MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018621	AGA	2	6	209953	209958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456391
4002	NC_018621	AAT	2	6	209983	209988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456391
4003	NC_018621	TCCG	2	8	209992	209999	0 %	25 %	25 %	50 %	407456391
4004	NC_018621	AG	3	6	210070	210075	50 %	0 %	50 %	0 %	407456391
4005	NC_018621	ATG	2	6	210522	210527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456392
4006	NC_018621	GAT	2	6	210537	210542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456392
4007	NC_018621	GCA	2	6	210612	210617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456392
4008	NC_018621	TCG	2	6	210625	210630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456392
4009	NC_018621	GATT	2	8	210643	210650	25 %	50 %	25 %	0 %	407456392
4010	NC_018621	GT	3	6	210661	210666	0 %	50 %	50 %	0 %	407456392
4011	NC_018621	AG	3	6	210681	210686	50 %	0 %	50 %	0 %	407456392
4012	NC_018621	AAAG	2	8	210695	210702	75 %	0 %	25 %	0 %	407456392
4013	NC_018621	TTG	2	6	210794	210799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456392
4014	NC_018621	CTC	2	6	210829	210834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456392
4015	NC_018621	CTAA	2	8	210853	210860	50 %	25 %	0 %	25 %	407456392
4016	NC_018621	AAT	2	6	211203	211208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456393
4017	NC_018621	AAGC	2	8	211218	211225	50 %	0 %	25 %	25 %	407456393
4018	NC_018621	ATT	2	6	211263	211268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456393
4019	NC_018621	AAG	2	6	211289	211294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456393
4020	NC_018621	GTT	2	6	211311	211316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456393
4021	NC_018621	GTA	2	6	211369	211374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456393
4022	NC_018621	GA	3	6	211403	211408	50 %	0 %	50 %	0 %	407456393
4023	NC_018621	GTAG	2	8	211690	211697	25 %	25 %	50 %	0 %	407456394
4024	NC_018621	TGA	2	6	211704	211709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456394
4025	NC_018621	TTG	2	6	211736	211741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456394
4026	NC_018621	AT	3	6	211764	211769	50 %	50 %	0 %	0 %	407456394
4027	NC_018621	TTC	2	6	211775	211780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456394
4028	NC_018621	GGT	2	6	212016	212021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456395
4029	NC_018621	GAA	2	6	212141	212146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456395
4030	NC_018621	GTT	2	6	212247	212252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456395
4031	NC_018621	AGG	2	6	212267	212272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456395
4032	NC_018621	ATT	2	6	212423	212428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456395
4033	NC_018621	ATT	2	6	212627	212632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456395
4034	NC_018621	GTT	2	6	212633	212638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456395
4035	NC_018621	TCC	2	6	212667	212672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456395
4036	NC_018621	AGA	3	9	212675	212683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456395
4037	NC_018621	TGA	2	6	212765	212770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456395
4038	NC_018621	T	7	7	213713	213719	0 %	100 %	0 %	0 %	407456396
4039	NC_018621	TTG	2	6	213750	213755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456396
4040	NC_018621	GTT	2	6	213770	213775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456396
4041	NC_018621	ATG	2	6	213820	213825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456396
4042	NC_018621	GTT	2	6	213891	213896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456396
4043	NC_018621	AGAT	2	8	213997	214004	50 %	25 %	25 %	0 %	407456396
4044	NC_018621	AGAA	2	8	214120	214127	75 %	0 %	25 %	0 %	407456396
4045	NC_018621	GAAAA	2	10	214149	214158	80 %	0 %	20 %	0 %	407456396
4046	NC_018621	TGC	2	6	214172	214177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456396
4047	NC_018621	T	7	7	214204	214210	0 %	100 %	0 %	0 %	407456396
4048	NC_018621	GTA	2	6	214241	214246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456396
4049	NC_018621	AAC	2	6	214262	214267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456396
4050	NC_018621	GTT	2	6	214280	214285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456396
4051	NC_018621	C	6	6	214288	214293	0 %	0 %	0 %	100 %	407456396
4052	NC_018621	CAA	2	6	214314	214319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456396
4053	NC_018621	GTT	2	6	214432	214437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456397
4054	NC_018621	ATT	2	6	214452	214457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456397
4055	NC_018621	TTC	2	6	214467	214472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456397
4056	NC_018621	TAGCA	2	10	214515	214524	40 %	20 %	20 %	20 %	407456397
4057	NC_018621	AGC	2	6	214590	214595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456397
4058	NC_018621	ACA	2	6	214600	214605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456397
4059	NC_018621	ACG	2	6	214642	214647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456397
4060	NC_018621	GCT	2	6	214712	214717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456397
4061	NC_018621	AGC	2	6	214719	214724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456397
4062	NC_018621	AG	3	6	214826	214831	50 %	0 %	50 %	0 %	407456397
4063	NC_018621	T	6	6	214945	214950	0 %	100 %	0 %	0 %	407456397
4064	NC_018621	T	7	7	214978	214984	0 %	100 %	0 %	0 %	407456397
4065	NC_018621	T	6	6	215039	215044	0 %	100 %	0 %	0 %	407456397
4066	NC_018621	TTC	2	6	215178	215183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456397
4067	NC_018621	AAGAA	2	10	215213	215222	80 %	0 %	20 %	0 %	407456397
4068	NC_018621	GAA	2	6	215847	215852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456398
4069	NC_018621	TCA	2	6	215872	215877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456398
4070	NC_018621	AG	3	6	215982	215987	50 %	0 %	50 %	0 %	407456398
4071	NC_018621	GT	3	6	216066	216071	0 %	50 %	50 %	0 %	407456398
4072	NC_018621	GACA	2	8	216103	216110	50 %	0 %	25 %	25 %	407456398
4073	NC_018621	AG	3	6	216132	216137	50 %	0 %	50 %	0 %	407456398
4074	NC_018621	CTC	2	6	216189	216194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456398
4075	NC_018621	ATT	2	6	216217	216222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456398
4076	NC_018621	TTG	2	6	216325	216330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456398
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4079	NC_018621	TTG	2	6	216457	216462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456398
4080	NC_018621	AAG	2	6	216492	216497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456399
4081	NC_018621	GAAAG	2	10	216513	216522	60 %	0 %	40 %	0 %	407456399
4082	NC_018621	TAT	2	6	216601	216606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456399
4083	NC_018621	AGA	2	6	216628	216633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456399
4084	NC_018621	ATTT	2	8	216684	216691	25 %	75 %	0 %	0 %	407456399
4085	NC_018621	TCA	2	6	216796	216801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456399
4086	NC_018621	GTG	2	6	216879	216884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456399
4087	NC_018621	ACTC	2	8	216893	216900	25 %	25 %	0 %	50 %	407456399
4088	NC_018621	TTA	2	6	216987	216992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456399
4089	NC_018621	TGT	2	6	217045	217050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456399
4090	NC_018621	TG	3	6	217149	217154	0 %	50 %	50 %	0 %	407456399
4091	NC_018621	TAG	2	6	217234	217239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456399
4092	NC_018621	TAC	2	6	217250	217255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456399
4093	NC_018621	AT	3	6	217485	217490	50 %	50 %	0 %	0 %	407456400
4094	NC_018621	AGAA	2	8	217790	217797	75 %	0 %	25 %	0 %	407456400
4095	NC_018621	TTG	2	6	217802	217807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456400
4096	NC_018621	CAAC	2	8	217857	217864	50 %	0 %	0 %	50 %	407456400
4097	NC_018621	TTC	2	6	218196	218201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456400
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4099	NC_018621	ATC	2	6	218262	218267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456400
4100	NC_018621	TGT	2	6	218288	218293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456400
4101	NC_018621	GA	3	6	218319	218324	50 %	0 %	50 %	0 %	407456400
4102	NC_018621	AGT	2	6	218357	218362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456400
4103	NC_018621	GCG	2	6	218385	218390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407456400
4104	NC_018621	CTC	2	6	218394	218399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456400
4105	NC_018621	AT	3	6	218461	218466	50 %	50 %	0 %	0 %	407456400
4106	NC_018621	GTTAG	2	10	218497	218506	20 %	40 %	40 %	0 %	407456400
4107	NC_018621	CTA	2	6	218521	218526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456400
4108	NC_018621	TAAG	2	8	218565	218572	50 %	25 %	25 %	0 %	407456400
4109	NC_018621	TGGAT	2	10	218649	218658	20 %	40 %	40 %	0 %	407456400
4110	NC_018621	CTG	4	12	218711	218722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456400
4111	NC_018621	AGG	2	6	218748	218753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456400
4112	NC_018621	TCT	2	6	218767	218772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456400
4113	NC_018621	GTT	2	6	218802	218807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456400
4114	NC_018621	T	6	6	218929	218934	0 %	100 %	0 %	0 %	407456400
4115	NC_018621	AAT	2	6	219010	219015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456400
4116	NC_018621	TTA	2	6	219058	219063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456400
4117	NC_018621	AGA	2	6	219090	219095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456400
4118	NC_018621	CAT	2	6	219119	219124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456400
4119	NC_018621	GATT	2	8	219136	219143	25 %	50 %	25 %	0 %	407456400
4120	NC_018621	TGC	2	6	219144	219149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456400
4121	NC_018621	AGAA	2	8	219188	219195	75 %	0 %	25 %	0 %	407456400
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4123	NC_018621	TGC	2	6	219284	219289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456400
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4242	NC_018621	TTTA	2	8	224962	224969	25 %	75 %	0 %	0 %	407456401
4243	NC_018621	CCA	3	9	225083	225091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456401
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