MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 330

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018416	ATTTT	2	10	542	551	20 %	80 %	0 %	0 %	400404264
2	NC_018416	AAAAT	2	10	965	974	80 %	20 %	0 %	0 %	400404264
3	NC_018416	TAAAT	2	10	1026	1035	60 %	40 %	0 %	0 %	400404264
4	NC_018416	AAAAT	2	10	1084	1093	80 %	20 %	0 %	0 %	400404264
5	NC_018416	ATTTT	2	10	2727	2736	20 %	80 %	0 %	0 %	400404265
6	NC_018416	ATTAA	2	10	2851	2860	60 %	40 %	0 %	0 %	400404266
7	NC_018416	ATTTA	2	10	3009	3018	40 %	60 %	0 %	0 %	400404266
8	NC_018416	AATTT	2	10	3379	3388	40 %	60 %	0 %	0 %	400404266
9	NC_018416	TAAAT	2	10	3881	3890	60 %	40 %	0 %	0 %	400404268
10	NC_018416	AATAA	2	10	4168	4177	80 %	20 %	0 %	0 %	400404268
11	NC_018416	ATTGT	2	10	4467	4476	20 %	60 %	20 %	0 %	400404270
12	NC_018416	ATTAT	2	10	5577	5586	40 %	60 %	0 %	0 %	400404270
13	NC_018416	ATATT	2	10	5717	5726	40 %	60 %	0 %	0 %	400404270
14	NC_018416	ATAAA	2	10	5784	5793	80 %	20 %	0 %	0 %	400404271
15	NC_018416	TAAAA	2	10	8006	8015	80 %	20 %	0 %	0 %	400404273
16	NC_018416	TGATG	2	10	10041	10050	20 %	40 %	40 %	0 %	400404276
17	NC_018416	ATTTT	2	10	10525	10534	20 %	80 %	0 %	0 %	400404276
18	NC_018416	ATTAT	2	10	10869	10878	40 %	60 %	0 %	0 %	400404276
19	NC_018416	TTATA	2	10	10879	10888	40 %	60 %	0 %	0 %	400404276
20	NC_018416	ATTTT	2	10	11007	11016	20 %	80 %	0 %	0 %	400404276
21	NC_018416	ATTAT	2	10	11367	11376	40 %	60 %	0 %	0 %	400404276
22	NC_018416	TAAAT	2	10	11582	11591	60 %	40 %	0 %	0 %	400404277
23	NC_018416	TTAAT	2	10	12124	12133	40 %	60 %	0 %	0 %	400404277
24	NC_018416	AAATT	2	10	12750	12759	60 %	40 %	0 %	0 %	400404277
25	NC_018416	TATTT	2	10	13044	13053	20 %	80 %	0 %	0 %	400404278
26	NC_018416	ATTTA	2	10	13278	13287	40 %	60 %	0 %	0 %	400404278
27	NC_018416	TAAAA	2	10	13706	13715	80 %	20 %	0 %	0 %	400404278
28	NC_018416	TATAA	2	10	13864	13873	60 %	40 %	0 %	0 %	400404279
29	NC_018416	ATATT	3	15	14801	14815	40 %	60 %	0 %	0 %	400404280
30	NC_018416	GAAAA	2	10	15103	15112	80 %	0 %	20 %	0 %	400404281
31	NC_018416	ATATA	2	10	15594	15603	60 %	40 %	0 %	0 %	400404281
32	NC_018416	ATAAA	2	10	15658	15667	80 %	20 %	0 %	0 %	400404281
33	NC_018416	ATATT	2	10	15961	15970	40 %	60 %	0 %	0 %	400404282
34	NC_018416	TTTTA	2	10	17698	17707	20 %	80 %	0 %	0 %	400404285
35	NC_018416	ATATT	2	10	17884	17893	40 %	60 %	0 %	0 %	400404285
36	NC_018416	TTTAA	2	10	19823	19832	40 %	60 %	0 %	0 %	400404285
37	NC_018416	TAAAA	2	10	20032	20041	80 %	20 %	0 %	0 %	400404285
38	NC_018416	AAATT	2	10	20343	20352	60 %	40 %	0 %	0 %	400404285
39	NC_018416	ATTTA	2	10	20470	20479	40 %	60 %	0 %	0 %	400404285
40	NC_018416	TAAAA	2	10	20560	20569	80 %	20 %	0 %	0 %	400404285
41	NC_018416	ATTAT	2	10	20621	20630	40 %	60 %	0 %	0 %	400404285
42	NC_018416	ATTAA	2	10	20774	20783	60 %	40 %	0 %	0 %	400404285
43	NC_018416	ATTTT	2	10	20860	20869	20 %	80 %	0 %	0 %	400404286
44	NC_018416	ATTAT	2	10	21668	21677	40 %	60 %	0 %	0 %	400404287
45	NC_018416	ATTTT	2	10	24234	24243	20 %	80 %	0 %	0 %	400404290
46	NC_018416	TATAA	2	10	24733	24742	60 %	40 %	0 %	0 %	400404291
47	NC_018416	TAAAT	2	10	25053	25062	60 %	40 %	0 %	0 %	400404291
48	NC_018416	AATAA	2	10	25180	25189	80 %	20 %	0 %	0 %	400404291
49	NC_018416	ATTTT	2	10	25190	25199	20 %	80 %	0 %	0 %	400404291
50	NC_018416	TAAAT	2	10	25663	25672	60 %	40 %	0 %	0 %	400404292
51	NC_018416	ATTTA	2	10	25966	25975	40 %	60 %	0 %	0 %	400404292
52	NC_018416	CAAAT	2	10	26373	26382	60 %	20 %	0 %	20 %	400404292
53	NC_018416	ATTAT	2	10	28512	28521	40 %	60 %	0 %	0 %	400404295
54	NC_018416	TAATT	2	10	29160	29169	40 %	60 %	0 %	0 %	400404296
55	NC_018416	ATTAA	2	10	29575	29584	60 %	40 %	0 %	0 %	400404296
56	NC_018416	TAAAT	2	10	29871	29880	60 %	40 %	0 %	0 %	400404296
57	NC_018416	AATTT	2	10	30007	30016	40 %	60 %	0 %	0 %	400404296
58	NC_018416	ATTTT	2	10	31817	31826	20 %	80 %	0 %	0 %	400404298
59	NC_018416	TTTAT	2	10	32093	32102	20 %	80 %	0 %	0 %	400404298
60	NC_018416	GATTA	2	10	32121	32130	40 %	40 %	20 %	0 %	400404298
61	NC_018416	ATTTT	2	10	32763	32772	20 %	80 %	0 %	0 %	400404299
62	NC_018416	TTTAA	2	10	33219	33228	40 %	60 %	0 %	0 %	400404300
63	NC_018416	ATTTT	2	10	33869	33878	20 %	80 %	0 %	0 %	400404300
64	NC_018416	TTTTA	2	10	34011	34020	20 %	80 %	0 %	0 %	400404300
65	NC_018416	AAAAT	2	10	34197	34206	80 %	20 %	0 %	0 %	400404300
66	NC_018416	AATTT	2	10	34364	34373	40 %	60 %	0 %	0 %	400404301
67	NC_018416	ATTTT	2	10	34537	34546	20 %	80 %	0 %	0 %	400404301
68	NC_018416	TAATT	2	10	35210	35219	40 %	60 %	0 %	0 %	400404302
69	NC_018416	TAAAA	2	10	36920	36929	80 %	20 %	0 %	0 %	400404304
70	NC_018416	TTAAT	2	10	36931	36940	40 %	60 %	0 %	0 %	400404304
71	NC_018416	TATTT	2	10	37219	37228	20 %	80 %	0 %	0 %	400404305
72	NC_018416	TAATA	2	10	38065	38074	60 %	40 %	0 %	0 %	400404305
73	NC_018416	ATTAA	2	10	38126	38135	60 %	40 %	0 %	0 %	400404305
74	NC_018416	ATTTT	2	10	38347	38356	20 %	80 %	0 %	0 %	400404305
75	NC_018416	TAATT	2	10	38517	38526	40 %	60 %	0 %	0 %	400404306
76	NC_018416	TAAAT	2	10	38622	38631	60 %	40 %	0 %	0 %	400404306
77	NC_018416	ATTTT	2	10	39122	39131	20 %	80 %	0 %	0 %	400404307
78	NC_018416	TTAAA	2	10	39149	39158	60 %	40 %	0 %	0 %	400404307
79	NC_018416	AATTT	2	10	39235	39244	40 %	60 %	0 %	0 %	400404307
80	NC_018416	AAAAT	2	10	39307	39316	80 %	20 %	0 %	0 %	400404307
81	NC_018416	ATTTT	2	10	39521	39530	20 %	80 %	0 %	0 %	400404307
82	NC_018416	TCTTG	2	10	40160	40169	0 %	60 %	20 %	20 %	400404308
83	NC_018416	ATTAT	2	10	40250	40259	40 %	60 %	0 %	0 %	400404308
84	NC_018416	ATTTT	2	10	40640	40649	20 %	80 %	0 %	0 %	400404309
85	NC_018416	AAAAT	2	10	41509	41518	80 %	20 %	0 %	0 %	400404310
86	NC_018416	ATTAA	2	10	41610	41619	60 %	40 %	0 %	0 %	400404310
87	NC_018416	TCATT	2	10	41644	41653	20 %	60 %	0 %	20 %	400404310
88	NC_018416	TTAAA	2	10	41890	41899	60 %	40 %	0 %	0 %	400404310
89	NC_018416	TTTTA	2	10	42366	42375	20 %	80 %	0 %	0 %	400404311
90	NC_018416	ATTTA	2	10	42537	42546	40 %	60 %	0 %	0 %	400404311
91	NC_018416	TATTT	2	10	42681	42690	20 %	80 %	0 %	0 %	400404311
92	NC_018416	AATTT	2	10	42698	42707	40 %	60 %	0 %	0 %	400404311
93	NC_018416	ATATT	2	10	42719	42728	40 %	60 %	0 %	0 %	400404311
94	NC_018416	AAATT	2	10	43037	43046	60 %	40 %	0 %	0 %	400404311
95	NC_018416	TTTCA	2	10	43699	43708	20 %	60 %	0 %	20 %	400404312
96	NC_018416	ATGTT	2	10	45156	45165	20 %	60 %	20 %	0 %	400404314
97	NC_018416	AAAAT	2	10	45465	45474	80 %	20 %	0 %	0 %	400404315
98	NC_018416	ATTTT	2	10	45857	45866	20 %	80 %	0 %	0 %	400404316
99	NC_018416	AAATT	2	10	46015	46024	60 %	40 %	0 %	0 %	400404316
100	NC_018416	TAAAA	2	10	46725	46734	80 %	20 %	0 %	0 %	400404317
101	NC_018416	AATTA	2	10	46737	46746	60 %	40 %	0 %	0 %	400404317
102	NC_018416	AAATA	2	10	47194	47203	80 %	20 %	0 %	0 %	400404318
103	NC_018416	TAATT	2	10	47314	47323	40 %	60 %	0 %	0 %	400404318
104	NC_018416	TTATA	2	10	47937	47946	40 %	60 %	0 %	0 %	400404319
105	NC_018416	ATTTT	2	10	48602	48611	20 %	80 %	0 %	0 %	400404319
106	NC_018416	ATTTT	2	10	48707	48716	20 %	80 %	0 %	0 %	400404319
107	NC_018416	AAATA	2	10	49408	49417	80 %	20 %	0 %	0 %	400404320
108	NC_018416	ATTTT	2	10	50444	50453	20 %	80 %	0 %	0 %	400404321
109	NC_018416	ATTTT	2	10	51447	51456	20 %	80 %	0 %	0 %	400404321
110	NC_018416	TAAAA	2	10	52458	52467	80 %	20 %	0 %	0 %	400404323
111	NC_018416	ATTTT	2	10	54182	54191	20 %	80 %	0 %	0 %	400404325
112	NC_018416	TTTAA	2	10	54254	54263	40 %	60 %	0 %	0 %	400404326
113	NC_018416	AATTT	2	10	54264	54273	40 %	60 %	0 %	0 %	400404326
114	NC_018416	TAAAA	2	10	54331	54340	80 %	20 %	0 %	0 %	400404326
115	NC_018416	TTTTG	2	10	55439	55448	0 %	80 %	20 %	0 %	400404328
116	NC_018416	ATTAT	2	10	55476	55485	40 %	60 %	0 %	0 %	400404328
117	NC_018416	ATTTT	2	10	55733	55742	20 %	80 %	0 %	0 %	400404329
118	NC_018416	TAATT	2	10	55785	55794	40 %	60 %	0 %	0 %	400404329
119	NC_018416	ATTTT	2	10	55926	55935	20 %	80 %	0 %	0 %	400404329
120	NC_018416	ATTTA	2	10	57056	57065	40 %	60 %	0 %	0 %	400404330
121	NC_018416	TTTAA	2	10	57408	57417	40 %	60 %	0 %	0 %	400404330
122	NC_018416	ATTTT	2	10	57477	57486	20 %	80 %	0 %	0 %	400404330
123	NC_018416	AATTT	2	10	57550	57559	40 %	60 %	0 %	0 %	400404330
124	NC_018416	ATTTA	2	10	57632	57641	40 %	60 %	0 %	0 %	400404330
125	NC_018416	ATTTT	2	10	58693	58702	20 %	80 %	0 %	0 %	400404332
126	NC_018416	AAAAT	2	10	60100	60109	80 %	20 %	0 %	0 %	400404334
127	NC_018416	AATTT	2	10	60662	60671	40 %	60 %	0 %	0 %	400404335
128	NC_018416	ATTTA	2	10	60825	60834	40 %	60 %	0 %	0 %	400404335
129	NC_018416	ATTTT	2	10	63367	63376	20 %	80 %	0 %	0 %	400404338
130	NC_018416	TAATT	2	10	63428	63437	40 %	60 %	0 %	0 %	400404338
131	NC_018416	ATTTT	2	10	63574	63583	20 %	80 %	0 %	0 %	400404338
132	NC_018416	TTTAT	2	10	63838	63847	20 %	80 %	0 %	0 %	400404338
133	NC_018416	AAAAT	2	10	64184	64193	80 %	20 %	0 %	0 %	400404339
134	NC_018416	TATTT	2	10	64497	64506	20 %	80 %	0 %	0 %	400404340
135	NC_018416	AAAAT	2	10	64973	64982	80 %	20 %	0 %	0 %	400404340
136	NC_018416	TAATT	2	10	65928	65937	40 %	60 %	0 %	0 %	400404341
137	NC_018416	AATTT	2	10	66017	66026	40 %	60 %	0 %	0 %	400404341
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.