MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	407454816
2	NC_018620	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	407454816
3	NC_018620	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	407454818
4	NC_018620	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	407454819
5	NC_018620	AAGAA	2	10	9570	9579	80 %	0 %	20 %	0 %	407454821
6	NC_018620	ATAAA	2	10	13045	13054	80 %	20 %	0 %	0 %	407454822
7	NC_018620	GTTTT	2	10	13559	13568	0 %	80 %	20 %	0 %	407454822
8	NC_018620	GAAAC	2	10	14327	14336	60 %	0 %	20 %	20 %	407454825
9	NC_018620	AACAA	2	10	15356	15365	80 %	0 %	0 %	20 %	407454825
10	NC_018620	AATAG	2	10	17068	17077	60 %	20 %	20 %	0 %	407454827
11	NC_018620	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	407454830
12	NC_018620	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	407454831
13	NC_018620	ATCAG	2	10	29178	29187	40 %	20 %	20 %	20 %	407454834
14	NC_018620	GCCAC	2	10	29440	29449	20 %	0 %	20 %	60 %	407454835
15	NC_018620	AAGGA	2	10	38572	38581	60 %	0 %	40 %	0 %	407454845
16	NC_018620	CCATA	2	10	38779	38788	40 %	20 %	0 %	40 %	407454845
17	NC_018620	GGATT	2	10	39765	39774	20 %	40 %	40 %	0 %	407454847
18	NC_018620	CGCAG	2	10	40530	40539	20 %	0 %	40 %	40 %	407454848
19	NC_018620	CTTTC	2	10	43208	43217	0 %	60 %	0 %	40 %	407454851
20	NC_018620	ACAAA	2	10	43870	43879	80 %	0 %	0 %	20 %	407454852
21	NC_018620	TATGG	2	10	44280	44289	20 %	40 %	40 %	0 %	407454853
22	NC_018620	TCTTT	2	10	46088	46097	0 %	80 %	0 %	20 %	407454855
23	NC_018620	AGCCC	2	10	47085	47094	20 %	0 %	20 %	60 %	407454856
24	NC_018620	TCAAA	2	10	47440	47449	60 %	20 %	0 %	20 %	407454856
25	NC_018620	TCTAT	2	10	49559	49568	20 %	60 %	0 %	20 %	407454858
26	NC_018620	TTTGG	2	10	51473	51482	0 %	60 %	40 %	0 %	407454858
27	NC_018620	TTTTC	2	10	55340	55349	0 %	80 %	0 %	20 %	407454862
28	NC_018620	GTAAG	2	10	57388	57397	40 %	20 %	40 %	0 %	407454865
29	NC_018620	GGGTT	2	10	58381	58390	0 %	40 %	60 %	0 %	407454866
30	NC_018620	GCTGG	2	10	58659	58668	0 %	20 %	60 %	20 %	407454866
31	NC_018620	AAAAT	2	10	60179	60188	80 %	20 %	0 %	0 %	407454867
32	NC_018620	TTATG	2	10	61213	61222	20 %	60 %	20 %	0 %	407454867
33	NC_018620	ATTTT	2	10	61259	61268	20 %	80 %	0 %	0 %	407454867
34	NC_018620	TAGTT	2	10	62781	62790	20 %	60 %	20 %	0 %	407454867
35	NC_018620	TCCTA	2	10	64845	64854	20 %	40 %	0 %	40 %	407454869
36	NC_018620	AGAAA	2	10	70101	70110	80 %	0 %	20 %	0 %	407454873
37	NC_018620	GGATA	2	10	70909	70918	40 %	20 %	40 %	0 %	407454875
38	NC_018620	ATAGC	2	10	74348	74357	40 %	20 %	20 %	20 %	407454879
39	NC_018620	GCACA	2	10	77181	77190	40 %	0 %	20 %	40 %	407454881
40	NC_018620	AAAGA	2	10	78134	78143	80 %	0 %	20 %	0 %	407454882
41	NC_018620	GCAGG	2	10	79493	79502	20 %	0 %	60 %	20 %	407454883
42	NC_018620	ACTAG	2	10	79581	79590	40 %	20 %	20 %	20 %	407454883
43	NC_018620	CGTAT	2	10	81516	81525	20 %	40 %	20 %	20 %	407454884
44	NC_018620	GAAAA	2	10	82726	82735	80 %	0 %	20 %	0 %	407454885
45	NC_018620	AGGAA	2	10	84725	84734	60 %	0 %	40 %	0 %	407454888
46	NC_018620	CTTTT	2	10	85614	85623	0 %	80 %	0 %	20 %	407454890
47	NC_018620	CAAAG	2	10	87085	87094	60 %	0 %	20 %	20 %	407454892
48	NC_018620	AACAA	2	10	87252	87261	80 %	0 %	0 %	20 %	407454892
49	NC_018620	AAAGA	2	10	89159	89168	80 %	0 %	20 %	0 %	407454894
50	NC_018620	TTTTC	2	10	90174	90183	0 %	80 %	0 %	20 %	407454894
51	NC_018620	AGGAT	2	10	90697	90706	40 %	20 %	40 %	0 %	407454894
52	NC_018620	ATAAC	2	10	90783	90792	60 %	20 %	0 %	20 %	407454894
53	NC_018620	TGGCA	2	10	93268	93277	20 %	20 %	40 %	20 %	407454895
54	NC_018620	TGTTT	2	10	94993	95002	0 %	80 %	20 %	0 %	407454897
55	NC_018620	TCACC	2	10	96567	96576	20 %	20 %	0 %	60 %	407454898
56	NC_018620	AAAAT	2	10	96702	96711	80 %	20 %	0 %	0 %	407454898
57	NC_018620	TTAAT	2	10	97746	97755	40 %	60 %	0 %	0 %	407454899
58	NC_018620	ATTAC	2	10	102878	102887	40 %	40 %	0 %	20 %	407454907
59	NC_018620	CTACA	2	10	103252	103261	40 %	20 %	0 %	40 %	407454907
60	NC_018620	AATTA	2	10	104799	104808	60 %	40 %	0 %	0 %	407454909
61	NC_018620	CTATA	2	10	105789	105798	40 %	40 %	0 %	20 %	407454910
62	NC_018620	AGCTT	2	10	108443	108452	20 %	40 %	20 %	20 %	407454914
63	NC_018620	GTTTG	2	10	108750	108759	0 %	60 %	40 %	0 %	407454914
64	NC_018620	AGTTA	2	10	115555	115564	40 %	40 %	20 %	0 %	407454929
65	NC_018620	AGTTT	2	10	116045	116054	20 %	60 %	20 %	0 %	407454930
66	NC_018620	TTTGC	2	10	116960	116969	0 %	60 %	20 %	20 %	407454932
67	NC_018620	TTTAC	2	10	119157	119166	20 %	60 %	0 %	20 %	407454935
68	NC_018620	AATTA	2	10	122050	122059	60 %	40 %	0 %	0 %	407454938
69	NC_018620	GAGAT	2	10	123402	123411	40 %	20 %	40 %	0 %	407454939
70	NC_018620	GTCAA	2	10	124721	124730	40 %	20 %	20 %	20 %	407454941
71	NC_018620	TAGGG	2	10	127193	127202	20 %	20 %	60 %	0 %	407454944
72	NC_018620	AACTT	2	10	128125	128134	40 %	40 %	0 %	20 %	407454944
73	NC_018620	TGTCA	2	10	132010	132019	20 %	40 %	20 %	20 %	407454947
74	NC_018620	AAAAG	2	10	135416	135425	80 %	0 %	20 %	0 %	407454949
75	NC_018620	TAAAA	2	10	135697	135706	80 %	20 %	0 %	0 %	407454949
76	NC_018620	GATTT	2	10	137956	137965	20 %	60 %	20 %	0 %	407454951
77	NC_018620	TTGTT	2	10	138298	138307	0 %	80 %	20 %	0 %	407454951
78	NC_018620	AAGAA	2	10	138779	138788	80 %	0 %	20 %	0 %	407454951
79	NC_018620	TTCTT	2	10	139372	139381	0 %	80 %	0 %	20 %	407454953
80	NC_018620	CTTTG	2	10	141276	141285	0 %	60 %	20 %	20 %	407454955
81	NC_018620	AGAAA	2	10	143313	143322	80 %	0 %	20 %	0 %	407454958
82	NC_018620	AAAGA	2	10	145978	145987	80 %	0 %	20 %	0 %	407454960
83	NC_018620	TAGAG	2	10	146649	146658	40 %	20 %	40 %	0 %	407454962
84	NC_018620	TGTTT	2	10	147143	147152	0 %	80 %	20 %	0 %	407454963
85	NC_018620	CGTTT	2	10	149591	149600	0 %	60 %	20 %	20 %	407454966
86	NC_018620	ATTTT	2	10	149731	149740	20 %	80 %	0 %	0 %	407454966
87	NC_018620	TGCTT	2	10	150448	150457	0 %	60 %	20 %	20 %	407454966
88	NC_018620	TGGTT	2	10	150789	150798	0 %	60 %	40 %	0 %	407454966
89	NC_018620	ATGCT	2	10	151331	151340	20 %	40 %	20 %	20 %	407454967
90	NC_018620	AAGAG	2	10	152570	152579	60 %	0 %	40 %	0 %	407454968
91	NC_018620	CAGAA	2	10	152725	152734	60 %	0 %	20 %	20 %	407454968
92	NC_018620	AAAAG	2	10	154124	154133	80 %	0 %	20 %	0 %	407454969
93	NC_018620	GCTTG	2	10	163610	163619	0 %	40 %	40 %	20 %	407454979
94	NC_018620	CTACG	2	10	166193	166202	20 %	20 %	20 %	40 %	407454980
95	NC_018620	AAATG	2	10	166330	166339	60 %	20 %	20 %	0 %	407454980
96	NC_018620	CTGTT	2	10	169632	169641	0 %	60 %	20 %	20 %	407454983
97	NC_018620	AATGA	2	10	169667	169676	60 %	20 %	20 %	0 %	407454983
98	NC_018620	ATTTT	2	10	173126	173135	20 %	80 %	0 %	0 %	407454987
99	NC_018620	GAGAG	2	10	173143	173152	40 %	0 %	60 %	0 %	407454987
100	NC_018620	CTAAG	2	10	181092	181101	40 %	20 %	20 %	20 %	407454994
101	NC_018620	TTTTC	2	10	181692	181701	0 %	80 %	0 %	20 %	407454994
102	NC_018620	GGTAC	2	10	183687	183696	20 %	20 %	40 %	20 %	407454996
103	NC_018620	AGGGA	2	10	186874	186883	40 %	0 %	60 %	0 %	407455001
104	NC_018620	AGGAA	2	10	187897	187906	60 %	0 %	40 %	0 %	407455002
105	NC_018620	TTCTT	2	10	188276	188285	0 %	80 %	0 %	20 %	407455002
106	NC_018620	GATAA	2	10	190919	190928	60 %	20 %	20 %	0 %	407455002
107	NC_018620	TTATT	2	10	194131	194140	20 %	80 %	0 %	0 %	407455004
108	NC_018620	AGGGT	2	10	197040	197049	20 %	20 %	60 %	0 %	407455006
109	NC_018620	AGCTA	2	10	197536	197545	40 %	20 %	20 %	20 %	407455006
110	NC_018620	TTTTC	2	10	197643	197652	0 %	80 %	0 %	20 %	407455006
111	NC_018620	CTTTA	2	10	197841	197850	20 %	60 %	0 %	20 %	407455006
112	NC_018620	TTGGT	2	10	201326	201335	0 %	60 %	40 %	0 %	407455011
113	NC_018620	AGCAA	2	10	203803	203812	60 %	0 %	20 %	20 %	407455014
114	NC_018620	ATGTG	2	10	204189	204198	20 %	40 %	40 %	0 %	407455015
115	NC_018620	TAATG	2	10	204918	204927	40 %	40 %	20 %	0 %	407455015
116	NC_018620	AAAAT	2	10	206864	206873	80 %	20 %	0 %	0 %	407455019
117	NC_018620	TGGTT	2	10	207783	207792	0 %	60 %	40 %	0 %	407455019
118	NC_018620	TCTCT	2	10	208561	208570	0 %	60 %	0 %	40 %	407455021
119	NC_018620	GAAAA	2	10	214094	214103	80 %	0 %	20 %	0 %	407455028
120	NC_018620	TAGCA	2	10	214460	214469	40 %	20 %	20 %	20 %	407455029
121	NC_018620	AAGAA	2	10	215158	215167	80 %	0 %	20 %	0 %	407455029
122	NC_018620	GAAAG	2	10	216460	216469	60 %	0 %	40 %	0 %	407455031
123	NC_018620	TTGTA	2	10	221261	221270	20 %	60 %	20 %	0 %	407455032
124	NC_018620	GCTTA	2	10	222392	222401	20 %	40 %	20 %	20 %	407455032
125	NC_018620	GCTGA	2	10	227271	227280	20 %	20 %	40 %	20 %	407455036
126	NC_018620	AGGAG	2	10	230581	230590	40 %	0 %	60 %	0 %	407455041
127	NC_018620	TGCCC	2	10	230884	230893	0 %	20 %	20 %	60 %	407455041
128	NC_018620	TACCT	2	10	231750	231759	20 %	40 %	0 %	40 %	407455042
129	NC_018620	CTAGT	2	10	232041	232050	20 %	40 %	20 %	20 %	407455042
130	NC_018620	TGCGT	2	10	234207	234216	0 %	40 %	40 %	20 %	407455044
131	NC_018620	GTTTT	2	10	234252	234261	0 %	80 %	20 %	0 %	407455044
132	NC_018620	TGGTG	2	10	239165	239174	0 %	40 %	60 %	0 %	407455049
133	NC_018620	AGCGT	2	10	240617	240626	20 %	20 %	40 %	20 %	407455051
134	NC_018620	TTCAG	2	10	241238	241247	20 %	40 %	20 %	20 %	407455052
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136	NC_018620	ATACC	2	10	242251	242260	40 %	20 %	0 %	40 %	407455052
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