MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 21342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018622	GAA	2	6	242453	242458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
4502	NC_018622	ATT	2	6	242468	242473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
4503	NC_018622	GAA	2	6	242561	242566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
4504	NC_018622	TTA	2	6	242588	242593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
4505	NC_018622	TTTAG	2	10	242632	242641	20 %	60 %	20 %	0 %	407457785
4506	NC_018622	AG	3	6	242702	242707	50 %	0 %	50 %	0 %	407457786
4507	NC_018622	T	7	7	242733	242739	0 %	100 %	0 %	0 %	407457786
4508	NC_018622	GCA	2	6	242763	242768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457786
4509	NC_018622	AAG	2	6	242778	242783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457786
4510	NC_018622	TAAT	2	8	242830	242837	50 %	50 %	0 %	0 %	407457786
4511	NC_018622	ATG	2	6	242889	242894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457786
4512	NC_018622	ACT	2	6	242907	242912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457786
4513	NC_018622	GCT	2	6	242928	242933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457786
4514	NC_018622	CGT	2	6	242973	242978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457786
4515	NC_018622	CTC	2	6	242986	242991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457786
4516	NC_018622	GAA	2	6	243086	243091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457786
4517	NC_018622	ATCG	2	8	243153	243160	25 %	25 %	25 %	25 %	407457786
4518	NC_018622	CAG	2	6	243175	243180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457786
4519	NC_018622	TTA	2	6	243201	243206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457786
4520	NC_018622	AAT	2	6	243303	243308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457787
4521	NC_018622	TTC	2	6	243353	243358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457787
4522	NC_018622	CTT	2	6	243359	243364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457787
4523	NC_018622	CTG	2	6	243368	243373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457787
4524	NC_018622	TTA	2	6	243383	243388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457787
4525	NC_018622	ATG	2	6	243395	243400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457787
4526	NC_018622	TG	3	6	243419	243424	0 %	50 %	50 %	0 %	407457787
4527	NC_018622	GTTGT	2	10	243437	243446	0 %	60 %	40 %	0 %	407457787
4528	NC_018622	A	6	6	243469	243474	100 %	0 %	0 %	0 %	407457787
4529	NC_018622	GGTA	2	8	243502	243509	25 %	25 %	50 %	0 %	407457787
4530	NC_018622	GTT	2	6	243538	243543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457787
4531	NC_018622	CA	4	8	243590	243597	50 %	0 %	0 %	50 %	407457787
4532	NC_018622	TTG	2	6	243650	243655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457787
4533	NC_018622	AG	3	6	243811	243816	50 %	0 %	50 %	0 %	407457787
4534	NC_018622	GCG	2	6	243847	243852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457787
4535	NC_018622	GT	3	6	243947	243952	0 %	50 %	50 %	0 %	407457787
4536	NC_018622	AAAG	2	8	243973	243980	75 %	0 %	25 %	0 %	407457787
4537	NC_018622	TTA	2	6	244158	244163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457788
4538	NC_018622	TTTA	2	8	244216	244223	25 %	75 %	0 %	0 %	407457788
4539	NC_018622	AAG	2	6	244270	244275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457788
4540	NC_018622	GAA	2	6	244293	244298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457788
4541	NC_018622	A	6	6	244384	244389	100 %	0 %	0 %	0 %	407457788
4542	NC_018622	GCA	2	6	244499	244504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457788
4543	NC_018622	TAT	2	6	244532	244537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457788
4544	NC_018622	TAA	3	9	244550	244558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457788
4545	NC_018622	GAA	2	6	244575	244580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457788
4546	NC_018622	GTT	2	6	244670	244675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457788
4547	NC_018622	TCC	2	6	244739	244744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457788
4548	NC_018622	TTTCCT	2	12	244823	244834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457788
4549	NC_018622	GAA	3	9	244887	244895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457788
4550	NC_018622	GA	3	6	244959	244964	50 %	0 %	50 %	0 %	407457788
4551	NC_018622	TTC	2	6	245025	245030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457788
4552	NC_018622	GAC	3	9	245037	245045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457788
4553	NC_018622	TGA	2	6	245051	245056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457788
4554	NC_018622	AGCT	2	8	245161	245168	25 %	25 %	25 %	25 %	407457789
4555	NC_018622	T	7	7	245172	245178	0 %	100 %	0 %	0 %	407457789
4556	NC_018622	GTT	2	6	245207	245212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457789
4557	NC_018622	GAG	2	6	245357	245362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457789
4558	NC_018622	TTTAGG	2	12	245430	245441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407457789
4559	NC_018622	CTC	2	6	245484	245489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457789
4560	NC_018622	TAAAAG	2	12	245522	245533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407457789
4561	NC_018622	GTT	2	6	245549	245554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457789
4562	NC_018622	ATG	2	6	245712	245717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457789
4563	NC_018622	AGATA	2	10	245727	245736	60 %	20 %	20 %	0 %	407457789
4564	NC_018622	TTATC	2	10	245741	245750	20 %	60 %	0 %	20 %	407457789
4565	NC_018622	TTG	2	6	245794	245799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457790
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4567	NC_018622	TCT	3	9	245846	245854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457790
4568	NC_018622	AGT	2	6	245877	245882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457790
4569	NC_018622	GCT	2	6	245936	245941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457790
4570	NC_018622	AG	3	6	245966	245971	50 %	0 %	50 %	0 %	407457790
4571	NC_018622	CTT	2	6	245982	245987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457790
4572	NC_018622	GAT	2	6	246009	246014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457790
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4574	NC_018622	CAT	2	6	246168	246173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457790
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4577	NC_018622	AGC	2	6	246268	246273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457790
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4582	NC_018622	AGA	2	6	246635	246640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457791
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4588	NC_018622	ATC	2	6	246902	246907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457791
4589	NC_018622	TG	3	6	246933	246938	0 %	50 %	50 %	0 %	407457791
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4593	NC_018622	T	6	6	247125	247130	0 %	100 %	0 %	0 %	407457791
4594	NC_018622	GTTT	2	8	247226	247233	0 %	75 %	25 %	0 %	407457791
4595	NC_018622	GTA	2	6	247256	247261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457791
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4598	NC_018622	TAG	2	6	247429	247434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457791
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4600	NC_018622	GGA	2	6	247451	247456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457791
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4604	NC_018622	TCT	2	6	247560	247565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457791
4605	NC_018622	ATC	2	6	247592	247597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457791
4606	NC_018622	GTTT	2	8	247687	247694	0 %	75 %	25 %	0 %	407457792
4607	NC_018622	T	6	6	247704	247709	0 %	100 %	0 %	0 %	407457792
4608	NC_018622	AAT	2	6	247798	247803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457792
4609	NC_018622	TCA	2	6	247835	247840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457792
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4611	NC_018622	TAC	2	6	248030	248035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457793
4612	NC_018622	GAA	2	6	248043	248048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457793
4613	NC_018622	TTGAG	2	10	248089	248098	20 %	40 %	40 %	0 %	407457793
4614	NC_018622	GTT	2	6	248155	248160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457793
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4616	NC_018622	GA	3	6	248259	248264	50 %	0 %	50 %	0 %	407457793
4617	NC_018622	TATT	2	8	248275	248282	25 %	75 %	0 %	0 %	407457793
4618	NC_018622	GAA	2	6	248331	248336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457793
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4993	NC_018622	GTT	2	6	268289	268294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457814
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