MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 21909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018619	AAC	2	6	50124	50129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453524
1002	NC_018619	CAA	2	6	50163	50168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453524
1003	NC_018619	AAG	3	9	50169	50177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453524
1004	NC_018619	TTA	2	6	50270	50275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453524
1005	NC_018619	TC	3	6	50377	50382	0 %	50 %	0 %	50 %	407453524
1006	NC_018619	TGT	2	6	50524	50529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453524
1007	NC_018619	TA	3	6	50550	50555	50 %	50 %	0 %	0 %	407453524
1008	NC_018619	ATT	2	6	50582	50587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453524
1009	NC_018619	ATG	2	6	50604	50609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453524
1010	NC_018619	AGC	2	6	50692	50697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453524
1011	NC_018619	TCC	2	6	50861	50866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453524
1012	NC_018619	AACA	2	8	50875	50882	75 %	0 %	0 %	25 %	407453524
1013	NC_018619	ACT	2	6	50893	50898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453524
1014	NC_018619	GAT	2	6	50936	50941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453524
1015	NC_018619	GCA	2	6	50954	50959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453524
1016	NC_018619	ATC	2	6	50968	50973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453524
1017	NC_018619	TCA	2	6	51105	51110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453524
1018	NC_018619	AAT	2	6	51143	51148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453524
1019	NC_018619	AGT	2	6	51187	51192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453524
1020	NC_018619	TGA	2	6	51307	51312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453524
1021	NC_018619	CCT	2	6	51386	51391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453524
1022	NC_018619	ATG	2	6	51455	51460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453524
1023	NC_018619	TTTGG	2	10	51476	51485	0 %	60 %	40 %	0 %	407453524
1024	NC_018619	CTC	2	6	51542	51547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453524
1025	NC_018619	CAA	2	6	51614	51619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453524
1026	NC_018619	CAT	2	6	51621	51626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453524
1027	NC_018619	TTG	2	6	51630	51635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453524
1028	NC_018619	AAC	2	6	51655	51660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453524
1029	NC_018619	ATT	2	6	51668	51673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453524
1030	NC_018619	TTG	3	9	51729	51737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453524
1031	NC_018619	GTT	2	6	51761	51766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453524
1032	NC_018619	GTT	2	6	51873	51878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453524
1033	NC_018619	CAG	2	6	51973	51978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453524
1034	NC_018619	ATG	2	6	52010	52015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453524
1035	NC_018619	TTA	2	6	52032	52037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453524
1036	NC_018619	CAA	2	6	52066	52071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453524
1037	NC_018619	TGA	2	6	52099	52104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453524
1038	NC_018619	C	6	6	52150	52155	0 %	0 %	0 %	100 %	407453524
1039	NC_018619	GAAG	2	8	52722	52729	50 %	0 %	50 %	0 %	407453525
1040	NC_018619	CCT	2	6	52732	52737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453525
1041	NC_018619	T	6	6	52744	52749	0 %	100 %	0 %	0 %	407453525
1042	NC_018619	TGC	2	6	52810	52815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453525
1043	NC_018619	CCT	2	6	52816	52821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453525
1044	NC_018619	TGC	2	6	52822	52827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453525
1045	NC_018619	AGG	2	6	52841	52846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453525
1046	NC_018619	CTT	2	6	52918	52923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453526
1047	NC_018619	TTA	2	6	52935	52940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453526
1048	NC_018619	GTT	2	6	52948	52953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453526
1049	NC_018619	ACG	2	6	52973	52978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453526
1050	NC_018619	TGT	2	6	53011	53016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453526
1051	NC_018619	ATCC	2	8	53028	53035	25 %	25 %	0 %	50 %	407453526
1052	NC_018619	GT	3	6	53102	53107	0 %	50 %	50 %	0 %	407453526
1053	NC_018619	T	6	6	53136	53141	0 %	100 %	0 %	0 %	407453526
1054	NC_018619	CTT	2	6	53168	53173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453526
1055	NC_018619	T	6	6	53172	53177	0 %	100 %	0 %	0 %	407453526
1056	NC_018619	TTC	2	6	53237	53242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453526
1057	NC_018619	AT	3	6	53289	53294	50 %	50 %	0 %	0 %	407453526
1058	NC_018619	AGCA	2	8	53320	53327	50 %	0 %	25 %	25 %	407453526
1059	NC_018619	AAT	2	6	53345	53350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453526
1060	NC_018619	TTCA	2	8	53480	53487	25 %	50 %	0 %	25 %	407453526
1061	NC_018619	A	6	6	53658	53663	100 %	0 %	0 %	0 %	407453526
1062	NC_018619	TCA	2	6	53724	53729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453526
1063	NC_018619	T	6	6	53780	53785	0 %	100 %	0 %	0 %	407453526
1064	NC_018619	CGT	2	6	53843	53848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453526
1065	NC_018619	AGG	2	6	53870	53875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453526
1066	NC_018619	AAG	2	6	53900	53905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453526
1067	NC_018619	GAA	2	6	53917	53922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453526
1068	NC_018619	T	6	6	53938	53943	0 %	100 %	0 %	0 %	407453527
1069	NC_018619	CAG	2	6	53969	53974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453527
1070	NC_018619	AGG	2	6	54037	54042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453527
1071	NC_018619	CGC	2	6	54054	54059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407453527
1072	NC_018619	ACC	2	6	54087	54092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453527
1073	NC_018619	GTAT	2	8	54133	54140	25 %	50 %	25 %	0 %	407453527
1074	NC_018619	TCA	2	6	54205	54210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453527
1075	NC_018619	CAG	2	6	54257	54262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453527
1076	NC_018619	TGT	2	6	54284	54289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453527
1077	NC_018619	GTA	2	6	54297	54302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453527
1078	NC_018619	CATA	2	8	54328	54335	50 %	25 %	0 %	25 %	407453527
1079	NC_018619	CTTATC	2	12	54348	54359	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407453527
1080	NC_018619	TTG	2	6	54377	54382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453527
1081	NC_018619	CTT	2	6	54853	54858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453528
1082	NC_018619	TCG	2	6	54873	54878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453528
1083	NC_018619	T	7	7	54913	54919	0 %	100 %	0 %	0 %	407453528
1084	NC_018619	TCT	2	6	54939	54944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453528
1085	NC_018619	T	7	7	54959	54965	0 %	100 %	0 %	0 %	407453528
1086	NC_018619	CTT	2	6	55012	55017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453528
1087	NC_018619	ACG	2	6	55025	55030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453528
1088	NC_018619	TAA	2	6	55039	55044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453528
1089	NC_018619	CTG	2	6	55060	55065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453528
1090	NC_018619	AAATTT	2	12	55116	55127	50 %	50 %	0 %	0 %	407453528
1091	NC_018619	GCA	2	6	55128	55133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453528
1092	NC_018619	ATA	2	6	55134	55139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453528
1093	NC_018619	CTA	2	6	55270	55275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453528
1094	NC_018619	CTT	2	6	55312	55317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453528
1095	NC_018619	AGC	2	6	55334	55339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453528
1096	NC_018619	TTTTC	2	10	55345	55354	0 %	80 %	0 %	20 %	407453528
1097	NC_018619	TCA	2	6	55411	55416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453529
1098	NC_018619	AG	3	6	55432	55437	50 %	0 %	50 %	0 %	407453529
1099	NC_018619	GCT	2	6	55660	55665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453529
1100	NC_018619	GTT	2	6	55675	55680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453529
1101	NC_018619	CTT	2	6	55736	55741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453529
1102	NC_018619	GAG	2	6	55751	55756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453529
1103	NC_018619	TAA	2	6	55797	55802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453529
1104	NC_018619	TCA	2	6	55813	55818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453529
1105	NC_018619	TAGC	2	8	55859	55866	25 %	25 %	25 %	25 %	407453529
1106	NC_018619	CAG	2	6	55880	55885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453529
1107	NC_018619	TTG	2	6	55911	55916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453529
1108	NC_018619	TGA	2	6	55928	55933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453529
1109	NC_018619	CTGT	2	8	56038	56045	0 %	50 %	25 %	25 %	407453529
1110	NC_018619	AG	4	8	56046	56053	50 %	0 %	50 %	0 %	407453529
1111	NC_018619	TAG	2	6	56235	56240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453530
1112	NC_018619	GAA	2	6	56253	56258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453530
1113	NC_018619	TGA	2	6	56276	56281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453530
1114	NC_018619	GAA	2	6	56320	56325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453530
1115	NC_018619	CTT	2	6	56330	56335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453530
1116	NC_018619	GCT	2	6	56392	56397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453530
1117	NC_018619	CTTT	2	8	56428	56435	0 %	75 %	0 %	25 %	407453530
1118	NC_018619	AGAA	2	8	56448	56455	75 %	0 %	25 %	0 %	407453530
1119	NC_018619	GTT	2	6	56512	56517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453530
1120	NC_018619	CAG	2	6	56747	56752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453531
1121	NC_018619	TGC	2	6	56772	56777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453531
1122	NC_018619	CTT	2	6	56786	56791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453531
1123	NC_018619	GTAA	2	8	56839	56846	50 %	25 %	25 %	0 %	407453531
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1125	NC_018619	TTAG	2	8	56962	56969	25 %	50 %	25 %	0 %	407453531
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1248	NC_018619	AAT	2	6	64773	64778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453536
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