MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018621	T	7	7	24800	24806	0 %	100 %	0 %	0 %	407456191
502	NC_018621	TGT	2	6	24821	24826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
503	NC_018621	GCT	2	6	24851	24856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456191
504	NC_018621	TTCT	2	8	24928	24935	0 %	75 %	0 %	25 %	407456191
505	NC_018621	ATC	2	6	24943	24948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456191
506	NC_018621	ACC	2	6	24967	24972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456191
507	NC_018621	TAGT	2	8	24986	24993	25 %	50 %	25 %	0 %	407456191
508	NC_018621	TTG	2	6	25011	25016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
509	NC_018621	TTG	2	6	25021	25026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
510	NC_018621	ATT	2	6	25114	25119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
511	NC_018621	TTC	2	6	25240	25245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
512	NC_018621	TTG	2	6	25390	25395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
513	NC_018621	GAAC	2	8	25445	25452	50 %	0 %	25 %	25 %	407456191
514	NC_018621	CAG	2	6	25470	25475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456191
515	NC_018621	TA	3	6	25505	25510	50 %	50 %	0 %	0 %	407456191
516	NC_018621	GCA	2	6	25511	25516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456191
517	NC_018621	GTT	2	6	25544	25549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
518	NC_018621	AG	3	6	25612	25617	50 %	0 %	50 %	0 %	407456191
519	NC_018621	TAA	2	6	25644	25649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456191
520	NC_018621	CTT	3	9	25650	25658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
521	NC_018621	TTA	2	6	25679	25684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
522	NC_018621	TTA	2	6	25754	25759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
523	NC_018621	TAT	2	6	25791	25796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
524	NC_018621	TCA	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456191
525	NC_018621	CCA	2	6	25817	25822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456191
526	NC_018621	TGG	2	6	25824	25829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456191
527	NC_018621	A	6	6	25867	25872	100 %	0 %	0 %	0 %	407456191
528	NC_018621	ATTC	2	8	25884	25891	25 %	50 %	0 %	25 %	407456191
529	NC_018621	TTC	2	6	25897	25902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
530	NC_018621	TCT	2	6	25919	25924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
531	NC_018621	T	6	6	25996	26001	0 %	100 %	0 %	0 %	407456191
532	NC_018621	TTTC	2	8	26016	26023	0 %	75 %	0 %	25 %	407456191
533	NC_018621	ATT	2	6	26041	26046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
534	NC_018621	ATAG	2	8	26111	26118	50 %	25 %	25 %	0 %	407456191
535	NC_018621	AAT	2	6	26119	26124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456191
536	NC_018621	TGT	2	6	26212	26217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
537	NC_018621	AGG	2	6	26296	26301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456191
538	NC_018621	AAC	2	6	26330	26335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456191
539	NC_018621	TAAA	2	8	26475	26482	75 %	25 %	0 %	0 %	407456191
540	NC_018621	TA	3	6	26515	26520	50 %	50 %	0 %	0 %	407456191
541	NC_018621	AGA	2	6	26524	26529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456191
542	NC_018621	TTC	2	6	26616	26621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456192
543	NC_018621	ATTT	2	8	26657	26664	25 %	75 %	0 %	0 %	407456192
544	NC_018621	ATTA	2	8	26668	26675	50 %	50 %	0 %	0 %	407456192
545	NC_018621	TTA	2	6	26699	26704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456192
546	NC_018621	A	6	6	26774	26779	100 %	0 %	0 %	0 %	407456193
547	NC_018621	CCA	2	6	26818	26823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456193
548	NC_018621	TTA	2	6	26825	26830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456193
549	NC_018621	CAA	2	6	26903	26908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
550	NC_018621	TGA	2	6	26911	26916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456193
551	NC_018621	AGA	2	6	26959	26964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
552	NC_018621	TAA	2	6	26974	26979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456193
553	NC_018621	CTG	2	6	27057	27062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456193
554	NC_018621	GTA	2	6	27066	27071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456193
555	NC_018621	ACA	2	6	27115	27120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
556	NC_018621	TTA	2	6	27134	27139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456193
557	NC_018621	A	6	6	27149	27154	100 %	0 %	0 %	0 %	407456193
558	NC_018621	CTGG	2	8	27188	27195	0 %	25 %	50 %	25 %	407456193
559	NC_018621	AAG	2	6	27276	27281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
560	NC_018621	AGC	2	6	27292	27297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
561	NC_018621	TA	3	6	27375	27380	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
562	NC_018621	TCT	2	6	27416	27421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456193
563	NC_018621	GGT	2	6	27431	27436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456193
564	NC_018621	TC	3	6	27460	27465	0 %	50 %	0 %	50 %	407456193
565	NC_018621	AGA	3	9	27565	27573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
566	NC_018621	ACA	2	6	27595	27600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
567	NC_018621	GCT	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456193
568	NC_018621	GTT	2	6	27794	27799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456193
569	NC_018621	CAG	2	6	27919	27924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
570	NC_018621	CGC	2	6	27925	27930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407456193
571	NC_018621	AATT	2	8	27961	27968	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
572	NC_018621	TGA	2	6	27976	27981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456193
573	NC_018621	AAC	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
574	NC_018621	TAA	2	6	28009	28014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456193
575	NC_018621	TA	3	6	28052	28057	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
576	NC_018621	TTG	2	6	28077	28082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456193
577	NC_018621	CTA	2	6	28098	28103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456193
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580	NC_018621	GAC	2	6	28198	28203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
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582	NC_018621	CAA	2	6	28289	28294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
583	NC_018621	GCA	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
584	NC_018621	T	6	6	28618	28623	0 %	100 %	0 %	0 %	407456193
585	NC_018621	TGC	2	6	28711	28716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456193
586	NC_018621	CAG	2	6	28748	28753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
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592	NC_018621	TAAGTG	2	12	29028	29039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456193
593	NC_018621	GAA	2	6	29078	29083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
594	NC_018621	GGCA	2	8	29088	29095	25 %	0 %	50 %	25 %	407456193
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600	NC_018621	AGGG	2	8	29433	29440	25 %	0 %	75 %	0 %	407456194
601	NC_018621	GCCAC	2	10	29448	29457	20 %	0 %	20 %	60 %	407456194
602	NC_018621	CAA	2	6	29463	29468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456194
603	NC_018621	TGT	2	6	29533	29538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456194
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609	NC_018621	TGC	2	6	29646	29651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456195
610	NC_018621	GAA	2	6	29682	29687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456195
611	NC_018621	GAA	2	6	29693	29698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456195
612	NC_018621	AAT	2	6	29711	29716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456195
613	NC_018621	TAA	2	6	29767	29772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456195
614	NC_018621	AGAA	2	8	29792	29799	75 %	0 %	25 %	0 %	407456195
615	NC_018621	CGT	2	6	29913	29918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456195
616	NC_018621	AG	3	6	29927	29932	50 %	0 %	50 %	0 %	407456195
617	NC_018621	T	6	6	29942	29947	0 %	100 %	0 %	0 %	407456195
618	NC_018621	ATC	2	6	29972	29977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456195
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622	NC_018621	TAG	2	6	30236	30241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456195
623	NC_018621	ACCA	2	8	30242	30249	50 %	0 %	0 %	50 %	407456195
624	NC_018621	CGT	2	6	30277	30282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456195
625	NC_018621	T	6	6	30293	30298	0 %	100 %	0 %	0 %	407456195
626	NC_018621	T	6	6	30306	30311	0 %	100 %	0 %	0 %	407456195
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628	NC_018621	AG	3	6	30588	30593	50 %	0 %	50 %	0 %	407456196
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