MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018622	ACA	2	6	322790	322795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457848
6002	NC_018622	AGC	2	6	322819	322824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457848
6003	NC_018622	AGC	2	6	322915	322920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457848
6004	NC_018622	T	6	6	322933	322938	0 %	100 %	0 %	0 %	407457848
6005	NC_018622	GTG	2	6	322952	322957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457848
6006	NC_018622	CCA	2	6	323012	323017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457848
6007	NC_018622	CAAA	2	8	323040	323047	75 %	0 %	0 %	25 %	407457848
6008	NC_018622	TAT	2	6	323055	323060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457848
6009	NC_018622	CTC	2	6	323076	323081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457848
6010	NC_018622	ATT	2	6	323104	323109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457848
6011	NC_018622	AGA	2	6	323116	323121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457848
6012	NC_018622	TCC	2	6	323194	323199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457848
6013	NC_018622	GTT	2	6	323242	323247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457848
6014	NC_018622	GAA	2	6	323288	323293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457848
6015	NC_018622	AGC	2	6	323299	323304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457848
6016	NC_018622	TGTC	2	8	323305	323312	0 %	50 %	25 %	25 %	407457848
6017	NC_018622	TCC	2	6	323356	323361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457848
6018	NC_018622	TGCA	2	8	323434	323441	25 %	25 %	25 %	25 %	407457848
6019	NC_018622	TA	3	6	323496	323501	50 %	50 %	0 %	0 %	407457848
6020	NC_018622	AAG	2	6	323502	323507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457848
6021	NC_018622	CCT	2	6	323674	323679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457849
6022	NC_018622	AGA	2	6	323700	323705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457849
6023	NC_018622	TGA	2	6	323761	323766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
6024	NC_018622	TTG	2	6	323804	323809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6025	NC_018622	TTGT	2	8	323917	323924	0 %	75 %	25 %	0 %	407457849
6026	NC_018622	T	6	6	323924	323929	0 %	100 %	0 %	0 %	407457849
6027	NC_018622	TCC	2	6	323997	324002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457849
6028	NC_018622	TCT	2	6	324019	324024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6029	NC_018622	TGT	2	6	324025	324030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6030	NC_018622	GAAAG	2	10	324054	324063	60 %	0 %	40 %	0 %	407457849
6031	NC_018622	TTC	2	6	324066	324071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6032	NC_018622	GAT	2	6	324080	324085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
6033	NC_018622	GTT	2	6	324132	324137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6034	NC_018622	TAAC	2	8	324290	324297	50 %	25 %	0 %	25 %	407457849
6035	NC_018622	GGT	2	6	324353	324358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457849
6036	NC_018622	TG	3	6	324421	324426	0 %	50 %	50 %	0 %	407457849
6037	NC_018622	CAA	2	6	324434	324439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457849
6038	NC_018622	CTT	2	6	324467	324472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6039	NC_018622	AAG	2	6	324496	324501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457849
6040	NC_018622	CAA	2	6	324560	324565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457849
6041	NC_018622	ACGC	2	8	324575	324582	25 %	0 %	25 %	50 %	407457849
6042	NC_018622	GTA	2	6	324796	324801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
6043	NC_018622	AAG	2	6	324817	324822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457849
6044	NC_018622	TAA	2	6	324843	324848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457849
6045	NC_018622	GCT	2	6	324928	324933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6046	NC_018622	TTA	2	6	324982	324987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457849
6047	NC_018622	TCT	2	6	325012	325017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6048	NC_018622	CTT	2	6	325051	325056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6049	NC_018622	AGA	2	6	325074	325079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457849
6050	NC_018622	AGC	2	6	325164	325169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6051	NC_018622	CCAT	2	8	325198	325205	25 %	25 %	0 %	50 %	407457849
6052	NC_018622	CTT	2	6	325220	325225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6053	NC_018622	CAA	2	6	325241	325246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457849
6054	NC_018622	TTG	2	6	325313	325318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6055	NC_018622	TC	3	6	325355	325360	0 %	50 %	0 %	50 %	407457849
6056	NC_018622	TA	3	6	325382	325387	50 %	50 %	0 %	0 %	407457849
6057	NC_018622	TTG	2	6	325395	325400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6058	NC_018622	GT	3	6	325439	325444	0 %	50 %	50 %	0 %	407457849
6059	NC_018622	GCA	2	6	325477	325482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6060	NC_018622	AGC	3	9	325566	325574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6061	NC_018622	AGT	2	6	325581	325586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
6062	NC_018622	TAT	2	6	325685	325690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457849
6063	NC_018622	AGA	2	6	325785	325790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457849
6064	NC_018622	TTG	2	6	325809	325814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6065	NC_018622	TAG	2	6	325823	325828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
6066	NC_018622	GCT	2	6	325879	325884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6067	NC_018622	AGC	2	6	325920	325925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6068	NC_018622	CCT	2	6	325966	325971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457849
6069	NC_018622	ATT	2	6	325983	325988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457849
6070	NC_018622	ACT	2	6	326020	326025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457849
6071	NC_018622	TTA	3	9	326065	326073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457849
6072	NC_018622	CAG	2	6	326114	326119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6073	NC_018622	TTG	2	6	326130	326135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6074	NC_018622	CTA	2	6	326159	326164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457849
6075	NC_018622	GTTT	2	8	326191	326198	0 %	75 %	25 %	0 %	407457849
6076	NC_018622	AATA	2	8	326258	326265	75 %	25 %	0 %	0 %	407457849
6077	NC_018622	CCA	2	6	326269	326274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457849
6078	NC_018622	CTT	2	6	326288	326293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6079	NC_018622	T	6	6	326315	326320	0 %	100 %	0 %	0 %	407457849
6080	NC_018622	GGA	2	6	326340	326345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457849
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6083	NC_018622	AC	3	6	326498	326503	50 %	0 %	0 %	50 %	407457849
6084	NC_018622	CTA	2	6	326536	326541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457849
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6087	NC_018622	CAC	2	6	326609	326614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457849
6088	NC_018622	TCT	2	6	326647	326652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6089	NC_018622	TAG	2	6	326669	326674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
6090	NC_018622	ACT	2	6	326784	326789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457849
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6092	NC_018622	TGT	2	6	326903	326908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
6093	NC_018622	AG	3	6	326980	326985	50 %	0 %	50 %	0 %	407457849
6094	NC_018622	AAC	2	6	327002	327007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457849
6095	NC_018622	TGT	2	6	327036	327041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
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6099	NC_018622	CTTT	2	8	327166	327173	0 %	75 %	0 %	25 %	407457849
6100	NC_018622	TCT	2	6	327190	327195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
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6102	NC_018622	TG	3	6	327235	327240	0 %	50 %	50 %	0 %	407457849
6103	NC_018622	CAG	2	6	327245	327250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457849
6104	NC_018622	GAT	2	6	327329	327334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
6105	NC_018622	TCT	2	6	327337	327342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457849
6106	NC_018622	CT	3	6	327355	327360	0 %	50 %	0 %	50 %	407457849
6107	NC_018622	T	6	6	327360	327365	0 %	100 %	0 %	0 %	407457849
6108	NC_018622	ATC	2	6	327366	327371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457849
6109	NC_018622	TGGA	2	8	327395	327402	25 %	25 %	50 %	0 %	407457849
6110	NC_018622	TGT	2	6	327442	327447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457849
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6113	NC_018622	GAT	2	6	327670	327675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457849
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6116	NC_018622	AATTT	2	10	327954	327963	40 %	60 %	0 %	0 %	407457850
6117	NC_018622	GCA	2	6	327999	328004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457850
6118	NC_018622	T	6	6	328020	328025	0 %	100 %	0 %	0 %	407457850
6119	NC_018622	TTA	2	6	328046	328051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457850
6120	NC_018622	GTAA	2	8	328083	328090	50 %	25 %	25 %	0 %	407457850
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6492	NC_018622	AG	3	6	349766	349771	50 %	0 %	50 %	0 %	407457869
6493	NC_018622	CAT	2	6	349827	349832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457869
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