MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 21909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_018619	TAGG	2	8	1152205	1152212	25 %	25 %	50 %	0 %	407454575
21502	NC_018619	CCTC	2	8	1152229	1152236	0 %	25 %	0 %	75 %	407454575
21503	NC_018619	GTG	2	6	1152272	1152277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454575
21504	NC_018619	TC	3	6	1152293	1152298	0 %	50 %	0 %	50 %	407454575
21505	NC_018619	GAT	2	6	1152339	1152344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454575
21506	NC_018619	GAA	2	6	1152396	1152401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454575
21507	NC_018619	TCTA	2	8	1152406	1152413	25 %	50 %	0 %	25 %	407454575
21508	NC_018619	CTT	2	6	1152446	1152451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454575
21509	NC_018619	TAC	2	6	1152476	1152481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454575
21510	NC_018619	TGTT	2	8	1152551	1152558	0 %	75 %	25 %	0 %	407454576
21511	NC_018619	TCT	2	6	1152559	1152564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454576
21512	NC_018619	TGT	2	6	1152566	1152571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454576
21513	NC_018619	ACTCAC	2	12	1152613	1152624	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407454576
21514	NC_018619	CAT	2	6	1152634	1152639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454576
21515	NC_018619	A	6	6	1152686	1152691	100 %	0 %	0 %	0 %	407454576
21516	NC_018619	TC	4	8	1152709	1152716	0 %	50 %	0 %	50 %	407454576
21517	NC_018619	GTAT	2	8	1152741	1152748	25 %	50 %	25 %	0 %	407454576
21518	NC_018619	GAG	2	6	1152759	1152764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454576
21519	NC_018619	ACA	2	6	1152782	1152787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454576
21520	NC_018619	ACC	2	6	1152789	1152794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454576
21521	NC_018619	AAAATC	2	12	1152875	1152886	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407454576
21522	NC_018619	AGG	2	6	1152901	1152906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454576
21523	NC_018619	CAG	2	6	1152927	1152932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454576
21524	NC_018619	GCT	2	6	1152992	1152997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454576
21525	NC_018619	ATTA	2	8	1152998	1153005	50 %	50 %	0 %	0 %	407454576
21526	NC_018619	TAC	2	6	1153037	1153042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454576
21527	NC_018619	CTA	2	6	1153130	1153135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454576
21528	NC_018619	A	6	6	1153135	1153140	100 %	0 %	0 %	0 %	407454576
21529	NC_018619	GAA	2	6	1153187	1153192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454576
21530	NC_018619	CT	3	6	1153208	1153213	0 %	50 %	0 %	50 %	407454576
21531	NC_018619	GAA	3	9	1153214	1153222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454576
21532	NC_018619	TCA	2	6	1153270	1153275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454576
21533	NC_018619	AACGGA	2	12	1153295	1153306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407454576
21534	NC_018619	CTAT	2	8	1153314	1153321	25 %	50 %	0 %	25 %	407454576
21535	NC_018619	CGTT	2	8	1153350	1153357	0 %	50 %	25 %	25 %	407454576
21536	NC_018619	TTC	2	6	1153410	1153415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454576
21537	NC_018619	ATAA	2	8	1153577	1153584	75 %	25 %	0 %	0 %	407454576
21538	NC_018619	A	6	6	1153586	1153591	100 %	0 %	0 %	0 %	407454576
21539	NC_018619	TAT	2	6	1153610	1153615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454576
21540	NC_018619	GAA	2	6	1153640	1153645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454576
21541	NC_018619	AGAT	2	8	1153710	1153717	50 %	25 %	25 %	0 %	407454576
21542	NC_018619	CAG	2	6	1153731	1153736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454576
21543	NC_018619	A	6	6	1153766	1153771	100 %	0 %	0 %	0 %	407454576
21544	NC_018619	TTC	2	6	1154071	1154076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454577
21545	NC_018619	CT	3	6	1154085	1154090	0 %	50 %	0 %	50 %	407454577
21546	NC_018619	CAC	2	6	1154142	1154147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454577
21547	NC_018619	CA	3	6	1154155	1154160	50 %	0 %	0 %	50 %	407454577
21548	NC_018619	GATAAC	2	12	1154186	1154197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407454577
21549	NC_018619	TGG	3	9	1154212	1154220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454577
21550	NC_018619	A	6	6	1154286	1154291	100 %	0 %	0 %	0 %	407454577
21551	NC_018619	AATG	2	8	1154762	1154769	50 %	25 %	25 %	0 %	407454578
21552	NC_018619	A	6	6	1154781	1154786	100 %	0 %	0 %	0 %	407454578
21553	NC_018619	AGC	2	6	1154795	1154800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454578
21554	NC_018619	TAT	2	6	1154837	1154842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454578
21555	NC_018619	CTA	2	6	1154878	1154883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454578
21556	NC_018619	CGCT	2	8	1154986	1154993	0 %	25 %	25 %	50 %	407454578
21557	NC_018619	A	6	6	1155016	1155021	100 %	0 %	0 %	0 %	407454578
21558	NC_018619	TGC	2	6	1155032	1155037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454578
21559	NC_018619	GCT	2	6	1155204	1155209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454578
21560	NC_018619	ATG	2	6	1155273	1155278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454578
21561	NC_018619	ACA	3	9	1155387	1155395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454578
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21563	NC_018619	TCG	2	6	1155440	1155445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454578
21564	NC_018619	CAG	2	6	1155538	1155543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454578
21565	NC_018619	CAG	2	6	1155577	1155582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454578
21566	NC_018619	AATAT	2	10	1155607	1155616	60 %	40 %	0 %	0 %	407454578
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21571	NC_018619	A	6	6	1155777	1155782	100 %	0 %	0 %	0 %	407454578
21572	NC_018619	GAA	2	6	1155783	1155788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454578
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21585	NC_018619	AAG	2	6	1156391	1156396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454579
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21589	NC_018619	TA	3	6	1156878	1156883	50 %	50 %	0 %	0 %	407454580
21590	NC_018619	GAG	2	6	1156892	1156897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454580
21591	NC_018619	TAATCC	2	12	1156914	1156925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454580
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21597	NC_018619	AATA	2	8	1157147	1157154	75 %	25 %	0 %	0 %	407454580
21598	NC_018619	T	6	6	1157169	1157174	0 %	100 %	0 %	0 %	407454580
21599	NC_018619	GTT	3	9	1157191	1157199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454580
21600	NC_018619	CAA	2	6	1157207	1157212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454580
21601	NC_018619	CTC	2	6	1157286	1157291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454580
21602	NC_018619	ATC	2	6	1157307	1157312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454580
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21604	NC_018619	TCC	2	6	1157397	1157402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454581
21605	NC_018619	GAA	2	6	1157425	1157430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454581
21606	NC_018619	CCA	2	6	1157478	1157483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407454581
21607	NC_018619	TCC	2	6	1157515	1157520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454581
21608	NC_018619	AGA	2	6	1157536	1157541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454581
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21611	NC_018619	AAT	2	6	1157626	1157631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454581
21612	NC_018619	TTC	2	6	1157639	1157644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454581
21613	NC_018619	A	7	7	1157715	1157721	100 %	0 %	0 %	0 %	407454581
21614	NC_018619	TGC	3	9	1157828	1157836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454582
21615	NC_018619	CAT	2	6	1157863	1157868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454582
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