MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 3710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018618	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
2	NC_018618	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
3	NC_018618	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
4	NC_018618	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
5	NC_018618	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453020
6	NC_018618	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453020
7	NC_018618	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
8	NC_018618	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
9	NC_018618	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453020
10	NC_018618	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
11	NC_018618	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453020
12	NC_018618	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
13	NC_018618	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
14	NC_018618	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453020
15	NC_018618	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453020
16	NC_018618	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453020
17	NC_018618	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
18	NC_018618	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
19	NC_018618	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
20	NC_018618	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
21	NC_018618	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
22	NC_018618	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
23	NC_018618	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453020
24	NC_018618	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
25	NC_018618	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
26	NC_018618	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453020
27	NC_018618	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453020
28	NC_018618	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453020
29	NC_018618	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
30	NC_018618	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453020
31	NC_018618	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
32	NC_018618	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
33	NC_018618	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
34	NC_018618	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
35	NC_018618	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453020
36	NC_018618	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
37	NC_018618	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
38	NC_018618	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
39	NC_018618	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453020
40	NC_018618	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453020
41	NC_018618	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453020
42	NC_018618	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453020
43	NC_018618	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453021
44	NC_018618	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453021
45	NC_018618	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453021
46	NC_018618	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453021
47	NC_018618	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453021
48	NC_018618	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453021
49	NC_018618	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453021
50	NC_018618	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453021
51	NC_018618	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453021
52	NC_018618	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453021
53	NC_018618	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453021
54	NC_018618	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453021
55	NC_018618	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
56	NC_018618	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
57	NC_018618	GTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453022
58	NC_018618	ATT	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
59	NC_018618	ATA	3	9	4489	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
60	NC_018618	CTG	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453022
61	NC_018618	AAC	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453022
62	NC_018618	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
63	NC_018618	GTT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453022
64	NC_018618	TAA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
65	NC_018618	ATT	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
66	NC_018618	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
67	NC_018618	ATT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
68	NC_018618	TAT	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
69	NC_018618	AGT	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453022
70	NC_018618	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453022
71	NC_018618	ATA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
72	NC_018618	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
73	NC_018618	ATA	2	6	5208	5213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
74	NC_018618	AGA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453022
75	NC_018618	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
76	NC_018618	TAA	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
77	NC_018618	ATT	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
78	NC_018618	CTT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453022
79	NC_018618	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
80	NC_018618	ATT	2	6	5537	5542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
81	NC_018618	ATA	2	6	5580	5585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
82	NC_018618	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
83	NC_018618	TAT	2	6	5602	5607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
84	NC_018618	TTA	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
85	NC_018618	TAA	2	6	5652	5657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453022
86	NC_018618	ATT	2	6	5663	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453022
87	NC_018618	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
88	NC_018618	ATT	2	6	5782	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453023
89	NC_018618	TAA	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
90	NC_018618	ATA	2	6	5895	5900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
91	NC_018618	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
92	NC_018618	TCC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453023
93	NC_018618	TTA	4	12	6155	6166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453023
94	NC_018618	ATA	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
95	NC_018618	ATA	2	6	6343	6348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
96	NC_018618	TAA	2	6	6414	6419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
97	NC_018618	GCT	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453023
98	NC_018618	TAA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
99	NC_018618	TTA	2	6	6668	6673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453023
100	NC_018618	ATT	2	6	6778	6783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453023
101	NC_018618	AAT	2	6	6831	6836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
102	NC_018618	CAA	2	6	6852	6857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453023
103	NC_018618	TTA	2	6	6883	6888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453023
104	NC_018618	TAC	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453023
105	NC_018618	TAA	2	6	6936	6941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453023
106	NC_018618	ACC	2	6	7021	7026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453023
107	NC_018618	AAC	2	6	7106	7111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453023
108	NC_018618	TAA	2	6	7211	7216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
109	NC_018618	CAA	2	6	7231	7236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453024
110	NC_018618	TAT	2	6	7321	7326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
111	NC_018618	TTA	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
112	NC_018618	AAC	2	6	7457	7462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453024
113	NC_018618	TAA	2	6	7479	7484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
114	NC_018618	AGC	2	6	7508	7513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453024
115	NC_018618	ATT	2	6	7536	7541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
116	NC_018618	GAA	2	6	7542	7547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453024
117	NC_018618	ACA	2	6	7556	7561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453024
118	NC_018618	TAT	2	6	7576	7581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
119	NC_018618	TTA	2	6	7612	7617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
120	NC_018618	TAA	2	6	7643	7648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
121	NC_018618	TTA	2	6	7698	7703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
122	NC_018618	TAA	2	6	7711	7716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
123	NC_018618	TTA	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
124	NC_018618	CTA	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453024
125	NC_018618	TTG	2	6	7809	7814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453024
126	NC_018618	TAA	2	6	7870	7875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
127	NC_018618	ACC	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453024
128	NC_018618	ATA	2	6	7919	7924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
129	NC_018618	ATT	2	6	8001	8006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453024
130	NC_018618	ATC	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453024
131	NC_018618	TAA	3	9	8183	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453024
132	NC_018618	TGC	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453024
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259	NC_018618	CTT	2	6	14624	14629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453030
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