MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018622	ATC	2	6	268734	268739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457814
5002	NC_018622	TCTT	2	8	268831	268838	0 %	75 %	0 %	25 %	407457814
5003	NC_018622	TGA	2	6	268897	268902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457814
5004	NC_018622	TA	4	8	269007	269014	50 %	50 %	0 %	0 %	407457814
5005	NC_018622	GAA	2	6	269102	269107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457814
5006	NC_018622	ATT	2	6	269247	269252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457814
5007	NC_018622	AGG	2	6	269309	269314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457815
5008	NC_018622	AT	3	6	269346	269351	50 %	50 %	0 %	0 %	407457815
5009	NC_018622	GAA	2	6	269382	269387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457815
5010	NC_018622	GGTT	2	8	269425	269432	0 %	50 %	50 %	0 %	407457815
5011	NC_018622	TTGGT	2	10	269445	269454	0 %	60 %	40 %	0 %	407457815
5012	NC_018622	TC	4	8	269470	269477	0 %	50 %	0 %	50 %	407457815
5013	NC_018622	GCA	2	6	269484	269489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457815
5014	NC_018622	AGG	2	6	269513	269518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457815
5015	NC_018622	T	6	6	269519	269524	0 %	100 %	0 %	0 %	407457815
5016	NC_018622	GAG	2	6	269634	269639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457815
5017	NC_018622	TGTA	2	8	269661	269668	25 %	50 %	25 %	0 %	407457815
5018	NC_018622	AG	3	6	269726	269731	50 %	0 %	50 %	0 %	407457815
5019	NC_018622	TCC	3	9	269780	269788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457815
5020	NC_018622	ATG	2	6	269793	269798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457815
5021	NC_018622	GGA	2	6	269814	269819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457815
5022	NC_018622	AAT	2	6	269865	269870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457815
5023	NC_018622	TCT	2	6	269880	269885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457815
5024	NC_018622	TAG	2	6	270147	270152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457815
5025	NC_018622	AAG	3	9	270187	270195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457815
5026	NC_018622	GA	3	6	270205	270210	50 %	0 %	50 %	0 %	407457815
5027	NC_018622	AAG	2	6	270255	270260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457815
5028	NC_018622	GTT	2	6	270271	270276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457815
5029	NC_018622	T	8	8	270312	270319	0 %	100 %	0 %	0 %	407457815
5030	NC_018622	AAAT	2	8	270391	270398	75 %	25 %	0 %	0 %	407457815
5031	NC_018622	GTT	2	6	270426	270431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457815
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5033	NC_018622	GAA	2	6	270527	270532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457815
5034	NC_018622	TG	3	6	270600	270605	0 %	50 %	50 %	0 %	407457815
5035	NC_018622	TGT	2	6	270633	270638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457815
5036	NC_018622	ACA	2	6	270663	270668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457815
5037	NC_018622	AGGA	2	8	270821	270828	50 %	0 %	50 %	0 %	407457815
5038	NC_018622	GTC	2	6	270893	270898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457815
5039	NC_018622	TTCT	2	8	270982	270989	0 %	75 %	0 %	25 %	407457815
5040	NC_018622	AAT	2	6	271032	271037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457815
5041	NC_018622	GTA	3	9	271108	271116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457815
5042	NC_018622	AAG	2	6	271236	271241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457815
5043	NC_018622	TATTTC	2	12	271259	271270	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407457815
5044	NC_018622	GTAT	2	8	271277	271284	25 %	50 %	25 %	0 %	407457815
5045	NC_018622	CGT	2	6	271336	271341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457815
5046	NC_018622	AT	3	6	271365	271370	50 %	50 %	0 %	0 %	407457815
5047	NC_018622	AAG	2	6	271526	271531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457816
5048	NC_018622	AC	3	6	271539	271544	50 %	0 %	0 %	50 %	407457816
5049	NC_018622	TGA	2	6	271562	271567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457816
5050	NC_018622	TTG	2	6	271603	271608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457816
5051	NC_018622	TG	4	8	271664	271671	0 %	50 %	50 %	0 %	407457816
5052	NC_018622	A	6	6	271699	271704	100 %	0 %	0 %	0 %	407457816
5053	NC_018622	CAC	2	6	271713	271718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457816
5054	NC_018622	AAC	2	6	271777	271782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457816
5055	NC_018622	AGA	2	6	271796	271801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457816
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5057	NC_018622	AAG	2	6	271870	271875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457816
5058	NC_018622	GAA	2	6	271917	271922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457816
5059	NC_018622	GGA	2	6	271924	271929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457816
5060	NC_018622	TGT	2	6	272027	272032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457816
5061	NC_018622	T	6	6	272067	272072	0 %	100 %	0 %	0 %	407457816
5062	NC_018622	TGGCA	2	10	272083	272092	20 %	20 %	40 %	20 %	407457816
5063	NC_018622	T	8	8	272103	272110	0 %	100 %	0 %	0 %	407457816
5064	NC_018622	GGT	2	6	272112	272117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457816
5065	NC_018622	TTC	2	6	272167	272172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457816
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5067	NC_018622	GAA	2	6	272259	272264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457816
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5075	NC_018622	TTA	2	6	272724	272729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457818
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5079	NC_018622	GAT	2	6	273093	273098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457818
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5081	NC_018622	ATG	2	6	273187	273192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457818
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5086	NC_018622	TC	3	6	273327	273332	0 %	50 %	0 %	50 %	407457818
5087	NC_018622	AAG	2	6	273370	273375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457818
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5099	NC_018622	AG	3	6	273957	273962	50 %	0 %	50 %	0 %	407457818
5100	NC_018622	TGCT	2	8	273985	273992	0 %	50 %	25 %	25 %	407457818
5101	NC_018622	AGTAA	2	10	274005	274014	60 %	20 %	20 %	0 %	407457818
5102	NC_018622	A	7	7	274013	274019	100 %	0 %	0 %	0 %	407457818
5103	NC_018622	CAA	2	6	274047	274052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457818
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5105	NC_018622	ATT	2	6	274076	274081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457818
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5108	NC_018622	TGT	2	6	274305	274310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457818
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5112	NC_018622	T	7	7	274578	274584	0 %	100 %	0 %	0 %	407457819
5113	NC_018622	AG	3	6	274589	274594	50 %	0 %	50 %	0 %	407457819
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5369	NC_018622	ATT	2	6	287755	287760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457830
5370	NC_018622	GAA	2	6	287774	287779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457830
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5372	NC_018622	TGGA	2	8	287924	287931	25 %	25 %	50 %	0 %	407457830
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5381	NC_018622	AGG	2	6	288643	288648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457830
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5385	NC_018622	CTG	2	6	288923	288928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457830
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5462	NC_018622	GAT	2	6	292746	292751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457832
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5488	NC_018622	TCTTTT	2	12	294237	294248	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407457833
5489	NC_018622	TTG	2	6	294260	294265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457833
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5491	NC_018622	TGT	2	6	294308	294313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457833
5492	NC_018622	TGG	2	6	294372	294377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457833
5493	NC_018622	GCC	2	6	294398	294403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457833
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5495	NC_018622	GTA	2	6	294462	294467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457833
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