MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 21909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018619	TTC	2	6	211815	211820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453695
4002	NC_018619	GGT	2	6	212056	212061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453696
4003	NC_018619	GAA	2	6	212181	212186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453696
4004	NC_018619	GTT	2	6	212287	212292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453696
4005	NC_018619	AGG	2	6	212307	212312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453696
4006	NC_018619	ATT	2	6	212463	212468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453696
4007	NC_018619	ATT	2	6	212667	212672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453696
4008	NC_018619	GTT	2	6	212673	212678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453696
4009	NC_018619	TCC	2	6	212707	212712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453696
4010	NC_018619	AGA	3	9	212715	212723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453696
4011	NC_018619	TGA	2	6	212805	212810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453696
4012	NC_018619	T	7	7	213753	213759	0 %	100 %	0 %	0 %	407453697
4013	NC_018619	TTG	2	6	213790	213795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4014	NC_018619	GTT	2	6	213810	213815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4015	NC_018619	ATG	2	6	213860	213865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453697
4016	NC_018619	GTT	2	6	213931	213936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4017	NC_018619	AGAT	2	8	214037	214044	50 %	25 %	25 %	0 %	407453697
4018	NC_018619	AGAA	2	8	214160	214167	75 %	0 %	25 %	0 %	407453697
4019	NC_018619	GAAAA	2	10	214189	214198	80 %	0 %	20 %	0 %	407453697
4020	NC_018619	TGC	2	6	214212	214217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453697
4021	NC_018619	T	7	7	214244	214250	0 %	100 %	0 %	0 %	407453697
4022	NC_018619	GTA	2	6	214281	214286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453697
4023	NC_018619	AAC	2	6	214302	214307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453697
4024	NC_018619	GTT	2	6	214320	214325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453697
4025	NC_018619	C	6	6	214328	214333	0 %	0 %	0 %	100 %	407453697
4026	NC_018619	CAA	2	6	214354	214359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453697
4027	NC_018619	GTT	2	6	214472	214477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453698
4028	NC_018619	ATT	2	6	214492	214497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453698
4029	NC_018619	TTC	2	6	214507	214512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453698
4030	NC_018619	TAGCA	2	10	214555	214564	40 %	20 %	20 %	20 %	407453698
4031	NC_018619	AGC	2	6	214630	214635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453698
4032	NC_018619	ACA	2	6	214640	214645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453698
4033	NC_018619	ACG	2	6	214682	214687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453698
4034	NC_018619	GCT	2	6	214752	214757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453698
4035	NC_018619	AGC	2	6	214759	214764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453698
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4037	NC_018619	T	6	6	214985	214990	0 %	100 %	0 %	0 %	407453698
4038	NC_018619	T	7	7	215018	215024	0 %	100 %	0 %	0 %	407453698
4039	NC_018619	T	6	6	215079	215084	0 %	100 %	0 %	0 %	407453698
4040	NC_018619	TTC	2	6	215218	215223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453698
4041	NC_018619	AAGAA	2	10	215253	215262	80 %	0 %	20 %	0 %	407453698
4042	NC_018619	AAG	2	6	215269	215274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453698
4043	NC_018619	GAA	2	6	215887	215892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453699
4044	NC_018619	TCA	2	6	215912	215917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453699
4045	NC_018619	AG	3	6	216022	216027	50 %	0 %	50 %	0 %	407453699
4046	NC_018619	GT	3	6	216106	216111	0 %	50 %	50 %	0 %	407453699
4047	NC_018619	GACA	2	8	216143	216150	50 %	0 %	25 %	25 %	407453699
4048	NC_018619	AG	3	6	216172	216177	50 %	0 %	50 %	0 %	407453699
4049	NC_018619	CTC	2	6	216229	216234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453699
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4053	NC_018619	AGC	2	6	216432	216437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453699
4054	NC_018619	TTG	2	6	216497	216502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453699
4055	NC_018619	AAG	2	6	216532	216537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453700
4056	NC_018619	GAAAG	2	10	216553	216562	60 %	0 %	40 %	0 %	407453700
4057	NC_018619	TAT	2	6	216641	216646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453700
4058	NC_018619	AGA	2	6	216668	216673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453700
4059	NC_018619	ATTT	2	8	216724	216731	25 %	75 %	0 %	0 %	407453700
4060	NC_018619	TCA	2	6	216836	216841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453700
4061	NC_018619	GTG	2	6	216919	216924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453700
4062	NC_018619	ACTC	2	8	216933	216940	25 %	25 %	0 %	50 %	407453700
4063	NC_018619	TTA	2	6	217027	217032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453700
4064	NC_018619	TGT	2	6	217085	217090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453700
4065	NC_018619	TG	3	6	217189	217194	0 %	50 %	50 %	0 %	407453700
4066	NC_018619	TAG	2	6	217274	217279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453700
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4069	NC_018619	AGAA	2	8	217830	217837	75 %	0 %	25 %	0 %	407453701
4070	NC_018619	TTG	2	6	217842	217847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453701
4071	NC_018619	CAAC	2	8	217897	217904	50 %	0 %	0 %	50 %	407453701
4072	NC_018619	TTC	2	6	218236	218241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453701
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4076	NC_018619	GA	3	6	218359	218364	50 %	0 %	50 %	0 %	407453701
4077	NC_018619	AGT	2	6	218397	218402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453701
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4081	NC_018619	GTTAG	2	10	218537	218546	20 %	40 %	40 %	0 %	407453701
4082	NC_018619	CTA	2	6	218561	218566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453701
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4084	NC_018619	TGGAT	2	10	218689	218698	20 %	40 %	40 %	0 %	407453701
4085	NC_018619	CTG	4	12	218751	218762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453701
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4090	NC_018619	AAT	2	6	219050	219055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453701
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4095	NC_018619	TGC	2	6	219184	219189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453701
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4104	NC_018619	CAC	2	6	219552	219557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453701
4105	NC_018619	GTTG	2	8	219706	219713	0 %	50 %	50 %	0 %	407453701
4106	NC_018619	CCA	2	6	219728	219733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453701
4107	NC_018619	TTC	2	6	219784	219789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453701
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4109	NC_018619	TGT	2	6	219907	219912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453701
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4119	NC_018619	CAC	2	6	220416	220421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453701
4120	NC_018619	T	6	6	220436	220441	0 %	100 %	0 %	0 %	407453701
4121	NC_018619	CAG	2	6	220488	220493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453701
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4123	NC_018619	GCA	2	6	220511	220516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453701
4124	NC_018619	ACT	2	6	220517	220522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453701
4125	NC_018619	GATT	2	8	220582	220589	25 %	50 %	25 %	0 %	407453701
4126	NC_018619	GTTA	2	8	220594	220601	25 %	50 %	25 %	0 %	407453701
4127	NC_018619	CCA	2	6	220628	220633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453701
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4131	NC_018619	GGT	2	6	220774	220779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453701
4132	NC_018619	CCA	2	6	220850	220855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453701
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4136	NC_018619	CCA	2	6	221021	221026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453701
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4140	NC_018619	ATAG	2	8	221290	221297	50 %	25 %	25 %	0 %	407453701
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4144	NC_018619	TGG	2	6	221343	221348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453701
4145	NC_018619	TTGTA	2	10	221353	221362	20 %	60 %	20 %	0 %	407453701
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4149	NC_018619	TGC	3	9	221650	221658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453701
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4151	NC_018619	T	6	6	221676	221681	0 %	100 %	0 %	0 %	407453701
4152	NC_018619	AAT	2	6	221695	221700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453701
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4154	NC_018619	CTG	2	6	221850	221855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453701
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4164	NC_018619	AATG	2	8	222196	222203	50 %	25 %	25 %	0 %	407453701
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4232	NC_018619	TTC	2	6	226053	226058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453703
4233	NC_018619	TGTT	2	8	226116	226123	0 %	75 %	25 %	0 %	407453703
4234	NC_018619	T	7	7	226173	226179	0 %	100 %	0 %	0 %	407453703
4235	NC_018619	TTTC	2	8	226206	226213	0 %	75 %	0 %	25 %	407453703
4236	NC_018619	CAC	2	6	226223	226228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453703
4237	NC_018619	GCCAAC	2	12	226292	226303	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407453703
4238	NC_018619	T	6	6	226372	226377	0 %	100 %	0 %	0 %	407453704
4239	NC_018619	CTC	2	6	226422	226427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453704
4240	NC_018619	TGA	2	6	226467	226472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453704
4241	NC_018619	TTG	2	6	226499	226504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453704
4242	NC_018619	AACC	2	8	226514	226521	50 %	0 %	0 %	50 %	407453704
4243	NC_018619	TCG	2	6	226581	226586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453704
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4492	NC_018619	ATT	2	6	241536	241541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
4493	NC_018619	GTTT	2	8	241647	241654	0 %	75 %	25 %	0 %	407453721
4494	NC_018619	AGG	2	6	241673	241678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453721
4495	NC_018619	TG	3	6	241731	241736	0 %	50 %	50 %	0 %	407453721
4496	NC_018619	ATT	2	6	241771	241776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
4497	NC_018619	TTC	2	6	241832	241837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453721
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4500	NC_018619	TTG	2	6	241930	241935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453721

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