2	6	51386	51391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458838
1021	NC_018623	ATG	2	6	51455	51460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458838
1022	NC_018623	TTTGG	2	10	51476	51485	0 %	60 %	40 %	0 %	407458838
1023	NC_018623	CTC	2	6	51542	51547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458838
1024	NC_018623	CAA	2	6	51614	51619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458838
1025	NC_018623	CAT	2	6	51621	51626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458838
1026	NC_018623	TTG	2	6	51630	51635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458838
1027	NC_018623	AAC	2	6	51655	51660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458838
1028	NC_018623	ATT	2	6	51668	51673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458838
1029	NC_018623	TTG	3	9	51729	51737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458838
1030	NC_018623	GTT	2	6	51761	51766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458838
1031	NC_018623	AACA	2	8	51780	51787	75 %	0 %	0 %	25 %	407458838
1032	NC_018623	GTT	2	6	51873	51878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458838
1033	NC_018623	CAG	2	6	51973	51978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458838
1034	NC_018623	ATG	2	6	52010	52015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458838
1035	NC_018623	TTA	2	6	52032	52037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458838
1036	NC_018623	CAA	2	6	52066	52071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458838
1037	NC_018623	TGA	2	6	52099	52104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458838
1038	NC_018623	C	6	6	52150	52155	0 %	0 %	0 %	100 %	407458838
1039	NC_018623	GAAG	2	8	52722	52729	50 %	0 %	50 %	0 %	407458839
1040	NC_018623	CCT	2	6	52732	52737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458839
1041	NC_018623	T	6	6	52744	52749	0 %	100 %	0 %	0 %	407458839
1042	NC_018623	TGC	2	6	52810	52815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458839
1043	NC_018623	CCT	2	6	52816	52821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458839
1044	NC_018623	TGC	2	6	52822	52827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458839
1045	NC_018623	AGG	2	6	52841	52846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458839
1046	NC_018623	CTT	2	6	52918	52923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458840
1047	NC_018623	TTA	2	6	52935	52940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458840
1048	NC_018623	GTT	2	6	52948	52953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458840
1049	NC_018623	ACG	2	6	52973	52978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458840
1050	NC_018623	TGT	2	6	53011	53016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458840
1051	NC_018623	ATCC	2	8	53028	53035	25 %	25 %	0 %	50 %	407458840
1052	NC_018623	GT	3	6	53102	53107	0 %	50 %	50 %	0 %	407458840
1053	NC_018623	T	6	6	53136	53141	0 %	100 %	0 %	0 %	407458840
1054	NC_018623	CTT	2	6	53168	53173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458840
1055	NC_018623	T	6	6	53172	53177	0 %	100 %	0 %	0 %	407458840
1056	NC_018623	TTC	2	6	53237	53242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458840
1057	NC_018623	AT	3	6	53289	53294	50 %	50 %	0 %	0 %	407458840
1058	NC_018623	AGCA	2	8	53320	53327	50 %	0 %	25 %	25 %	407458840
1059	NC_018623	AAT	2	6	53345	53350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458840
1060	NC_018623	TTCA	2	8	53480	53487	25 %	50 %	0 %	25 %	407458840
1061	NC_018623	A	6	6	53658	53663	100 %	0 %	0 %	0 %	407458840
1062	NC_018623	TCA	2	6	53724	53729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458840
1063	NC_018623	T	6	6	53780	53785	0 %	100 %	0 %	0 %	407458840
1064	NC_018623	CGT	2	6	53843	53848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458840
1065	NC_018623	AGG	2	6	53870	53875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458840
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1067	NC_018623	GAA	2	6	53917	53922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458840
1068	NC_018623	T	6	6	53938	53943	0 %	100 %	0 %	0 %	407458841
1069	NC_018623	CAG	2	6	53969	53974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458841
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1076	NC_018623	GTA	2	6	54297	54302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458841
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1080	NC_018623	TCG	2	6	54873	54878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458842
1081	NC_018623	T	7	7	54913	54919	0 %	100 %	0 %	0 %	407458842
1082	NC_018623	TCT	2	6	54939	54944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458842
1083	NC_018623	T	6	6	54960	54965	0 %	100 %	0 %	0 %	407458842
1084	NC_018623	CTT	2	6	55012	55017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458842
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1088	NC_018623	GCA	2	6	55128	55133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458842
1089	NC_018623	TTA	2	6	55161	55166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458842
1090	NC_018623	TCG	2	6	55237	55242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458842
1091	NC_018623	CTA	2	6	55270	55275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458842
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1095	NC_018623	TCA	2	6	55411	55416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458843
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1098	NC_018623	TAG	2	6	55613	55618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458843
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1106	NC_018623	TTG	2	6	55911	55916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458843
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1108	NC_018623	CTGT	2	8	56038	56045	0 %	50 %	25 %	25 %	407458843
1109	NC_018623	AG	4	8	56046	56053	50 %	0 %	50 %	0 %	407458843
1110	NC_018623	TAG	2	6	56235	56240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458844
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1112	NC_018623	ATT	2	6	56278	56283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458844
1113	NC_018623	GAA	2	6	56320	56325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458844
1114	NC_018623	CTT	2	6	56330	56335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458844
1115	NC_018623	GCT	2	6	56392	56397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458844
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1117	NC_018623	AGAA	2	8	56448	56455	75 %	0 %	25 %	0 %	407458844
1118	NC_018623	GTT	2	6	56512	56517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458844
1119	NC_018623	TC	3	6	56552	56557	0 %	50 %	0 %	50 %	407458844
1120	NC_018623	GAAG	2	8	56617	56624	50 %	0 %	50 %	0 %	407458844
1121	NC_018623	CAA	2	6	56672	56677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458844
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1123	NC_018623	CAG	2	6	56747	56752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458844
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1261	NC_018623	ATTA	2	8	65343	65350	50 %	50 %	0 %	0 %	407458849
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1377	NC_018623	A	6	6	71742	71747	100 %	0 %	0 %	0 %	407458856
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