MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 21909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018619	CGG	2	6	241937	241942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407453721
4502	NC_018619	TTG	2	6	241948	241953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453721
4503	NC_018619	ATT	2	6	241983	241988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
4504	NC_018619	ATG	2	6	242053	242058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
4505	NC_018619	ATG	2	6	242085	242090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
4506	NC_018619	GCA	2	6	242115	242120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453721
4507	NC_018619	AAG	2	6	242137	242142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453721
4508	NC_018619	A	6	6	242160	242165	100 %	0 %	0 %	0 %	407453721
4509	NC_018619	TCA	2	6	242171	242176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453721
4510	NC_018619	GCTT	2	8	242230	242237	0 %	50 %	25 %	25 %	407453721
4511	NC_018619	AT	3	6	242311	242316	50 %	50 %	0 %	0 %	407453721
4512	NC_018619	TGA	2	6	242435	242440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
4513	NC_018619	GAA	2	6	242445	242450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453721
4514	NC_018619	ATT	2	6	242460	242465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
4515	NC_018619	TGA	2	6	242504	242509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
4516	NC_018619	GAA	2	6	242553	242558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453721
4517	NC_018619	TTA	2	6	242580	242585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
4518	NC_018619	TTTAG	2	10	242624	242633	20 %	60 %	20 %	0 %	407453721
4519	NC_018619	AG	3	6	242694	242699	50 %	0 %	50 %	0 %	407453722
4520	NC_018619	T	7	7	242725	242731	0 %	100 %	0 %	0 %	407453722
4521	NC_018619	GCA	2	6	242755	242760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453722
4522	NC_018619	TAAT	2	8	242822	242829	50 %	50 %	0 %	0 %	407453722
4523	NC_018619	ATG	2	6	242881	242886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453722
4524	NC_018619	ACT	2	6	242899	242904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453722
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4526	NC_018619	CGT	2	6	242965	242970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453722
4527	NC_018619	G	6	6	243016	243021	0 %	0 %	100 %	0 %	407453722
4528	NC_018619	TTTA	2	8	243098	243105	25 %	75 %	0 %	0 %	407453722
4529	NC_018619	ATCG	2	8	243145	243152	25 %	25 %	25 %	25 %	407453722
4530	NC_018619	AAT	2	6	243295	243300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453723
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4533	NC_018619	CTG	2	6	243360	243365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453723
4534	NC_018619	TTA	2	6	243375	243380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453723
4535	NC_018619	ATG	2	6	243387	243392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453723
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4537	NC_018619	GTTGT	2	10	243429	243438	0 %	60 %	40 %	0 %	407453723
4538	NC_018619	A	6	6	243461	243466	100 %	0 %	0 %	0 %	407453723
4539	NC_018619	GGTA	2	8	243494	243501	25 %	25 %	50 %	0 %	407453723
4540	NC_018619	GTT	2	6	243530	243535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453723
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4542	NC_018619	TTG	2	6	243642	243647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453723
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4544	NC_018619	GCG	2	6	243839	243844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407453723
4545	NC_018619	GT	3	6	243939	243944	0 %	50 %	50 %	0 %	407453723
4546	NC_018619	AAAG	2	8	243965	243972	75 %	0 %	25 %	0 %	407453723
4547	NC_018619	TTA	2	6	244150	244155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453724
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4549	NC_018619	AAG	2	6	244262	244267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453724
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4551	NC_018619	A	6	6	244376	244381	100 %	0 %	0 %	0 %	407453724
4552	NC_018619	GCA	2	6	244491	244496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453724
4553	NC_018619	TAT	2	6	244524	244529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453724
4554	NC_018619	TAA	3	9	244542	244550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453724
4555	NC_018619	GAA	2	6	244567	244572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453724
4556	NC_018619	GTT	2	6	244662	244667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453724
4557	NC_018619	TCC	2	6	244731	244736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453724
4558	NC_018619	TTTCCT	2	12	244815	244826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453724
4559	NC_018619	GAA	3	9	244879	244887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453724
4560	NC_018619	GA	3	6	244951	244956	50 %	0 %	50 %	0 %	407453724
4561	NC_018619	TTC	2	6	245017	245022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453724
4562	NC_018619	GAC	3	9	245029	245037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453724
4563	NC_018619	TGA	2	6	245043	245048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453724
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4565	NC_018619	T	8	8	245164	245171	0 %	100 %	0 %	0 %	407453725
4566	NC_018619	GTT	2	6	245200	245205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453725
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4570	NC_018619	TAAAAG	2	12	245515	245526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407453725
4571	NC_018619	GTT	2	6	245542	245547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453725
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4573	NC_018619	AGATA	2	10	245720	245729	60 %	20 %	20 %	0 %	407453725
4574	NC_018619	TTATC	2	10	245734	245743	20 %	60 %	0 %	20 %	407453725
4575	NC_018619	TTG	2	6	245787	245792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453726
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4586	NC_018619	CTTT	2	8	246250	246257	0 %	75 %	0 %	25 %	407453726
4587	NC_018619	AGC	2	6	246261	246266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453726
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4592	NC_018619	AGA	2	6	246629	246634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453727
4593	NC_018619	TG	3	6	246663	246668	0 %	50 %	50 %	0 %	407453727
4594	NC_018619	G	6	6	246795	246800	0 %	0 %	100 %	0 %	407453727
4595	NC_018619	TGA	2	6	246804	246809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453727
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4599	NC_018619	TAACA	2	10	246960	246969	60 %	20 %	0 %	20 %	407453727
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4602	NC_018619	GAATC	2	10	247099	247108	40 %	20 %	20 %	20 %	407453727
4603	NC_018619	T	6	6	247119	247124	0 %	100 %	0 %	0 %	407453727
4604	NC_018619	GTTT	2	8	247220	247227	0 %	75 %	25 %	0 %	407453727
4605	NC_018619	GTA	2	6	247250	247255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453727
4606	NC_018619	TCC	2	6	247280	247285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453727
4607	NC_018619	T	6	6	247327	247332	0 %	100 %	0 %	0 %	407453727
4608	NC_018619	TAG	2	6	247423	247428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453727
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4610	NC_018619	GGA	2	6	247445	247450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453727
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4617	NC_018619	T	6	6	247698	247703	0 %	100 %	0 %	0 %	407453728
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4621	NC_018619	TAC	2	6	248024	248029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453729
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4993	NC_018619	AAGA	2	8	267209	267216	75 %	0 %	25 %	0 %	407453748
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