MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018621	ATGT	2	8	266373	266380	25 %	50 %	25 %	0 %	407456447
5002	NC_018621	AGG	2	6	266388	266393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456447
5003	NC_018621	ATA	2	6	266414	266419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456447
5004	NC_018621	TTC	2	6	266511	266516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456447
5005	NC_018621	GTT	2	6	266525	266530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456448
5006	NC_018621	T	7	7	266575	266581	0 %	100 %	0 %	0 %	407456448
5007	NC_018621	AGG	3	9	266844	266852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456449
5008	NC_018621	CGTGG	2	10	266869	266878	0 %	20 %	60 %	20 %	407456449
5009	NC_018621	G	6	6	266877	266882	0 %	0 %	100 %	0 %	407456449
5010	NC_018621	AAG	2	6	266892	266897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456449
5011	NC_018621	GTAA	2	8	266956	266963	50 %	25 %	25 %	0 %	407456449
5012	NC_018621	CAAG	2	8	267102	267109	50 %	0 %	25 %	25 %	407456449
5013	NC_018621	AAGAT	2	10	267125	267134	60 %	20 %	20 %	0 %	407456449
5014	NC_018621	AAGA	2	8	267163	267170	75 %	0 %	25 %	0 %	407456449
5015	NC_018621	AAG	2	6	267215	267220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456449
5016	NC_018621	CTG	2	6	267245	267250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456449
5017	NC_018621	CAA	2	6	267418	267423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456449
5018	NC_018621	GA	3	6	267430	267435	50 %	0 %	50 %	0 %	407456449
5019	NC_018621	AAC	2	6	267479	267484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456449
5020	NC_018621	AAG	2	6	267505	267510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456449
5021	NC_018621	TATT	2	8	268032	268039	25 %	75 %	0 %	0 %	407456450
5022	NC_018621	A	6	6	268109	268114	100 %	0 %	0 %	0 %	407456450
5023	NC_018621	GTT	2	6	268167	268172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456450
5024	NC_018621	T	6	6	268210	268215	0 %	100 %	0 %	0 %	407456450
5025	NC_018621	GTT	2	6	268232	268237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456450
5026	NC_018621	TCT	2	6	268260	268265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456450
5027	NC_018621	TTA	2	6	268308	268313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456450
5028	NC_018621	AGA	2	6	268384	268389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456450
5029	NC_018621	AAG	2	6	268443	268448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456450
5030	NC_018621	GTT	2	6	268544	268549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456450
5031	NC_018621	TGG	2	6	268576	268581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456450
5032	NC_018621	T	6	6	268656	268661	0 %	100 %	0 %	0 %	407456450
5033	NC_018621	ATC	2	6	268677	268682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456450
5034	NC_018621	TCTT	2	8	268774	268781	0 %	75 %	0 %	25 %	407456450
5035	NC_018621	TGA	2	6	268840	268845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456450
5036	NC_018621	TA	4	8	268950	268957	50 %	50 %	0 %	0 %	407456450
5037	NC_018621	GAA	2	6	269045	269050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456450
5038	NC_018621	ATT	2	6	269190	269195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456450
5039	NC_018621	AGG	2	6	269252	269257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456451
5040	NC_018621	AT	3	6	269289	269294	50 %	50 %	0 %	0 %	407456451
5041	NC_018621	GAA	2	6	269325	269330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456451
5042	NC_018621	GGTT	2	8	269368	269375	0 %	50 %	50 %	0 %	407456451
5043	NC_018621	TTGGT	2	10	269388	269397	0 %	60 %	40 %	0 %	407456451
5044	NC_018621	TC	4	8	269413	269420	0 %	50 %	0 %	50 %	407456451
5045	NC_018621	GCA	2	6	269427	269432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456451
5046	NC_018621	AGG	2	6	269456	269461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456451
5047	NC_018621	T	6	6	269462	269467	0 %	100 %	0 %	0 %	407456451
5048	NC_018621	GAG	2	6	269577	269582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456451
5049	NC_018621	TGTA	2	8	269604	269611	25 %	50 %	25 %	0 %	407456451
5050	NC_018621	AG	3	6	269669	269674	50 %	0 %	50 %	0 %	407456451
5051	NC_018621	TCC	3	9	269723	269731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456451
5052	NC_018621	ATG	2	6	269736	269741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456451
5053	NC_018621	GGA	2	6	269757	269762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456451
5054	NC_018621	AAT	2	6	269808	269813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456451
5055	NC_018621	TCT	2	6	269823	269828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456451
5056	NC_018621	TAG	2	6	270090	270095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456451
5057	NC_018621	AAG	3	9	270130	270138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456451
5058	NC_018621	GA	3	6	270148	270153	50 %	0 %	50 %	0 %	407456451
5059	NC_018621	AAG	2	6	270198	270203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456451
5060	NC_018621	GTT	2	6	270214	270219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456451
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5062	NC_018621	AAAT	2	8	270334	270341	75 %	25 %	0 %	0 %	407456451
5063	NC_018621	GTT	2	6	270369	270374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456451
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5067	NC_018621	TGT	2	6	270576	270581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456451
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5070	NC_018621	GTC	2	6	270836	270841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456451
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5077	NC_018621	CGT	2	6	271279	271284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456451
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5079	NC_018621	A	8	8	271319	271326	100 %	0 %	0 %	0 %	407456452
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5087	NC_018621	A	6	6	271641	271646	100 %	0 %	0 %	0 %	407456453
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5097	NC_018621	TGGCA	2	10	272025	272034	20 %	20 %	40 %	20 %	407456453
5098	NC_018621	T	7	7	272045	272051	0 %	100 %	0 %	0 %	407456453
5099	NC_018621	GGT	2	6	272053	272058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456453
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5106	NC_018621	A	6	6	272445	272450	100 %	0 %	0 %	0 %	407456455
5107	NC_018621	ATT	2	6	272514	272519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456455
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5109	NC_018621	TGT	2	6	272757	272762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456456
5110	NC_018621	AGA	2	6	272902	272907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456456
5111	NC_018621	CAA	2	6	272915	272920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456456
5112	NC_018621	GAT	2	6	273035	273040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456456
5113	NC_018621	CTGT	2	8	273108	273115	0 %	50 %	25 %	25 %	407456456
5114	NC_018621	ATG	2	6	273129	273134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456456
5115	NC_018621	ATG	2	6	273152	273157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456456
5116	NC_018621	TGC	2	6	273169	273174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456456
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5118	NC_018621	TCCT	2	8	273195	273202	0 %	50 %	0 %	50 %	407456456
5119	NC_018621	TC	3	6	273269	273274	0 %	50 %	0 %	50 %	407456456
5120	NC_018621	TCTAGA	2	12	273296	273307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407456456
5121	NC_018621	AAG	2	6	273312	273317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456456
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5123	NC_018621	GAA	2	6	273365	273370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456456
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5239	NC_018621	GAA	3	9	278651	278659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456461
5240	NC_018621	AATCC	2	10	278713	278722	40 %	20 %	0 %	40 %	407456461
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5243	NC_018621	GA	3	6	278928	278933	50 %	0 %	50 %	0 %	407456461
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