MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018622	TCC	2	6	159190	159195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457706
3002	NC_018622	GTC	2	6	159199	159204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457706
3003	NC_018622	GTT	2	6	159428	159433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457707
3004	NC_018622	TGA	2	6	159511	159516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457707
3005	NC_018622	A	7	7	159719	159725	100 %	0 %	0 %	0 %	407457707
3006	NC_018622	T	7	7	159735	159741	0 %	100 %	0 %	0 %	407457707
3007	NC_018622	CCTT	2	8	159750	159757	0 %	50 %	0 %	50 %	407457707
3008	NC_018622	TTG	2	6	159777	159782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457707
3009	NC_018622	TCT	2	6	159809	159814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457707
3010	NC_018622	ACTG	2	8	159854	159861	25 %	25 %	25 %	25 %	407457707
3011	NC_018622	GGA	2	6	159984	159989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457707
3012	NC_018622	GAA	2	6	160017	160022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457707
3013	NC_018622	TTC	2	6	160030	160035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457707
3014	NC_018622	TTC	2	6	160039	160044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457707
3015	NC_018622	TTTC	2	8	160514	160521	0 %	75 %	0 %	25 %	407457708
3016	NC_018622	AAG	2	6	160676	160681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457708
3017	NC_018622	CTC	2	6	160810	160815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457708
3018	NC_018622	GAA	2	6	160909	160914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457708
3019	NC_018622	GGT	2	6	160957	160962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457708
3020	NC_018622	AGT	2	6	161066	161071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457708
3021	NC_018622	AGA	2	6	161184	161189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457709
3022	NC_018622	TGCA	2	8	161204	161211	25 %	25 %	25 %	25 %	407457709
3023	NC_018622	TCT	2	6	161232	161237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457709
3024	NC_018622	ATC	2	6	161247	161252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457709
3025	NC_018622	CAG	2	6	161254	161259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457709
3026	NC_018622	TCC	2	6	161287	161292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457709
3027	NC_018622	CAGA	2	8	161314	161321	50 %	0 %	25 %	25 %	407457709
3028	NC_018622	T	7	7	161326	161332	0 %	100 %	0 %	0 %	407457709
3029	NC_018622	TGC	2	6	161336	161341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457709
3030	NC_018622	TGT	2	6	161345	161350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457709
3031	NC_018622	GA	3	6	161352	161357	50 %	0 %	50 %	0 %	407457709
3032	NC_018622	A	7	7	161451	161457	100 %	0 %	0 %	0 %	407457709
3033	NC_018622	A	6	6	161461	161466	100 %	0 %	0 %	0 %	407457709
3034	NC_018622	T	6	6	161571	161576	0 %	100 %	0 %	0 %	407457709
3035	NC_018622	AGT	2	6	161589	161594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457709
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3037	NC_018622	AAG	2	6	161705	161710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457709
3038	NC_018622	G	6	6	161716	161721	0 %	0 %	100 %	0 %	407457709
3039	NC_018622	TAG	2	6	161836	161841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457710
3040	NC_018622	GT	4	8	161887	161894	0 %	50 %	50 %	0 %	407457710
3041	NC_018622	TGTT	2	8	161913	161920	0 %	75 %	25 %	0 %	407457710
3042	NC_018622	T	6	6	161922	161927	0 %	100 %	0 %	0 %	407457710
3043	NC_018622	ACA	2	6	161935	161940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457710
3044	NC_018622	ATA	2	6	161959	161964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457710
3045	NC_018622	TAA	2	6	161976	161981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457710
3046	NC_018622	TTG	2	6	161994	161999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457710
3047	NC_018622	TCAA	2	8	162022	162029	50 %	25 %	0 %	25 %	407457710
3048	NC_018622	CAG	2	6	162030	162035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457710
3049	NC_018622	GAC	2	6	162113	162118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457710
3050	NC_018622	AGGC	2	8	162123	162130	25 %	0 %	50 %	25 %	407457710
3051	NC_018622	AGA	2	6	162148	162153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457710
3052	NC_018622	AAT	2	6	162183	162188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457710
3053	NC_018622	CGG	2	6	162195	162200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457710
3054	NC_018622	TTC	2	6	162249	162254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457710
3055	NC_018622	GA	3	6	162300	162305	50 %	0 %	50 %	0 %	407457710
3056	NC_018622	TCG	2	6	162314	162319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457710
3057	NC_018622	ATC	2	6	162327	162332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457710
3058	NC_018622	TTTG	2	8	162390	162397	0 %	75 %	25 %	0 %	407457711
3059	NC_018622	AGAA	2	8	162487	162494	75 %	0 %	25 %	0 %	407457711
3060	NC_018622	TTTC	2	8	162508	162515	0 %	75 %	0 %	25 %	407457711
3061	NC_018622	T	7	7	162526	162532	0 %	100 %	0 %	0 %	407457711
3062	NC_018622	ATA	2	6	162553	162558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457711
3063	NC_018622	AG	3	6	162563	162568	50 %	0 %	50 %	0 %	407457711
3064	NC_018622	ATC	2	6	162601	162606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457711
3065	NC_018622	CTT	2	6	162645	162650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457711
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3067	NC_018622	TCT	2	6	162675	162680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457711
3068	NC_018622	T	7	7	162723	162729	0 %	100 %	0 %	0 %	407457711
3069	NC_018622	TGT	2	6	162764	162769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457711
3070	NC_018622	ACT	2	6	162883	162888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457711
3071	NC_018622	ATG	2	6	162896	162901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457711
3072	NC_018622	T	8	8	162976	162983	0 %	100 %	0 %	0 %	407457711
3073	NC_018622	GGTG	2	8	163343	163350	0 %	25 %	75 %	0 %	407457712
3074	NC_018622	TAT	2	6	163466	163471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457712
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3078	NC_018622	GAGG	2	8	163541	163548	25 %	0 %	75 %	0 %	407457712
3079	NC_018622	T	6	6	163595	163600	0 %	100 %	0 %	0 %	407457712
3080	NC_018622	CTT	2	6	163610	163615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457712
3081	NC_018622	TCC	2	6	163671	163676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457712
3082	NC_018622	TTCT	2	8	163689	163696	0 %	75 %	0 %	25 %	407457712
3083	NC_018622	GCTTG	2	10	163715	163724	0 %	40 %	40 %	20 %	407457712
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3088	NC_018622	CTT	2	6	163943	163948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457712
3089	NC_018622	ATG	2	6	164187	164192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457712
3090	NC_018622	TGA	2	6	164276	164281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457712
3091	NC_018622	AAT	2	6	164319	164324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457712
3092	NC_018622	CAG	2	6	164375	164380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457712
3093	NC_018622	GA	3	6	164387	164392	50 %	0 %	50 %	0 %	407457712
3094	NC_018622	AGA	2	6	164404	164409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457712
3095	NC_018622	GAAA	2	8	164416	164423	75 %	0 %	25 %	0 %	407457712
3096	NC_018622	TCA	2	6	164471	164476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457712
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3098	NC_018622	CTT	2	6	164679	164684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457713
3099	NC_018622	AG	4	8	164743	164750	50 %	0 %	50 %	0 %	407457713
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3101	NC_018622	GAAA	2	8	164770	164777	75 %	0 %	25 %	0 %	407457713
3102	NC_018622	AG	3	6	164784	164789	50 %	0 %	50 %	0 %	407457713
3103	NC_018622	ATT	2	6	164803	164808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457713
3104	NC_018622	TACT	2	8	164847	164854	25 %	50 %	0 %	25 %	407457713
3105	NC_018622	TGCA	2	8	164934	164941	25 %	25 %	25 %	25 %	407457713
3106	NC_018622	A	7	7	164957	164963	100 %	0 %	0 %	0 %	407457713
3107	NC_018622	CA	3	6	164968	164973	50 %	0 %	0 %	50 %	407457713
3108	NC_018622	GTT	2	6	165013	165018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457713
3109	NC_018622	AAGA	2	8	165090	165097	75 %	0 %	25 %	0 %	407457713
3110	NC_018622	AGGA	2	8	165134	165141	50 %	0 %	50 %	0 %	407457713
3111	NC_018622	TCT	2	6	165164	165169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457713
3112	NC_018622	A	6	6	165175	165180	100 %	0 %	0 %	0 %	407457713
3113	NC_018622	T	6	6	165192	165197	0 %	100 %	0 %	0 %	407457713
3114	NC_018622	TGA	2	6	165238	165243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457713
3115	NC_018622	ATC	2	6	165270	165275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457713
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3118	NC_018622	CAA	2	6	165485	165490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457713
3119	NC_018622	TGC	2	6	165522	165527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457713
3120	NC_018622	AAG	3	9	165594	165602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457713
3121	NC_018622	TTC	2	6	165709	165714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457713
3122	NC_018622	ACAT	2	8	165720	165727	50 %	25 %	0 %	25 %	407457713
3123	NC_018622	AAT	2	6	165737	165742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457713
3124	NC_018622	AAG	2	6	165753	165758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457713
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3128	NC_018622	AGA	2	6	166090	166095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457713
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3139	NC_018622	AAGAGA	2	12	166635	166646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457713
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3234	NC_018622	TAAAGA	2	12	173138	173149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407457719
3235	NC_018622	ATTTT	2	10	173230	173239	20 %	80 %	0 %	0 %	407457720
3236	NC_018622	GAGAG	2	10	173247	173256	40 %	0 %	60 %	0 %	407457720
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3240	NC_018622	T	7	7	173386	173392	0 %	100 %	0 %	0 %	407457720
3241	NC_018622	GCT	2	6	173432	173437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457720
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3243	NC_018622	T	7	7	173483	173489	0 %	100 %	0 %	0 %	407457720
3244	NC_018622	ATG	2	6	174026	174031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457721
3245	NC_018622	TGCTGG	2	12	174171	174182	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407457721
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3247	NC_018622	TGA	3	9	174450	174458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457721
3248	NC_018622	GATAGA	2	12	174459	174470	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407457721
3249	NC_018622	TCCG	2	8	174473	174480	0 %	25 %	25 %	50 %	407457721
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3492	NC_018622	GTT	2	6	186279	186284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457734
3493	NC_018622	CAG	2	6	186310	186315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457734
3494	NC_018622	GTA	2	6	186325	186330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457734
3495	NC_018622	ATT	2	6	186374	186379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457734
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3500	NC_018622	A	6	6	186616	186621	100 %	0 %	0 %	0 %	407457734

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