MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018621	GGA	2	6	131104	131109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456311
2502	NC_018621	CT	3	6	131132	131137	0 %	50 %	0 %	50 %	407456311
2503	NC_018621	T	6	6	131137	131142	0 %	100 %	0 %	0 %	407456311
2504	NC_018621	AGT	2	6	131157	131162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456311
2505	NC_018621	TAT	2	6	131169	131174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456311
2506	NC_018621	AG	4	8	131256	131263	50 %	0 %	50 %	0 %	407456311
2507	NC_018621	TCA	2	6	131537	131542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456312
2508	NC_018621	AT	3	6	131585	131590	50 %	50 %	0 %	0 %	407456312
2509	NC_018621	ATT	2	6	131649	131654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456312
2510	NC_018621	CCT	2	6	131656	131661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456312
2511	NC_018621	GTG	2	6	131684	131689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456312
2512	NC_018621	GGTT	2	8	131777	131784	0 %	50 %	50 %	0 %	407456312
2513	NC_018621	T	6	6	131811	131816	0 %	100 %	0 %	0 %	407456312
2514	NC_018621	TTTCTT	2	12	131842	131853	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407456312
2515	NC_018621	TTAT	2	8	131865	131872	25 %	75 %	0 %	0 %	407456312
2516	NC_018621	CTA	2	6	131983	131988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456312
2517	NC_018621	TGTCA	2	10	131989	131998	20 %	40 %	20 %	20 %	407456312
2518	NC_018621	ATTA	2	8	132088	132095	50 %	50 %	0 %	0 %	407456312
2519	NC_018621	ATCT	2	8	132108	132115	25 %	50 %	0 %	25 %	407456312
2520	NC_018621	GA	3	6	132129	132134	50 %	0 %	50 %	0 %	407456312
2521	NC_018621	AC	3	6	132154	132159	50 %	0 %	0 %	50 %	407456312
2522	NC_018621	AGA	2	6	132328	132333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456312
2523	NC_018621	AG	3	6	132349	132354	50 %	0 %	50 %	0 %	407456312
2524	NC_018621	GAA	2	6	132397	132402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456312
2525	NC_018621	GTT	2	6	132491	132496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456312
2526	NC_018621	TAC	2	6	132562	132567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456312
2527	NC_018621	GGC	2	6	132592	132597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407456312
2528	NC_018621	AG	3	6	132714	132719	50 %	0 %	50 %	0 %	407456312
2529	NC_018621	TGG	2	6	132733	132738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456312
2530	NC_018621	GGT	2	6	132779	132784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456312
2531	NC_018621	AGA	2	6	132870	132875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456312
2532	NC_018621	GCT	2	6	132887	132892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456312
2533	NC_018621	AGG	2	6	132925	132930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456312
2534	NC_018621	GCA	2	6	132974	132979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456312
2535	NC_018621	GTA	2	6	132998	133003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456312
2536	NC_018621	CTT	2	6	133004	133009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456312
2537	NC_018621	TGT	2	6	133033	133038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456312
2538	NC_018621	AG	3	6	133052	133057	50 %	0 %	50 %	0 %	407456312
2539	NC_018621	ACA	2	6	133059	133064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456312
2540	NC_018621	GCT	3	9	133073	133081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456312
2541	NC_018621	TGC	2	6	133084	133089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456312
2542	NC_018621	ACT	2	6	133136	133141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456312
2543	NC_018621	AAG	3	9	133158	133166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456312
2544	NC_018621	GTTG	2	8	133381	133388	0 %	50 %	50 %	0 %	407456313
2545	NC_018621	GAAT	2	8	133401	133408	50 %	25 %	25 %	0 %	407456313
2546	NC_018621	ATT	2	6	133475	133480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456313
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2548	NC_018621	AAT	2	6	133651	133656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456313
2549	NC_018621	AGC	2	6	133668	133673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456313
2550	NC_018621	GGT	2	6	133721	133726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456313
2551	NC_018621	TAT	2	6	133727	133732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456313
2552	NC_018621	TGC	2	6	133741	133746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456313
2553	NC_018621	TCT	2	6	133769	133774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456313
2554	NC_018621	AAG	2	6	133821	133826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456313
2555	NC_018621	TGT	2	6	133969	133974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456313
2556	NC_018621	GT	3	6	134016	134021	0 %	50 %	50 %	0 %	407456313
2557	NC_018621	AGA	2	6	134056	134061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456313
2558	NC_018621	ACA	2	6	134092	134097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456313
2559	NC_018621	TAG	2	6	134112	134117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456313
2560	NC_018621	GAA	2	6	134176	134181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456313
2561	NC_018621	TCA	2	6	134189	134194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456313
2562	NC_018621	TAC	2	6	134273	134278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456313
2563	NC_018621	TGATTC	2	12	134288	134299	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407456313
2564	NC_018621	TTC	2	6	134392	134397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456314
2565	NC_018621	TAA	2	6	134440	134445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456314
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2567	NC_018621	ACA	2	6	134499	134504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456314
2568	NC_018621	A	6	6	134552	134557	100 %	0 %	0 %	0 %	407456314
2569	NC_018621	CAA	2	6	134573	134578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456314
2570	NC_018621	AGA	2	6	134632	134637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456314
2571	NC_018621	TGA	2	6	134647	134652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456314
2572	NC_018621	AGCA	2	8	134673	134680	50 %	0 %	25 %	25 %	407456314
2573	NC_018621	GTT	2	6	134750	134755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456314
2574	NC_018621	CCT	2	6	134780	134785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456314
2575	NC_018621	C	6	6	134821	134826	0 %	0 %	0 %	100 %	407456314
2576	NC_018621	TGG	2	6	134853	134858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456314
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2578	NC_018621	A	6	6	134903	134908	100 %	0 %	0 %	0 %	407456314
2579	NC_018621	TGA	2	6	134962	134967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456314
2580	NC_018621	TTA	2	6	135017	135022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456314
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2582	NC_018621	TAAT	2	8	135195	135202	50 %	50 %	0 %	0 %	407456314
2583	NC_018621	AGT	2	6	135203	135208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456314
2584	NC_018621	CT	3	6	135289	135294	0 %	50 %	0 %	50 %	407456314
2585	NC_018621	TTA	2	6	135334	135339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456314
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2587	NC_018621	ATC	2	6	135438	135443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456314
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2589	NC_018621	CTT	2	6	135545	135550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456314
2590	NC_018621	GTTT	2	8	135658	135665	0 %	75 %	25 %	0 %	407456314
2591	NC_018621	TAAAA	2	10	135676	135685	80 %	20 %	0 %	0 %	407456314
2592	NC_018621	A	7	7	135682	135688	100 %	0 %	0 %	0 %	407456314
2593	NC_018621	AGA	2	6	135697	135702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456314
2594	NC_018621	GAAA	2	8	135776	135783	75 %	0 %	25 %	0 %	407456314
2595	NC_018621	GGA	2	6	135802	135807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456314
2596	NC_018621	GA	3	6	135821	135826	50 %	0 %	50 %	0 %	407456314
2597	NC_018621	TGA	2	6	135856	135861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456314
2598	NC_018621	CTT	2	6	135882	135887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456314
2599	NC_018621	TA	3	6	135924	135929	50 %	50 %	0 %	0 %	407456314
2600	NC_018621	CTA	2	6	135966	135971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456314
2601	NC_018621	TTA	2	6	135992	135997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456314
2602	NC_018621	TTG	2	6	136011	136016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456314
2603	NC_018621	A	6	6	136017	136022	100 %	0 %	0 %	0 %	407456314
2604	NC_018621	CT	3	6	136052	136057	0 %	50 %	0 %	50 %	407456314
2605	NC_018621	AAT	2	6	136238	136243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456314
2606	NC_018621	T	6	6	136246	136251	0 %	100 %	0 %	0 %	407456314
2607	NC_018621	ATT	2	6	136260	136265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456314
2608	NC_018621	CA	3	6	136346	136351	50 %	0 %	0 %	50 %	407456314
2609	NC_018621	AGA	2	6	136384	136389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456314
2610	NC_018621	GCAA	2	8	136411	136418	50 %	0 %	25 %	25 %	407456314
2611	NC_018621	TAT	2	6	136435	136440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456314
2612	NC_018621	CAA	2	6	136448	136453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456314
2613	NC_018621	TGA	2	6	136552	136557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456314
2614	NC_018621	AAT	2	6	136615	136620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456314
2615	NC_018621	TGC	2	6	136651	136656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456314
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2620	NC_018621	AGA	2	6	136822	136827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456314
2621	NC_018621	A	6	6	136906	136911	100 %	0 %	0 %	0 %	407456314
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2623	NC_018621	GTC	2	6	137066	137071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456315
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2993	NC_018621	ATAG	2	8	157902	157909	50 %	25 %	25 %	0 %	407456338
2994	NC_018621	GAA	2	6	157914	157919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456338
2995	NC_018621	A	7	7	157918	157924	100 %	0 %	0 %	0 %	407456338
2996	NC_018621	A	6	6	158225	158230	100 %	0 %	0 %	0 %	407456339
2997	NC_018621	T	6	6	158241	158246	0 %	100 %	0 %	0 %	407456339
2998	NC_018621	GAA	2	6	158272	158277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456339
2999	NC_018621	TTG	2	6	158287	158292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456339
3000	NC_018621	GTA	2	6	158414	158419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456339

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