MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018622	TGA	2	6	212813	212818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457759
4002	NC_018622	TGC	2	6	213179	213184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457760
4003	NC_018622	AGC	2	6	213192	213197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457760
4004	NC_018622	T	7	7	213761	213767	0 %	100 %	0 %	0 %	407457761
4005	NC_018622	TTG	2	6	213798	213803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4006	NC_018622	GTT	2	6	213818	213823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4007	NC_018622	ATG	2	6	213868	213873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457761
4008	NC_018622	GTT	2	6	213939	213944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4009	NC_018622	AGAT	2	8	214045	214052	50 %	25 %	25 %	0 %	407457761
4010	NC_018622	AGAA	2	8	214168	214175	75 %	0 %	25 %	0 %	407457761
4011	NC_018622	GAAAA	2	10	214197	214206	80 %	0 %	20 %	0 %	407457761
4012	NC_018622	TGC	2	6	214220	214225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457761
4013	NC_018622	T	7	7	214252	214258	0 %	100 %	0 %	0 %	407457761
4014	NC_018622	GTA	2	6	214289	214294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457761
4015	NC_018622	AAC	2	6	214310	214315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457761
4016	NC_018622	GTT	2	6	214328	214333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4017	NC_018622	C	6	6	214336	214341	0 %	0 %	0 %	100 %	407457761
4018	NC_018622	CAA	2	6	214362	214367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457761
4019	NC_018622	GTT	2	6	214480	214485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457762
4020	NC_018622	ATT	2	6	214500	214505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457762
4021	NC_018622	TTC	2	6	214515	214520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457762
4022	NC_018622	TAGCA	2	10	214563	214572	40 %	20 %	20 %	20 %	407457762
4023	NC_018622	AGC	2	6	214638	214643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4024	NC_018622	ACA	2	6	214648	214653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457762
4025	NC_018622	ACG	2	6	214690	214695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4026	NC_018622	GCT	2	6	214760	214765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4027	NC_018622	AGC	2	6	214767	214772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4028	NC_018622	AG	3	6	214874	214879	50 %	0 %	50 %	0 %	407457762
4029	NC_018622	T	6	6	214993	214998	0 %	100 %	0 %	0 %	407457762
4030	NC_018622	T	7	7	215026	215032	0 %	100 %	0 %	0 %	407457762
4031	NC_018622	GCAC	2	8	215077	215084	25 %	0 %	25 %	50 %	407457762
4032	NC_018622	T	6	6	215087	215092	0 %	100 %	0 %	0 %	407457762
4033	NC_018622	TCT	2	6	215227	215232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457762
4034	NC_018622	AAGAA	2	10	215261	215270	80 %	0 %	20 %	0 %	407457762
4035	NC_018622	AAAG	2	8	215276	215283	75 %	0 %	25 %	0 %	407457762
4036	NC_018622	GAA	2	6	215897	215902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457763
4037	NC_018622	TCA	2	6	215922	215927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457763
4038	NC_018622	ACA	2	6	215935	215940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457763
4039	NC_018622	AG	3	6	216032	216037	50 %	0 %	50 %	0 %	407457763
4040	NC_018622	TTG	2	6	216038	216043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457763
4041	NC_018622	GACA	2	8	216153	216160	50 %	0 %	25 %	25 %	407457763
4042	NC_018622	ATC	2	6	216206	216211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457763
4043	NC_018622	ATT	2	6	216267	216272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457763
4044	NC_018622	GGT	2	6	216386	216391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457763
4045	NC_018622	AGC	2	6	216442	216447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457763
4046	NC_018622	TTG	2	6	216507	216512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457763
4047	NC_018622	AAG	2	6	216542	216547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457764
4048	NC_018622	GAAAG	2	10	216563	216572	60 %	0 %	40 %	0 %	407457764
4049	NC_018622	TAT	2	6	216651	216656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457764
4050	NC_018622	ATTT	2	8	216734	216741	25 %	75 %	0 %	0 %	407457764
4051	NC_018622	TCA	2	6	216846	216851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457764
4052	NC_018622	CTTT	2	8	216898	216905	0 %	75 %	0 %	25 %	407457764
4053	NC_018622	GTG	2	6	216929	216934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457764
4054	NC_018622	ACTC	2	8	216943	216950	25 %	25 %	0 %	50 %	407457764
4055	NC_018622	TTA	2	6	217037	217042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457764
4056	NC_018622	TGT	2	6	217095	217100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457764
4057	NC_018622	TG	3	6	217268	217273	0 %	50 %	50 %	0 %	407457764
4058	NC_018622	TAG	2	6	217284	217289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457764
4059	NC_018622	TAC	2	6	217300	217305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457764
4060	NC_018622	CA	3	6	217586	217591	50 %	0 %	0 %	50 %	407457765
4061	NC_018622	AGAA	2	8	217838	217845	75 %	0 %	25 %	0 %	407457765
4062	NC_018622	TTG	2	6	217850	217855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4063	NC_018622	CAAC	2	8	217905	217912	50 %	0 %	0 %	50 %	407457765
4064	NC_018622	ATGG	2	8	217948	217955	25 %	25 %	50 %	0 %	407457765
4065	NC_018622	GCA	2	6	218006	218011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4066	NC_018622	TTC	2	6	218244	218249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457765
4067	NC_018622	CAT	2	6	218309	218314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4068	NC_018622	ATT	2	6	218325	218330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4069	NC_018622	TGT	2	6	218336	218341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4070	NC_018622	AGT	2	6	218405	218410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457765
4071	NC_018622	GCG	2	6	218433	218438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457765
4072	NC_018622	CTC	2	6	218442	218447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457765
4073	NC_018622	CTA	2	6	218569	218574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4074	NC_018622	TAAG	2	8	218613	218620	50 %	25 %	25 %	0 %	407457765
4075	NC_018622	CTG	5	15	218756	218770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4076	NC_018622	AGG	2	6	218796	218801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457765
4077	NC_018622	TCT	2	6	218815	218820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457765
4078	NC_018622	GTT	2	6	218850	218855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4079	NC_018622	TCC	2	6	218883	218888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457765
4080	NC_018622	GAA	2	6	219055	219060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457765
4081	NC_018622	AAT	2	6	219061	219066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457765
4082	NC_018622	GGA	2	6	219085	219090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457765
4083	NC_018622	TTA	2	6	219109	219114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4084	NC_018622	TTA	2	6	219133	219138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4085	NC_018622	AGA	2	6	219141	219146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457765
4086	NC_018622	CAT	2	6	219170	219175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4087	NC_018622	GATT	2	8	219187	219194	25 %	50 %	25 %	0 %	407457765
4088	NC_018622	GCA	2	6	219196	219201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4089	NC_018622	AGAT	2	8	219243	219250	50 %	25 %	25 %	0 %	407457765
4090	NC_018622	TTCC	2	8	219344	219351	0 %	50 %	0 %	50 %	407457765
4091	NC_018622	GCT	2	6	219448	219453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4092	NC_018622	T	6	6	219466	219471	0 %	100 %	0 %	0 %	407457765
4093	NC_018622	CGT	2	6	219491	219496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4094	NC_018622	GTT	2	6	219721	219726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4095	NC_018622	CCA	2	6	219739	219744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4096	NC_018622	CAG	2	6	219785	219790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4097	NC_018622	CTG	2	6	219797	219802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4098	NC_018622	ATT	2	6	219856	219861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4099	NC_018622	TGT	2	6	219900	219905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4100	NC_018622	TGT	2	6	219918	219923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4101	NC_018622	CAG	2	6	220016	220021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4102	NC_018622	ATC	2	6	220047	220052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4103	NC_018622	GTT	2	6	220160	220165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4104	NC_018622	TAG	2	6	220172	220177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457765
4105	NC_018622	ATAG	2	8	220251	220258	50 %	25 %	25 %	0 %	407457765
4106	NC_018622	TAT	2	6	220280	220285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4107	NC_018622	CAC	2	6	220343	220348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4108	NC_018622	GGT	2	6	220382	220387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457765
4109	NC_018622	GA	3	6	220394	220399	50 %	0 %	50 %	0 %	407457765
4110	NC_018622	CAC	2	6	220427	220432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4111	NC_018622	T	6	6	220447	220452	0 %	100 %	0 %	0 %	407457765
4112	NC_018622	CAG	2	6	220499	220504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4113	NC_018622	TGC	2	6	220509	220514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4114	NC_018622	GCA	2	6	220522	220527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4115	NC_018622	ACT	2	6	220528	220533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4116	NC_018622	GATT	2	8	220593	220600	25 %	50 %	25 %	0 %	407457765
4117	NC_018622	GTTA	2	8	220605	220612	25 %	50 %	25 %	0 %	407457765
4118	NC_018622	CCA	2	6	220639	220644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4119	NC_018622	AGA	2	6	220710	220715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457765
4120	NC_018622	CCA	3	9	220768	220776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4121	NC_018622	T	7	7	220778	220784	0 %	100 %	0 %	0 %	407457765
4122	NC_018622	GGT	2	6	220785	220790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457765
4123	NC_018622	CCA	2	6	220861	220866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4124	NC_018622	TTC	2	6	220869	220874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457765
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4126	NC_018622	CCA	2	6	221032	221037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4127	NC_018622	CCG	2	6	221116	221121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457765
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4130	NC_018622	ATAG	2	8	221301	221308	50 %	25 %	25 %	0 %	407457765
4131	NC_018622	CCA	2	6	221311	221316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457765
4132	NC_018622	GTT	2	6	221328	221333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
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4134	NC_018622	TGG	2	6	221354	221359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457765
4135	NC_018622	TTGTA	2	10	221364	221373	20 %	60 %	20 %	0 %	407457765
4136	NC_018622	AATGGT	2	12	221538	221549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457765
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4139	NC_018622	TGC	3	9	221661	221669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
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4141	NC_018622	T	6	6	221687	221692	0 %	100 %	0 %	0 %	407457765
4142	NC_018622	AAT	2	6	221706	221711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457765
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4144	NC_018622	CTG	2	6	221861	221866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
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4147	NC_018622	AGG	2	6	221913	221918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457765
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4151	NC_018622	TTG	2	6	222069	222074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4152	NC_018622	ATC	2	6	222081	222086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4153	NC_018622	TA	3	6	222136	222141	50 %	50 %	0 %	0 %	407457765
4154	NC_018622	AATG	2	8	222207	222214	50 %	25 %	25 %	0 %	407457765
4155	NC_018622	AGTAGA	2	12	222267	222278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407457765
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4158	NC_018622	AG	3	6	222337	222342	50 %	0 %	50 %	0 %	407457765
4159	NC_018622	ATG	2	6	222413	222418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457765
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4161	NC_018622	TTTG	2	8	222515	222522	0 %	75 %	25 %	0 %	407457765
4162	NC_018622	ACT	2	6	222534	222539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
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4225	NC_018622	TTTC	2	8	226217	226224	0 %	75 %	0 %	25 %	407457767
4226	NC_018622	CAC	2	6	226234	226239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457767
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4228	NC_018622	T	6	6	226383	226388	0 %	100 %	0 %	0 %	407457768
4229	NC_018622	CTC	2	6	226433	226438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457768
4230	NC_018622	TGA	2	6	226478	226483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457768
4231	NC_018622	TTG	2	6	226510	226515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457768
4232	NC_018622	AACC	2	8	226525	226532	50 %	0 %	0 %	50 %	407457768
4233	NC_018622	TCG	2	6	226592	226597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457768
4234	NC_018622	GGA	2	6	226942	226947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457769
4235	NC_018622	AGG	3	9	227027	227035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457769
4236	NC_018622	CAA	2	6	227056	227061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457769
4237	NC_018622	GA	4	8	227073	227080	50 %	0 %	50 %	0 %	407457769
4238	NC_018622	TCC	2	6	227131	227136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457769
4239	NC_018622	T	6	6	227161	227166	0 %	100 %	0 %	0 %	407457769
4240	NC_018622	AAT	2	6	227185	227190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457769
4241	NC_018622	AAG	2	6	227213	227218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457769
4242	NC_018622	AAGACC	2	12	227298	227309	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407457769
4243	NC_018622	GCTGA	2	10	227374	227383	20 %	20 %	40 %	20 %	407457769
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4245	NC_018622	AAT	2	6	227422	227427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457769
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4491	NC_018622	TGA	2	6	241888	241893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
4492	NC_018622	CTGGT	2	10	241932	241941	0 %	40 %	40 %	20 %	407457785
4493	NC_018622	ATT	2	6	241991	241996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
4494	NC_018622	ATG	2	6	242061	242066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
4495	NC_018622	TGA	2	6	242091	242096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
4496	NC_018622	AAG	2	6	242145	242150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
4497	NC_018622	GCTT	2	8	242238	242245	0 %	50 %	25 %	25 %	407457785
4498	NC_018622	ATACC	2	10	242355	242364	40 %	20 %	0 %	40 %	407457785
4499	NC_018622	AAC	2	6	242422	242427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457785
4500	NC_018622	TGA	2	6	242443	242448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785

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