MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 21902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018623	TTGC	2	8	25253	25260	0 %	50 %	25 %	25 %	407458813
502	NC_018623	AGC	2	6	25373	25378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458813
503	NC_018623	TTG	2	6	25386	25391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458813
504	NC_018623	GTTT	2	8	25417	25424	0 %	75 %	25 %	0 %	407458813
505	NC_018623	GAAC	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	407458813
506	NC_018623	TGT	2	6	25482	25487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458813
507	NC_018623	TA	3	6	25501	25506	50 %	50 %	0 %	0 %	407458813
508	NC_018623	GCA	2	6	25507	25512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458813
509	NC_018623	GTT	2	6	25540	25545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458813
510	NC_018623	TCT	3	9	25585	25593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458813
511	NC_018623	AG	3	6	25608	25613	50 %	0 %	50 %	0 %	407458813
512	NC_018623	AGTT	2	8	25626	25633	25 %	50 %	25 %	0 %	407458813
513	NC_018623	CTT	3	9	25646	25654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458813
514	NC_018623	CAC	2	6	25655	25660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458813
515	NC_018623	TTA	2	6	25675	25680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458813
516	NC_018623	TAGCAT	2	12	25713	25724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407458813
517	NC_018623	T	6	6	25769	25774	0 %	100 %	0 %	0 %	407458813
518	NC_018623	TCA	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458813
519	NC_018623	CCA	2	6	25813	25818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458813
520	NC_018623	A	6	6	25863	25868	100 %	0 %	0 %	0 %	407458813
521	NC_018623	TCT	2	6	25915	25920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458813
522	NC_018623	T	6	6	25992	25997	0 %	100 %	0 %	0 %	407458813
523	NC_018623	ATT	2	6	26037	26042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458813
524	NC_018623	T	8	8	26049	26056	0 %	100 %	0 %	0 %	407458813
525	NC_018623	AAT	2	6	26115	26120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458813
526	NC_018623	TGT	2	6	26208	26213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458813
527	NC_018623	AGG	2	6	26292	26297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458813
528	NC_018623	TCTATA	2	12	26407	26418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407458813
529	NC_018623	TAAA	2	8	26471	26478	75 %	25 %	0 %	0 %	407458813
530	NC_018623	TA	3	6	26511	26516	50 %	50 %	0 %	0 %	407458813
531	NC_018623	AGA	2	6	26520	26525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458813
532	NC_018623	ATC	2	6	26736	26741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458814
533	NC_018623	A	6	6	26769	26774	100 %	0 %	0 %	0 %	407458814
534	NC_018623	ATA	2	6	26781	26786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458814
535	NC_018623	TGT	2	6	26867	26872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458814
536	NC_018623	AGA	2	6	26954	26959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458814
537	NC_018623	GGT	2	6	27035	27040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458814
538	NC_018623	CTA	2	6	27043	27048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458814
539	NC_018623	AGA	2	6	27083	27088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458814
540	NC_018623	CTA	2	6	27103	27108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458814
541	NC_018623	AAC	2	6	27109	27114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458814
542	NC_018623	TTA	2	6	27129	27134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458814
543	NC_018623	TAA	2	6	27155	27160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458814
544	NC_018623	AGC	2	6	27290	27295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458814
545	NC_018623	TA	3	6	27373	27378	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
546	NC_018623	GGT	2	6	27429	27434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458814
547	NC_018623	AGA	3	9	27563	27571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458814
548	NC_018623	ACA	2	6	27593	27598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458814
549	NC_018623	TA	3	6	27751	27756	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
550	NC_018623	GCT	2	6	27768	27773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458814
551	NC_018623	TGT	3	9	27788	27796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458814
552	NC_018623	CCT	2	6	27862	27867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458814
553	NC_018623	AGC	2	6	27918	27923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458814
554	NC_018623	AATT	2	8	27959	27966	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
555	NC_018623	TGA	2	6	27974	27979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458814
556	NC_018623	AAC	2	6	27991	27996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458814
557	NC_018623	AAT	2	6	28008	28013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458814
558	NC_018623	AC	3	6	28021	28026	50 %	0 %	0 %	50 %	407458814
559	NC_018623	TA	3	6	28050	28055	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
560	NC_018623	TTG	2	6	28075	28080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458814
561	NC_018623	CTA	2	6	28096	28101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458814
562	NC_018623	ACA	2	6	28104	28109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458814
563	NC_018623	CCA	2	6	28186	28191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458814
564	NC_018623	TAA	4	12	28244	28255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458814
565	NC_018623	CAA	2	6	28287	28292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458814
566	NC_018623	GCA	2	6	28368	28373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458814
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568	NC_018623	T	6	6	28616	28621	0 %	100 %	0 %	0 %	407458814
569	NC_018623	GCT	2	6	28710	28715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458814
570	NC_018623	CAG	2	6	28746	28751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458814
571	NC_018623	CTG	2	6	28753	28758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458814
572	NC_018623	AAAT	2	8	28808	28815	75 %	25 %	0 %	0 %	407458814
573	NC_018623	AGC	2	6	28835	28840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458814
574	NC_018623	GAA	2	6	28881	28886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458814
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577	NC_018623	TAAGTG	2	12	29026	29037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458814
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584	NC_018623	GCCAC	2	10	29449	29458	20 %	0 %	20 %	60 %	407458815
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597	NC_018623	AGAA	2	8	29793	29800	75 %	0 %	25 %	0 %	407458816
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608	NC_018623	CCT	2	6	30386	30391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458817
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610	NC_018623	A	6	6	30631	30636	100 %	0 %	0 %	0 %	407458817
611	NC_018623	T	7	7	30676	30682	0 %	100 %	0 %	0 %	407458817
612	NC_018623	A	6	6	30689	30694	100 %	0 %	0 %	0 %	407458817
613	NC_018623	GGA	2	6	30695	30700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458817
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618	NC_018623	AGC	2	6	31163	31168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458818
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620	NC_018623	AGAA	2	8	31203	31210	75 %	0 %	25 %	0 %	407458818
621	NC_018623	GA	4	8	31241	31248	50 %	0 %	50 %	0 %	407458818
622	NC_018623	T	6	6	31257	31262	0 %	100 %	0 %	0 %	407458818
623	NC_018623	TAA	2	6	31268	31273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458818
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628	NC_018623	CTT	2	6	31370	31375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458818
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755	NC_018623	T	6	6	38552	38557	0 %	100 %	0 %	0 %	407458825
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