MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 2584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018621	AAGG	2	8	268	275	50 %	0 %	50 %	0 %	407456173
2	NC_018621	GCGT	2	8	590	597	0 %	25 %	50 %	25 %	407456173
3	NC_018621	TTAA	2	8	1355	1362	50 %	50 %	0 %	0 %	407456174
4	NC_018621	AGAT	2	8	2545	2552	50 %	25 %	25 %	0 %	407456174
5	NC_018621	TGTT	2	8	2843	2850	0 %	75 %	25 %	0 %	407456175
6	NC_018621	GAAG	2	8	2954	2961	50 %	0 %	50 %	0 %	407456175
7	NC_018621	AGTA	2	8	2984	2991	50 %	25 %	25 %	0 %	407456175
8	NC_018621	TTTG	2	8	3302	3309	0 %	75 %	25 %	0 %	407456176
9	NC_018621	TCCT	2	8	3328	3335	0 %	50 %	0 %	50 %	407456176
10	NC_018621	GAAA	2	8	5257	5264	75 %	0 %	25 %	0 %	407456176
11	NC_018621	CGAG	2	8	5528	5535	25 %	0 %	50 %	25 %	407456177
12	NC_018621	TAAT	2	8	6734	6741	50 %	50 %	0 %	0 %	407456178
13	NC_018621	AGAA	2	8	6966	6973	75 %	0 %	25 %	0 %	407456179
14	NC_018621	TCCC	2	8	7283	7290	0 %	25 %	0 %	75 %	407456179
15	NC_018621	GTAG	2	8	7317	7324	25 %	25 %	50 %	0 %	407456179
16	NC_018621	AATA	2	8	8014	8021	75 %	25 %	0 %	0 %	407456180
17	NC_018621	ATGA	2	8	8485	8492	50 %	25 %	25 %	0 %	407456180
18	NC_018621	TGGA	2	8	8673	8680	25 %	25 %	50 %	0 %	407456180
19	NC_018621	CTGT	2	8	8683	8690	0 %	50 %	25 %	25 %	407456180
20	NC_018621	ATTT	2	8	9404	9411	25 %	75 %	0 %	0 %	407456181
21	NC_018621	AAAG	2	8	10228	10235	75 %	0 %	25 %	0 %	407456181
22	NC_018621	AAGT	2	8	10527	10534	50 %	25 %	25 %	0 %	407456181
23	NC_018621	AGGG	2	8	10766	10773	25 %	0 %	75 %	0 %	407456181
24	NC_018621	TAAG	2	8	10776	10783	50 %	25 %	25 %	0 %	407456181
25	NC_018621	AAAG	2	8	11069	11076	75 %	0 %	25 %	0 %	407456182
26	NC_018621	AGTA	2	8	11727	11734	50 %	25 %	25 %	0 %	407456182
27	NC_018621	TCTT	2	8	12008	12015	0 %	75 %	0 %	25 %	407456182
28	NC_018621	TAAT	2	8	12149	12156	50 %	50 %	0 %	0 %	407456182
29	NC_018621	CAAA	2	8	12460	12467	75 %	0 %	0 %	25 %	407456182
30	NC_018621	AGAT	2	8	12570	12577	50 %	25 %	25 %	0 %	407456182
31	NC_018621	AAGA	2	8	12581	12588	75 %	0 %	25 %	0 %	407456182
32	NC_018621	ACTT	2	8	12703	12710	25 %	50 %	0 %	25 %	407456182
33	NC_018621	CACT	2	8	12800	12807	25 %	25 %	0 %	50 %	407456182
34	NC_018621	GCAA	2	8	13328	13335	50 %	0 %	25 %	25 %	407456182
35	NC_018621	GAAA	2	8	13748	13755	75 %	0 %	25 %	0 %	407456182
36	NC_018621	AGAT	2	8	14317	14324	50 %	25 %	25 %	0 %	407456183
37	NC_018621	TTGT	2	8	14367	14374	0 %	75 %	25 %	0 %	407456183
38	NC_018621	GGAT	2	8	14951	14958	25 %	25 %	50 %	0 %	407456183
39	NC_018621	CCCA	2	8	15422	15429	25 %	0 %	0 %	75 %	407456183
40	NC_018621	AGAA	2	8	17166	17173	75 %	0 %	25 %	0 %	407456185
41	NC_018621	TCTT	2	8	17436	17443	0 %	75 %	0 %	25 %	407456185
42	NC_018621	GTCA	2	8	17839	17846	25 %	25 %	25 %	25 %	407456186
43	NC_018621	AAGC	2	8	18230	18237	50 %	0 %	25 %	25 %	407456186
44	NC_018621	ATTA	2	8	18370	18377	50 %	50 %	0 %	0 %	407456186
45	NC_018621	ATTA	2	8	18992	18999	50 %	50 %	0 %	0 %	407456187
46	NC_018621	GTTT	2	8	19265	19272	0 %	75 %	25 %	0 %	407456187
47	NC_018621	TTTG	2	8	19505	19512	0 %	75 %	25 %	0 %	407456187
48	NC_018621	TGCC	2	8	19537	19544	0 %	25 %	25 %	50 %	407456187
49	NC_018621	GCGT	2	8	19669	19676	0 %	25 %	50 %	25 %	407456187
50	NC_018621	TGGT	2	8	20450	20457	0 %	50 %	50 %	0 %	407456188
51	NC_018621	TAAA	2	8	21090	21097	75 %	25 %	0 %	0 %	407456188
52	NC_018621	TATG	2	8	21589	21596	25 %	50 %	25 %	0 %	407456188
53	NC_018621	CAAT	2	8	22284	22291	50 %	25 %	0 %	25 %	407456189
54	NC_018621	AGAA	2	8	22701	22708	75 %	0 %	25 %	0 %	407456189
55	NC_018621	TGAT	2	8	22908	22915	25 %	50 %	25 %	0 %	407456189
56	NC_018621	AGCT	2	8	24169	24176	25 %	25 %	25 %	25 %	407456190
57	NC_018621	AAAT	2	8	24506	24513	75 %	25 %	0 %	0 %	407456190
58	NC_018621	AATT	2	8	24631	24638	50 %	50 %	0 %	0 %	407456190
59	NC_018621	ATAA	2	8	24698	24705	75 %	25 %	0 %	0 %	407456190
60	NC_018621	TTCT	2	8	24928	24935	0 %	75 %	0 %	25 %	407456191
61	NC_018621	TAGT	2	8	24986	24993	25 %	50 %	25 %	0 %	407456191
62	NC_018621	GAAC	2	8	25445	25452	50 %	0 %	25 %	25 %	407456191
63	NC_018621	ATTC	2	8	25884	25891	25 %	50 %	0 %	25 %	407456191
64	NC_018621	TTTC	2	8	26016	26023	0 %	75 %	0 %	25 %	407456191
65	NC_018621	ATAG	2	8	26111	26118	50 %	25 %	25 %	0 %	407456191
66	NC_018621	TAAA	2	8	26475	26482	75 %	25 %	0 %	0 %	407456191
67	NC_018621	ATTT	2	8	26657	26664	25 %	75 %	0 %	0 %	407456192
68	NC_018621	ATTA	2	8	26668	26675	50 %	50 %	0 %	0 %	407456192
69	NC_018621	CTGG	2	8	27188	27195	0 %	25 %	50 %	25 %	407456193
70	NC_018621	AATT	2	8	27961	27968	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
71	NC_018621	AAAT	2	8	28810	28817	75 %	25 %	0 %	0 %	407456193
72	NC_018621	GGCA	2	8	29088	29095	25 %	0 %	50 %	25 %	407456193
73	NC_018621	AGGG	2	8	29433	29440	25 %	0 %	75 %	0 %	407456194
74	NC_018621	GAAT	2	8	29627	29634	50 %	25 %	25 %	0 %	407456195
75	NC_018621	AGAA	2	8	29792	29799	75 %	0 %	25 %	0 %	407456195
76	NC_018621	ACCA	2	8	30242	30249	50 %	0 %	0 %	50 %	407456195
77	NC_018621	GTTT	2	8	31413	31420	0 %	75 %	25 %	0 %	407456197
78	NC_018621	ATTT	2	8	32436	32443	25 %	75 %	0 %	0 %	407456199
79	NC_018621	TTGT	2	8	32462	32469	0 %	75 %	25 %	0 %	407456199
80	NC_018621	TAGA	2	8	32668	32675	50 %	25 %	25 %	0 %	407456199
81	NC_018621	TTTA	2	8	33122	33129	25 %	75 %	0 %	0 %	407456199
82	NC_018621	TGAA	2	8	34019	34026	50 %	25 %	25 %	0 %	407456201
83	NC_018621	GTAC	2	8	34097	34104	25 %	25 %	25 %	25 %	407456201
84	NC_018621	GATA	2	8	34133	34140	50 %	25 %	25 %	0 %	407456201
85	NC_018621	TCTT	2	8	34393	34400	0 %	75 %	0 %	25 %	407456202
86	NC_018621	AGGA	2	8	35345	35352	50 %	0 %	50 %	0 %	407456202
87	NC_018621	TAAT	2	8	36133	36140	50 %	50 %	0 %	0 %	407456203
88	NC_018621	CGCT	2	8	36849	36856	0 %	25 %	25 %	50 %	407456203
89	NC_018621	AAAG	2	8	38203	38210	75 %	0 %	25 %	0 %	407456205
90	NC_018621	TAAT	2	8	38219	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	407456205
91	NC_018621	TCAA	2	8	38354	38361	50 %	25 %	0 %	25 %	407456206
92	NC_018621	TTTA	2	8	38687	38694	25 %	75 %	0 %	0 %	407456206
93	NC_018621	CTTT	2	8	38817	38824	0 %	75 %	0 %	25 %	407456206
94	NC_018621	AGCG	2	8	39006	39013	25 %	0 %	50 %	25 %	407456206
95	NC_018621	CCTG	2	8	40302	40309	0 %	25 %	25 %	50 %	407456209
96	NC_018621	GAAA	2	8	41243	41250	75 %	0 %	25 %	0 %	407456209
97	NC_018621	AGCA	2	8	41414	41421	50 %	0 %	25 %	25 %	407456209
98	NC_018621	CTGT	2	8	41882	41889	0 %	50 %	25 %	25 %	407456209
99	NC_018621	TCTT	2	8	41922	41929	0 %	75 %	0 %	25 %	407456209
100	NC_018621	GAAG	2	8	42333	42340	50 %	0 %	50 %	0 %	407456209
101	NC_018621	AATA	2	8	42364	42371	75 %	25 %	0 %	0 %	407456209
102	NC_018621	GAAA	2	8	43501	43508	75 %	0 %	25 %	0 %	407456213
103	NC_018621	GTCG	2	8	44199	44206	0 %	25 %	50 %	25 %	407456214
104	NC_018621	TTAA	2	8	44229	44236	50 %	50 %	0 %	0 %	407456214
105	NC_018621	ATCA	2	8	44818	44825	50 %	25 %	0 %	25 %	407456214
106	NC_018621	ATGA	2	8	45096	45103	50 %	25 %	25 %	0 %	407456214
107	NC_018621	TAAA	2	8	45995	46002	75 %	25 %	0 %	0 %	407456215
108	NC_018621	GAAA	2	8	46977	46984	75 %	0 %	25 %	0 %	407456217
109	NC_018621	TCTT	2	8	47083	47090	0 %	75 %	0 %	25 %	407456217
110	NC_018621	GCTT	2	8	47612	47619	0 %	50 %	25 %	25 %	407456217
111	NC_018621	TGTT	2	8	48464	48471	0 %	75 %	25 %	0 %	407456218
112	NC_018621	TAAA	2	8	49699	49706	75 %	25 %	0 %	0 %	407456220
113	NC_018621	AAGC	2	8	49728	49735	50 %	0 %	25 %	25 %	407456220
114	NC_018621	CCAA	2	8	49752	49759	50 %	0 %	0 %	50 %	407456220
115	NC_018621	TTCC	2	8	49899	49906	0 %	50 %	0 %	50 %	407456220
116	NC_018621	AACA	2	8	50876	50883	75 %	0 %	0 %	25 %	407456220
117	NC_018621	GAAG	2	8	52723	52730	50 %	0 %	50 %	0 %	407456221
118	NC_018621	ATCC	2	8	53029	53036	25 %	25 %	0 %	50 %	407456222
119	NC_018621	AGCA	2	8	53321	53328	50 %	0 %	25 %	25 %	407456222
120	NC_018621	TTCA	2	8	53481	53488	25 %	50 %	0 %	25 %	407456222
121	NC_018621	GTAT	2	8	54134	54141	25 %	50 %	25 %	0 %	407456223
122	NC_018621	CATA	2	8	54329	54336	50 %	25 %	0 %	25 %	407456223
123	NC_018621	TAGC	2	8	55860	55867	25 %	25 %	25 %	25 %	407456225
124	NC_018621	CTGT	2	8	56039	56046	0 %	50 %	25 %	25 %	407456225
125	NC_018621	CTTT	2	8	56429	56436	0 %	75 %	0 %	25 %	407456226
126	NC_018621	AGAA	2	8	56449	56456	75 %	0 %	25 %	0 %	407456226
127	NC_018621	GAAG	2	8	56618	56625	50 %	0 %	50 %	0 %	407456226
128	NC_018621	GTAA	2	8	56841	56848	50 %	25 %	25 %	0 %	407456226
129	NC_018621	TTAG	2	8	56964	56971	25 %	50 %	25 %	0 %	407456226
130	NC_018621	CTTT	2	8	57314	57321	0 %	75 %	0 %	25 %	407456227
131	NC_018621	GTTA	2	8	57471	57478	25 %	50 %	25 %	0 %	407456227
132	NC_018621	CGTA	2	8	60432	60439	25 %	25 %	25 %	25 %	407456229
133	NC_018621	TTCG	2	8	60940	60947	0 %	50 %	25 %	25 %	407456229
134	NC_018621	GTTG	2	8	61132	61139	0 %	50 %	50 %	0 %	407456229
135	NC_018621	ACTT	2	8	61241	61248	25 %	50 %	0 %	25 %	407456229
136	NC_018621	GTTG	2	8	61604	61611	0 %	50 %	50 %	0 %	407456229
137	NC_018621	TCTG	2	8	61980	61987	0 %	50 %	25 %	25 %	407456229
138	NC_018621	GCTT	2	8	62626	62633	0 %	50 %	25 %	25 %	407456229
139	NC_018621	GGTT	2	8	63068	63075	0 %	50 %	50 %	0 %	407456229
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