MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 21902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018623	TGG	2	6	240540	240545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407459030
4502	NC_018623	T	6	6	240563	240568	0 %	100 %	0 %	0 %	407459030
4503	NC_018623	AAAT	2	8	240582	240589	75 %	25 %	0 %	0 %	407459030
4504	NC_018623	GCGTA	2	10	240650	240659	20 %	20 %	40 %	20 %	407459030
4505	NC_018623	GAG	2	6	240663	240668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407459030
4506	NC_018623	CTT	2	6	240671	240676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459030
4507	NC_018623	TTG	2	6	241083	241088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459031
4508	NC_018623	GAA	2	6	241115	241120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459031
4509	NC_018623	ATC	2	6	241162	241167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459031
4510	NC_018623	GAT	2	6	241238	241243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459031
4511	NC_018623	TTCAG	2	10	241268	241277	20 %	40 %	20 %	20 %	407459031
4512	NC_018623	ACTT	2	8	241291	241298	25 %	50 %	0 %	25 %	407459031
4513	NC_018623	TTG	2	6	241343	241348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459031
4514	NC_018623	TTA	2	6	241452	241457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459031
4515	NC_018623	ATT	2	6	241470	241475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459031
4516	NC_018623	AGG	2	6	241607	241612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407459031
4517	NC_018623	TG	3	6	241665	241670	0 %	50 %	50 %	0 %	407459031
4518	NC_018623	TAA	2	6	241682	241687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407459031
4519	NC_018623	ATT	2	6	241705	241710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459031
4520	NC_018623	TTC	2	6	241766	241771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459031
4521	NC_018623	AGA	2	6	241779	241784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459031
4522	NC_018623	GAT	2	6	241815	241820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459031
4523	NC_018623	TTG	2	6	241864	241869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459031
4524	NC_018623	TATT	2	8	241879	241886	25 %	75 %	0 %	0 %	407459031
4525	NC_018623	ATT	2	6	241917	241922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459031
4526	NC_018623	ATG	2	6	241987	241992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459031
4527	NC_018623	ATG	2	6	242019	242024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459031
4528	NC_018623	GCA	2	6	242049	242054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407459031
4529	NC_018623	AAG	2	6	242071	242076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459031
4530	NC_018623	A	6	6	242094	242099	100 %	0 %	0 %	0 %	407459031
4531	NC_018623	TCA	2	6	242105	242110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459031
4532	NC_018623	GCTT	2	8	242164	242171	0 %	50 %	25 %	25 %	407459031
4533	NC_018623	AT	3	6	242245	242250	50 %	50 %	0 %	0 %	407459031
4534	NC_018623	ATACC	2	10	242281	242290	40 %	20 %	0 %	40 %	407459031
4535	NC_018623	TGC	2	6	242297	242302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407459031
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4537	NC_018623	TGA	2	6	242369	242374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459031
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4539	NC_018623	ATT	2	6	242394	242399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459031
4540	NC_018623	TGA	2	6	242438	242443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459031
4541	NC_018623	GAA	2	6	242487	242492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407459031
4542	NC_018623	TTA	2	6	242514	242519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459031
4543	NC_018623	TTTAG	2	10	242558	242567	20 %	60 %	20 %	0 %	407459031
4544	NC_018623	AG	3	6	242628	242633	50 %	0 %	50 %	0 %	407459032
4545	NC_018623	T	7	7	242659	242665	0 %	100 %	0 %	0 %	407459032
4546	NC_018623	GCA	2	6	242689	242694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407459032
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4548	NC_018623	ATG	2	6	242815	242820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459032
4549	NC_018623	ACT	2	6	242833	242838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459032
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4551	NC_018623	CGT	2	6	242899	242904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407459032
4552	NC_018623	CTC	2	6	242912	242917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407459032
4553	NC_018623	G	6	6	242950	242955	0 %	0 %	100 %	0 %	407459032
4554	NC_018623	TTTA	2	8	243032	243039	25 %	75 %	0 %	0 %	407459032
4555	NC_018623	ATCG	2	8	243079	243086	25 %	25 %	25 %	25 %	407459032
4556	NC_018623	CAG	2	6	243101	243106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407459032
4557	NC_018623	TTA	2	6	243127	243132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459032
4558	NC_018623	AAT	2	6	243229	243234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407459033
4559	NC_018623	TTC	2	6	243279	243284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459033
4560	NC_018623	CTT	2	6	243285	243290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459033
4561	NC_018623	TTA	2	6	243309	243314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407459033
4562	NC_018623	TG	3	6	243345	243350	0 %	50 %	50 %	0 %	407459033
4563	NC_018623	GTTGT	2	10	243363	243372	0 %	60 %	40 %	0 %	407459033
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4565	NC_018623	TA	3	6	243430	243435	50 %	50 %	0 %	0 %	407459033
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4574	NC_018623	TTTA	2	8	244142	244149	25 %	75 %	0 %	0 %	407459034
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4592	NC_018623	ACT	2	6	245123	245128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459035
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4598	NC_018623	TTTAGG	2	12	245357	245368	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407459035
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4601	NC_018623	GTT	2	6	245476	245481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459035
4602	NC_018623	ATG	2	6	245639	245644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459035
4603	NC_018623	AGATA	2	10	245654	245663	60 %	20 %	20 %	0 %	407459035
4604	NC_018623	TTATC	2	10	245668	245677	20 %	60 %	0 %	20 %	407459035
4605	NC_018623	TTG	2	6	245721	245726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407459036
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4607	NC_018623	AGT	2	6	245804	245809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459036
4608	NC_018623	AG	3	6	245893	245898	50 %	0 %	50 %	0 %	407459036
4609	NC_018623	CTT	2	6	245909	245914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407459036
4610	NC_018623	GAC	2	6	245916	245921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407459036
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4612	NC_018623	AGAA	2	8	245943	245950	75 %	0 %	25 %	0 %	407459036
4613	NC_018623	GAT	2	6	246032	246037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407459036
4614	NC_018623	CAT	2	6	246095	246100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407459036
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4616	NC_018623	CTTT	2	8	246184	246191	0 %	75 %	0 %	25 %	407459036
4617	NC_018623	ATGG	2	8	246302	246309	25 %	25 %	50 %	0 %	407459036
4618	NC_018623	TAA	2	6	246312	246317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407459036
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4620	NC_018623	CT	3	6	246408	246413	0 %	50 %	0 %	50 %	407459036
4621	NC_018623	T	7	7	246512	246518	0 %	100 %	0 %	0 %	407459037
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4744	NC_018623	GAG	2	6	253317	253322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407459046
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