MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018621	GAAAA	2	10	3358	3367	80 %	0 %	20 %	0 %	407456176
2	NC_018621	TGTTT	2	10	6763	6772	0 %	80 %	20 %	0 %	407456178
3	NC_018621	AACAT	2	10	7327	7336	60 %	20 %	0 %	20 %	407456179
4	NC_018621	AAGAA	2	10	9572	9581	80 %	0 %	20 %	0 %	407456181
5	NC_018621	ATAAA	2	10	13047	13056	80 %	20 %	0 %	0 %	407456182
6	NC_018621	AACTC	2	10	13491	13500	40 %	20 %	0 %	40 %	407456182
7	NC_018621	GTTTT	2	10	13561	13570	0 %	80 %	20 %	0 %	407456182
8	NC_018621	GAAAC	2	10	14329	14338	60 %	0 %	20 %	20 %	407456183
9	NC_018621	AACAA	2	10	15358	15367	80 %	0 %	0 %	20 %	407456183
10	NC_018621	AATAG	2	10	17070	17079	60 %	20 %	20 %	0 %	407456185
11	NC_018621	GCCTA	2	10	19906	19915	20 %	20 %	20 %	40 %	407456187
12	NC_018621	AGTGT	2	10	21120	21129	20 %	40 %	40 %	0 %	407456188
13	NC_018621	GCCAC	2	10	29448	29457	20 %	0 %	20 %	60 %	407456194
14	NC_018621	AAGGA	2	10	38578	38587	60 %	0 %	40 %	0 %	407456206
15	NC_018621	CCATA	2	10	38785	38794	40 %	20 %	0 %	40 %	407456206
16	NC_018621	CTTTA	2	10	38951	38960	20 %	60 %	0 %	20 %	407456206
17	NC_018621	CTTTC	2	10	43214	43223	0 %	60 %	0 %	40 %	407456212
18	NC_018621	ACAAA	2	10	43876	43885	80 %	0 %	0 %	20 %	407456213
19	NC_018621	TATGG	2	10	44286	44295	20 %	40 %	40 %	0 %	407456214
20	NC_018621	TTGTC	2	10	45145	45154	0 %	60 %	20 %	20 %	407456214
21	NC_018621	TCTTT	2	10	46094	46103	0 %	80 %	0 %	20 %	407456216
22	NC_018621	AGCCC	2	10	47091	47100	20 %	0 %	20 %	60 %	407456217
23	NC_018621	TCAAA	2	10	47446	47455	60 %	20 %	0 %	20 %	407456217
24	NC_018621	TCTAT	2	10	49563	49572	20 %	60 %	0 %	20 %	407456220
25	NC_018621	TTTGG	2	10	51477	51486	0 %	60 %	40 %	0 %	407456220
26	NC_018621	TTTTC	2	10	55346	55355	0 %	80 %	0 %	20 %	407456224
27	NC_018621	GTAAG	2	10	57394	57403	40 %	20 %	40 %	0 %	407456227
28	NC_018621	AAAAT	2	10	60184	60193	80 %	20 %	0 %	0 %	407456229
29	NC_018621	GTTAT	2	10	61217	61226	20 %	60 %	20 %	0 %	407456229
30	NC_018621	AGTTT	2	10	62787	62796	20 %	60 %	20 %	0 %	407456229
31	NC_018621	GAATG	2	10	62802	62811	40 %	20 %	40 %	0 %	407456229
32	NC_018621	TCCTA	2	10	64851	64860	20 %	40 %	0 %	40 %	407456230
33	NC_018621	GGATA	2	10	70913	70922	40 %	20 %	40 %	0 %	407456236
34	NC_018621	ATAGC	2	10	74352	74361	40 %	20 %	20 %	20 %	407456240
35	NC_018621	GCACA	2	10	77185	77194	40 %	0 %	20 %	40 %	407456242
36	NC_018621	AAAGA	2	10	78138	78147	80 %	0 %	20 %	0 %	407456243
37	NC_018621	AGTTC	2	10	79143	79152	20 %	40 %	20 %	20 %	407456243
38	NC_018621	CGTAT	2	10	81511	81520	20 %	40 %	20 %	20 %	407456246
39	NC_018621	GAAAA	2	10	82721	82730	80 %	0 %	20 %	0 %	407456247
40	NC_018621	CTTTT	2	10	85609	85618	0 %	80 %	0 %	20 %	407456251
41	NC_018621	CAAAG	2	10	87081	87090	60 %	0 %	20 %	20 %	407456253
42	NC_018621	AACAA	2	10	87248	87257	80 %	0 %	0 %	20 %	407456253
43	NC_018621	AAAGA	2	10	89145	89154	80 %	0 %	20 %	0 %	407456256
44	NC_018621	TTTTC	2	10	90160	90169	0 %	80 %	0 %	20 %	407456256
45	NC_018621	AGGAT	2	10	90683	90692	40 %	20 %	40 %	0 %	407456256
46	NC_018621	ATAAC	2	10	90769	90778	60 %	20 %	0 %	20 %	407456256
47	NC_018621	TGGCA	2	10	93254	93263	20 %	20 %	40 %	20 %	407456257
48	NC_018621	TCACC	2	10	96552	96561	20 %	20 %	0 %	60 %	407456261
49	NC_018621	AAAAT	2	10	96687	96696	80 %	20 %	0 %	0 %	407456262
50	NC_018621	TTAAT	2	10	97731	97740	40 %	60 %	0 %	0 %	407456263
51	NC_018621	ATTAC	2	10	102862	102871	40 %	40 %	0 %	20 %	407456271
52	NC_018621	CTACA	2	10	103236	103245	40 %	20 %	0 %	40 %	407456271
53	NC_018621	AATTA	2	10	104783	104792	60 %	40 %	0 %	0 %	407456273
54	NC_018621	CTATA	2	10	105773	105782	40 %	40 %	0 %	20 %	407456274
55	NC_018621	AGCTT	2	10	108427	108436	20 %	40 %	20 %	20 %	407456278
56	NC_018621	GTTTG	2	10	108734	108743	0 %	60 %	40 %	0 %	407456278
57	NC_018621	AGTTA	2	10	115535	115544	40 %	40 %	20 %	0 %	407456293
58	NC_018621	AGTTT	2	10	116025	116034	20 %	60 %	20 %	0 %	407456294
59	NC_018621	TTTGC	2	10	116940	116949	0 %	60 %	20 %	20 %	407456296
60	NC_018621	TTTAC	2	10	119137	119146	20 %	60 %	0 %	20 %	407456299
61	NC_018621	AATTA	2	10	122030	122039	60 %	40 %	0 %	0 %	407456302
62	NC_018621	GAGAT	2	10	123382	123391	40 %	20 %	40 %	0 %	407456303
63	NC_018621	GTCAA	2	10	124701	124710	40 %	20 %	20 %	20 %	407456305
64	NC_018621	TAGGG	2	10	127173	127182	20 %	20 %	60 %	0 %	407456308
65	NC_018621	AACTT	2	10	128105	128114	40 %	40 %	0 %	20 %	407456308
66	NC_018621	TGTCA	2	10	131989	131998	20 %	40 %	20 %	20 %	407456312
67	NC_018621	AAAAG	2	10	135395	135404	80 %	0 %	20 %	0 %	407456314
68	NC_018621	TAAAA	2	10	135676	135685	80 %	20 %	0 %	0 %	407456314
69	NC_018621	GATTT	2	10	137935	137944	20 %	60 %	20 %	0 %	407456316
70	NC_018621	TTGTT	2	10	138277	138286	0 %	80 %	20 %	0 %	407456316
71	NC_018621	AAGAA	2	10	138758	138767	80 %	0 %	20 %	0 %	407456316
72	NC_018621	TTCTT	2	10	139351	139360	0 %	80 %	0 %	20 %	407456318
73	NC_018621	CTTTG	2	10	141255	141264	0 %	60 %	20 %	20 %	407456320
74	NC_018621	AGAAA	2	10	143291	143300	80 %	0 %	20 %	0 %	407456324
75	NC_018621	AAAGA	2	10	145956	145965	80 %	0 %	20 %	0 %	407456326
76	NC_018621	TACTC	2	10	149587	149596	20 %	40 %	0 %	40 %	407456333
77	NC_018621	CGTTT	2	10	149634	149643	0 %	60 %	20 %	20 %	407456333
78	NC_018621	ATTTT	2	10	149774	149783	20 %	80 %	0 %	0 %	407456333
79	NC_018621	ACCAT	2	10	151805	151814	40 %	20 %	0 %	40 %	407456334
80	NC_018621	CAGAA	2	10	152770	152779	60 %	0 %	20 %	20 %	407456335
81	NC_018621	TTCAT	2	10	153340	153349	20 %	60 %	0 %	20 %	407456335
82	NC_018621	AAAGG	2	10	154170	154179	60 %	0 %	40 %	0 %	407456336
83	NC_018621	ATAGG	2	10	155862	155871	40 %	20 %	40 %	0 %	407456338
84	NC_018621	TTTGA	2	10	155948	155957	20 %	60 %	20 %	0 %	407456338
85	NC_018621	AAGGT	2	10	160888	160897	40 %	20 %	40 %	0 %	407456342
86	NC_018621	TTTTG	2	10	161827	161836	0 %	80 %	20 %	0 %	407456344
87	NC_018621	GGGGC	2	10	161974	161983	0 %	0 %	80 %	20 %	407456344
88	NC_018621	AGCAT	2	10	163266	163275	40 %	20 %	20 %	20 %	407456346
89	NC_018621	AAATG	2	10	166379	166388	60 %	20 %	20 %	0 %	407456348
90	NC_018621	GGGGA	2	10	168154	168163	20 %	0 %	80 %	0 %	407456349
91	NC_018621	CTGTT	2	10	169680	169689	0 %	60 %	20 %	20 %	407456351
92	NC_018621	AATGA	2	10	169715	169724	60 %	20 %	20 %	0 %	407456351
93	NC_018621	ATTTT	2	10	173174	173183	20 %	80 %	0 %	0 %	407456356
94	NC_018621	GAGAG	2	10	173191	173200	40 %	0 %	60 %	0 %	407456356
95	NC_018621	CTAAG	2	10	181139	181148	40 %	20 %	20 %	20 %	407456364
96	NC_018621	TTTTC	2	10	181738	181747	0 %	80 %	0 %	20 %	407456364
97	NC_018621	GGTAC	2	10	183733	183742	20 %	20 %	40 %	20 %	407456366
98	NC_018621	AGGGA	2	10	186920	186929	40 %	0 %	60 %	0 %	407456371
99	NC_018621	AGGAA	2	10	187943	187952	60 %	0 %	40 %	0 %	407456372
100	NC_018621	TTCTT	2	10	188322	188331	0 %	80 %	0 %	20 %	407456372
101	NC_018621	GATAA	2	10	190965	190974	60 %	20 %	20 %	0 %	407456372
102	NC_018621	CCCTT	2	10	193169	193178	0 %	40 %	0 %	60 %	407456373
103	NC_018621	AGTTA	2	10	194160	194169	40 %	40 %	20 %	0 %	407456374
104	NC_018621	TTATT	2	10	194180	194189	20 %	80 %	0 %	0 %	407456374
105	NC_018621	AGGGT	2	10	197104	197113	20 %	20 %	60 %	0 %	407456376
106	NC_018621	TGGAT	2	10	197545	197554	20 %	40 %	40 %	0 %	407456376
107	NC_018621	CTAAA	2	10	197602	197611	60 %	20 %	0 %	20 %	407456376
108	NC_018621	CTTTA	2	10	197905	197914	20 %	60 %	0 %	20 %	407456376
109	NC_018621	AAAAT	2	10	198082	198091	80 %	20 %	0 %	0 %	407456376
110	NC_018621	TTGGT	2	10	201382	201391	0 %	60 %	40 %	0 %	407456380
111	NC_018621	AGCAA	2	10	203859	203868	60 %	0 %	20 %	20 %	407456383
112	NC_018621	ATGTG	2	10	204245	204254	20 %	40 %	40 %	0 %	407456384
113	NC_018621	TAATG	2	10	204974	204983	40 %	40 %	20 %	0 %	407456384
114	NC_018621	AAAAT	2	10	206920	206929	80 %	20 %	0 %	0 %	407456388
115	NC_018621	TGGTT	2	10	207839	207848	0 %	60 %	40 %	0 %	407456388
116	NC_018621	TCTCT	2	10	208617	208626	0 %	60 %	0 %	40 %	407456390
117	NC_018621	GAAAA	2	10	214149	214158	80 %	0 %	20 %	0 %	407456396
118	NC_018621	TAGCA	2	10	214515	214524	40 %	20 %	20 %	20 %	407456397
119	NC_018621	AAGAA	2	10	215213	215222	80 %	0 %	20 %	0 %	407456397
120	NC_018621	GAAAG	2	10	216513	216522	60 %	0 %	40 %	0 %	407456399
121	NC_018621	GTTAG	2	10	218497	218506	20 %	40 %	40 %	0 %	407456400
122	NC_018621	TGGAT	2	10	218649	218658	20 %	40 %	40 %	0 %	407456400
123	NC_018621	TTGTA	2	10	221313	221322	20 %	60 %	20 %	0 %	407456400
124	NC_018621	GCTTA	2	10	222444	222453	20 %	40 %	20 %	20 %	407456400
125	NC_018621	GCTGA	2	10	227323	227332	20 %	20 %	40 %	20 %	407456404
126	NC_018621	AGGAG	2	10	230633	230642	40 %	0 %	60 %	0 %	407456409
127	NC_018621	TGCCC	2	10	230936	230945	0 %	20 %	20 %	60 %	407456409
128	NC_018621	TACCT	2	10	231802	231811	20 %	40 %	0 %	40 %	407456410
129	NC_018621	CTAGT	2	10	232093	232102	20 %	40 %	20 %	20 %	407456410
130	NC_018621	TGCGT	2	10	234259	234268	0 %	40 %	40 %	20 %	407456412
131	NC_018621	GTTTT	2	10	234304	234313	0 %	80 %	20 %	0 %	407456412
132	NC_018621	TAAAA	2	10	240064	240073	80 %	20 %	0 %	0 %	407456418
133	NC_018621	TTCAG	2	10	241292	241301	20 %	40 %	20 %	20 %	407456420
134	NC_018621	TTTAG	2	10	242582	242591	20 %	60 %	20 %	0 %	407456420
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