MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TC	3	6	256	261	0 %	50 %	0 %	50 %	406025742
2	NC_018606	TA	3	6	396	401	50 %	50 %	0 %	0 %	406025742
3	NC_018606	AC	3	6	731	736	50 %	0 %	0 %	50 %	406025742
4	NC_018606	TA	3	6	1845	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	406025743
5	NC_018606	TC	3	6	3825	3830	0 %	50 %	0 %	50 %	406025746
6	NC_018606	TA	3	6	4014	4019	50 %	50 %	0 %	0 %	406025746
7	NC_018606	AG	3	6	4144	4149	50 %	0 %	50 %	0 %	406025746
8	NC_018606	TA	3	6	5201	5206	50 %	50 %	0 %	0 %	406025747
9	NC_018606	AT	3	6	6628	6633	50 %	50 %	0 %	0 %	406025748
10	NC_018606	GT	3	6	7883	7888	0 %	50 %	50 %	0 %	406025752
11	NC_018606	TA	3	6	8218	8223	50 %	50 %	0 %	0 %	406025752
12	NC_018606	GA	3	6	8358	8363	50 %	0 %	50 %	0 %	406025752
13	NC_018606	TA	3	6	8766	8771	50 %	50 %	0 %	0 %	406025753
14	NC_018606	TC	3	6	8783	8788	0 %	50 %	0 %	50 %	406025753
15	NC_018606	AT	3	6	9609	9614	50 %	50 %	0 %	0 %	406025754
16	NC_018606	TA	3	6	10074	10079	50 %	50 %	0 %	0 %	406025754
17	NC_018606	TA	3	6	10245	10250	50 %	50 %	0 %	0 %	406025754
18	NC_018606	AT	3	6	11047	11052	50 %	50 %	0 %	0 %	406025755
19	NC_018606	AT	3	6	11342	11347	50 %	50 %	0 %	0 %	406025755
20	NC_018606	TC	3	6	11748	11753	0 %	50 %	0 %	50 %	406025756
21	NC_018606	TA	3	6	11804	11809	50 %	50 %	0 %	0 %	406025756
22	NC_018606	TA	3	6	12258	12263	50 %	50 %	0 %	0 %	406025756
23	NC_018606	AG	3	6	13615	13620	50 %	0 %	50 %	0 %	406025758
24	NC_018606	TA	3	6	14131	14136	50 %	50 %	0 %	0 %	406025758
25	NC_018606	TA	3	6	14602	14607	50 %	50 %	0 %	0 %	406025759
26	NC_018606	AT	3	6	14995	15000	50 %	50 %	0 %	0 %	406025759
27	NC_018606	AT	4	8	15768	15775	50 %	50 %	0 %	0 %	406025760
28	NC_018606	TA	3	6	15888	15893	50 %	50 %	0 %	0 %	406025760
29	NC_018606	GT	4	8	16112	16119	0 %	50 %	50 %	0 %	406025761
30	NC_018606	TA	4	8	16163	16170	50 %	50 %	0 %	0 %	406025761
31	NC_018606	AT	3	6	16597	16602	50 %	50 %	0 %	0 %	406025761
32	NC_018606	AT	3	6	17567	17572	50 %	50 %	0 %	0 %	406025762
33	NC_018606	TC	3	6	18340	18345	0 %	50 %	0 %	50 %	406025762
34	NC_018606	TG	3	6	18978	18983	0 %	50 %	50 %	0 %	406025762
35	NC_018606	TA	3	6	19131	19136	50 %	50 %	0 %	0 %	406025762
36	NC_018606	TA	5	10	20245	20254	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
37	NC_018606	AT	3	6	20312	20317	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
38	NC_018606	TC	3	6	20334	20339	0 %	50 %	0 %	50 %	406025765
39	NC_018606	CT	3	6	20387	20392	0 %	50 %	0 %	50 %	406025765
40	NC_018606	AT	3	6	20632	20637	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
41	NC_018606	TC	3	6	21163	21168	0 %	50 %	0 %	50 %	406025765
42	NC_018606	AG	3	6	21173	21178	50 %	0 %	50 %	0 %	406025765
43	NC_018606	TA	3	6	21865	21870	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
44	NC_018606	TA	4	8	22103	22110	50 %	50 %	0 %	0 %	406025765
45	NC_018606	TA	4	8	22924	22931	50 %	50 %	0 %	0 %	406025766
46	NC_018606	TA	3	6	24032	24037	50 %	50 %	0 %	0 %	406025767
47	NC_018606	AT	3	6	24077	24082	50 %	50 %	0 %	0 %	406025767
48	NC_018606	TA	3	6	24746	24751	50 %	50 %	0 %	0 %	406025767
49	NC_018606	TG	3	6	25125	25130	0 %	50 %	50 %	0 %	406025768
50	NC_018606	CT	3	6	25680	25685	0 %	50 %	0 %	50 %	406025769
51	NC_018606	TC	3	6	26326	26331	0 %	50 %	0 %	50 %	406025769
52	NC_018606	AT	3	6	26477	26482	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
53	NC_018606	TA	3	6	26699	26704	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
54	NC_018606	AT	5	10	26866	26875	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
55	NC_018606	CT	3	6	26878	26883	0 %	50 %	0 %	50 %	406025769
56	NC_018606	AT	3	6	27075	27080	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
57	NC_018606	TA	3	6	27768	27773	50 %	50 %	0 %	0 %	406025771
58	NC_018606	TA	3	6	27967	27972	50 %	50 %	0 %	0 %	406025772
59	NC_018606	AT	3	6	28040	28045	50 %	50 %	0 %	0 %	406025772
60	NC_018606	GA	3	6	29169	29174	50 %	0 %	50 %	0 %	406025774
61	NC_018606	AG	3	6	29558	29563	50 %	0 %	50 %	0 %	406025774
62	NC_018606	TA	3	6	29951	29956	50 %	50 %	0 %	0 %	406025774
63	NC_018606	AT	3	6	30243	30248	50 %	50 %	0 %	0 %	406025774
64	NC_018606	AT	3	6	32892	32897	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
65	NC_018606	AT	4	8	32927	32934	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
66	NC_018606	TA	3	6	33013	33018	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
67	NC_018606	TA	3	6	33104	33109	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
68	NC_018606	TA	3	6	33238	33243	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
69	NC_018606	AT	3	6	33479	33484	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
70	NC_018606	CT	3	6	34035	34040	0 %	50 %	0 %	50 %	406025777
71	NC_018606	AT	3	6	34239	34244	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
72	NC_018606	TA	3	6	34614	34619	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
73	NC_018606	AT	3	6	35773	35778	50 %	50 %	0 %	0 %	406025779
74	NC_018606	TC	3	6	36344	36349	0 %	50 %	0 %	50 %	406025780
75	NC_018606	TA	3	6	36533	36538	50 %	50 %	0 %	0 %	406025780
76	NC_018606	AG	3	6	36663	36668	50 %	0 %	50 %	0 %	406025780
77	NC_018606	CT	3	6	37502	37507	0 %	50 %	0 %	50 %	406025781
78	NC_018606	AT	3	6	39020	39025	50 %	50 %	0 %	0 %	406025784
79	NC_018606	TA	3	6	39399	39404	50 %	50 %	0 %	0 %	406025784
80	NC_018606	AT	4	8	39656	39663	50 %	50 %	0 %	0 %	406025784
81	NC_018606	TA	3	6	40150	40155	50 %	50 %	0 %	0 %	406025785
82	NC_018606	TA	3	6	40408	40413	50 %	50 %	0 %	0 %	406025785
83	NC_018606	AT	3	6	40737	40742	50 %	50 %	0 %	0 %	406025786
84	NC_018606	TA	3	6	41364	41369	50 %	50 %	0 %	0 %	406025787
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86	NC_018606	TA	3	6	42660	42665	50 %	50 %	0 %	0 %	406025788
87	NC_018606	GA	3	6	42800	42805	50 %	0 %	50 %	0 %	406025788
88	NC_018606	AT	3	6	43246	43251	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
89	NC_018606	AT	4	8	43269	43276	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
90	NC_018606	TA	3	6	43328	43333	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
91	NC_018606	AT	3	6	43388	43393	50 %	50 %	0 %	0 %	406025789
92	NC_018606	CT	3	6	43643	43648	0 %	50 %	0 %	50 %	406025790
93	NC_018606	AT	3	6	44333	44338	50 %	50 %	0 %	0 %	406025791
94	NC_018606	TA	3	6	44507	44512	50 %	50 %	0 %	0 %	406025791
95	NC_018606	TC	3	6	44932	44937	0 %	50 %	0 %	50 %	406025792
96	NC_018606	AT	3	6	45237	45242	50 %	50 %	0 %	0 %	406025792
97	NC_018606	TA	3	6	45374	45379	50 %	50 %	0 %	0 %	406025792
98	NC_018606	AT	3	6	46132	46137	50 %	50 %	0 %	0 %	406025792
99	NC_018606	AT	3	6	46372	46377	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
100	NC_018606	AT	3	6	46506	46511	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
101	NC_018606	AT	3	6	46528	46533	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
102	NC_018606	TA	3	6	46718	46723	50 %	50 %	0 %	0 %	406025793
103	NC_018606	AT	3	6	47464	47469	50 %	50 %	0 %	0 %	406025794
104	NC_018606	TA	3	6	48770	48775	50 %	50 %	0 %	0 %	406025795
105	NC_018606	AT	3	6	49372	49377	50 %	50 %	0 %	0 %	406025796
106	NC_018606	TA	5	10	50499	50508	50 %	50 %	0 %	0 %	406025798
107	NC_018606	CT	3	6	52599	52604	0 %	50 %	0 %	50 %	406025801
108	NC_018606	CT	3	6	54527	54532	0 %	50 %	0 %	50 %	406025803
109	NC_018606	TA	3	6	54657	54662	50 %	50 %	0 %	0 %	406025803
110	NC_018606	GA	3	6	54846	54851	50 %	0 %	50 %	0 %	406025803
111	NC_018606	TA	3	6	55396	55401	50 %	50 %	0 %	0 %	406025804
112	NC_018606	TA	5	10	56144	56153	50 %	50 %	0 %	0 %	406025805

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.