MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018622	A	6	6	49880	49885	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1002	NC_018622	TTCC	2	8	49896	49903	0 %	50 %	0 %	50 %	407457591
1003	NC_018622	AAG	2	6	49909	49914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1004	NC_018622	A	6	6	49915	49920	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1005	NC_018622	GAA	3	9	49944	49952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1006	NC_018622	GC	3	6	49970	49975	0 %	0 %	50 %	50 %	407457591
1007	NC_018622	A	6	6	50016	50021	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1008	NC_018622	AGA	2	6	50027	50032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1009	NC_018622	AAG	3	9	50053	50061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1010	NC_018622	AAC	2	6	50122	50127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1011	NC_018622	CAA	2	6	50161	50166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1012	NC_018622	AAG	3	9	50167	50175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1013	NC_018622	TTA	2	6	50268	50273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457591
1014	NC_018622	TC	3	6	50375	50380	0 %	50 %	0 %	50 %	407457591
1015	NC_018622	TGT	2	6	50522	50527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457591
1016	NC_018622	TA	3	6	50548	50553	50 %	50 %	0 %	0 %	407457591
1017	NC_018622	ATT	2	6	50580	50585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457591
1018	NC_018622	ATG	2	6	50602	50607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1019	NC_018622	AGC	2	6	50690	50695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457591
1020	NC_018622	TCC	2	6	50859	50864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457591
1021	NC_018622	AACA	2	8	50873	50880	75 %	0 %	0 %	25 %	407457591
1022	NC_018622	ACT	2	6	50891	50896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
1023	NC_018622	GAT	2	6	50934	50939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1024	NC_018622	GCA	2	6	50952	50957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457591
1025	NC_018622	ATC	2	6	50966	50971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
1026	NC_018622	TCA	2	6	51103	51108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
1027	NC_018622	AAT	2	6	51141	51146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457591
1028	NC_018622	AGT	2	6	51185	51190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1029	NC_018622	TGA	2	6	51305	51310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1030	NC_018622	CCT	2	6	51384	51389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457591
1031	NC_018622	ATG	2	6	51453	51458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1032	NC_018622	TTTGG	2	10	51474	51483	0 %	60 %	40 %	0 %	407457591
1033	NC_018622	CTC	2	6	51540	51545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457591
1034	NC_018622	CAA	2	6	51612	51617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1035	NC_018622	CAT	2	6	51619	51624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
1036	NC_018622	TTG	2	6	51628	51633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457591
1037	NC_018622	AAC	2	6	51653	51658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1038	NC_018622	ATT	2	6	51666	51671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457591
1039	NC_018622	TTG	3	9	51727	51735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457591
1040	NC_018622	GTT	2	6	51759	51764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457591
1041	NC_018622	CTT	2	6	51875	51880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457591
1042	NC_018622	CAG	2	6	51971	51976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457591
1043	NC_018622	ATG	2	6	52008	52013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1044	NC_018622	TTA	2	6	52030	52035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457591
1045	NC_018622	CAA	2	6	52064	52069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1046	NC_018622	C	6	6	52148	52153	0 %	0 %	0 %	100 %	407457591
1047	NC_018622	GAAG	2	8	52720	52727	50 %	0 %	50 %	0 %	407457592
1048	NC_018622	CCT	2	6	52730	52735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457592
1049	NC_018622	T	6	6	52742	52747	0 %	100 %	0 %	0 %	407457592
1050	NC_018622	TGC	2	6	52808	52813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457592
1051	NC_018622	CCT	2	6	52814	52819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457592
1052	NC_018622	TGC	2	6	52820	52825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457592
1053	NC_018622	AGG	2	6	52839	52844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457592
1054	NC_018622	CTT	2	6	52916	52921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457593
1055	NC_018622	TTA	2	6	52933	52938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457593
1056	NC_018622	GTT	2	6	52946	52951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457593
1057	NC_018622	ACG	2	6	52971	52976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457593
1058	NC_018622	TGT	2	6	53009	53014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457593
1059	NC_018622	ATCC	2	8	53026	53033	25 %	25 %	0 %	50 %	407457593
1060	NC_018622	GT	3	6	53100	53105	0 %	50 %	50 %	0 %	407457593
1061	NC_018622	T	6	6	53134	53139	0 %	100 %	0 %	0 %	407457593
1062	NC_018622	CTT	2	6	53166	53171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457593
1063	NC_018622	T	6	6	53170	53175	0 %	100 %	0 %	0 %	407457593
1064	NC_018622	TTC	2	6	53235	53240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457593
1065	NC_018622	AT	3	6	53287	53292	50 %	50 %	0 %	0 %	407457593
1066	NC_018622	AGCA	2	8	53318	53325	50 %	0 %	25 %	25 %	407457593
1067	NC_018622	AAT	2	6	53343	53348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457593
1068	NC_018622	TTCA	2	8	53478	53485	25 %	50 %	0 %	25 %	407457593
1069	NC_018622	A	6	6	53656	53661	100 %	0 %	0 %	0 %	407457593
1070	NC_018622	TCA	2	6	53722	53727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457593
1071	NC_018622	T	6	6	53778	53783	0 %	100 %	0 %	0 %	407457593
1072	NC_018622	CGT	2	6	53841	53846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457593
1073	NC_018622	AGG	2	6	53868	53873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457593
1074	NC_018622	AAG	2	6	53898	53903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457593
1075	NC_018622	GAA	2	6	53915	53920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457593
1076	NC_018622	T	6	6	53936	53941	0 %	100 %	0 %	0 %	407457594
1077	NC_018622	CAG	2	6	53967	53972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457594
1078	NC_018622	AGG	2	6	54035	54040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457594
1079	NC_018622	CGC	2	6	54052	54057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457594
1080	NC_018622	ACC	2	6	54085	54090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457594
1081	NC_018622	GTAT	2	8	54131	54138	25 %	50 %	25 %	0 %	407457594
1082	NC_018622	TCA	2	6	54203	54208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457594
1083	NC_018622	CAG	2	6	54255	54260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457594
1084	NC_018622	TGT	2	6	54282	54287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457594
1085	NC_018622	GTA	2	6	54295	54300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457594
1086	NC_018622	CATA	2	8	54326	54333	50 %	25 %	0 %	25 %	407457594
1087	NC_018622	CTTATC	2	12	54346	54357	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407457594
1088	NC_018622	TTG	2	6	54375	54380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457594
1089	NC_018622	CTT	2	6	54851	54856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457595
1090	NC_018622	TCG	2	6	54871	54876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457595
1091	NC_018622	T	7	7	54911	54917	0 %	100 %	0 %	0 %	407457595
1092	NC_018622	TCT	2	6	54937	54942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457595
1093	NC_018622	T	7	7	54957	54963	0 %	100 %	0 %	0 %	407457595
1094	NC_018622	CTT	2	6	55010	55015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457595
1095	NC_018622	ACG	2	6	55023	55028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457595
1096	NC_018622	TAA	2	6	55037	55042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457595
1097	NC_018622	CTG	2	6	55058	55063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457595
1098	NC_018622	AAATTT	2	12	55114	55125	50 %	50 %	0 %	0 %	407457595
1099	NC_018622	GCA	2	6	55126	55131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457595
1100	NC_018622	ATA	2	6	55132	55137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457595
1101	NC_018622	CTA	2	6	55268	55273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457595
1102	NC_018622	CTT	2	6	55310	55315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457595
1103	NC_018622	AGC	2	6	55332	55337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457595
1104	NC_018622	TTTTC	2	10	55343	55352	0 %	80 %	0 %	20 %	407457595
1105	NC_018622	TCA	2	6	55409	55414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457596
1106	NC_018622	AG	3	6	55430	55435	50 %	0 %	50 %	0 %	407457596
1107	NC_018622	GCT	2	6	55658	55663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457596
1108	NC_018622	GTT	2	6	55673	55678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457596
1109	NC_018622	CTT	2	6	55734	55739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457596
1110	NC_018622	GAG	2	6	55749	55754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457596
1111	NC_018622	TAA	2	6	55795	55800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457596
1112	NC_018622	TCA	2	6	55811	55816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457596
1113	NC_018622	TAGC	2	8	55857	55864	25 %	25 %	25 %	25 %	407457596
1114	NC_018622	CAG	2	6	55878	55883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457596
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1116	NC_018622	TGA	2	6	55926	55931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457596
1117	NC_018622	CTGT	2	8	56036	56043	0 %	50 %	25 %	25 %	407457596
1118	NC_018622	AG	4	8	56044	56051	50 %	0 %	50 %	0 %	407457596
1119	NC_018622	TAG	2	6	56233	56238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457597
1120	NC_018622	GAA	2	6	56251	56256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457597
1121	NC_018622	TGA	2	6	56274	56279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457597
1122	NC_018622	GAA	2	6	56318	56323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457597
1123	NC_018622	CTT	2	6	56328	56333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457597
1124	NC_018622	GCT	2	6	56390	56395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457597
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1253	NC_018622	GAA	2	6	64053	64058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457601
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