MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018622	AGG	2	6	24537	24542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457567
502	NC_018622	GTA	2	6	24550	24555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457567
503	NC_018622	GCA	2	6	24611	24616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457567
504	NC_018622	TTA	2	6	24620	24625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457567
505	NC_018622	AATT	2	8	24627	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
506	NC_018622	ATAA	2	8	24694	24701	75 %	25 %	0 %	0 %	407457567
507	NC_018622	T	8	8	24796	24803	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
508	NC_018622	TGT	2	6	24818	24823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
509	NC_018622	GCT	2	6	24848	24853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457567
510	NC_018622	GCT	2	6	24878	24883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457567
511	NC_018622	CTA	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457567
512	NC_018622	TCTG	2	8	24926	24933	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
513	NC_018622	ACC	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457567
514	NC_018622	TAGT	2	8	24983	24990	25 %	50 %	25 %	0 %	407457567
515	NC_018622	TTG	2	6	25008	25013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
516	NC_018622	TTG	2	6	25018	25023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
517	NC_018622	ATT	2	6	25111	25116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457567
518	NC_018622	T	6	6	25233	25238	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
519	NC_018622	TTGC	2	8	25254	25261	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
520	NC_018622	AGC	2	6	25374	25379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457567
521	NC_018622	TTG	2	6	25387	25392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
522	NC_018622	GAAC	2	8	25442	25449	50 %	0 %	25 %	25 %	407457567
523	NC_018622	GCA	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457567
524	NC_018622	GTT	2	6	25541	25546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
525	NC_018622	CTT	2	6	25587	25592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457567
526	NC_018622	AG	3	6	25609	25614	50 %	0 %	50 %	0 %	407457567
527	NC_018622	GAGT	2	8	25626	25633	25 %	25 %	50 %	0 %	407457567
528	NC_018622	TAA	2	6	25641	25646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457567
529	NC_018622	CTT	3	9	25647	25655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457567
530	NC_018622	CAC	2	6	25656	25661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457567
531	NC_018622	TTA	2	6	25676	25681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457567
532	NC_018622	TTA	2	6	25751	25756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457567
533	NC_018622	TCAT	2	8	25790	25797	25 %	50 %	0 %	25 %	407457567
534	NC_018622	CCA	2	6	25814	25819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457567
535	NC_018622	A	6	6	25864	25869	100 %	0 %	0 %	0 %	407457567
536	NC_018622	TCT	2	6	25916	25921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457567
537	NC_018622	T	6	6	25993	25998	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
538	NC_018622	TCTT	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	407457567
539	NC_018622	T	7	7	26051	26057	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
540	NC_018622	ATAG	2	8	26108	26115	50 %	25 %	25 %	0 %	407457567
541	NC_018622	AAT	2	6	26116	26121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457567
542	NC_018622	TGT	2	6	26209	26214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
543	NC_018622	AGG	2	6	26293	26298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457567
544	NC_018622	AAC	2	6	26327	26332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457567
545	NC_018622	TAAA	2	8	26472	26479	75 %	25 %	0 %	0 %	407457567
546	NC_018622	TA	3	6	26512	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
547	NC_018622	AGA	2	6	26521	26526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457567
548	NC_018622	A	6	6	26771	26776	100 %	0 %	0 %	0 %	407457568
549	NC_018622	ACA	2	6	26806	26811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
550	NC_018622	CCA	2	6	26815	26820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457568
551	NC_018622	TTA	2	6	26822	26827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457568
552	NC_018622	CAA	2	6	26900	26905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
553	NC_018622	TGA	2	6	26908	26913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457568
554	NC_018622	AGA	2	6	26956	26961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
555	NC_018622	TAA	2	6	26971	26976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457568
556	NC_018622	CTG	2	6	27054	27059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457568
557	NC_018622	GTA	2	6	27063	27068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457568
558	NC_018622	ACA	2	6	27112	27117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
559	NC_018622	TTA	2	6	27131	27136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457568
560	NC_018622	A	6	6	27146	27151	100 %	0 %	0 %	0 %	407457568
561	NC_018622	CTGG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	407457568
562	NC_018622	AAG	2	6	27273	27278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
563	NC_018622	AGC	2	6	27289	27294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457568
564	NC_018622	TA	3	6	27372	27377	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
565	NC_018622	AAG	2	6	27386	27391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
566	NC_018622	TCT	2	6	27413	27418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457568
567	NC_018622	GGT	2	6	27428	27433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457568
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569	NC_018622	AGA	3	9	27562	27570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
570	NC_018622	ACA	2	6	27592	27597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
571	NC_018622	AC	3	6	27625	27630	50 %	0 %	0 %	50 %	407457568
572	NC_018622	AATC	2	8	27721	27728	50 %	25 %	0 %	25 %	407457568
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574	NC_018622	GTT	2	6	27791	27796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457568
575	NC_018622	TCA	2	6	27820	27825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457568
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579	NC_018622	AATT	2	8	27958	27965	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
580	NC_018622	TGA	2	6	27973	27978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457568
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583	NC_018622	TA	3	6	28049	28054	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
584	NC_018622	TTG	2	6	28074	28079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457568
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588	NC_018622	CAA	2	6	28286	28291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
589	NC_018622	AGAT	2	8	28452	28459	50 %	25 %	25 %	0 %	407457568
590	NC_018622	ATCG	2	8	28583	28590	25 %	25 %	25 %	25 %	407457568
591	NC_018622	T	6	6	28612	28617	0 %	100 %	0 %	0 %	407457568
592	NC_018622	GAT	2	6	28675	28680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457568
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594	NC_018622	GA	3	6	28758	28763	50 %	0 %	50 %	0 %	407457568
595	NC_018622	AAAT	2	8	28804	28811	75 %	25 %	0 %	0 %	407457568
596	NC_018622	A	7	7	28825	28831	100 %	0 %	0 %	0 %	407457568
597	NC_018622	CAT	2	6	28936	28941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457568
598	NC_018622	GTGA	2	8	29027	29034	25 %	25 %	50 %	0 %	407457568
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600	NC_018622	GGCA	2	8	29082	29089	25 %	0 %	50 %	25 %	407457568
601	NC_018622	AGA	2	6	29104	29109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
602	NC_018622	G	6	6	29147	29152	0 %	0 %	100 %	0 %	407457568
603	NC_018622	CTA	2	6	29169	29174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457568
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608	NC_018622	AGGG	2	8	29426	29433	25 %	0 %	75 %	0 %	407457569
609	NC_018622	GCCAC	2	10	29441	29450	20 %	0 %	20 %	60 %	407457569
610	NC_018622	CAA	2	6	29456	29461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457569
611	NC_018622	TGT	2	6	29526	29531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457569
612	NC_018622	AAG	2	6	29580	29585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457569
613	NC_018622	TAA	2	6	29612	29617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457569
614	NC_018622	GAAT	2	8	29620	29627	50 %	25 %	25 %	0 %	407457570
615	NC_018622	TGC	2	6	29639	29644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457570
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617	NC_018622	GAA	2	6	29686	29691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457570
618	NC_018622	AAT	2	6	29704	29709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457570
619	NC_018622	TAA	2	6	29760	29765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457570
620	NC_018622	CGT	2	6	29906	29911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457570
621	NC_018622	AG	3	6	29920	29925	50 %	0 %	50 %	0 %	407457570
622	NC_018622	T	6	6	29935	29940	0 %	100 %	0 %	0 %	407457570
623	NC_018622	ATC	2	6	29965	29970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457570
624	NC_018622	AGA	2	6	29984	29989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457570
625	NC_018622	TTG	2	6	29995	30000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457570
626	NC_018622	GTT	2	6	30203	30208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457570
627	NC_018622	TAG	2	6	30229	30234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457570
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760	NC_018622	TAAT	2	8	38213	38220	50 %	50 %	0 %	0 %	407457579
761	NC_018622	T	8	8	38247	38254	0 %	100 %	0 %	0 %	407457579
762	NC_018622	T	6	6	38262	38267	0 %	100 %	0 %	0 %	407457579
763	NC_018622	TGA	2	6	38271	38276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457579
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765	NC_018622	TCT	2	6	38374	38379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457579
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767	NC_018622	CG	3	6	38497	38502	0 %	0 %	50 %	50 %	407457579
768	NC_018622	TA	3	6	38503	38508	50 %	50 %	0 %	0 %	407457579
769	NC_018622	AAGGA	2	10	38573	38582	60 %	0 %	40 %	0 %	407457579
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773	NC_018622	TTTA	2	8	38682	38689	25 %	75 %	0 %	0 %	407457579
774	NC_018622	T	6	6	38756	38761	0 %	100 %	0 %	0 %	407457579
775	NC_018622	A	6	6	38769	38774	100 %	0 %	0 %	0 %	407457579
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782	NC_018622	A	7	7	39101	39107	100 %	0 %	0 %	0 %	407457579
783	NC_018622	A	6	6	39531	39536	100 %	0 %	0 %	0 %	407457580
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788	NC_018622	GAA	2	6	39811	39816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457580
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