MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_018622	TGT	2	6	1124518	1124523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458576
21002	NC_018622	TAAT	2	8	1124590	1124597	50 %	50 %	0 %	0 %	407458577
21003	NC_018622	GAA	2	6	1124618	1124623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458577
21004	NC_018622	GAA	2	6	1124645	1124650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458577
21005	NC_018622	TTG	2	6	1124661	1124666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458577
21006	NC_018622	TTA	2	6	1124747	1124752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458577
21007	NC_018622	AGT	2	6	1124765	1124770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458577
21008	NC_018622	TA	3	6	1124925	1124930	50 %	50 %	0 %	0 %	407458577
21009	NC_018622	CTTT	2	8	1124988	1124995	0 %	75 %	0 %	25 %	407458577
21010	NC_018622	GCT	2	6	1124999	1125004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458577
21011	NC_018622	CTT	2	6	1125030	1125035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458577
21012	NC_018622	CTT	2	6	1125096	1125101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458577
21013	NC_018622	AAG	2	6	1125118	1125123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458577
21014	NC_018622	TGAT	2	8	1125290	1125297	25 %	50 %	25 %	0 %	407458577
21015	NC_018622	TCT	2	6	1125477	1125482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458578
21016	NC_018622	CAG	2	6	1125529	1125534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458578
21017	NC_018622	TA	3	6	1125605	1125610	50 %	50 %	0 %	0 %	407458578
21018	NC_018622	GAG	2	6	1125619	1125624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458578
21019	NC_018622	TAATCC	2	12	1125641	1125652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458578
21020	NC_018622	CTA	2	6	1125688	1125693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458578
21021	NC_018622	TTG	2	6	1125751	1125756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458578
21022	NC_018622	TAA	2	6	1125761	1125766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458578
21023	NC_018622	TCA	2	6	1125807	1125812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458578
21024	NC_018622	CTT	2	6	1125842	1125847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458578
21025	NC_018622	AATA	2	8	1125874	1125881	75 %	25 %	0 %	0 %	407458578
21026	NC_018622	T	6	6	1125896	1125901	0 %	100 %	0 %	0 %	407458578
21027	NC_018622	GTT	3	9	1125918	1125926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458578
21028	NC_018622	CAA	2	6	1125934	1125939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458578
21029	NC_018622	CTC	2	6	1126013	1126018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458578
21030	NC_018622	ATC	2	6	1126034	1126039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458578
21031	NC_018622	ATGAAC	2	12	1126040	1126051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407458578
21032	NC_018622	TCC	2	6	1126124	1126129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458579
21033	NC_018622	GAA	2	6	1126152	1126157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458579
21034	NC_018622	CCA	2	6	1126205	1126210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458579
21035	NC_018622	TCC	2	6	1126242	1126247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407458579
21036	NC_018622	AGA	2	6	1126263	1126268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458579
21037	NC_018622	GTT	2	6	1126271	1126276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458579
21038	NC_018622	AGA	2	6	1126299	1126304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458579
21039	NC_018622	AAT	2	6	1126353	1126358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458579
21040	NC_018622	TTC	2	6	1126366	1126371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458579
21041	NC_018622	A	7	7	1126442	1126448	100 %	0 %	0 %	0 %	407458579
21042	NC_018622	TGC	3	9	1126555	1126563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458580
21043	NC_018622	CAT	2	6	1126590	1126595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458580
21044	NC_018622	GTAA	2	8	1126602	1126609	50 %	25 %	25 %	0 %	407458580
21045	NC_018622	TGT	2	6	1126622	1126627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458580
21046	NC_018622	CAT	2	6	1126671	1126676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458580
21047	NC_018622	CAA	2	6	1126684	1126689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458580
21048	NC_018622	AAT	2	6	1126816	1126821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458580
21049	NC_018622	CAA	2	6	1126845	1126850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458580
21050	NC_018622	TGC	2	6	1126862	1126867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458580
21051	NC_018622	GGA	2	6	1126931	1126936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458580
21052	NC_018622	TGAT	2	8	1126949	1126956	25 %	50 %	25 %	0 %	407458580
21053	NC_018622	TAA	3	9	1126960	1126968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458580
21054	NC_018622	GCC	2	6	1127005	1127010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458580
21055	NC_018622	CAT	2	6	1127016	1127021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458580
21056	NC_018622	CT	3	6	1127052	1127057	0 %	50 %	0 %	50 %	407458580
21057	NC_018622	TAA	2	6	1127058	1127063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458580
21058	NC_018622	TCAA	2	8	1127174	1127181	50 %	25 %	0 %	25 %	407458580
21059	NC_018622	TTGC	2	8	1127202	1127209	0 %	50 %	25 %	25 %	407458580
21060	NC_018622	AAT	2	6	1127243	1127248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458580
21061	NC_018622	AT	3	6	1127282	1127287	50 %	50 %	0 %	0 %	407458580
21062	NC_018622	A	6	6	1127336	1127341	100 %	0 %	0 %	0 %	407458580
21063	NC_018622	GTA	2	6	1127342	1127347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458580
21064	NC_018622	AAT	2	6	1127365	1127370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458580
21065	NC_018622	TAG	2	6	1127451	1127456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458580
21066	NC_018622	ATG	2	6	1127506	1127511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458580
21067	NC_018622	ATG	3	9	1127516	1127524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458580
21068	NC_018622	TCA	2	6	1127543	1127548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458580
21069	NC_018622	A	7	7	1127692	1127698	100 %	0 %	0 %	0 %	407458580
21070	NC_018622	CAA	2	6	1127728	1127733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458580
21071	NC_018622	TCT	2	6	1127771	1127776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458580
21072	NC_018622	AGG	2	6	1127931	1127936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458581
21073	NC_018622	CTA	2	6	1128026	1128031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458581
21074	NC_018622	CTT	2	6	1128056	1128061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458581
21075	NC_018622	AAG	2	6	1128068	1128073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458581
21076	NC_018622	GCAT	2	8	1128090	1128097	25 %	25 %	25 %	25 %	407458581
21077	NC_018622	ATC	2	6	1128105	1128110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458581
21078	NC_018622	AAAG	3	12	1128135	1128146	75 %	0 %	25 %	0 %	407458581
21079	NC_018622	GAC	2	6	1128147	1128152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458581
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21082	NC_018622	T	6	6	1128319	1128324	0 %	100 %	0 %	0 %	407458582
21083	NC_018622	CTT	2	6	1128325	1128330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458582
21084	NC_018622	CAAAA	2	10	1128497	1128506	80 %	0 %	0 %	20 %	407458582
21085	NC_018622	CTG	2	6	1128577	1128582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458582
21086	NC_018622	CCTC	2	8	1128630	1128637	0 %	25 %	0 %	75 %	407458582
21087	NC_018622	CAT	2	6	1128758	1128763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458582
21088	NC_018622	CAC	2	6	1128775	1128780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458582
21089	NC_018622	GAA	2	6	1128781	1128786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458582
21090	NC_018622	CCA	2	6	1128872	1128877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458582
21091	NC_018622	TCA	2	6	1128934	1128939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458582
21092	NC_018622	AAG	2	6	1128969	1128974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458582
21093	NC_018622	T	6	6	1128995	1129000	0 %	100 %	0 %	0 %	407458582
21094	NC_018622	T	6	6	1129043	1129048	0 %	100 %	0 %	0 %	407458582
21095	NC_018622	TCCA	2	8	1129065	1129072	25 %	25 %	0 %	50 %	407458582
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21098	NC_018622	TTC	2	6	1129114	1129119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458582
21099	NC_018622	CTG	2	6	1129120	1129125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458582
21100	NC_018622	AGC	2	6	1129154	1129159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458582
21101	NC_018622	TGC	3	9	1129169	1129177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458582
21102	NC_018622	TTTC	2	8	1129185	1129192	0 %	75 %	0 %	25 %	407458582
21103	NC_018622	AAGA	2	8	1129233	1129240	75 %	0 %	25 %	0 %	407458582
21104	NC_018622	GAC	2	6	1129288	1129293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458582
21105	NC_018622	AAC	2	6	1129300	1129305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458582
21106	NC_018622	TCG	2	6	1129344	1129349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458582
21107	NC_018622	TCT	2	6	1129365	1129370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458582
21108	NC_018622	ATT	2	6	1129379	1129384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458582
21109	NC_018622	TCT	2	6	1129422	1129427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458582
21110	NC_018622	AGC	2	6	1129455	1129460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458582
21111	NC_018622	AAG	2	6	1129464	1129469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458582
21112	NC_018622	CTT	2	6	1129486	1129491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458582
21113	NC_018622	AAT	2	6	1129499	1129504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458582
21114	NC_018622	TGA	2	6	1129528	1129533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458582
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21116	NC_018622	GAA	2	6	1129563	1129568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458582
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21233	NC_018622	CTA	2	6	1135150	1135155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458587
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