MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 21508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018620	AGA	2	6	50026	50031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1002	NC_018620	AAG	3	9	50052	50060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1003	NC_018620	AAC	2	6	50121	50126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1004	NC_018620	CAA	2	6	50160	50165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1005	NC_018620	AAG	3	9	50166	50174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1006	NC_018620	TTA	2	6	50267	50272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454858
1007	NC_018620	TC	3	6	50374	50379	0 %	50 %	0 %	50 %	407454858
1008	NC_018620	TGT	2	6	50521	50526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454858
1009	NC_018620	TA	3	6	50547	50552	50 %	50 %	0 %	0 %	407454858
1010	NC_018620	ATT	2	6	50579	50584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454858
1011	NC_018620	ATG	2	6	50601	50606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1012	NC_018620	AGC	2	6	50689	50694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454858
1013	NC_018620	TCC	2	6	50858	50863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454858
1014	NC_018620	AACA	2	8	50872	50879	75 %	0 %	0 %	25 %	407454858
1015	NC_018620	ACT	2	6	50890	50895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1016	NC_018620	GAT	2	6	50933	50938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1017	NC_018620	GCA	2	6	50951	50956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454858
1018	NC_018620	ATC	2	6	50965	50970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1019	NC_018620	TCA	2	6	51102	51107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1020	NC_018620	AAT	2	6	51140	51145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454858
1021	NC_018620	AGT	2	6	51184	51189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1022	NC_018620	TGA	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1023	NC_018620	CCT	2	6	51383	51388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454858
1024	NC_018620	ATG	2	6	51452	51457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1025	NC_018620	TTTGG	2	10	51473	51482	0 %	60 %	40 %	0 %	407454858
1026	NC_018620	CTC	2	6	51539	51544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454858
1027	NC_018620	CAA	2	6	51611	51616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1028	NC_018620	CAT	2	6	51618	51623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1029	NC_018620	TTG	2	6	51627	51632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454858
1030	NC_018620	AAC	2	6	51652	51657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1031	NC_018620	ATT	2	6	51665	51670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454858
1032	NC_018620	TTG	3	9	51726	51734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454858
1033	NC_018620	GTT	2	6	51758	51763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454858
1034	NC_018620	GTT	2	6	51870	51875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454858
1035	NC_018620	CAG	2	6	51970	51975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454858
1036	NC_018620	ATG	2	6	52007	52012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1037	NC_018620	TTA	2	6	52029	52034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454858
1038	NC_018620	CAA	2	6	52063	52068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1039	NC_018620	TGA	2	6	52096	52101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1040	NC_018620	C	6	6	52147	52152	0 %	0 %	0 %	100 %	407454858
1041	NC_018620	GAAG	2	8	52719	52726	50 %	0 %	50 %	0 %	407454859
1042	NC_018620	CCT	2	6	52729	52734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454859
1043	NC_018620	T	6	6	52741	52746	0 %	100 %	0 %	0 %	407454859
1044	NC_018620	TGC	2	6	52807	52812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454859
1045	NC_018620	CCT	2	6	52813	52818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454859
1046	NC_018620	TGC	2	6	52819	52824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454859
1047	NC_018620	AGG	2	6	52838	52843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454859
1048	NC_018620	CTT	2	6	52915	52920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454860
1049	NC_018620	TTA	2	6	52932	52937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454860
1050	NC_018620	GTT	2	6	52945	52950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454860
1051	NC_018620	ACG	2	6	52970	52975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454860
1052	NC_018620	TGT	2	6	53008	53013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454860
1053	NC_018620	ATCC	2	8	53025	53032	25 %	25 %	0 %	50 %	407454860
1054	NC_018620	GT	3	6	53099	53104	0 %	50 %	50 %	0 %	407454860
1055	NC_018620	T	6	6	53133	53138	0 %	100 %	0 %	0 %	407454860
1056	NC_018620	CTT	2	6	53165	53170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454860
1057	NC_018620	T	6	6	53169	53174	0 %	100 %	0 %	0 %	407454860
1058	NC_018620	TTC	2	6	53234	53239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454860
1059	NC_018620	AT	3	6	53286	53291	50 %	50 %	0 %	0 %	407454860
1060	NC_018620	AGCA	2	8	53317	53324	50 %	0 %	25 %	25 %	407454860
1061	NC_018620	AAT	2	6	53342	53347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454860
1062	NC_018620	TTCA	2	8	53477	53484	25 %	50 %	0 %	25 %	407454860
1063	NC_018620	A	6	6	53655	53660	100 %	0 %	0 %	0 %	407454860
1064	NC_018620	TCA	2	6	53721	53726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454860
1065	NC_018620	T	6	6	53777	53782	0 %	100 %	0 %	0 %	407454860
1066	NC_018620	CGT	2	6	53840	53845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454860
1067	NC_018620	AGG	2	6	53867	53872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454860
1068	NC_018620	AAG	2	6	53897	53902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454860
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1070	NC_018620	T	6	6	53935	53940	0 %	100 %	0 %	0 %	407454861
1071	NC_018620	CAG	2	6	53966	53971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454861
1072	NC_018620	AGG	2	6	54034	54039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454861
1073	NC_018620	CGC	2	6	54051	54056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407454861
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1075	NC_018620	GTAT	2	8	54130	54137	25 %	50 %	25 %	0 %	407454861
1076	NC_018620	TCA	2	6	54202	54207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454861
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1078	NC_018620	TGT	2	6	54281	54286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454861
1079	NC_018620	GTA	2	6	54294	54299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454861
1080	NC_018620	CATA	2	8	54325	54332	50 %	25 %	0 %	25 %	407454861
1081	NC_018620	CTTATC	2	12	54345	54356	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407454861
1082	NC_018620	TTG	2	6	54374	54379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454861
1083	NC_018620	CTT	2	6	54848	54853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454862
1084	NC_018620	TCG	2	6	54868	54873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454862
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1086	NC_018620	TCT	2	6	54934	54939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454862
1087	NC_018620	T	7	7	54954	54960	0 %	100 %	0 %	0 %	407454862
1088	NC_018620	CTT	2	6	55007	55012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454862
1089	NC_018620	ACG	2	6	55020	55025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454862
1090	NC_018620	TAA	2	6	55034	55039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454862
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1093	NC_018620	GCA	2	6	55123	55128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454862
1094	NC_018620	ATA	2	6	55129	55134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454862
1095	NC_018620	CTA	2	6	55265	55270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454862
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1097	NC_018620	AGC	2	6	55329	55334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454862
1098	NC_018620	TTTTC	2	10	55340	55349	0 %	80 %	0 %	20 %	407454862
1099	NC_018620	TCA	2	6	55406	55411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454863
1100	NC_018620	AG	3	6	55427	55432	50 %	0 %	50 %	0 %	407454863
1101	NC_018620	CAG	2	6	55488	55493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454863
1102	NC_018620	TAG	2	6	55608	55613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454863
1103	NC_018620	GCT	2	6	55655	55660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454863
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1105	NC_018620	CTT	2	6	55731	55736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454863
1106	NC_018620	TAA	2	6	55792	55797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454863
1107	NC_018620	GTC	2	6	55807	55812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454863
1108	NC_018620	ATTA	2	8	55843	55850	50 %	50 %	0 %	0 %	407454863
1109	NC_018620	CAG	2	6	55875	55880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454863
1110	NC_018620	TTG	2	6	55906	55911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454863
1111	NC_018620	TTA	2	6	56107	56112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454864
1112	NC_018620	TAG	2	6	56160	56165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454864
1113	NC_018620	TAG	2	6	56230	56235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454864
1114	NC_018620	GAA	2	6	56248	56253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454864
1115	NC_018620	TGA	2	6	56271	56276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454864
1116	NC_018620	GAA	2	6	56315	56320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454864
1117	NC_018620	CTT	2	6	56325	56330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454864
1118	NC_018620	CTTT	2	8	56360	56367	0 %	75 %	0 %	25 %	407454864
1119	NC_018620	GCT	2	6	56387	56392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454864
1120	NC_018620	TCA	2	6	56429	56434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454864
1121	NC_018620	AGAA	2	8	56443	56450	75 %	0 %	25 %	0 %	407454864
1122	NC_018620	GTT	2	6	56507	56512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454864
1123	NC_018620	CAA	2	6	56667	56672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454864
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