MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 21840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018621	AAAT	2	8	240603	240610	75 %	25 %	0 %	0 %	407456419
4502	NC_018621	TCT	2	6	240653	240658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456419
4503	NC_018621	GAG	2	6	240684	240689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456419
4504	NC_018621	CTT	2	6	240692	240697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456419
4505	NC_018621	CGT	2	6	241102	241107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456420
4506	NC_018621	GAA	2	6	241139	241144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456420
4507	NC_018621	ATC	2	6	241186	241191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456420
4508	NC_018621	TAT	2	6	241223	241228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
4509	NC_018621	GAG	2	6	241238	241243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456420
4510	NC_018621	GAT	2	6	241262	241267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
4511	NC_018621	TTCAG	2	10	241292	241301	20 %	40 %	20 %	20 %	407456420
4512	NC_018621	TTG	2	6	241367	241372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456420
4513	NC_018621	CAT	2	6	241484	241489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456420
4514	NC_018621	ATT	2	6	241494	241499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
4515	NC_018621	GTTT	2	8	241605	241612	0 %	75 %	25 %	0 %	407456420
4516	NC_018621	AGG	2	6	241631	241636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456420
4517	NC_018621	TG	3	6	241689	241694	0 %	50 %	50 %	0 %	407456420
4518	NC_018621	ATT	2	6	241729	241734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
4519	NC_018621	TTC	2	6	241790	241795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456420
4520	NC_018621	AGA	2	6	241803	241808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456420
4521	NC_018621	TGA	2	6	241838	241843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
4522	NC_018621	TTG	2	6	241888	241893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456420
4523	NC_018621	CGG	2	6	241895	241900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407456420
4524	NC_018621	TTG	2	6	241906	241911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456420
4525	NC_018621	ATT	2	6	241941	241946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
4526	NC_018621	ATG	2	6	242011	242016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
4527	NC_018621	ATG	2	6	242043	242048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
4528	NC_018621	GCA	2	6	242073	242078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456420
4529	NC_018621	AAG	2	6	242095	242100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456420
4530	NC_018621	A	6	6	242118	242123	100 %	0 %	0 %	0 %	407456420
4531	NC_018621	TCA	2	6	242129	242134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456420
4532	NC_018621	GCTT	2	8	242188	242195	0 %	50 %	25 %	25 %	407456420
4533	NC_018621	AT	3	6	242269	242274	50 %	50 %	0 %	0 %	407456420
4534	NC_018621	TGA	2	6	242393	242398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
4535	NC_018621	GAA	2	6	242403	242408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456420
4536	NC_018621	ATT	2	6	242418	242423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
4537	NC_018621	TGA	2	6	242462	242467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456420
4538	NC_018621	GAA	2	6	242511	242516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456420
4539	NC_018621	TTA	2	6	242538	242543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456420
4540	NC_018621	TTTAG	2	10	242582	242591	20 %	60 %	20 %	0 %	407456420
4541	NC_018621	AG	3	6	242652	242657	50 %	0 %	50 %	0 %	407456421
4542	NC_018621	T	7	7	242683	242689	0 %	100 %	0 %	0 %	407456421
4543	NC_018621	GCA	2	6	242713	242718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456421
4544	NC_018621	TAAT	2	8	242780	242787	50 %	50 %	0 %	0 %	407456421
4545	NC_018621	ATG	2	6	242839	242844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456421
4546	NC_018621	ACT	2	6	242857	242862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456421
4547	NC_018621	GCT	2	6	242878	242883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456421
4548	NC_018621	CGT	2	6	242923	242928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456421
4549	NC_018621	G	6	6	242974	242979	0 %	0 %	100 %	0 %	407456421
4550	NC_018621	TTTA	2	8	243056	243063	25 %	75 %	0 %	0 %	407456421
4551	NC_018621	ATCG	2	8	243103	243110	25 %	25 %	25 %	25 %	407456421
4552	NC_018621	AAT	2	6	243253	243258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456422
4553	NC_018621	TTC	2	6	243303	243308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456422
4554	NC_018621	CTT	2	6	243309	243314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456422
4555	NC_018621	CTG	2	6	243318	243323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456422
4556	NC_018621	TTA	2	6	243333	243338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456422
4557	NC_018621	ATG	2	6	243345	243350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456422
4558	NC_018621	TG	3	6	243369	243374	0 %	50 %	50 %	0 %	407456422
4559	NC_018621	GTTGT	2	10	243387	243396	0 %	60 %	40 %	0 %	407456422
4560	NC_018621	A	6	6	243419	243424	100 %	0 %	0 %	0 %	407456422
4561	NC_018621	GGTA	2	8	243452	243459	25 %	25 %	50 %	0 %	407456422
4562	NC_018621	GTT	2	6	243488	243493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456422
4563	NC_018621	CA	4	8	243540	243547	50 %	0 %	0 %	50 %	407456422
4564	NC_018621	TTG	2	6	243600	243605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456422
4565	NC_018621	AG	3	6	243761	243766	50 %	0 %	50 %	0 %	407456422
4566	NC_018621	GCG	2	6	243797	243802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407456422
4567	NC_018621	GT	3	6	243897	243902	0 %	50 %	50 %	0 %	407456422
4568	NC_018621	AAAG	2	8	243923	243930	75 %	0 %	25 %	0 %	407456422
4569	NC_018621	TTA	2	6	244108	244113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456423
4570	NC_018621	TTTA	2	8	244166	244173	25 %	75 %	0 %	0 %	407456423
4571	NC_018621	AAG	2	6	244220	244225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456423
4572	NC_018621	GAA	2	6	244243	244248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456423
4573	NC_018621	A	6	6	244334	244339	100 %	0 %	0 %	0 %	407456423
4574	NC_018621	GCA	2	6	244449	244454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456423
4575	NC_018621	TAT	2	6	244482	244487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456423
4576	NC_018621	TAA	3	9	244500	244508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456423
4577	NC_018621	GTT	2	6	244620	244625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456423
4578	NC_018621	TCC	2	6	244689	244694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456423
4579	NC_018621	TTTCCT	2	12	244773	244784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456423
4580	NC_018621	GAA	3	9	244837	244845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456423
4581	NC_018621	GA	3	6	244909	244914	50 %	0 %	50 %	0 %	407456423
4582	NC_018621	TTC	2	6	244975	244980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456423
4583	NC_018621	GAC	3	9	244987	244995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456423
4584	NC_018621	TGA	2	6	245001	245006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456423
4585	NC_018621	AGCT	2	8	245111	245118	25 %	25 %	25 %	25 %	407456424
4586	NC_018621	T	7	7	245122	245128	0 %	100 %	0 %	0 %	407456424
4587	NC_018621	GTT	2	6	245157	245162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456424
4588	NC_018621	GAG	2	6	245307	245312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456424
4589	NC_018621	TTTAGG	2	12	245380	245391	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407456424
4590	NC_018621	CTC	2	6	245434	245439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456424
4591	NC_018621	TAAAAG	2	12	245472	245483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407456424
4592	NC_018621	GTT	2	6	245499	245504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456424
4593	NC_018621	ATG	2	6	245662	245667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456424
4594	NC_018621	AGATA	2	10	245677	245686	60 %	20 %	20 %	0 %	407456424
4595	NC_018621	TTATC	2	10	245691	245700	20 %	60 %	0 %	20 %	407456424
4596	NC_018621	TTG	2	6	245744	245749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456425
4597	NC_018621	TAG	2	6	245755	245760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456425
4598	NC_018621	TCT	3	9	245796	245804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456425
4599	NC_018621	AGT	2	6	245827	245832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456425
4600	NC_018621	GCT	2	6	245886	245891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456425
4601	NC_018621	AG	3	6	245916	245921	50 %	0 %	50 %	0 %	407456425
4602	NC_018621	CTT	2	6	245932	245937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456425
4603	NC_018621	GAT	2	6	245959	245964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456425
4604	NC_018621	AGAA	2	8	245966	245973	75 %	0 %	25 %	0 %	407456425
4605	NC_018621	CAT	2	6	246118	246123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456425
4606	NC_018621	ATT	2	6	246192	246197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456425
4607	NC_018621	CTTT	2	8	246207	246214	0 %	75 %	0 %	25 %	407456425
4608	NC_018621	AGC	2	6	246218	246223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456425
4609	NC_018621	ATGG	2	8	246325	246332	25 %	25 %	50 %	0 %	407456425
4610	NC_018621	TAA	2	6	246335	246340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456425
4611	NC_018621	AAG	2	6	246380	246385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456425
4612	NC_018621	T	7	7	246535	246541	0 %	100 %	0 %	0 %	407456426
4613	NC_018621	AGA	2	6	246586	246591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456426
4614	NC_018621	TG	3	6	246620	246625	0 %	50 %	50 %	0 %	407456426
4615	NC_018621	G	6	6	246752	246757	0 %	0 %	100 %	0 %	407456426
4616	NC_018621	TGA	2	6	246761	246766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456426
4617	NC_018621	ATT	2	6	246802	246807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456426
4618	NC_018621	AAT	2	6	246824	246829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456426
4619	NC_018621	ATC	2	6	246853	246858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456426
4620	NC_018621	TAACA	2	10	246917	246926	60 %	20 %	0 %	20 %	407456426
4621	NC_018621	TCA	2	6	247025	247030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456426
4622	NC_018621	TCC	3	9	247045	247053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456426
4623	NC_018621	GAATC	2	10	247056	247065	40 %	20 %	20 %	20 %	407456426
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