MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 21508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018620	TAA	2	6	322312	322317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455112
6002	NC_018620	GTCTTT	2	12	322362	322373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407455112
6003	NC_018620	TCT	2	6	322408	322413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455112
6004	NC_018620	C	13	13	322951	322963	0 %	0 %	0 %	100 %	407455113
6005	NC_018620	TTAG	2	8	322988	322995	25 %	50 %	25 %	0 %	407455113
6006	NC_018620	ACA	2	6	323051	323056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455113
6007	NC_018620	TG	3	6	323072	323077	0 %	50 %	50 %	0 %	407455113
6008	NC_018620	T	7	7	323080	323086	0 %	100 %	0 %	0 %	407455113
6009	NC_018620	GTT	2	6	323142	323147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455113
6010	NC_018620	TTC	2	6	323182	323187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455113
6011	NC_018620	AGA	2	6	323208	323213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455113
6012	NC_018620	AGT	2	6	323230	323235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455113
6013	NC_018620	TTTA	2	8	323248	323255	25 %	75 %	0 %	0 %	407455113
6014	NC_018620	AGA	3	9	323301	323309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455113
6015	NC_018620	ATT	2	6	323350	323355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455113
6016	NC_018620	TGA	2	6	323409	323414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455113
6017	NC_018620	ATC	2	6	323476	323481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455113
6018	NC_018620	TTA	2	6	323528	323533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455113
6019	NC_018620	AGA	2	6	323602	323607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455113
6020	NC_018620	ATT	2	6	323632	323637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455113
6021	NC_018620	ACC	2	6	323683	323688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407455113
6022	NC_018620	AAGAC	2	10	323714	323723	60 %	0 %	20 %	20 %	407455113
6023	NC_018620	CTTG	2	8	323873	323880	0 %	50 %	25 %	25 %	407455113
6024	NC_018620	AT	3	6	324000	324005	50 %	50 %	0 %	0 %	407455113
6025	NC_018620	TGT	2	6	324022	324027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455113
6026	NC_018620	TTGG	2	8	324037	324044	0 %	50 %	50 %	0 %	407455113
6027	NC_018620	CAG	2	6	324096	324101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455113
6028	NC_018620	T	6	6	324111	324116	0 %	100 %	0 %	0 %	407455113
6029	NC_018620	TG	3	6	324264	324269	0 %	50 %	50 %	0 %	407455114
6030	NC_018620	GA	3	6	324310	324315	50 %	0 %	50 %	0 %	407455114
6031	NC_018620	ACTG	2	8	324387	324394	25 %	25 %	25 %	25 %	407455115
6032	NC_018620	TCG	2	6	324465	324470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6033	NC_018620	TACA	2	8	324544	324551	50 %	25 %	0 %	25 %	407455115
6034	NC_018620	TC	3	6	324576	324581	0 %	50 %	0 %	50 %	407455115
6035	NC_018620	GCT	2	6	324637	324642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6036	NC_018620	TGT	2	6	324661	324666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455115
6037	NC_018620	AGA	2	6	324739	324744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455115
6038	NC_018620	TGT	2	6	324846	324851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455115
6039	NC_018620	AAC	2	6	324915	324920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455115
6040	NC_018620	TCA	2	6	324953	324958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455115
6041	NC_018620	ATA	2	6	324976	324981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455115
6042	NC_018620	TTAC	2	8	325013	325020	25 %	50 %	0 %	25 %	407455115
6043	NC_018620	CT	3	6	325075	325080	0 %	50 %	0 %	50 %	407455115
6044	NC_018620	GAA	2	6	325162	325167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455115
6045	NC_018620	ACG	2	6	325195	325200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6046	NC_018620	ACG	2	6	325297	325302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6047	NC_018620	TTA	2	6	325370	325375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455115
6048	NC_018620	GT	3	6	325417	325422	0 %	50 %	50 %	0 %	407455115
6049	NC_018620	ACA	2	6	325436	325441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455115
6050	NC_018620	TGT	3	9	325456	325464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455115
6051	NC_018620	TCC	2	6	325492	325497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455115
6052	NC_018620	CAA	2	6	325551	325556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455115
6053	NC_018620	GCA	2	6	325592	325597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6054	NC_018620	TCT	2	6	325670	325675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455115
6055	NC_018620	CTG	2	6	325722	325727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6056	NC_018620	CAG	2	6	325782	325787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6057	NC_018620	CAG	2	6	325833	325838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6058	NC_018620	TTC	2	6	325843	325848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455115
6059	NC_018620	TTC	2	6	325875	325880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455115
6060	NC_018620	TTTA	2	8	325906	325913	25 %	75 %	0 %	0 %	407455115
6061	NC_018620	CAG	2	6	325926	325931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6062	NC_018620	GTT	2	6	326047	326052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455115
6063	NC_018620	TG	3	6	326054	326059	0 %	50 %	50 %	0 %	407455115
6064	NC_018620	ACCAAT	2	12	326125	326136	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407455115
6065	NC_018620	GCA	2	6	326153	326158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6066	NC_018620	ATAA	2	8	326177	326184	75 %	25 %	0 %	0 %	407455115
6067	NC_018620	TCC	2	6	326191	326196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455115
6068	NC_018620	TGA	2	6	326239	326244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455115
6069	NC_018620	TGA	2	6	326299	326304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455115
6070	NC_018620	CAG	2	6	326343	326348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6071	NC_018620	GTT	3	9	326362	326370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455115
6072	NC_018620	ACA	2	6	326375	326380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455115
6073	NC_018620	AGC	2	6	326404	326409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
6074	NC_018620	AGC	2	6	326500	326505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455115
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6076	NC_018620	GTG	2	6	326537	326542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455115
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6078	NC_018620	CAAA	2	8	326625	326632	75 %	0 %	0 %	25 %	407455115
6079	NC_018620	TAT	2	6	326640	326645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455115
6080	NC_018620	CTC	2	6	326661	326666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455115
6081	NC_018620	ATT	2	6	326689	326694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455115
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6084	NC_018620	GTT	2	6	326827	326832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455115
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6088	NC_018620	TCC	2	6	326941	326946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455115
6089	NC_018620	CCT	2	6	327259	327264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455116
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6091	NC_018620	TGA	2	6	327346	327351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455116
6092	NC_018620	TTG	2	6	327389	327394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455116
6093	NC_018620	TTGT	2	8	327502	327509	0 %	75 %	25 %	0 %	407455116
6094	NC_018620	T	6	6	327509	327514	0 %	100 %	0 %	0 %	407455116
6095	NC_018620	TCC	2	6	327582	327587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455116
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6098	NC_018620	GAAAG	2	10	327639	327648	60 %	0 %	40 %	0 %	407455116
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6101	NC_018620	GTT	2	6	327717	327722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407455116
6102	NC_018620	TAAC	2	8	327875	327882	50 %	25 %	0 %	25 %	407455116
6103	NC_018620	GGT	2	6	327938	327943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455116
6104	NC_018620	TG	3	6	328006	328011	0 %	50 %	50 %	0 %	407455116
6105	NC_018620	CAA	2	6	328019	328024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455116
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6109	NC_018620	ACGC	2	8	328160	328167	25 %	0 %	25 %	50 %	407455116
6110	NC_018620	GTA	2	6	328381	328386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455116
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6119	NC_018620	CCAT	2	8	328783	328790	25 %	25 %	0 %	50 %	407455116
6120	NC_018620	CTT	2	6	328805	328810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455116
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6491	NC_018620	CTA	2	6	349109	349114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455134
6492	NC_018620	TCTT	2	8	349156	349163	0 %	75 %	0 %	25 %	407455134
6493	NC_018620	AT	3	6	349193	349198	50 %	50 %	0 %	0 %	407455134
6494	NC_018620	ATG	2	6	349243	349248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455134
6495	NC_018620	GAA	2	6	349315	349320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455134
6496	NC_018620	AAACT	2	10	349328	349337	60 %	20 %	0 %	20 %	407455134
6497	NC_018620	G	6	6	349473	349478	0 %	0 %	100 %	0 %	407455134
6498	NC_018620	TTTG	2	8	349483	349490	0 %	75 %	25 %	0 %	407455134
6499	NC_018620	CTT	2	6	349621	349626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455134
6500	NC_018620	GAA	2	6	349657	349662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455134

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