MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018621	TTAG	2	8	320230	320237	25 %	50 %	25 %	0 %	407456487
6002	NC_018621	ACA	2	6	320290	320295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456487
6003	NC_018621	TCTG	2	8	320305	320312	0 %	50 %	25 %	25 %	407456487
6004	NC_018621	T	7	7	320319	320325	0 %	100 %	0 %	0 %	407456487
6005	NC_018621	GTT	2	6	320381	320386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456487
6006	NC_018621	T	6	6	320415	320420	0 %	100 %	0 %	0 %	407456487
6007	NC_018621	AGA	2	6	320447	320452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456487
6008	NC_018621	TTTA	2	8	320487	320494	25 %	75 %	0 %	0 %	407456487
6009	NC_018621	AGA	2	6	320540	320545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456487
6010	NC_018621	CTT	2	6	320558	320563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456487
6011	NC_018621	TGA	2	6	320648	320653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456487
6012	NC_018621	ATA	2	6	320671	320676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456487
6013	NC_018621	ACT	2	6	320706	320711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456487
6014	NC_018621	ATC	2	6	320715	320720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456487
6015	NC_018621	TTA	2	6	320767	320772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456487
6016	NC_018621	CCT	2	6	320788	320793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456487
6017	NC_018621	A	6	6	320855	320860	100 %	0 %	0 %	0 %	407456487
6018	NC_018621	TAC	2	6	320897	320902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456487
6019	NC_018621	TGCT	2	8	320903	320910	0 %	50 %	25 %	25 %	407456487
6020	NC_018621	AATA	2	8	320915	320922	75 %	25 %	0 %	0 %	407456487
6021	NC_018621	ACC	2	6	320925	320930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456487
6022	NC_018621	TGT	2	6	320934	320939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456487
6023	NC_018621	AAGAC	2	10	320956	320965	60 %	0 %	20 %	20 %	407456487
6024	NC_018621	GTG	2	6	320983	320988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456487
6025	NC_018621	G	6	6	321028	321033	0 %	0 %	100 %	0 %	407456487
6026	NC_018621	AAT	2	6	321049	321054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456487
6027	NC_018621	CTTG	2	8	321115	321122	0 %	50 %	25 %	25 %	407456487
6028	NC_018621	AT	3	6	321242	321247	50 %	50 %	0 %	0 %	407456487
6029	NC_018621	TGT	2	6	321264	321269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456487
6030	NC_018621	TTGG	2	8	321279	321286	0 %	50 %	50 %	0 %	407456487
6031	NC_018621	CAG	2	6	321338	321343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456487
6032	NC_018621	T	6	6	321353	321358	0 %	100 %	0 %	0 %	407456487
6033	NC_018621	ACTG	2	8	321624	321631	25 %	25 %	25 %	25 %	407456488
6034	NC_018621	TCG	2	6	321702	321707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6035	NC_018621	TACA	2	8	321781	321788	50 %	25 %	0 %	25 %	407456488
6036	NC_018621	TC	4	8	321811	321818	0 %	50 %	0 %	50 %	407456488
6037	NC_018621	GCT	2	6	321874	321879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6038	NC_018621	TGT	2	6	321898	321903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456488
6039	NC_018621	AGA	2	6	321976	321981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456488
6040	NC_018621	TGT	2	6	322083	322088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456488
6041	NC_018621	TGG	2	6	322089	322094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456488
6042	NC_018621	AAC	2	6	322152	322157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456488
6043	NC_018621	TCA	2	6	322190	322195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456488
6044	NC_018621	ATA	2	6	322213	322218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456488
6045	NC_018621	TTAC	2	8	322250	322257	25 %	50 %	0 %	25 %	407456488
6046	NC_018621	CT	3	6	322312	322317	0 %	50 %	0 %	50 %	407456488
6047	NC_018621	GAA	2	6	322399	322404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456488
6048	NC_018621	ACG	2	6	322432	322437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6049	NC_018621	ACG	2	6	322534	322539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6050	NC_018621	TAT	2	6	322608	322613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456488
6051	NC_018621	GT	3	6	322654	322659	0 %	50 %	50 %	0 %	407456488
6052	NC_018621	ACA	2	6	322673	322678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456488
6053	NC_018621	TGT	3	9	322693	322701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456488
6054	NC_018621	TCC	2	6	322729	322734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456488
6055	NC_018621	CAA	2	6	322788	322793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456488
6056	NC_018621	CAG	2	6	322827	322832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6057	NC_018621	TCT	2	6	322907	322912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456488
6058	NC_018621	CTG	2	6	322959	322964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6059	NC_018621	CAG	2	6	323019	323024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6060	NC_018621	CAG	2	6	323070	323075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6061	NC_018621	TTC	2	6	323080	323085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456488
6062	NC_018621	TTC	2	6	323112	323117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456488
6063	NC_018621	TTTA	2	8	323143	323150	25 %	75 %	0 %	0 %	407456488
6064	NC_018621	CAG	2	6	323163	323168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6065	NC_018621	ACCAAT	2	12	323362	323373	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407456488
6066	NC_018621	ATAA	2	8	323414	323421	75 %	25 %	0 %	0 %	407456488
6067	NC_018621	TCC	2	6	323428	323433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456488
6068	NC_018621	TGA	2	6	323476	323481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456488
6069	NC_018621	TGA	2	6	323536	323541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456488
6070	NC_018621	CAG	2	6	323580	323585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6071	NC_018621	GTT	3	9	323599	323607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456488
6072	NC_018621	ACA	2	6	323612	323617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456488
6073	NC_018621	AGC	2	6	323641	323646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
6074	NC_018621	AGC	2	6	323737	323742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456488
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6079	NC_018621	ATT	2	6	323878	323883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456488
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6081	NC_018621	TCC	2	6	324015	324020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456489
6082	NC_018621	GTT	2	6	324063	324068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456489
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6089	NC_018621	TGA	2	6	324582	324587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456490
6090	NC_018621	TTG	2	6	324625	324630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456490
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6092	NC_018621	T	6	6	324745	324750	0 %	100 %	0 %	0 %	407456490
6093	NC_018621	TCC	2	6	324818	324823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456490
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6101	NC_018621	GGT	2	6	325174	325179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456490
6102	NC_018621	TG	3	6	325242	325247	0 %	50 %	50 %	0 %	407456490
6103	NC_018621	CAA	2	6	325255	325260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456490
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6107	NC_018621	ACGC	2	8	325396	325403	25 %	0 %	25 %	50 %	407456490
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6110	NC_018621	GCT	2	6	325749	325754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456490
6111	NC_018621	GTT	2	6	325802	325807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456490
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6114	NC_018621	AGA	2	6	325895	325900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456490
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6118	NC_018621	TC	3	6	326176	326181	0 %	50 %	0 %	50 %	407456490
6119	NC_018621	TTG	2	6	326216	326221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456490
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6121	NC_018621	TAC	2	6	326291	326296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456490
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6491	NC_018621	AGT	2	6	346720	346725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456510
6492	NC_018621	GCC	2	6	346736	346741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407456510
6493	NC_018621	GC	3	6	346779	346784	0 %	0 %	50 %	50 %	407456510
6494	NC_018621	TGC	2	6	346989	346994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456510
6495	NC_018621	GAA	2	6	347027	347032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456510
6496	NC_018621	TTAT	2	8	347057	347064	25 %	75 %	0 %	0 %	407456510
6497	NC_018621	TGCG	2	8	347106	347113	0 %	25 %	50 %	25 %	407456510
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6499	NC_018621	GAA	2	6	347156	347161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456510
6500	NC_018621	AAC	2	6	347216	347221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456511

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