MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018416	AT	3	6	133	138	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
2	NC_018416	TA	3	6	392	397	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
3	NC_018416	TA	4	8	890	897	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
4	NC_018416	AT	4	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
5	NC_018416	TA	3	6	1256	1261	50 %	50 %	0 %	0 %	400404264
6	NC_018416	TA	3	6	1627	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
7	NC_018416	TA	3	6	2090	2095	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
8	NC_018416	AT	3	6	2220	2225	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
9	NC_018416	TA	3	6	2526	2531	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
10	NC_018416	AT	3	6	2634	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
11	NC_018416	TA	3	6	2644	2649	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
12	NC_018416	TA	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
13	NC_018416	AT	3	6	2709	2714	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
14	NC_018416	AT	3	6	2801	2806	50 %	50 %	0 %	0 %	400404265
15	NC_018416	AT	3	6	3032	3037	50 %	50 %	0 %	0 %	400404266
16	NC_018416	TA	3	6	3157	3162	50 %	50 %	0 %	0 %	400404266
17	NC_018416	AT	3	6	3228	3233	50 %	50 %	0 %	0 %	400404266
18	NC_018416	AT	3	6	3311	3316	50 %	50 %	0 %	0 %	400404266
19	NC_018416	AT	3	6	3451	3456	50 %	50 %	0 %	0 %	400404266
20	NC_018416	TA	4	8	3684	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	400404267
21	NC_018416	TA	3	6	3786	3791	50 %	50 %	0 %	0 %	400404268
22	NC_018416	TA	3	6	4294	4299	50 %	50 %	0 %	0 %	400404269
23	NC_018416	AG	3	6	4740	4745	50 %	0 %	50 %	0 %	400404270
24	NC_018416	AT	3	6	4955	4960	50 %	50 %	0 %	0 %	400404270
25	NC_018416	TA	4	8	6103	6110	50 %	50 %	0 %	0 %	400404271
26	NC_018416	AT	3	6	6577	6582	50 %	50 %	0 %	0 %	400404272
27	NC_018416	TA	4	8	6590	6597	50 %	50 %	0 %	0 %	400404272
28	NC_018416	AT	3	6	7111	7116	50 %	50 %	0 %	0 %	400404272
29	NC_018416	AT	3	6	7746	7751	50 %	50 %	0 %	0 %	400404272
30	NC_018416	AT	3	6	8771	8776	50 %	50 %	0 %	0 %	400404274
31	NC_018416	TA	3	6	9078	9083	50 %	50 %	0 %	0 %	400404275
32	NC_018416	TA	3	6	9179	9184	50 %	50 %	0 %	0 %	400404275
33	NC_018416	AT	3	6	9420	9425	50 %	50 %	0 %	0 %	400404275
34	NC_018416	TA	5	10	9941	9950	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
35	NC_018416	TA	3	6	10247	10252	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
36	NC_018416	AT	4	8	10369	10376	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
37	NC_018416	AT	3	6	10563	10568	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
38	NC_018416	TA	4	8	10585	10592	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
39	NC_018416	TA	4	8	10729	10736	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
40	NC_018416	AT	3	6	10843	10848	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
41	NC_018416	AT	3	6	10859	10864	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
42	NC_018416	TA	3	6	11174	11179	50 %	50 %	0 %	0 %	400404276
43	NC_018416	TA	3	6	11575	11580	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
44	NC_018416	TA	3	6	11599	11604	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
45	NC_018416	AT	4	8	11804	11811	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
46	NC_018416	TA	3	6	11997	12002	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
47	NC_018416	AT	3	6	12049	12054	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
48	NC_018416	AT	3	6	12063	12068	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
49	NC_018416	AT	3	6	12251	12256	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
50	NC_018416	TA	3	6	12280	12285	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
51	NC_018416	TA	3	6	12374	12379	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
52	NC_018416	GA	5	10	12645	12654	50 %	0 %	50 %	0 %	400404277
53	NC_018416	AT	3	6	12875	12880	50 %	50 %	0 %	0 %	400404277
54	NC_018416	TA	15	30	13725	13754	50 %	50 %	0 %	0 %	400404279
55	NC_018416	AT	4	8	13828	13835	50 %	50 %	0 %	0 %	400404279
56	NC_018416	AT	5	10	13886	13895	50 %	50 %	0 %	0 %	400404279
57	NC_018416	TA	4	8	14265	14272	50 %	50 %	0 %	0 %	400404280
58	NC_018416	AT	3	6	14426	14431	50 %	50 %	0 %	0 %	400404280
59	NC_018416	AT	3	6	14587	14592	50 %	50 %	0 %	0 %	400404280
60	NC_018416	TA	3	6	15142	15147	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
61	NC_018416	AT	3	6	15233	15238	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
62	NC_018416	TA	3	6	15433	15438	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
63	NC_018416	TA	4	8	15477	15484	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
64	NC_018416	TA	3	6	15608	15613	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
65	NC_018416	TA	3	6	15632	15637	50 %	50 %	0 %	0 %	400404281
66	NC_018416	TA	3	6	17849	17854	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
67	NC_018416	AT	3	6	17980	17985	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
68	NC_018416	AT	3	6	18010	18015	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
69	NC_018416	TA	3	6	18722	18727	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
70	NC_018416	AT	3	6	18930	18935	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
71	NC_018416	AT	3	6	19892	19897	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
72	NC_018416	AT	3	6	20113	20118	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
73	NC_018416	TA	3	6	20131	20136	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
74	NC_018416	TA	3	6	20442	20447	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
75	NC_018416	AT	3	6	20640	20645	50 %	50 %	0 %	0 %	400404285
76	NC_018416	AT	3	6	21841	21846	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
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78	NC_018416	AT	3	6	22333	22338	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
79	NC_018416	AT	3	6	22907	22912	50 %	50 %	0 %	0 %	400404287
80	NC_018416	AT	3	6	23466	23471	50 %	50 %	0 %	0 %	400404288
81	NC_018416	AT	3	6	23490	23495	50 %	50 %	0 %	0 %	400404288
82	NC_018416	AT	3	6	24308	24313	50 %	50 %	0 %	0 %	400404291
83	NC_018416	TA	3	6	24385	24390	50 %	50 %	0 %	0 %	400404291
84	NC_018416	AT	3	6	24495	24500	50 %	50 %	0 %	0 %	400404291
85	NC_018416	TA	3	6	24724	24729	50 %	50 %	0 %	0 %	400404291
86	NC_018416	AT	5	10	26500	26509	50 %	50 %	0 %	0 %	400404292
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88	NC_018416	AT	3	6	26691	26696	50 %	50 %	0 %	0 %	400404292
89	NC_018416	AT	3	6	27019	27024	50 %	50 %	0 %	0 %	400404293
90	NC_018416	AT	3	6	27136	27141	50 %	50 %	0 %	0 %	400404293
91	NC_018416	TA	3	6	27142	27147	50 %	50 %	0 %	0 %	400404293
92	NC_018416	AT	3	6	27168	27173	50 %	50 %	0 %	0 %	400404293
93	NC_018416	AT	3	6	27396	27401	50 %	50 %	0 %	0 %	400404294
94	NC_018416	AT	3	6	27425	27430	50 %	50 %	0 %	0 %	400404294
95	NC_018416	AT	4	8	27824	27831	50 %	50 %	0 %	0 %	400404294
96	NC_018416	TA	3	6	28165	28170	50 %	50 %	0 %	0 %	400404294
97	NC_018416	TA	4	8	28549	28556	50 %	50 %	0 %	0 %	400404295
98	NC_018416	TA	3	6	28798	28803	50 %	50 %	0 %	0 %	400404295
99	NC_018416	TA	3	6	28882	28887	50 %	50 %	0 %	0 %	400404295
100	NC_018416	AT	3	6	29498	29503	50 %	50 %	0 %	0 %	400404296
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102	NC_018416	TA	3	6	29905	29910	50 %	50 %	0 %	0 %	400404296
103	NC_018416	AT	3	6	30048	30053	50 %	50 %	0 %	0 %	400404296
104	NC_018416	TA	3	6	30194	30199	50 %	50 %	0 %	0 %	400404296
105	NC_018416	TA	3	6	30771	30776	50 %	50 %	0 %	0 %	400404297
106	NC_018416	TA	3	6	31976	31981	50 %	50 %	0 %	0 %	400404298
107	NC_018416	TA	3	6	32010	32015	50 %	50 %	0 %	0 %	400404298
108	NC_018416	TA	3	6	32240	32245	50 %	50 %	0 %	0 %	400404298
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110	NC_018416	TA	3	6	33547	33552	50 %	50 %	0 %	0 %	400404300
111	NC_018416	AT	4	8	34462	34469	50 %	50 %	0 %	0 %	400404301
112	NC_018416	TA	4	8	34557	34564	50 %	50 %	0 %	0 %	400404301
113	NC_018416	AT	3	6	34688	34693	50 %	50 %	0 %	0 %	400404301
114	NC_018416	AT	3	6	34821	34826	50 %	50 %	0 %	0 %	400404301
115	NC_018416	TA	3	6	34881	34886	50 %	50 %	0 %	0 %	400404301
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117	NC_018416	AT	3	6	35639	35644	50 %	50 %	0 %	0 %	400404303
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119	NC_018416	AT	3	6	36542	36547	50 %	50 %	0 %	0 %	400404304
120	NC_018416	TA	3	6	36809	36814	50 %	50 %	0 %	0 %	400404304
121	NC_018416	AT	3	6	37031	37036	50 %	50 %	0 %	0 %	400404304
122	NC_018416	TA	3	6	37535	37540	50 %	50 %	0 %	0 %	400404305
123	NC_018416	TA	4	8	37558	37565	50 %	50 %	0 %	0 %	400404305
124	NC_018416	AT	3	6	37635	37640	50 %	50 %	0 %	0 %	400404305
125	NC_018416	AT	3	6	37787	37792	50 %	50 %	0 %	0 %	400404305
126	NC_018416	AT	3	6	37883	37888	50 %	50 %	0 %	0 %	400404305
127	NC_018416	AT	3	6	38630	38635	50 %	50 %	0 %	0 %	400404306
128	NC_018416	TA	3	6	39357	39362	50 %	50 %	0 %	0 %	400404307
129	NC_018416	TA	3	6	39388	39393	50 %	50 %	0 %	0 %	400404307
130	NC_018416	TA	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	400404307
131	NC_018416	AT	3	6	39584	39589	50 %	50 %	0 %	0 %	400404308
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134	NC_018416	AT	3	6	40470	40475	50 %	50 %	0 %	0 %	400404309
135	NC_018416	TA	3	6	41194	41199	50 %	50 %	0 %	0 %	400404310
136	NC_018416	AT	4	8	41231	41238	50 %	50 %	0 %	0 %	400404310
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138	NC_018416	AT	3	6	42188	42193	50 %	50 %	0 %	0 %	400404310
139	NC_018416	TA	3	6	42566	42571	50 %	50 %	0 %	0 %	400404311
140	NC_018416	AT	4	8	42648	42655	50 %	50 %	0 %	0 %	400404311
141	NC_018416	AT	3	6	42742	42747	50 %	50 %	0 %	0 %	400404311
142	NC_018416	TA	3	6	42756	42761	50 %	50 %	0 %	0 %	400404311
143	NC_018416	AT	3	6	43058	43063	50 %	50 %	0 %	0 %	400404311
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