MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018621	AAC	2	6	50125	50130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456220
1002	NC_018621	CAA	2	6	50164	50169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456220
1003	NC_018621	AAG	3	9	50170	50178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456220
1004	NC_018621	TTA	2	6	50271	50276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456220
1005	NC_018621	TC	3	6	50378	50383	0 %	50 %	0 %	50 %	407456220
1006	NC_018621	TGT	2	6	50525	50530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456220
1007	NC_018621	TA	3	6	50551	50556	50 %	50 %	0 %	0 %	407456220
1008	NC_018621	ATT	2	6	50583	50588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456220
1009	NC_018621	ATG	2	6	50605	50610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456220
1010	NC_018621	TCC	2	6	50862	50867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456220
1011	NC_018621	AACA	2	8	50876	50883	75 %	0 %	0 %	25 %	407456220
1012	NC_018621	ACT	2	6	50894	50899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456220
1013	NC_018621	GAT	2	6	50937	50942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456220
1014	NC_018621	GCA	2	6	50955	50960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456220
1015	NC_018621	ATC	2	6	50969	50974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456220
1016	NC_018621	TCA	2	6	51106	51111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456220
1017	NC_018621	AAT	2	6	51144	51149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456220
1018	NC_018621	AGT	2	6	51188	51193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456220
1019	NC_018621	CCT	2	6	51387	51392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456220
1020	NC_018621	ATG	2	6	51456	51461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456220
1021	NC_018621	TTTGG	2	10	51477	51486	0 %	60 %	40 %	0 %	407456220
1022	NC_018621	CTC	2	6	51543	51548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456220
1023	NC_018621	CAA	2	6	51615	51620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456220
1024	NC_018621	CAT	2	6	51622	51627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456220
1025	NC_018621	TTG	2	6	51631	51636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456220
1026	NC_018621	AAC	2	6	51656	51661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456220
1027	NC_018621	ATT	2	6	51669	51674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456220
1028	NC_018621	TTG	3	9	51730	51738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456220
1029	NC_018621	GTT	2	6	51762	51767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456220
1030	NC_018621	GTT	2	6	51874	51879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456220
1031	NC_018621	CAG	2	6	51974	51979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456220
1032	NC_018621	ATG	2	6	52011	52016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456220
1033	NC_018621	TTA	2	6	52033	52038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456220
1034	NC_018621	CAA	2	6	52067	52072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456220
1035	NC_018621	TGA	2	6	52100	52105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456220
1036	NC_018621	C	6	6	52151	52156	0 %	0 %	0 %	100 %	407456220
1037	NC_018621	GAAG	2	8	52723	52730	50 %	0 %	50 %	0 %	407456221
1038	NC_018621	CCT	2	6	52733	52738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456221
1039	NC_018621	T	6	6	52745	52750	0 %	100 %	0 %	0 %	407456221
1040	NC_018621	TGC	2	6	52811	52816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456221
1041	NC_018621	CCT	2	6	52817	52822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456221
1042	NC_018621	TGC	2	6	52823	52828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456221
1043	NC_018621	AGG	2	6	52842	52847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456221
1044	NC_018621	CTT	2	6	52919	52924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456222
1045	NC_018621	TTA	2	6	52936	52941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456222
1046	NC_018621	GTT	2	6	52949	52954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456222
1047	NC_018621	ACG	2	6	52974	52979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456222
1048	NC_018621	TGT	2	6	53012	53017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456222
1049	NC_018621	ATCC	2	8	53029	53036	25 %	25 %	0 %	50 %	407456222
1050	NC_018621	GT	3	6	53103	53108	0 %	50 %	50 %	0 %	407456222
1051	NC_018621	T	6	6	53137	53142	0 %	100 %	0 %	0 %	407456222
1052	NC_018621	CTT	2	6	53169	53174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456222
1053	NC_018621	T	6	6	53173	53178	0 %	100 %	0 %	0 %	407456222
1054	NC_018621	TTC	2	6	53238	53243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456222
1055	NC_018621	AT	3	6	53290	53295	50 %	50 %	0 %	0 %	407456222
1056	NC_018621	AGCA	2	8	53321	53328	50 %	0 %	25 %	25 %	407456222
1057	NC_018621	AAT	2	6	53346	53351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456222
1058	NC_018621	TTCA	2	8	53481	53488	25 %	50 %	0 %	25 %	407456222
1059	NC_018621	A	6	6	53659	53664	100 %	0 %	0 %	0 %	407456222
1060	NC_018621	TCA	2	6	53725	53730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456222
1061	NC_018621	T	6	6	53781	53786	0 %	100 %	0 %	0 %	407456222
1062	NC_018621	CGT	2	6	53844	53849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456222
1063	NC_018621	AGG	2	6	53871	53876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456222
1064	NC_018621	AAG	2	6	53901	53906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456222
1065	NC_018621	GAA	2	6	53918	53923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456222
1066	NC_018621	T	6	6	53939	53944	0 %	100 %	0 %	0 %	407456223
1067	NC_018621	CAG	2	6	53970	53975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456223
1068	NC_018621	AGG	2	6	54038	54043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456223
1069	NC_018621	CGC	2	6	54055	54060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407456223
1070	NC_018621	ACC	2	6	54088	54093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456223
1071	NC_018621	GTAT	2	8	54134	54141	25 %	50 %	25 %	0 %	407456223
1072	NC_018621	TCA	2	6	54206	54211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456223
1073	NC_018621	CAG	2	6	54258	54263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456223
1074	NC_018621	TGT	2	6	54285	54290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456223
1075	NC_018621	GTA	2	6	54298	54303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456223
1076	NC_018621	CATA	2	8	54329	54336	50 %	25 %	0 %	25 %	407456223
1077	NC_018621	CTTATC	2	12	54349	54360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407456223
1078	NC_018621	TTG	2	6	54378	54383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456223
1079	NC_018621	CTT	2	6	54854	54859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456224
1080	NC_018621	TCG	2	6	54874	54879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456224
1081	NC_018621	T	7	7	54914	54920	0 %	100 %	0 %	0 %	407456224
1082	NC_018621	TCT	2	6	54940	54945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456224
1083	NC_018621	T	7	7	54960	54966	0 %	100 %	0 %	0 %	407456224
1084	NC_018621	CTT	2	6	55013	55018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456224
1085	NC_018621	ACG	2	6	55026	55031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456224
1086	NC_018621	TAA	2	6	55040	55045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456224
1087	NC_018621	CTG	2	6	55061	55066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456224
1088	NC_018621	AAATTT	2	12	55117	55128	50 %	50 %	0 %	0 %	407456224
1089	NC_018621	GCA	2	6	55129	55134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456224
1090	NC_018621	ATA	2	6	55135	55140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456224
1091	NC_018621	CTA	2	6	55271	55276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456224
1092	NC_018621	CTT	2	6	55313	55318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456224
1093	NC_018621	AGC	2	6	55335	55340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456224
1094	NC_018621	TTTTC	2	10	55346	55355	0 %	80 %	0 %	20 %	407456224
1095	NC_018621	TCA	2	6	55412	55417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456225
1096	NC_018621	AG	3	6	55433	55438	50 %	0 %	50 %	0 %	407456225
1097	NC_018621	GCT	2	6	55661	55666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456225
1098	NC_018621	GTT	2	6	55676	55681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456225
1099	NC_018621	CTT	2	6	55737	55742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456225
1100	NC_018621	GAG	2	6	55752	55757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456225
1101	NC_018621	TAA	2	6	55798	55803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456225
1102	NC_018621	TCA	2	6	55814	55819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456225
1103	NC_018621	TAGC	2	8	55860	55867	25 %	25 %	25 %	25 %	407456225
1104	NC_018621	CAG	2	6	55881	55886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456225
1105	NC_018621	TTG	2	6	55912	55917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456225
1106	NC_018621	TGA	2	6	55929	55934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456225
1107	NC_018621	CTGT	2	8	56039	56046	0 %	50 %	25 %	25 %	407456225
1108	NC_018621	AG	4	8	56047	56054	50 %	0 %	50 %	0 %	407456225
1109	NC_018621	TAG	2	6	56236	56241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456226
1110	NC_018621	GAA	2	6	56254	56259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456226
1111	NC_018621	TGA	2	6	56277	56282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456226
1112	NC_018621	GAA	2	6	56321	56326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456226
1113	NC_018621	CTT	2	6	56331	56336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456226
1114	NC_018621	GCT	2	6	56393	56398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456226
1115	NC_018621	CTTT	2	8	56429	56436	0 %	75 %	0 %	25 %	407456226
1116	NC_018621	AGAA	2	8	56449	56456	75 %	0 %	25 %	0 %	407456226
1117	NC_018621	GTT	2	6	56513	56518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456226
1118	NC_018621	GAAG	2	8	56618	56625	50 %	0 %	50 %	0 %	407456226
1119	NC_018621	GTA	2	6	56628	56633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456226
1120	NC_018621	CAA	2	6	56673	56678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456226
1121	NC_018621	ATT	2	6	56707	56712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456226
1122	NC_018621	CAG	2	6	56748	56753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456226
1123	NC_018621	TGC	2	6	56773	56778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456226
1124	NC_018621	CTT	2	6	56787	56792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456226
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1126	NC_018621	GTAA	2	8	56841	56848	50 %	25 %	25 %	0 %	407456226
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1374	NC_018621	GTT	2	6	70100	70105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456234
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