MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 21508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018620	T	7	7	213658	213664	0 %	100 %	0 %	0 %	407455028
4002	NC_018620	TTG	2	6	213695	213700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455028
4003	NC_018620	GTT	2	6	213715	213720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455028
4004	NC_018620	ATG	2	6	213765	213770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455028
4005	NC_018620	GTT	2	6	213836	213841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455028
4006	NC_018620	AGAT	2	8	213942	213949	50 %	25 %	25 %	0 %	407455028
4007	NC_018620	AGAA	2	8	214065	214072	75 %	0 %	25 %	0 %	407455028
4008	NC_018620	GAAAA	2	10	214094	214103	80 %	0 %	20 %	0 %	407455028
4009	NC_018620	TGC	2	6	214117	214122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455028
4010	NC_018620	T	7	7	214149	214155	0 %	100 %	0 %	0 %	407455028
4011	NC_018620	GTA	2	6	214186	214191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455028
4012	NC_018620	AAC	2	6	214207	214212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455028
4013	NC_018620	GTT	2	6	214225	214230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455028
4014	NC_018620	C	6	6	214233	214238	0 %	0 %	0 %	100 %	407455028
4015	NC_018620	CAA	2	6	214259	214264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455028
4016	NC_018620	GTT	2	6	214377	214382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455029
4017	NC_018620	ATT	2	6	214397	214402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455029
4018	NC_018620	TTC	2	6	214412	214417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455029
4019	NC_018620	TAGCA	2	10	214460	214469	40 %	20 %	20 %	20 %	407455029
4020	NC_018620	AGC	2	6	214535	214540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455029
4021	NC_018620	ACA	2	6	214545	214550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455029
4022	NC_018620	ACG	2	6	214587	214592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455029
4023	NC_018620	GCT	2	6	214657	214662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455029
4024	NC_018620	AGC	2	6	214664	214669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455029
4025	NC_018620	AG	3	6	214771	214776	50 %	0 %	50 %	0 %	407455029
4026	NC_018620	T	6	6	214890	214895	0 %	100 %	0 %	0 %	407455029
4027	NC_018620	T	7	7	214923	214929	0 %	100 %	0 %	0 %	407455029
4028	NC_018620	GCAC	2	8	214974	214981	25 %	0 %	25 %	50 %	407455029
4029	NC_018620	T	6	6	214984	214989	0 %	100 %	0 %	0 %	407455029
4030	NC_018620	TCT	2	6	215124	215129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455029
4031	NC_018620	AAGAA	2	10	215158	215167	80 %	0 %	20 %	0 %	407455029
4032	NC_018620	AAAG	2	8	215173	215180	75 %	0 %	25 %	0 %	407455029
4033	NC_018620	GAA	2	6	215794	215799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455030
4034	NC_018620	TCA	2	6	215819	215824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455030
4035	NC_018620	ACA	2	6	215832	215837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455030
4036	NC_018620	AG	3	6	215929	215934	50 %	0 %	50 %	0 %	407455030
4037	NC_018620	TTG	2	6	215935	215940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455030
4038	NC_018620	GACA	2	8	216050	216057	50 %	0 %	25 %	25 %	407455030
4039	NC_018620	ATC	2	6	216103	216108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455030
4040	NC_018620	ATT	2	6	216164	216169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455030
4041	NC_018620	GGT	2	6	216283	216288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455030
4042	NC_018620	AGC	2	6	216339	216344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455030
4043	NC_018620	TTG	2	6	216404	216409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455030
4044	NC_018620	AAG	2	6	216439	216444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455031
4045	NC_018620	GAAAG	2	10	216460	216469	60 %	0 %	40 %	0 %	407455031
4046	NC_018620	TAT	2	6	216548	216553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455031
4047	NC_018620	ATTT	2	8	216631	216638	25 %	75 %	0 %	0 %	407455031
4048	NC_018620	TCA	2	6	216743	216748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455031
4049	NC_018620	CTTT	2	8	216795	216802	0 %	75 %	0 %	25 %	407455031
4050	NC_018620	GTG	2	6	216826	216831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455031
4051	NC_018620	ACTC	2	8	216840	216847	25 %	25 %	0 %	50 %	407455031
4052	NC_018620	TTA	2	6	216934	216939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455031
4053	NC_018620	TGT	2	6	216992	216997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455031
4054	NC_018620	TG	3	6	217165	217170	0 %	50 %	50 %	0 %	407455031
4055	NC_018620	TAG	2	6	217181	217186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455031
4056	NC_018620	TAC	2	6	217197	217202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455031
4057	NC_018620	CA	3	6	217483	217488	50 %	0 %	0 %	50 %	407455032
4058	NC_018620	AGAA	2	8	217735	217742	75 %	0 %	25 %	0 %	407455032
4059	NC_018620	TTG	2	6	217747	217752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455032
4060	NC_018620	CAAC	2	8	217802	217809	50 %	0 %	0 %	50 %	407455032
4061	NC_018620	ATGG	2	8	217845	217852	25 %	25 %	50 %	0 %	407455032
4062	NC_018620	GCA	2	6	217903	217908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4063	NC_018620	TTC	2	6	218141	218146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455032
4064	NC_018620	CAT	2	6	218206	218211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455032
4065	NC_018620	ATT	2	6	218222	218227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455032
4066	NC_018620	TGT	2	6	218233	218238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455032
4067	NC_018620	AGT	2	6	218302	218307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455032
4068	NC_018620	GCG	2	6	218330	218335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407455032
4069	NC_018620	CTC	2	6	218339	218344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455032
4070	NC_018620	CTA	2	6	218466	218471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455032
4071	NC_018620	TAAG	2	8	218510	218517	50 %	25 %	25 %	0 %	407455032
4072	NC_018620	CTG	3	9	218653	218661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4073	NC_018620	AGG	2	6	218693	218698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455032
4074	NC_018620	TCT	2	6	218712	218717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455032
4075	NC_018620	GTT	2	6	218747	218752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455032
4076	NC_018620	TCC	2	6	218780	218785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455032
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4079	NC_018620	GGA	2	6	218982	218987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455032
4080	NC_018620	TTA	2	6	219006	219011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455032
4081	NC_018620	TTA	2	6	219030	219035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455032
4082	NC_018620	AGA	2	6	219038	219043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455032
4083	NC_018620	CAT	2	6	219067	219072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455032
4084	NC_018620	GATT	2	8	219084	219091	25 %	50 %	25 %	0 %	407455032
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4086	NC_018620	AGAT	2	8	219140	219147	50 %	25 %	25 %	0 %	407455032
4087	NC_018620	TTCC	2	8	219241	219248	0 %	50 %	0 %	50 %	407455032
4088	NC_018620	GCT	2	6	219345	219350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
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4090	NC_018620	CGT	2	6	219388	219393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
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4093	NC_018620	CAG	2	6	219682	219687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4094	NC_018620	CTG	2	6	219694	219699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4095	NC_018620	ATT	2	6	219753	219758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455032
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4099	NC_018620	ATC	2	6	219944	219949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455032
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4101	NC_018620	TAG	2	6	220069	220074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455032
4102	NC_018620	ATAG	2	8	220148	220155	50 %	25 %	25 %	0 %	407455032
4103	NC_018620	TAT	2	6	220177	220182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455032
4104	NC_018620	CAC	2	6	220240	220245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455032
4105	NC_018620	GGT	2	6	220279	220284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455032
4106	NC_018620	GA	3	6	220291	220296	50 %	0 %	50 %	0 %	407455032
4107	NC_018620	CAC	2	6	220324	220329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455032
4108	NC_018620	T	6	6	220344	220349	0 %	100 %	0 %	0 %	407455032
4109	NC_018620	CAG	2	6	220396	220401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4110	NC_018620	TGC	2	6	220406	220411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4111	NC_018620	GCA	2	6	220419	220424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4112	NC_018620	ACT	2	6	220425	220430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455032
4113	NC_018620	GATT	2	8	220490	220497	25 %	50 %	25 %	0 %	407455032
4114	NC_018620	GTTA	2	8	220502	220509	25 %	50 %	25 %	0 %	407455032
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4117	NC_018620	CCA	3	9	220665	220673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455032
4118	NC_018620	T	7	7	220675	220681	0 %	100 %	0 %	0 %	407455032
4119	NC_018620	GGT	2	6	220682	220687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455032
4120	NC_018620	CCA	2	6	220758	220763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455032
4121	NC_018620	TTC	2	6	220766	220771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455032
4122	NC_018620	AC	3	6	220921	220926	50 %	0 %	0 %	50 %	407455032
4123	NC_018620	CCA	2	6	220929	220934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455032
4124	NC_018620	CCG	2	6	221013	221018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407455032
4125	NC_018620	AGG	2	6	221030	221035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455032
4126	NC_018620	GTTA	2	8	221171	221178	25 %	50 %	25 %	0 %	407455032
4127	NC_018620	ATAG	2	8	221198	221205	50 %	25 %	25 %	0 %	407455032
4128	NC_018620	CCA	2	6	221208	221213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455032
4129	NC_018620	GTT	2	6	221225	221230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455032
4130	NC_018620	TG	3	6	221241	221246	0 %	50 %	50 %	0 %	407455032
4131	NC_018620	TGG	2	6	221251	221256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455032
4132	NC_018620	TTGTA	2	10	221261	221270	20 %	60 %	20 %	0 %	407455032
4133	NC_018620	AATGGT	2	12	221435	221446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455032
4134	NC_018620	AGG	2	6	221486	221491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455032
4135	NC_018620	CTT	2	6	221494	221499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455032
4136	NC_018620	TGC	3	9	221558	221566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
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4138	NC_018620	T	6	6	221584	221589	0 %	100 %	0 %	0 %	407455032
4139	NC_018620	AAT	2	6	221603	221608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455032
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4141	NC_018620	CTG	2	6	221758	221763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
4142	NC_018620	CTT	2	6	221764	221769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455032
4143	NC_018620	GA	3	6	221770	221775	50 %	0 %	50 %	0 %	407455032
4144	NC_018620	AGG	2	6	221810	221815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455032
4145	NC_018620	GCT	2	6	221841	221846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455032
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4147	NC_018620	CAC	2	6	221956	221961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455032
4148	NC_018620	TTG	2	6	221966	221971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455032
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4150	NC_018620	TA	3	6	222033	222038	50 %	50 %	0 %	0 %	407455032
4151	NC_018620	AATG	2	8	222104	222111	50 %	25 %	25 %	0 %	407455032
4152	NC_018620	AGTAGA	2	12	222164	222175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407455032
4153	NC_018620	TGT	2	6	222182	222187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455032
4154	NC_018620	GTA	2	6	222192	222197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455032
4155	NC_018620	AG	3	6	222234	222239	50 %	0 %	50 %	0 %	407455032
4156	NC_018620	ATG	2	6	222310	222315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455032
4157	NC_018620	GCTTA	2	10	222392	222401	20 %	40 %	20 %	20 %	407455032
4158	NC_018620	TTTG	2	8	222412	222419	0 %	75 %	25 %	0 %	407455032
4159	NC_018620	ACT	2	6	222431	222436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455032
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4162	NC_018620	CTA	2	6	222481	222486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455032
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4203	NC_018620	TTTA	2	8	224910	224917	25 %	75 %	0 %	0 %	407455033
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4223	NC_018620	CAC	2	6	226131	226136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455034
4224	NC_018620	GCCAAC	2	12	226200	226211	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407455034
4225	NC_018620	T	6	6	226280	226285	0 %	100 %	0 %	0 %	407455035
4226	NC_018620	CTC	2	6	226330	226335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455035
4227	NC_018620	TGA	2	6	226375	226380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455035
4228	NC_018620	TTG	2	6	226407	226412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455035
4229	NC_018620	AACC	2	8	226422	226429	50 %	0 %	0 %	50 %	407455035
4230	NC_018620	GGA	2	6	226839	226844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455036
4231	NC_018620	AGG	3	9	226924	226932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455036
4232	NC_018620	CAA	2	6	226953	226958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455036
4233	NC_018620	GA	4	8	226970	226977	50 %	0 %	50 %	0 %	407455036
4234	NC_018620	TCC	2	6	227028	227033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455036
4235	NC_018620	T	6	6	227058	227063	0 %	100 %	0 %	0 %	407455036
4236	NC_018620	AAT	2	6	227082	227087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455036
4237	NC_018620	AAG	2	6	227110	227115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455036
4238	NC_018620	AAGACC	2	12	227195	227206	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407455036
4239	NC_018620	GCTGA	2	10	227271	227280	20 %	20 %	40 %	20 %	407455036
4240	NC_018620	T	7	7	227295	227301	0 %	100 %	0 %	0 %	407455036
4241	NC_018620	AAT	2	6	227319	227324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455036
4242	NC_018620	TGG	2	6	227377	227382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455036
4243	NC_018620	TGA	2	6	227442	227447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455036
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4245	NC_018620	ACAG	2	8	227510	227517	50 %	0 %	25 %	25 %	407455036
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4370	NC_018620	AGT	2	6	234359	234364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455044
4371	NC_018620	TTA	2	6	234368	234373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455044
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4483	NC_018620	ATT	2	6	241675	241680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455052
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